Amira (telaffuz: Ah-meer-ah), 3B ve 4B veri görselleştirme, işleme ve analiz için bir yazılım platformudur. Thermo Fisher Scientific tarafından Zuse Institute Berlin (ZIB) ile işbirliği içinde aktif olarak geliştirilmekte ve Thermo Fisher Scientific tarafından ticari olarak dağıtılmaktadır.
Geliştirici(ler) | |
---|---|
İlk yayınlanma | Ekim 1999 | )
Güncel sürüm | 2020.3 |
İşletim sistemi | , Windows Vista, Windows 7 , , 5.5 |
Platform | IA-32, x64 |
Erişilebilirlik | İngilizce |
Tür | 3D veri görselleştirme ve işleme |
Lisans | |
Resmî sitesi | thermofisher.com/amira-avizo |
Genel bakış
Amira, bilimsel görselleştirme, veri analizi ve 3B ve 4B verilerin sunumu için genişletilebilir bir yazılım sistemidir. Dünya çapında akademi ve endüstride binlerce araştırmacı ve mühendis tarafından kullanılmaktadır. Esnek kullanıcı arayüzü ve modüler mimarisi, onu çeşitli modalitelerden gelen verilerin işlenmesi ve analizi için evrensel bir araç haline getirmiştir. Mikro-CT, PET, Ultrason kullanım alanlarına örnek verilmektedir. Sürekli genişleyen işlevselliği, onu biyoloji ve malzeme biliminde mikroskopi, moleküler biyoloji, kuantum fiziği, astrofizik, hesaplamalı akışkanlar dinamiği (CFD), sonlu gibi birçok alanda uygulanabilir ve kullanılan çok yönlü bir veri analizi ve görselleştirme çözümü haline getirmiştir. Eleman modelleme (FEM), tahribatsız test (NDT) ve çok daha fazlası mevcuttur. Veri görselleştirmenin yanı sıra kilit özelliklerden biri de Amira'nın görüntü bölütleme ve geometri yeniden yapılandırma araçları setidir. Bu, kullanıcının otomatik, yarı otomatik ve manuel araçları kullanarak 3B görüntü hacimlerindeki yapıları ve ilgi alanlarını işaretlemesine (veya segmentlere ayırmasına) olanak tanımaktadır. Segmentasyon daha sonra hacimsel analiz, yoğunluk analizi, şekil analizi veya görselleştirme, sayısal simülasyonlar veya hızlı prototipleme veya 3B baskı için 3B bilgisayar modellerinin oluşturulması gibi çeşitli sonraki görevler için kullanılabilmektedir. Diğer önemli Amira özellikleri, çok düzlemli ve hacim görselleştirme, görüntü kaydı, filament izleme, hücre ayırma ve analizi, tetrahedral ağ oluşturma, difüzyon tensör görüntüleme (DTI) verilerinden fiber izleme, iskeletleştirme, uzaysal grafik analizi ve 3D'nin stereoskopik görüntülenmesidir. CAVE'ler dahil olmak üzere birden fazla ekran ve sürükleyici sanal gerçeklik ortamları üzerinden veri işlenebilmektedir. Ticari bir ürün olarak Amira, bir lisans veya akademik abonelik satın alınmasını gerektirmektedir. Zaman sınırlı, ancak tam özellikli bir değerlendirme sürümü ücretsiz olarak indirilebilmektedir
Tarihçesi
1993–1998: Yazılımı araştırma
Amira'nın kökleri 1993'e ve Berlin Zuse Enstitüsü'ndeki (ZIB) Hans-Christian Hege başkanlığındaki Bilimsel Görselleştirme Departmanına kadar uzanmaktadır. ZIB, matematik ve bilişim için bir araştırma enstitüsüdür. Bilimsel Görselleştirme bölümünün misyonu, tıp, biyoloji, mühendislik ve malzeme biliminde hesaplama ve bilimsel olarak zorlu görevlerin çözülmesine yardımcı olmaktır. Bu amaçla 2D, 3D ve 4D veri görselleştirme ve görsel destekli keşif ve analiz için algoritmalar ve yazılımlar geliştirmektedir. O zaman, ZIB'deki genç görselleştirme grubu, genişletilebilir, veri akışı odaklı görselleştirme ortamları apE, IRIS Explorer ve Advanced Visualization Studio (AVS) ile deneyime sahiptir. Ancak bu ürünlerin etkileşimi, esnekliği ve kolaylığından bilgisayar dışı bilim adamları için kullanımda memnun kalınmamıştır
Bu nedenle, tıbbi yönelimli, çok disiplinli işbirlikçi bir araştırma merkezindeki bir araştırma projesinde yeni bir yazılım sisteminin geliştirilmesine başlanmıştır. Tobias Höllerer'in 1993 sonlarında yeni grafik kitaplığı IRIS Inventor ile edindiği deneyimlere dayanarak, bu kitaplığın kullanılmasına karar verilmiştir. Tıbbi planlama sisteminin geliştirilmesi, daha sonra Amira'nın baş yazılım mimarı olacak olan Detlev Stalling tarafından gerçekleştirilmiştir. Yeni yazılıma "HyperPlan" adı verildi ve başlangıçtaki hedef uygulaması olan hipertermi kanseri tedavisi için bir planlama sistemi vurgulanmıştır. Sistem, o zamanlar üst düzey grafik hesaplama için kullanılan standart iş istasyonları olan Silicon Graphics (SGI) bilgisayarlarında geliştirilmiştir. Yazılım, OpenGL (başlangıçta IRIS GL), Open Inventor (başlangıçta IRIS Inventor) ve grafik kullanıcı arabirimi kitaplıkları X11, Motif (yazılım) ve ViewKit gibi kitaplıklara dayanıyordu. 1998'de X11/Motif/Viewkit, Qt araç seti ile değiştirilmiştir.
HyperPlan çerçevesi, ZIB'de giderek daha fazla projenin temeli olarak hizmet etmiştir. İşbirliği yapan kurumlarda giderek artan sayıda araştırmacı tarafından kullanılmıştır. Projeler tıbbi görüntü hesaplama, tıbbi görselleştirme, nörobiyoloji, konfokal mikroskopi, akış görselleştirme, moleküler analitik ve hesaplamalı astrofizik uygulamalarını içermektedir.
1998-günümüz: Ticari olarak desteklenen ürün
ZIB'nin birincil görevi algoritmik araştırma olduğundan, sistemin artan kullanıcı sayısı, ZIB'nin yazılım dağıtımı ve desteği için ayırabileceği kapasiteleri aşmaya başlamıştır. Bu nedenle, bir yan şirket olan Indeed – Visual Concepts GmbH, yazılımın kapsamlı yeteneklerini dünya çapındaki endüstri ve akademi araştırmacılarının kullanımına sunma ve ürünü sağlama vizyonuyla Hans-Christian Hege, Detlev Stalling ve Malte Westerhoff tarafından kurulmultur. Günümüzün hızlı ve rekabetçi dünyasında ihtiyaç duyulan destek ve sağlamlık getirilmiştir.
