Moleküler biyolojide 7SK, 'da bol bulunan küçük bir nükleer RNA`dır. Pozitif transkripsiyon uzatma faktörünün kontrol transkripsiyonunu düzenlemede önemli bir rol oynar. 7SK kompleksinin stabilitesi ve fonksiyonunu düzenleyen diğer proteinler küçük bir nükleer ribonükleoprotein kompleksinde (snRNP) bulunur.
Yapı
İlk araştırmalar hücrelerinde 7SK`nın bir dizi protein ile birlikte ve belirtilen tarama bölgesinin sekonder yapıdaki RNA`nın farklı bölgeleri arasında baz çiftleşmesi için bir model olduğunu göstermiştir. 7SK snRNP işlevinde bir atılım bulgusu ile verilen pozitif transkripsiyon uzatma faktörü p-TEFb kompleksinin bileşenidir. 7SK, veya RNA bağlama proteinlerinin etkisiyle P-TEFb'nin siklin bağımlı kinaz aktivitesini birleştirir ve inhibe eder. 7SK'nın 5 'ucundaki gama fosfat, 7SK snRNP'nin kurucu bir bileşenini oluşturan metilfosfat kapatma enzimi MEPCE tarafından metilasyona tabi tutulur. La ilişkili protein LARP7’ninde, RNA'nın 3' ucu ile etkileşim yoluyla; 7SK parçasının kısmen ilişkisi bulunmuştur. SiRNA aracılı demonte tarafından MEPCE veya LARP7` ye azaltılması, in vivo olarak 7SK istikrarsızlığına yol açar.7SK snRNP`lerin bir alt kümesi, p-TEFb ve HEXIM`den yoksundur bunun yerine hnRNPs içerir.
İşlev
7SK snRNP'nin esas işlevi, transkripsiyonun uzama fazını düzenleyen bir faktör olan P-TEFb'nin kontrolüdür. Faktörü 7SK snRNP olduğunda, p-TEFb kinaz aktivitesi inhibe edilir. P-TEFb, HIV transaktivatör tat ya da bromodomain içeren proteinin (BRD4) biri ile 7SK snRNP serbest bırakılabilir. Bu durum, 7SK RNA`nın bir konformasyonel değişikliğine ve HEXIM’in dışarı atılmasına yol açar. HnRNP'ler, P-TEFb ve HEXIM'den yoksun kompleksi stabilize eder. P-TEFb, spesifik genler üzerinde işlev gördükten sonra bilinmeyen bir mekanizma ile 7SK snRNP'ye yeniden kenetlenir. 7SK snRNP hem insan hem de Drosophila'da karakterize edilmiştir.
Kaynakça
- ^ Diribarne G, Bensaude O (2009). . RNA Biology. 6 (2). ss. 122-8. (PMID) 19246988. 4 Mart 2014 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ a b Peterlin BM, Brogie JE, Price DH (2012). "7SK snRNA: a noncoding RNA that plays a major role in regulating eukaryotic transcription". Wiley Interdisciplinary Reviews. RNA. 3 (1). ss. 92-103. doi:10.1002/wrna.106. (PMC) 3223291 $2. (PMID) 21853533. 14 Kasım 2016 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Wassarman DA, Steitz JA (Temmuz 1991). "Structural analyses of the 7SK ribonucleoprotein (RNP), the most abundant human small RNP of unknown function". Molecular and Cellular Biology. 11 (7). ss. 3432-45. doi:10.1128/MCB.11.7.3432. (PMC) 361072 $2. (PMID) 1646389. 6 Ocak 2016 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Nguyen VT, Kiss T, Michels AA, Bensaude O (Kasım 2001). "7SK small nuclear RNA binds to and inhibits the activity of CDK9/cyclin T complexes". Nature. 414 (6861). ss. 322-5. doi:10.1038/35104581. (PMID) 11713533.
- ^ Yang Z, Zhu Q, Luo K, Zhou Q (Kasım 2001). "The 7SK small nuclear RNA inhibits the CDK9/cyclin T1 kinase to control transcription". Nature. 414 (6861). ss. 317-22. doi:10.1038/35104575. (PMID) 11713532.
