Üç iplikli DNA veya üç sarmallı DNA, üç oligonükleotitin birbiri etrafına sarılarak üçlü sarmal oluşturduğu bir DNA yapısıdır. Bu yapıda ipliklerden biri, B-biçimli DNA ile kurar. Bu bağ, ikili sarmalın büyük oluğunda oluşur.
Örneğin, bir T nükleobazı, Watson-Crick baz eşleşmesi ile oluşmuş bir A-T baz çiftindeki A ile kurarak bir AxT çifti oluşturur (x bir karşılık gelir). N-3 pozisyonunda protonlaşmış bir sitozin (C+ olarak temsil edilir) bir G-C çiftindeki G ile bağ kurarak bir GxC+ çifti oluşturur. Bu Hoogsteen eşleşmeleri ile oluşan DNA üçlü sarmalları iki homopirimidin ve bir homopürin iplikten oluşur, homopirimdin olan üçüncü sarmal, homopürin olan iplikle aynı doğrultudadır. (Homopürin ve homopirimidin, sadece pürin veya pirimidinlerden oluşan DNA iplikleri demektir.)
Homopürin olan bir üçüncü iplik ayrıca homopürin-homopirimidin ikiliye ters Hoogsteen bağlarıyla da bağlanabilir. Bu yapıda olan üçlülerde, A bazı bir T-A çiftine, G'da bir C-G çiftine bağlanır. Üçüncü iplikteki bazlar ters dönmek zorunda oldukları için, homopürin olan üçüncü iplik, orijinal ikili sarmaldaki homopürin ipliğin tersi doğrultusundadır (yani antiparaleldir).
Üç iplikcikli DNA ilk defa 1957'de betimlenmiştir. O zaman E. coli rekombinaz enzimi 'nın bir reaksiyon ara ürünü olduğu görülmüştü. Üçlü DNA'nın bu süreçteki rolü bilinmemektedir.
DNA ikili sarmallarına bağlanarak üçlü yapılar oluşturacak oligonükleotitler kullanmanın laboratuvarda mutasyonlara ve rekombinmasyona neden olduğu, ayrıca transkripsiyonu engelleyebildiği bulunmuştur. Bu yöntemin biyoteknoloji ve tedavide kullanılması beklenmektedir.
Kaynakça
- ^ a b Frank-Kamenetskii MD, Mirkin SM (1995). "Triplex DNA structures". Annu. Rev. Biochem. Cilt 64. ss. 65-95. doi:10.1146/annurev.bi.64.070195.000433. (PMID) 7574496.
- ^ FELSENFELD G, RICH A (Aralık 1957). "Studies on the formation of two- and three-stranded polyribonucleotides". Biochim. Biophys. Acta. 26 (3). ss. 457-68. (PMID) 13499402.
- ^ Seidman MM, Glazer PM (Ağustos 2003). "The potential for gene repair via triple helix formation". J. Clin. Invest. 112 (4). ss. 487-94. doi:10.1172/JCI19552. (PMC) 171401 $2. (PMID) 12925687.
- ^ Chan PP, Glazer PM (Nisan 1997). "Triplex DNA: fundamentals, advances, and potential applications for gene therapy". J. Mol. Med. 75 (4). ss. 267-82. (PMID) 9151213.
- ^ Jain A, Wang G, Vasquez KM (Ağustos 2008). "DNA triple helices: biological consequences and therapeutic potential". Biochimie. 90 (8). ss. 1117-30. doi:10.1016/j.biochi.2008.02.011. (PMC) 2586808 $2. (PMID) 18331847.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Uc iplikli DNA veya uc sarmalli DNA uc oligonukleotitin birbiri etrafina sarilarak uclu sarmal olusturdugu bir DNA yapisidir Bu yapida ipliklerden biri B bicimli DNA ile kurar Bu bag ikili sarmalin buyuk olugunda olusur DNA uclu sarmalinin sematik yapisi DNA uclu sarmalinda baz ucluleri Ornegin bir T nukleobazi Watson Crick baz eslesmesi ile olusmus bir A T baz ciftindeki A ile kurarak bir AxT cifti olusturur x bir karsilik gelir N 3 pozisyonunda protonlasmis bir sitozin C olarak temsil edilir bir G C ciftindeki G ile bag kurarak bir GxC cifti olusturur Bu Hoogsteen eslesmeleri ile olusan DNA uclu sarmallari iki homopirimidin ve bir homopurin iplikten olusur homopirimdin olan ucuncu sarmal homopurin olan iplikle ayni dogrultudadir Homopurin ve homopirimidin sadece purin veya pirimidinlerden olusan DNA iplikleri demektir Homopurin olan bir ucuncu iplik ayrica homopurin homopirimidin ikiliye ters Hoogsteen baglariyla da baglanabilir Bu yapida olan uclulerde A bazi bir T A ciftine G da bir C G ciftine baglanir Ucuncu iplikteki bazlar ters donmek zorunda olduklari icin homopurin olan ucuncu iplik orijinal ikili sarmaldaki homopurin ipligin tersi dogrultusundadir yani antiparaleldir Uc iplikcikli DNA ilk defa 1957 de betimlenmistir O zaman E coli rekombinaz enzimi nin bir reaksiyon ara urunu oldugu gorulmustu Uclu DNA nin bu surecteki rolu bilinmemektedir DNA ikili sarmallarina baglanarak uclu yapilar olusturacak oligonukleotitler kullanmanin laboratuvarda mutasyonlara ve rekombinmasyona neden oldugu ayrica transkripsiyonu engelleyebildigi bulunmustur Bu yontemin biyoteknoloji ve tedavide kullanilmasi beklenmektedir Kaynakca a b Frank Kamenetskii MD Mirkin SM 1995 Triplex DNA structures Annu Rev Biochem Cilt 64 ss 65 95 doi 10 1146 annurev bi 64 070195 000433 PMID 7574496 FELSENFELD G RICH A Aralik 1957 Studies on the formation of two and three stranded polyribonucleotides Biochim Biophys Acta 26 3 ss 457 68 PMID 13499402 Seidman MM Glazer PM Agustos 2003 The potential for gene repair via triple helix formation J Clin Invest 112 4 ss 487 94 doi 10 1172 JCI19552 PMC 171401 2 PMID 12925687 Chan PP Glazer PM Nisan 1997 Triplex DNA fundamentals advances and potential applications for gene therapy J Mol Med 75 4 ss 267 82 PMID 9151213 Jain A Wang G Vasquez KM Agustos 2008 DNA triple helices biological consequences and therapeutic potential Biochimie 90 8 ss 1117 30 doi 10 1016 j biochi 2008 02 011 PMC 2586808 2 PMID 18331847 KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link