Şubat 1998'de HyperPlan yazılımına yeni, uygulamadan bağımsız “Amira” adı verilmiştir. Bu isim bir kısaltma olmayıp, farklı dillerde telaffuz edilebildiği ve uygun bir çağrışım sağladığı için seçilmiştir.
Detlev Stalling ve Malte Westerhoff, yazılımı ticari olarak desteklenebilir bir ürün haline getirmek ve SGI olmayan bilgisayarlarda da kullanılabilir hale getirmek için yazılımın büyük bir yeniden tasarımını üstlenmiştir. Mart 1999'da ticari Amira'nın ilk versiyonu Almanya'nın Hannover kentindeki CeBIT fuarında SGI IRIX ve Hewlett-Packard UniX (HP-UX) stantlarında sergilenmiştir. Bunu takip eden on iki ay içinde Linux ve Microsoft Windows sürümleri izlemiştir. Daha sonra Mac OS X desteği eklenmiştir. Gerçekten – Visual Concepts GmbH, Amira'nın dünya çapındaki distribütörü olarak Bordeaux, Fransa ve San Diego, Amerika Birleşik Devletleri merkezli TGS, Inc.'i seçilmiştir. Sonraki dört yıl içinde beş ana yayın (versiyon 3.1'e kadar) tamamlanmıştır.
2003 yılında hem Indeed – Visual Concepts GmbH hem de TGS, Inc. Massachusetts merkezli Mercury Computer Systems, Inc. (NASDAQ:MRCY) tarafından satın alınmıştır. Mercury'nin daha sonra Visage Imaging olarak adlandırılan yeni kurulan yaşam bilimleri iş biriminin bir parçası olmuştur. 2009 yılında, Mercury Computer Systems, Inc., Visage Imaging'i yeniden üretti ve radyoloji bilgi sistemleri ve tıbbi BT çözümlerinin önde gelen sağlayıcısı olan Melbourne, Avustralya merkezli Promedicus Ltd'ye (ASX:PME) satmıştır. Bu süre boyunca, Amira Berlin, Almanya'da ve hala Amira'nın orijinal yaratıcıları tarafından yönetilen ZIB ile yakın işbirliği içinde geliştirilmeye devam etmiştir. Fransa, Bordeaux'da bulunan TGS, Mercury Computer Systems tarafından bir Fransız yatırımcıya satılmıştır. Ayrıca adı Visualization Sciences Group (VSG) olarak değiştirilmiştir. VSG, aynı kaynak koduna dayanan ancak malzeme bilimleri için özelleştirilmiş Avizo adlı tamamlayıcı bir ürün üzerinde çalışmaya devam etmiştir.
Ağustos 2012'de, o tarihe kadar Amira'nın en büyük OEM satıcısı olan FEI, VSG'yi ve Amira işini Promedicus'tan satın almıştır. Bu, iki yazılım kardeş Amira ve Avizo'yu tekrar bir araya getirmiştir. Ağustos 2013'te Görselleştirme Bilimleri Grubu (VSG), FEI'nin bir iş birimi haline gelmiştir. 2016 yılında FEI, Thermo Fisher Scientific tarafından satın almıştır. Ayırca, 2017 başlarında Malzeme ve Yapısal Analiz bölümünün bir parçası olmuştur.
Amira ve Avizo halen iki farklı ürün olarak pazarlanmaktadır. Yaşam bilimleri için Amira ve malzeme bilimi için Avizo kullanılmaktadır. Ancak geliştirme çabaları şimdi bir kez daha birleştirilmiştir. Bu arada Amira/Avizo yazılımını kullanan bilimsel makale sayısı 10 bin mertebesindedir. Başlangıçta olduğu gibi, Amira yol haritası, dünyanın dört bir yanındaki Amira kullanıcılarının, genellikle alanlarında öncü olan, yanıtlamaya çalıştıkları zorlu bilimsel sorular tarafından yönlendirilmeye devam etmektedir.
Amira seçenekleri
Amira seçenekleri
- Mikroskopi verileri için özel okuyucular
- Görüntü ters evrişim
- Hemen hemen her mikroskoptan elde edilen 3D görüntülerin keşfi
- Mikroskopi görüntülerinden filament ağlarının çıkarılması ve düzenlenmesi
DICOM okuyucu
- Klinik ve klinik öncesi verilerin DICOM formatında içe aktarılması
Kafes seçeneği
- Parçalı görüntü verilerinden 3B sonlu eleman (FE) ağlarının oluşturulması
- Birçok son teknoloji FE çözücü formatı desteği
- Skaler, vektör ve tensör alanı görüntüleme modüllerini kullanarak simülasyon ağı tabanlı sonuçların yüksek kaliteli görselleştirilmesi
İskeletleştirme seçeneği
- Sinir ve damar ağlarının yeniden yapılandırılması ve analizi
- İskeletleştirilmiş ağların görselleştirilmesi
- Ağ bölümlerinin uzunluk ve çap ölçümü
- Bir ağaç grafiğinde bölümlerin sıralanması
- Bir ağaç grafiğinde bölümlerin sıralanması
Moleküler seçenekler
- Molekül modellerinin görselleştirilmesi için gelişmiş araçlar
- Donanım hızlandırmalı hacim oluşturma
- Güçlü molekül düzenleyici
- Karmaşık moleküler görselleştirme için özel araçlar
Geliştirici seçenekleri
- Görselleştirme veya veri işleme için yeni özel bileşenlerin oluşturulması
- Yeni dosya okuyucularının veya yazarlarının uygulanması
- C++ programlama dili
- Hızlı bir başlangıç için geliştirme sihirbazı
Nöro seçeneği
- DTI ve beyin perfüzyonu için tıbbi görüntü analizi
- Birkaç akış hattı tabanlı algoritmayı destekleyen fiber izleme
- Kullanıcı tanımlı kaynak ve hedef bölgelere göre fiber demetlerine fiber ayırma
- Tensör alanlarının hesaplanması, difüzyon ağırlıklı haritalar
- Tensör alanlarının özdeğer ayrıştırması
- Ortalama geçiş süresi, beyin kan akımı ve beyin kan hacminin hesaplanması
VR seçenekleri
- Büyük döşemeli ekranlarda veya sürükleyici Sanal Gerçeklik (VR) ortamlarında verilerin görselleştirilmesi
- 3D navigasyon cihazlarının desteği
- Hızlı çok iş parçacıklı ve dağıtılmış işleme
Çok büyük veri seçeneği
- Verimli çekirdek dışı veri yönetimi kullanarak mevcut ana belleği aşan görüntü verilerinin görselleştirilmesi için destek
- Çekirdek dışı veriler üzerinde çalışmak için ortogonal ve eğik dilimleme, hacim oluşturma ve eş yüzey oluşturma gibi birçok standart modülün uzantıları
Uygulama alanları
- Anatomi
- Biyokimya
- Difüzyon MRG
- Embriyoloji
- Histoloji
- Yaşam ve malzeme bilimlerinde mikroskopi
Kaynakça
- ^ Stalling, D.; Westerhoff, M.; Hege, H.-C. (2005). C.D. Hansen and C.R. Johnson (Ed.). "Amira: A Highly Interactive System for Visual Data Analysis". The Visualization Handbook: 749-767. CiteSeerX 10.1.1.129.6785 $2. doi:10.1016/B978-012387582-2/50040-X. ISBN .