- ^ Michels AA, Nguyen VT, Fraldi A, Labas V, Edwards M, Bonnet F, Lania L, Bensaude O (Temmuz 2003). "MAQ1 and 7SK RNA interact with CDK9/cyclin T complexes in a transcription-dependent manner". Molecular and Cellular Biology. 23 (14). ss. 4859-69. doi:10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003. (PMC) 162212 $2. (PMID) 12832472. 2 Şubat 2019 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Yik JH, Chen R, Nishimura R, Jennings JL, Link AJ, Zhou Q (Ekim 2003). "Inhibition of P-TEFb (CDK9/Cyclin T) kinase and RNA polymerase II transcription by the coordinated actions of HEXIM1 and 7SK snRNA". Molecular Cell. 12 (4). ss. 971-82. doi:10.1016/S1097-2765(03)00388-5. (PMID) 14580347. 24 Eylül 2015 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Byers SA, Price JP, Cooper JJ, Li Q, Price DH (Nisan 2005). . The Journal of Biological Chemistry. 280 (16). ss. 16360-7. doi:10.1074/jbc.M500424200. (PMID) 15713662. 21 Eylül 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Yik JH, Chen R, Pezda AC, Zhou Q (Nisan 2005). "Compensatory contributions of HEXIM1 and HEXIM2 in maintaining the balance of active and inactive positive transcription elongation factor b complexes for control of transcription". The Journal of Biological Chemistry. 280 (16). ss. 16368-76. doi:10.1074/jbc.M500912200. (PMID) 15713661.[]
- ^ Jeronimo C, Forget D, Bouchard A, Li Q, Chua G, Poitras C, Thérien C, Bergeron D, Bourassa S, Greenblatt J, Chabot B, Poirier GG, Hughes TR, Blanchette M, Price DH, Coulombe B (Temmuz 2007). "Systematic analysis of the protein interaction network for the human transcription machinery reveals the identity of the 7SK capping enzyme". Molecular Cell. 27 (2). ss. 262-74. doi:10.1016/j.molcel.2007.06.027. (PMID) 17643375. 24 Eylül 2015 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Krueger BJ, Jeronimo C, Roy BB, Bouchard A, Barrandon C, Byers SA, Searcey CE, Cooper JJ, Bensaude O, Cohen EA, Coulombe B, Price DH (Nisan 2008). "LARP7 is a stable component of the 7SK snRNP while P-TEFb, HEXIM1 and hnRNP A1 are reversibly associated". Nucleic Acids Research. 36 (7). ss. 2219-29. doi:10.1093/nar/gkn061. (PMC) 2367717 $2. (PMID) 18281698.
- ^ Markert A, Grimm M, Martinez J, Wiesner J, Meyerhans A, Meyuhas O, Sickmann A, Fischer U (Haziran 2008). "The La-related protein LARP7 is a component of the 7SK ribonucleoprotein and affects transcription of cellular and viral polymerase II genes". EMBO Reports. 9 (6). ss. 569-75. doi:10.1038/embor.2008.72. (PMC) 2427381 $2. (PMID) 18483487. 24 Ekim 2010 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ He N, Jahchan NS, Hong E, Li Q, Bayfield MA, Maraia RJ, Luo K, Zhou Q (Mart 2008). "A La-related protein modulates 7SK snRNP integrity to suppress P-TEFb-dependent transcriptional elongation and tumorigenesis". Molecular Cell. 29 (5). ss. 588-99. doi:10.1016/j.molcel.2008.01.003. (PMID) 18249148. 24 Eylül 2015 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Krueger BJ, Varzavand K, Cooper JJ, Price DH (Ağustos 2010). Blagosklonny MV (Ed.). . PloS One. 5 (8). ss. e12335. doi:10.1371/journal.pone.0012335. (PMC) 2925947 $2. (PMID) 20808803. 13 Aralık 2014 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
- ^ Nguyen D, Krueger BJ, Sedore SC, Brogie JE, Rogers JT, Rajendra TK, Saunders A, Matera AG, Lis JT, Uguen P, Price DH (Temmuz 2012). "The Drosophila 7SK snRNP and the essential role of dHEXIM in development". Nucleic Acids Research. 40 (12). ss. 5283-97. doi:10.1093/nar/gks191. (PMC) 3384314 $2. (PMID) 22379134.