- ^ Adam, R.; Smith, A.R.; Sieren, J.C.; Eggleston, T.; McLennan, G. (2010). "Characterization Of The Airways And Lungs For The FABP/CFTR-Knockout Mouse Using Micro-Computed Tomography And Large Image Microscope Array" (PDF). American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 181: A6264. doi:10.1164/ajrccm-conference.2010.181.1_meetingabstracts.a6264.
- ^ Awasthi, V.; Holter, J.; Thorp, K.; Anderson, S.; Epstein, R. (2010). "F-18-fluorothymidine-PET evaluation of bone marrow transplant in a rat model". Nuclear Medicine Communications. 31 (2): 152-158. doi:10.1097/mnm.0b013e3283339f92. (PMID) 19966596.
- ^ a b Ayers, G.D.; McKinley, E.T.; Zhao, P.; Fritz, J.M.; Metry, R.E.; Deal, B.C.; Adlerz, K.M.; Coffey, R.J.; Manning, H.C. (2010). "Volume of Preclinical Xenograft Tumors Is More Accurately Assessed by Ultrasound Imaging Than Manual Caliper Measurements". Journal of Ultrasound in Medicine. 29 (6): 891-901. doi:10.7863/jum.2010.29.6.891. (PMC) 2925269 $2. (PMID) 20498463. 2 Ağustos 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
- ^ Dlasková, A.; Spacek, T.; Santorová, J.; Plecitá-Hlavatá, L.; Berková, Z.; Saudek, F.; Lessard, M.; Bewersdorf, J.; Jezek, P. (2010). "4Pi microscopy reveals an impaired three-dimensional mitochondrial network of pancreatic islet beta-cells, an experimental model of type-2 diabetes". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 1797 (6–7): 1327-1341. doi:10.1016/j.bbabio.2010.02.003. (PMID) 20144584.
- ^ Clark, N.D.L.; Daly., C. (2010). "Using confocal laser scanning microscopy to image trichome inclusions in amber" (PDF). Journal of Paleontological Techniques. 8. 4 Mart 2016 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
- ^ Amstalden van Hove, E.R.; Blackwell, T.R.; Klinkert, I.; Eijkel, G.B.; Heeren, R.; Glunde, K. (2010). "Multimodal Mass Spectrometric Imaging of Small Molecules Reveals Distinct Spatio-Molecular Signatures in Differentially Metastatic Breast Tumor Models". Cancer Research. 70 (22): 9012-9021. doi:10.1158/0008-5472.can-10-0360. (PMC) 5555163 $2. (PMID) 21045154.
- ^ Sherman, D.M. (2010). "Metal complexation and ion association in hydrothermal fluids: insights from quantum chemistry and molecular dynamics". Frontiers in Geofluids. Geofluids. 10. ss. 41-57. doi:10.1002/9781444394900.ch4. ISBN . 6 Ocak 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi.
- ^ O'Neill, S.M.; Jones, T.W. (2010). "Three-Dimensional Simulations of Bi-Directed Magnetohydrodynamic Jets Interacting with Cluster Environments". The Astrophysical Journal. 710 (1): 180-196. arXiv:1001.1747 $2. Bibcode:2010ApJ...710..180O. doi:10.1088/0004-637x/710/1/180.
- ^ Baharoglu, M.I.; Schirmer, C.M.; Hoit, D.A.; Gao, B.L.; Malek, A.M. (2010). . Morphometric and Computational Fluid Dynamic Analysis. 22 Haziran 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Mayıs 2012.
- ^ Bardyn, T.; Gédet, P.; Hallermann, W.; Büchler., P. (2010). "Prediction of dental implant torque with a fast and automatic finite element analysis: a pilot study". Oral Surgery, Oral Medicine, Oral Pathology, Oral Radiology, and Endodontology. 109 (4): 594-603. doi:10.1016/j.tripleo.2009.11.010. (PMID) 20163974.
- ^ Shearing, P.R.; Gelb, J.; Yi, J.; Lee, W.K.; Drakopolous, M.; Brandon, N.P. (2010). "Analysis of Triple Phase Contact in Ni-YSZ Microstructures Using Non-destructive X-ray Tomography with Synchrotron Radiation". Electrochemistry Communications. 12 (8): 1021-1024. doi:10.1016/j.elecom.2010.05.014 .
- ^ Jährling, N.; Becker, K.; Schönbauer, C.; Schnorrer, F.; Dodt, H.U. (2010). "Three-dimensional reconstruction and segmentation of intact Drosophila by ultramicroscopy". Frontiers in Systems Neuroscience. 4: 1. doi:10.3389/neuro.06.001.2010. (PMC) 2831709 $2. (PMID) 20204156.
- ^ Zheng, G. (2010). "Statistical shape model-based reconstruction of a scaled, patient-specific surface model of the pelvis from a single standard AP x-ray radiograph". Medical Physics. 37 (4): 1424-1439. Bibcode:2010MedPh..37.1424Z. doi:10.1118/1.3327453. (PMID) 20443464. 11 Temmuz 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Mayıs 2019.
- ^ Rodriguez-Soto, A.E.; Fritscher, K.D.; Schuler, B.; Issever, A.S.; Roth, T.; Kamelger, F.; Kammerlander, C.; Blauth, M.; Schubert, R.; Link, T.M. (2010). "Texture Analysis, Bone Mineral Density, and Cortical Thickness of the Proximal Femur: Fracture Risk Prediction". Journal of Computer Assisted Tomography. 34 (6): 949-957. doi:10.1097/rct.0b013e3181ec05e4. (PMID) 21084915.
- ^ a b Leischner, U.; Schierloh, A.; Zieglgänsberger, W.; Dodt, H.U. (2010). "Formalin-Induced Fluorescence Reveals Cell Shape and Morphology in Biological Tissue Samples". PLOS ONE. 5 (4): e10391. Bibcode:2010PLoSO...510391L. doi:10.1371/journal.pone.0010391. (PMC) 2861007 $2. (PMID) 20436930.
- ^ Felts, R.L.; Narayan, K.; Estes, J.D.; Shi, D.; Trubey, C.M.; Fu, J.; Hartnell, L.M.; Ruthel, G.T.; Schneider, D.K.; Nagashima, K. (2010). "3D visualization of HIV transfer at the virological synapse between dendritic cells and T cells". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 107 (30): 13336-13341. Bibcode:2010PNAS..10713336F. doi:10.1073/pnas.1003040107. (PMC) 2922156 $2. (PMID) 20624966.
- ^ Taylor, D.J.; Doorly, D.J.; Schroter, R.C. (2010). "Inflow boundary profile prescription for numerical simulation of nasal airflow". Journal of the Royal Society Interface. 7 (44): 515-527. doi:10.1098/rsif.2009.0306. (PMC) 2842801 $2. (PMID) 19740920.
- ^ Lucas, B.C.; Bogovic, J.A.; Carass, A.; Bazin, P.L.; Prince, J.L.; Pham, D.L.; Landman, B.A. (2010). "The Java Image Science Toolkit (JIST) for Rapid Prototyping and Publishing of Neuroimaging Software". Neuroinformatics. 8 (1): 5-17. doi:10.1007/s12021-009-9061-2. (PMC) 2860951 $2. (PMID) 20077162.
- ^ Dasgupta, S.; Feleppa, E.; Ramachandran, S.; Ketterling, J.; Kalisz, A.; Haker, S.; Tempany, C.; Porter, C.; Lacrampe, M.; Isacson, C. (2007). "8A-4 Spatial Co-Registration of Magnetic Resonance and Ultrasound Images of the Prostate as a Basis for Multi-Modality Tissue-Type Imaging". 2007 IEEE Ultrasonics Symposium Proceedings. ss. 641-643. doi:10.1109/ULTSYM.2007.166. ISBN .
- ^ Oberlaender, M.; Bruno, R.M.; Sakmann, B.; Broser, P.J. (2007). "Transmitted light brightfield mosaic microscopy for three-dimensional tracing of single neuron morphology". Journal of Biomedical Optics. 12 (6): 064029. Bibcode:2007JBO....12f4029O. doi:10.1117/1.2815693. (PMID) 18163845. 18 Temmuz 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Mayıs 2019.
- ^ Lamecker, H.; Mansi, T.; Relan, J.; Billet, F.; Sermesant, M.; Ayache, N.; Delingette., H. (2009). "Adaptive Tetrahedral Meshing for Personalized Cardiac Simulations". CiteSeerX 10.1.1.698.4292 $2.
- ^ Boretius, S.; Michaelis, T.; Tammer, R.; Ashery-Padan, R.; Frahm, J.; Stoykova, A. (2009). "In vivo MRI of altered brain anatomy and fiber connectivity in adult pax6 deficient mice". Cerebral Cortex. 19 (12): 2838-2847. doi:10.1093/cercor/bhp057 . (PMID) 19329571.
- ^ Kohjiya, S.; Katoh, A.; Suda, T.; Shimanuki, J.; Ikeda, Y. (2006). "Visualisation of carbon black networks in rubbery matrix by skeletonisation of 3D-TEM image". Polymer. 47 (10): 3298-3301. doi:10.1016/j.polymer.2006.03.008.
- ^ Clements, R.J.; Mintz, E.M.; Blank, J.L. (2009). "High resolution stereoscopic volume visualization of the mouse arginine vasopressin system". Journal of Neuroscience Methods. 187 (1): 41-45. doi:10.1016/j.jneumeth.2009.12.011. (PMID) 20036282.
- ^ Ohno, N.; Kageyama., A. (2009). "Region-of-interest visualization by CAVE VR system with automatic control of level-of-detail". Computer Physics Communications. 181 (4): 720-725. Bibcode:2010CoPhC.181..720O. doi:10.1016/j.cpc.2009.12.002.
- ^ Dyer, D.S. (1990). "A dataflow toolkit for visualization". Computer Graphics and Applications. 10 (4): 60-69. doi:10.1109/38.56300.
- ^ Foulser, D. (1995). "IRIS Explorer: A framework for investigation". Computer Graphics. 29 (2): 13-16. doi:10.1145/204362.204365.
- ^ . DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft. 20 Eylül 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Ocak 2015.
- ^ . DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft. 20 Eylül 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Ocak 2015.
- ^ Strauss, P.S. (1993). "IRIS Inventor, a 3D graphics toolkit". ACM SIGPLAN Notices. 28 (10): 192-200. doi:10.1145/167962.165889.
- ^ a b c de Boer, B.A.; Soufan, A.T.; Hagoort, J.; Mohun, T.J.; van den Hoff, M.J.B; Hasman, A.; Voorbraak, F.P.J.M.; Moorman, A.F.M.; Ruijter, J.M. (2011). "The interactive presentation of 3D information obtained from reconstructed datasets and 3D placement of single histological sections with the 3D portable document format". Development. 138 (1): 159-167. doi:10.1242/dev.051086. (PMC) 2998169 $2. (PMID) 21138978.
- ^ Specht, M.; Lebrun, R.; Zollikofer, C.P.E. (2007). "Visualizing shape transformation between chimpanzee and human braincases" (PDF). The Visual Computer: International Journal of Computer Graphics Archive. 23 (9): 743-751. CiteSeerX 10.1.1.108.7163 $2. doi:10.1007/s00371-007-0156-1. 22 Eylül 2017 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
- ^ a b c Gaemers, I.C.; Stallen, J.M.; Kunne, C.; Wallner, C.; van Werven, J.; Nederveen, A.; Lamers, W.H. (2011). "Lipotoxicity and steatohepatitis in an overfed mouse model for non-alcoholic fatty liver disease" (PDF). Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease. 1812 (4): 447-458. doi:10.1016/j.bbadis.2011.01.003. (PMID) 21216282. 28 Haziran 2021 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
- ^ a b Kudryashev, Mikhail; Cyrklaff, Marek; Alex, Björn; Lemgruber, Leandro; Baumeister, Wolfgang; Wallich, Reinhard; Frischknecht, Friedrich (2011). "Evidence of direct cell–cell fusion in Borrelia by cryogenic electron tomography". Cellular Microbiology (İngilizce). 13 (5): 731-741. doi:10.1111/j.1462-5822.2011.01571.x. ISSN 1462-5822. 28 Haziran 2021 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
- ^ Meisslitzer-Ruppitsch, C.; Röhrl, C.; Ranftler, C.; Neumüller, J.; Vetterlein, M.; Ellinger, A.; Pavelka, M. (2011). "The ceramide-enriched trans-Golgi compartments reorganize together with other parts of the Golgi apparatus in response to ATP-depletion". Histochemistry and Cell Biology. 135 (2): 159-171. doi:10.1007/s00418-010-0773-z. (PMID) 21225431.