- ^ C Quaresma AJ, Bugai A, Barboric M (Eylül 2016). "Cracking the control of RNA polymerase II elongation by 7SK snRNP and P-TEFb". Nucleic Acids Research. 44 (16). ss. 7527-39. doi:10.1093/nar/gkw585. (PMC) 5027500 $2. (PMID) 27369380. 20 Haziran 2020 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Aralık 2016.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Molekuler biyolojide 7SK da bol bulunan kucuk bir nukleer RNA dir Pozitif transkripsiyon uzatma faktorunun kontrol transkripsiyonunu duzenlemede onemli bir rol oynar 7SK kompleksinin stabilitesi ve fonksiyonunu duzenleyen diger proteinler kucuk bir nukleer ribonukleoprotein kompleksinde snRNP bulunur YapiIlk arastirmalar hucrelerinde 7SK nin bir dizi protein ile birlikte ve belirtilen tarama bolgesinin sekonder yapidaki RNA nin farkli bolgeleri arasinda baz ciftlesmesi icin bir model oldugunu gostermistir 7SK snRNP islevinde bir atilim bulgusu ile verilen pozitif transkripsiyon uzatma faktoru p TEFb kompleksinin bilesenidir 7SK veya RNA baglama proteinlerinin etkisiyle P TEFb nin siklin bagimli kinaz aktivitesini birlestirir ve inhibe eder 7SK nin 5 ucundaki gama fosfat 7SK snRNP nin kurucu bir bilesenini olusturan metilfosfat kapatma enzimi MEPCE tarafindan metilasyona tabi tutulur La iliskili protein LARP7 ninde RNA nin 3 ucu ile etkilesim yoluyla 7SK parcasinin kismen iliskisi bulunmustur SiRNA aracili demonte tarafindan MEPCE veya LARP7 ye azaltilmasi in vivo olarak 7SK istikrarsizligina yol acar 7SK snRNP lerin bir alt kumesi p TEFb ve HEXIM den yoksundur bunun yerine hnRNPs icerir Islev7SK snRNP nin esas islevi transkripsiyonun uzama fazini duzenleyen bir faktor olan P TEFb nin kontroludur Faktoru 7SK snRNP oldugunda p TEFb kinaz aktivitesi inhibe edilir P TEFb HIV transaktivator tat ya da bromodomain iceren proteinin BRD4 biri ile 7SK snRNP serbest birakilabilir Bu durum 7SK RNA nin bir konformasyonel degisikligine ve HEXIM in disari atilmasina yol acar HnRNP ler P TEFb ve HEXIM den yoksun kompleksi stabilize eder P TEFb spesifik genler uzerinde islev gordukten sonra bilinmeyen bir mekanizma ile 7SK snRNP ye yeniden kenetlenir 7SK snRNP hem insan hem de Drosophila da karakterize edilmistir Kaynakca Diribarne G Bensaude O 2009 RNA Biology 6 2 ss 122 8 PMID 19246988 4 Mart 2014 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Aralik 2016 a b Peterlin BM Brogie JE Price DH 2012 7SK snRNA a noncoding RNA that plays a major role in regulating eukaryotic transcription Wiley Interdisciplinary Reviews RNA 3 1 ss 92 103 doi 10 1002 wrna 106 PMC 3223291 2 PMID 21853533 14 Kasim 2016 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Wassarman DA Steitz JA Temmuz 1991 Structural analyses of the 7SK ribonucleoprotein RNP the most abundant human small RNP of unknown function Molecular and Cellular Biology 11 7 ss 3432 45 doi 10 1128 MCB 11 7 3432 PMC 361072 2 PMID 1646389 6 Ocak 2016 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Nguyen VT Kiss T Michels AA Bensaude O Kasim 2001 7SK small nuclear RNA binds to and inhibits the activity of CDK9 cyclin T complexes Nature 414 6861 ss 322 5 doi 10 1038 35104581 PMID 11713533 Yang Z Zhu Q Luo K Zhou Q Kasim 2001 The 7SK small nuclear RNA inhibits the CDK9 cyclin T1 kinase to control transcription Nature 414 6861 ss 317 22 doi 10 1038 35104575 PMID 11713532 Michels AA Nguyen VT Fraldi A Labas V Edwards M Bonnet F Lania L Bensaude O Temmuz 2003 MAQ1 and 