- ^ Bevan, R.L.T.; Sazonov, I.; Saksono, P.H.; Nithiarasu, P.; van Loon, R.; Luckraz, H.; Ashral, S. (2011). "Patient-specific blood flow simulation through an aneurysmal thoracic aorta with a folded proximal neck". Numerical Methods in Biomedical Engineering. 27 (8): 1167-1184. doi:10.1002/cnm.1425.
- ^ Jiang, Y.; Johnson, G.A. (2010). "Microscopic Diffusion Tensor Imaging of the Mouse Brain". NeuroImage. 50 (2): 465-471. doi:10.1016/j.neuroimage.2009.12.057. (PMC) 2826147 $2. (PMID) 20034583.
- ^ Bujotzek, A.; Shan, M.; Haag, R.; Weber, M. (2011). "Towards a rational spacer design for bivalent inhibition of estrogen receptor". Journal of Computer-Aided Molecular Design. 25 (3): 253-262. Bibcode:2011JCAMD..25..253B. doi:10.1007/s10822-011-9417-1. (PMID) 21331802.
- ^ a b Cai, W.; Lee, E.Y.; Vij, A.; Mahmood, S.A.; Yoshida, H. (2011). "MDCT for Computerized Volumetry of Pneumothoraces in Pediatric Patients". Academic Radiology. 18 (3): 315-23. doi:10.1016/j.acra.2010.11.008. (PMC) 3072076 $2. (PMID) 21216160.
- ^ a b Irving, S.; Moore, D.R.; Liberman, M.C.; Sumner, C.J. (2011). "Olivocochlear Efferent Control in Sound Localization and Experience-Dependent Learning". Journal of Neuroscience. 31 (7): 2493-2501. doi:10.1523/jneurosci.2679-10.2011. (PMC) 3292219 $2. (PMID) 21325517.
- ^ Kübel, C.; Voigt, A.; Schoenmakers, R.; Otten, M.; Su, D.; Lee, TC.; Carlsson, A.; Bradley, J. (2005). "Recent Advances in Electron Tomography: TEM and HAADF-STEM Tomography for Materials Science and Semiconductor Applications". Microsc. Microanal. 11 (5): 378-400. doi:10.1017/S1431927605050361. 888597. (PMID) 17481320.
- ^ Chan, S.; Li, P.; Locketz, G.; Salisbury, K.; Blevins, N.H. (2016). "High-fidelity haptic and visual rendering for patient-specific simulation of temporal bone surgery". Computer Assisted Surgery. 11 (1): 85-101. doi:10.1080/24699322.2016.1189966 . (PMID) 2797394.
- ^ a b Obenaus, A.; Hayes, P. (2011). Drill hole defects: induction, imaging, and analysis in the rodent. Methods in Molecular Biology. 690. ss. 301-314. doi:10.1007/978-1-60761-962-8_20. ISBN . (PMID) 21043001.
- ^ Ertürk, A.; Mauch, C.P.; Hellal, F.; Förstner, F.; Keck, T.; Becker, K.; Jährling, N.; Steffens, H.; Richter, M.; Hübener, M.; Kramer, E.; Kirchhoff, F.; Dodt; Bradke, F. (2011). . Nature Medicine. 18 (1): 166-171. doi:10.1038/nm.2600. (PMID) 22198277. 15 Eylül 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
- ^ Carlson, K.J.; Wrangham, R.W.; Muller, M.N.; Sumner, D.R.; Morbeck, M.E.; Nishida, T.; Yamanaka, A.; Boesch, C. (2011). Comparisons of Limb Structural Properties in Free-ranging Chimpanzees from Kibale, Gombe, Mahale, and Tai Communities. Primate Locomotion. ss. 155-182. doi:10.1007/978-1-4419-1420-0_9. ISBN .
- ^ Hartwig, T.; Streitparth, F.; Gro, C.; Müller, M.; Perka, C.; Putzier, M.; Strube, P. (2011). "Digital 3-Dimensional Analysis of the Paravertebral Lumbar Muscles After Circumferential Single-level Fusion". Journal of Spinal Disorders & Techniques. 30 (6): E702-E706. doi:10.1097/BSD.0000000000000249. (PMID) 28632556.
- ^ Lee, J.; Eddington, D.K.; Nadol, J.B. (2011). "The Histopathology of Revision Cochlear Implantation". Audiology and Neurotology. 16 (5): 336-346. doi:10.1159/000322307 . (PMC) 7265424 $2. (PMID) 21196725.
- ^ Han, M.; Kim, C.; Mozer, P.; Schafer, F.; Badaan, S.; Vigaru, B.; Tseng, K.; Petrisor, D.; Trock, B.; Stoianovici, D. (2011). "Tandem-robot Assisted Laparoscopic Radical Prostatectomy to Improve the Neurovascular Bundle Visualization: A Feasibility Study" (PDF). Urology. 77 (2): 502-6. doi:10.1016/j.urology.2010.06.064. (PMC) 3051397 $2. (PMID) 21067797. 15 Şubat 2020 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 28 Haziran 2021.
Ek bağlantılar
- Orijinal web sitesi 28 Haziran 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Vaka Galerisini Kullan 28 Haziran 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Sürüm notları 28 Haziran 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Amira telaffuz Ah meer ah 3B ve 4B veri gorsellestirme isleme ve analiz icin bir yazilim platformudur Thermo Fisher Scientific tarafindan Zuse Institute Berlin ZIB ile isbirligi icinde aktif olarak gelistirilmekte ve Thermo Fisher Scientific tarafindan ticari olarak dagitilmaktadir AmiraGelistirici ler Ilk yayinlanmaEkim 1999 24 yil once 1999 10 Guncel surum2020 3Isletim sistemi Windows Vista Windows 7 5 5PlatformIA 32 x64ErisilebilirlikIngilizceTur3D veri gorsellestirme ve islemeLisansResmi sitesithermofisher com amira avizoGenel bakisAmira bilimsel gorsellestirme veri analizi ve 3B ve 4B verilerin sunumu icin genisletilebilir bir yazilim sistemidir Dunya capinda akademi ve endustride binlerce arastirmaci ve muhendis tarafindan kullanilmaktadir Esnek kullanici arayuzu ve moduler mimarisi onu cesitli modalitelerden gelen verilerin islenmesi ve analizi icin evrensel bir arac haline getirmistir Mikro CT PET Ultrason kullanim alanlarina ornek verilmektedir Surekli genisleyen islevselligi onu biyoloji ve malzeme biliminde mikroskopi molekuler biyoloji kuantum fizigi astrofizik hesaplamali akiskanlar dinamigi CFD sonlu gibi bircok alanda uygulanabilir ve kullanilan cok yonlu bir veri analizi ve gorsellestirme cozumu haline getirmistir Eleman modelleme FEM tahribatsiz test NDT ve cok daha fazlasi mevcuttur Veri gorsellestirmenin yani sira kilit ozelliklerden biri de Amira nin goruntu bolutleme ve geometri yeniden yapilandirma araclari setidir Bu kullanicinin otomatik yari otomatik ve manuel araclari kullanarak 3B goruntu hacimlerindeki yapilari ve ilgi alanlarini isaretlemesine veya segmentlere ayirmasina olanak tanimaktadir Segmentasyon daha sonra hacimsel analiz yogunluk analizi sekil analizi veya gorsellestirme sayisal simulasyonlar veya hizli prototipleme veya 3B baski icin 3B bilgisayar modellerinin olusturulmasi gibi cesitli sonraki gorevler icin kullanilabilmektedir Diger onemli Amira ozellikleri cok duzlemli ve hacim gorsellestirme goruntu kaydi filament izleme hucre ayirma ve analizi tetrahedral ag olusturma difuzyon tensor goruntuleme DTI verilerinden fiber izleme iskeletlestirme uzaysal grafik analizi ve 3D nin stereoskopik goruntulenmesidir CAVE ler dahil olmak uzere birden fazla ekran ve surukleyici sanal gerceklik ortamlari uzerinden veri islenebilmektedir Ticari bir urun olarak Amira bir lisans veya akademik abonelik satin alinmasini gerektirmektedir Zaman sinirli ancak tam ozellikli bir degerlendirme surumu ucretsiz olarak indirilebilmektedirTarihcesi1993 1998 Yazilimi arastirma Amira nin kokleri 1993 e ve Berlin Zuse Enstitusu ndeki ZIB Hans Christian Hege baskanligindaki Bilimsel Gorsellestirme Departmanina kadar uzanmaktadir ZIB matematik ve bilisim icin bir arastirma enstitusudur Bilimsel Gorsellestirme bolumunun misyonu tip biyoloji muhendislik ve malzeme biliminde hesaplama ve bilimsel olarak zorlu gorevlerin cozulmesine yardimci olmaktir Bu amacla 2D 3D ve 4D veri gorsellestirme ve gorsel destekli kesif ve analiz icin algoritmalar ve yazilimlar gelistirmektedir O zaman ZIB deki genc gorsellestirme grubu genisletilebilir veri akisi odakli gorsellestirme ortamlari apE IRIS Explorer ve Advanced Visualization Studio AVS ile deneyime sahiptir Ancak bu urunlerin etkilesimi esnekligi ve kolayligindan bilgisayar disi bilim adamlari icin kullanimda memnun kalinmamistir Bu nedenle tibbi yonelimli cok disiplinli isbirlikci bir arastirma merkezindeki bir arastirma projesinde yeni bir yazilim sisteminin gelistirilmesine baslanmistir Tobias Hollerer in 1993 sonlarinda yeni grafik kitapligi IRIS Inventor ile edindigi deneyimlere dayanarak bu kitapligin kullanilmasina karar verilmistir Tibbi planlama sisteminin gelistirilmesi daha sonra Amira nin bas yazilim mimari olacak olan Detlev Stalling tarafindan gerceklestirilmistir Yeni yazilima HyperPlan adi verildi ve baslangictaki hedef uygulamasi olan hipertermi kanseri tedavisi icin bir planlama sistemi vurgulanmistir Sistem o zamanlar ust duzey grafik hesaplama icin kullanilan standart is istasyonlari olan Silicon Graphics SGI bilgisayarlarinda gelistirilmistir Yazilim OpenGL baslangicta IRIS GL Open Inventor baslangicta IRIS Inventor ve grafik kullanici arabirimi kitapliklari X11 Motif yazilim ve ViewKit gibi kitapliklara dayaniyordu 1998 de X11 Motif Viewkit Qt arac seti ile degistirilmistir HyperPlan cercevesi ZIB de giderek daha fazla projenin temeli olarak hizmet etmistir Isbirligi yapan kurumlarda giderek artan sayida arastirmaci tarafindan kullanilmistir Projeler tibbi goruntu hesaplama tibbi gorsellestirme norobiyoloji konfokal mikroskopi akis gorsellestirme molekuler analitik ve hesaplamali astrofizik uygulamalarini icermektedir 1998 gunumuz Ticari olarak desteklenen urun ZIB nin birincil gorevi algoritmik arastirma oldugundan sistemin artan kullanici sayisi ZIB nin yazilim dagitimi ve destegi icin ayirabilecegi kapasiteleri asmaya baslamistir Bu nedenle bir yan sirket olan Indeed Visual Concepts GmbH yazilimin kapsamli yeteneklerini dunya capindaki endustri ve akademi arastirmacilarinin kullanimina sunma ve urunu saglama vizyonuyla Hans Christian Hege Detlev Stalling ve Malte Westerhoff tarafindan kurulmultur Gunumuzun hizli ve rekabetci dunyasinda ihtiyac duyulan destek ve saglamlik getirilmistir Subat 1998 de HyperPlan yazilimina yeni uygulamadan bagimsiz Amira adi verilmistir Bu isim bir kisaltma olmayip farkli dillerde telaffuz edilebildigi ve uygun bir cagrisim sagladigi icin secilmistir Detlev Stalling ve Malte Westerhoff yazilimi ticari olarak desteklenebilir bir urun haline getirmek ve SGI olmayan bilgisayarlarda da kullanilabilir hale getirmek icin yazilimin buyuk