7SK RNA interact with CDK9 cyclin T complexes in a transcription dependent manner Molecular and Cellular Biology 23 14 ss 4859 69 doi 10 1128 MCB 23 14 4859 4869 2003 PMC 162212 2 PMID 12832472 2 Subat 2019 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Yik JH Chen R Nishimura R Jennings JL Link AJ Zhou Q Ekim 2003 Inhibition of P TEFb CDK9 Cyclin T kinase and RNA polymerase II transcription by the coordinated actions of HEXIM1 and 7SK snRNA Molecular Cell 12 4 ss 971 82 doi 10 1016 S1097 2765 03 00388 5 PMID 14580347 24 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Byers SA Price JP Cooper JJ Li Q Price DH Nisan 2005 The Journal of Biological Chemistry 280 16 ss 16360 7 doi 10 1074 jbc M500424200 PMID 15713662 21 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Yik JH Chen R Pezda AC Zhou Q Nisan 2005 Compensatory contributions of HEXIM1 and HEXIM2 in maintaining the balance of active and inactive positive transcription elongation factor b complexes for control of transcription The Journal of Biological Chemistry 280 16 ss 16368 76 doi 10 1074 jbc M500912200 PMID 15713661 olu kirik baglanti Jeronimo C Forget D Bouchard A Li Q Chua G Poitras C Therien C Bergeron D Bourassa S Greenblatt J Chabot B Poirier GG Hughes TR Blanchette M Price DH Coulombe B Temmuz 2007 Systematic analysis of the protein interaction network for the human transcription machinery reveals the identity of the 7SK capping enzyme Molecular Cell 27 2 ss 262 74 doi 10 1016 j molcel 2007 06 027 PMID 17643375 24 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Krueger BJ Jeronimo C Roy BB Bouchard A Barrandon C Byers SA Searcey CE Cooper JJ Bensaude O Cohen EA Coulombe B Price DH Nisan 2008 LARP7 is a stable component of the 7SK snRNP while P TEFb HEXIM1 and hnRNP A1 are reversibly associated Nucleic Acids Research 36 7 ss 2219 29 doi 10 1093 nar gkn061 PMC 2367717 2 PMID 18281698 Markert A Grimm M Martinez J Wiesner J Meyerhans A Meyuhas O Sickmann A Fischer U Haziran 2008 The La related protein LARP7 is a component of the 7SK ribonucleoprotein and affects transcription of cellular and viral polymerase II genes EMBO Reports 9 6 ss 569 75 doi 10 1038 embor 2008 72 PMC 2427381 2 PMID 18483487 24 Ekim 2010 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 He N Jahchan NS Hong E Li Q Bayfield MA Maraia RJ Luo K Zhou Q Mart 2008 A La related protein modulates 7SK snRNP integrity to suppress P TEFb dependent transcriptional elongation and tumorigenesis Molecular Cell 29 5 ss 588 99 doi 10 1016 j molcel 2008 01 003 PMID 18249148 24 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Krueger BJ Varzavand K Cooper JJ Price DH Agustos 2010 Blagosklonny MV Ed PloS One 5 8 ss e12335 doi 10 1371 journal pone 0012335 PMC 2925947 2 PMID 20808803 13 Aralik 2014 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Aralik 2016 Nguyen D Krueger BJ Sedore SC Brogie JE Rogers JT Rajendra TK Saunders A Matera AG Lis JT Uguen P Price DH Temmuz 2012 The Drosophila 7SK snRNP and the essential role of dHEXIM in development Nucleic Acids Research 40 12 ss 5283 97 doi 10 1093 nar gks191 PMC 3384314 2 PMID 22379134 C Quaresma AJ Bugai A Barboric M Eylul 2016 Cracking the control of RNA polymerase II elongation by 7SK snRNP and P TEFb Nucleic Acids Research 44 16 ss 7527 39 doi 10 1093 nar gkw585 PMC 5027500 2 PMID 27369380 20 Haziran 2020 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Aralik 2016