bir yeniden tasarimini ustlenmistir Mart 1999 da ticari Amira nin ilk versiyonu Almanya nin Hannover kentindeki CeBIT fuarinda SGI IRIX ve Hewlett Packard UniX HP UX stantlarinda sergilenmistir Bunu takip eden on iki ay icinde Linux ve Microsoft Windows surumleri izlemistir Daha sonra Mac OS X destegi eklenmistir Gercekten Visual Concepts GmbH Amira nin dunya capindaki distributoru olarak Bordeaux Fransa ve San Diego Amerika Birlesik Devletleri merkezli TGS Inc i secilmistir Sonraki dort yil icinde bes ana yayin versiyon 3 1 e kadar tamamlanmistir 2003 yilinda hem Indeed Visual Concepts GmbH hem de TGS Inc Massachusetts merkezli Mercury Computer Systems Inc NASDAQ MRCY tarafindan satin alinmistir Mercury nin daha sonra Visage Imaging olarak adlandirilan yeni kurulan yasam bilimleri is biriminin bir parcasi olmustur 2009 yilinda Mercury Computer Systems Inc Visage Imaging i yeniden uretti ve radyoloji bilgi sistemleri ve tibbi BT cozumlerinin onde gelen saglayicisi olan Melbourne Avustralya merkezli Promedicus Ltd ye ASX PME satmistir Bu sure boyunca Amira Berlin Almanya da ve hala Amira nin orijinal yaraticilari tarafindan yonetilen ZIB ile yakin isbirligi icinde gelistirilmeye devam etmistir Fransa Bordeaux da bulunan TGS Mercury Computer Systems tarafindan bir Fransiz yatirimciya satilmistir Ayrica adi Visualization Sciences Group VSG olarak degistirilmistir VSG ayni kaynak koduna dayanan ancak malzeme bilimleri icin ozellestirilmis Avizo adli tamamlayici bir urun uzerinde calismaya devam etmistir Agustos 2012 de o tarihe kadar Amira nin en buyuk OEM saticisi olan FEI VSG yi ve Amira isini Promedicus tan satin almistir Bu iki yazilim kardes Amira ve Avizo yu tekrar bir araya getirmistir Agustos 2013 te Gorsellestirme Bilimleri Grubu VSG FEI nin bir is birimi haline gelmistir 2016 yilinda FEI Thermo Fisher Scientific tarafindan satin almistir Ayirca 2017 baslarinda Malzeme ve Yapisal Analiz bolumunun bir parcasi olmustur Amira ve Avizo halen iki farkli urun olarak pazarlanmaktadir Yasam bilimleri icin Amira ve malzeme bilimi icin Avizo kullanilmaktadir Ancak gelistirme cabalari simdi bir kez daha birlestirilmistir Bu arada Amira Avizo yazilimini kullanan bilimsel makale sayisi 10 bin mertebesindedir Baslangicta oldugu gibi Amira yol haritasi dunyanin dort bir yanindaki Amira kullanicilarinin genellikle alanlarinda oncu olan yanitlamaya calistiklari zorlu bilimsel sorular tarafindan yonlendirilmeye devam etmektedir Amira secenekleriAmira secenekleri Mikroskopi verileri icin ozel okuyucular Goruntu ters evrisim Hemen hemen her mikroskoptan elde edilen 3D goruntulerin kesfi Mikroskopi goruntulerinden filament aglarinin cikarilmasi ve duzenlenmesiDICOM okuyucu Klinik ve klinik oncesi verilerin DICOM formatinda ice aktarilmasiKafes secenegi Parcali goruntu verilerinden 3B sonlu eleman FE aglarinin olusturulmasi Bircok son teknoloji FE cozucu formati destegi Skaler vektor ve tensor alani goruntuleme modullerini kullanarak simulasyon agi tabanli sonuclarin yuksek kaliteli gorsellestirilmesiIskeletlestirme secenegi Sinir ve damar aglarinin yeniden yapilandirilmasi ve analizi Iskeletlestirilmis aglarin gorsellestirilmesi Ag bolumlerinin uzunluk ve cap olcumu Bir agac grafiginde bolumlerin siralanmasi Bir agac grafiginde bolumlerin siralanmasiMolekuler secenekler Molekul modellerinin gorsellestirilmesi icin gelismis araclar Donanim hizlandirmali hacim olusturma Guclu molekul duzenleyici Karmasik molekuler gorsellestirme icin ozel araclarGelistirici secenekleri Gorsellestirme veya veri isleme icin yeni ozel bilesenlerin olusturulmasi Yeni dosya okuyucularinin veya yazarlarinin uygulanmasi C programlama dili Hizli bir baslangic icin gelistirme sihirbaziNoro secenegi DTI ve beyin perfuzyonu icin tibbi goruntu analizi Birkac akis hatti tabanli algoritmayi destekleyen fiber izleme Kullanici tanimli kaynak ve hedef bolgelere gore fiber demetlerine fiber ayirma Tensor alanlarinin hesaplanmasi difuzyon agirlikli haritalar Tensor alanlarinin ozdeger ayristirmasi Ortalama gecis suresi beyin kan akimi ve beyin kan hacminin hesaplanmasiVR secenekleri Buyuk dosemeli ekranlarda veya surukleyici Sanal Gerceklik VR ortamlarinda verilerin gorsellestirilmesi 3D navigasyon cihazlarinin destegi Hizli cok is parcacikli ve dagitilmis islemeCok buyuk veri secenegi Verimli cekirdek disi veri yonetimi kullanarak mevcut ana bellegi asan goruntu verilerinin gorsellestirilmesi icin destek Cekirdek disi veriler uzerinde calismak icin ortogonal ve egik dilimleme hacim olusturma ve es yuzey olusturma gibi bircok standart modulun uzantilariUygulama alanlariAnatomi Biyokimya Difuzyon MRG Embriyoloji Histoloji Yasam ve malzeme bilimlerinde mikroskopiKaynakca Stalling D Westerhoff M Hege H C 2005 C D Hansen and C R Johnson Ed Amira A Highly Interactive System for Visual Data Analysis The Visualization Handbook 749 767 CiteSeerX 10 1 1 129 6785 2 doi 10 1016 B978 012387582 2 50040 X ISBN 9780123875822 Adam R Smith A R Sieren J C Eggleston T McLennan G 2010 Characterization Of The Airways And Lungs For The FABP CFTR Knockout Mouse Using Micro Computed Tomography And Large Image Microscope Array PDF American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 181 A6264 doi 10 1164 ajrccm conference 2010 181 1 meetingabstracts a6264 Awasthi V Holter J Thorp K Anderson S Epstein R 2010 F 18 fluorothymidine PET evaluation of bone marrow transplant in a rat model Nuclear Medicine Communications 31 2 152 158 doi 10 1097 mnm 0b013e3283339f92 PMID 19966596 a b Ayers G D McKinley E T Zhao P Fritz J M Metry R E Deal B C Adlerz K M Coffey R J Manning H C 2010 Volume of Preclinical Xenograft Tumors Is More Accurately Assessed by Ultrasound Imaging Than Manual Caliper Measurements Journal of Ultrasound in Medicine 29 6 891 901 doi 10 7863 jum 2010 29 6 891 PMC 2925269 2 PMID 20498463 2 Agustos 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Haziran 2021 Dlaskova A Spacek T Santorova J Plecita Hlavata L Berkova Z Saudek F Lessard M Bewersdorf J Jezek P 2010 4Pi microscopy reveals an impaired three dimensional mitochondrial network of pancreatic islet beta cells an experimental model of type 2 diabetes Biochimica et Biophysica Acta BBA Bioenergetics 1797 6 7 1327 1341 doi 10 1016 j bbabio 2010 02 003 PMID 20144584 Clark N D L Daly C 2010 Using confocal laser scanning microscopy to image trichome inclusions in amber PDF Journal of Paleontological Techniques 8 4 Mart 2016 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 28 Haziran 2021 Amstalden van Hove E R Blackwell T R Klinkert I Eijkel G B Heeren R Glunde K 2010 Multimodal Mass Spectrometric Imaging of Small Molecules Reveals Distinct Spatio Molecular Signatures in Differentially Metastatic Breast Tumor Models Cancer Research 70 22 9012 9021 doi 10 1158 0008 5472 can 10 0360 PMC 5555163 2 PMID 21045154 Sherman D M 2010 Metal complexation and ion association in hydrothermal fluids insights from quantum chemistry and molecular dynamics Frontiers in Geofluids Geofluids 10 ss 41 57 doi 10 1002 9781444394900 ch4 ISBN 9781444394900 6 Ocak 2013 tarihinde kaynagindan arsivlendi O Neill S M Jones T W 2010 Three Dimensional Simulations of Bi Directed Magnetohydrodynamic Jets Interacting with Cluster Environments The Astrophysical Journal 710 1 180 196 arXiv 1001 1747 2 Bibcode 2010ApJ 710 180O doi 10 1088 0004 637x 710 1 180 Baharoglu M I Schirmer C M Hoit D A Gao B L Malek A M 2010 Morphometric and Computational Fluid Dynamic Analysis 22 Haziran 2010 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 17 Mayis 2012 Bardyn T Gedet P Hallermann W Buchler P 2010 Prediction of dental implant torque with a fast and automatic finite element analysis a pilot study Oral Surgery Oral Medicine Oral Pathology Oral Radiology and Endodontology 109 4 594 603 doi 10 1016 j tripleo 2009 11 010 PMID 20163974 Shearing P R Gelb J Yi J Lee W K Drakopolous M Brandon N P 2010 Analysis of Triple Phase Contact in Ni YSZ Microstructures Using Non destructive X ray Tomography with Synchrotron Radiation Electrochemistry Communications 12 8 1021 1024 doi 10 1016 j elecom 2010 05 014 Jahrling N Becker K Schonbauer C Schnorrer F Dodt H U 2010 Three dimensional reconstruction and segmentation of intact Drosophila by ultramicroscopy Frontiers in Systems Neuroscience 4 1 doi 10 3389 neuro 06 001 2010 PMC 2831709 2 PMID 20204156 Zheng G 2010 Statistical shape model based reconstruction of a scaled patient specific surface model of the pelvis from a single standard AP x ray radiograph Medical Physics 37 4 1424 1439 Bibcode 2010MedPh 37 1424Z doi 10 1118 1 3327453 PMID 20443464 11 Temmuz 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 15 Mayis 2019 Rodriguez Soto A E Fritscher K D Schuler B Issever A S Roth T Kamelger F Kammerlander C Blauth M Schubert R Link T M 2010 Texture Analysis Bone Mineral Density and Cortical Thickness of the Proximal Femur Fracture Risk Prediction Journal of Computer Assisted Tomography 34 6 949 957 doi 10 1097 rct 0b013e3181ec05e4 PMID 21084915 a b Leischner U Schierloh A Zieglgansberger W Dodt H U 2010 Formalin Induced Fluorescence Reveals Cell Shape and Morphology in Biological Tissue Samples PLOS ONE 5 4 e10391 Bibcode 2010PLoSO 510391L doi 10 1371 journal pone 0010391 PMC 2861007 2 PMID 20436930 Felts R L Narayan K Estes J D Shi D Trubey C M Fu J Hartnell L M Ruthel G T Schneider D K Nagashima K 2010 3D visualization of HIV transfer at the virological synapse between dendritic cells and T cells Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 107 30 13336 13341 Bibcode 2010PNAS 10713336F doi 10 1073 pnas 1003040107 PMC 2922156 2 PMID 20624966 Taylor D J Doorly D J Schroter R C 2010 Inflow boundary profile prescription for numerical simulation of nasal airflow Journal of the Royal Society Interface 7 44 515 527 doi 10 1098 rsif 2009 0306 PMC 2842801 2 PMID 19740920 Lucas B C Bogovic J A Carass A Bazin P L Prince J L Pham D L Landman B A 2010 The Java Image Science Toolkit JIST for Rapid Prototyping and Publishing of Neuroimaging Software Neuroinformatics 8 1 5 17 doi 10 1007 s12021 009 9061 2 PMC 2860951 2 PMID 20077162 Dasgupta S Feleppa E Ramachandran S Ketterling J Kalisz A Haker S Tempany C Porter C Lacrampe M Isacson C 2007 8A 4 Spatial Co Registration of Magnetic Resonance and Ultrasound Images of the Prostate as a Basis for Multi Modality Tissue Type Imaging 2007 IEEE Ultrasonics Symposium Proceedings ss 641 643 doi 10 1109 ULTSYM 2007 166 ISBN 978 1 4244 1383 6 Oberlaender M Bruno R M Sakmann B Broser P J 2007 Transmitted light brightfield mosaic microscopy for three dimensional tracing of single neuron morphology Journal of Biomedical Optics 12 6 064029 Bibcode 2007JBO 12f4029O doi 10 1117 1 2815693 PMID 18163845 18 Temmuz 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 15 Mayis 2019 Lamecker H Mansi T Relan J Billet F Sermesant M Ayache N Delingette H 2009 Adaptive Tetrahedral Meshing for Personalized Cardiac Simulations CiteSeerX 10 1 1 698 4292 2 Boretius S Michaelis T Tammer R Ashery Padan R Frahm J Stoykova A 2009 In vivo MRI of altered brain anatomy and fiber connectivity in adult pax6 deficient mice Cerebral Cortex 19 12 2838 2847 doi 10 1093 cercor bhp057 PMID 19329571 Kohjiya S Katoh A Suda T Shimanuki J Ikeda Y 2006 Visualisation of carbon black networks in rubbery matrix by skeletonisation of 3D TEM image Polymer 47 10 3298 3301 doi 10 1016 j polymer 2006 03 008 Clements R J Mintz E M Blank J L 2009 High resolution stereoscopic volume visualization of the mouse arginine vasopressin system Journal of Neuroscience Methods 187 1 41 45 doi 10 1016 j jneumeth 2009 12 011 PMID 20036282 Ohno N Kageyama A 2009 Region of interest visualization by CAVE VR system with automatic control of level of detail Computer Physics Communications 181 4 720 725 Bibcode 2010CoPhC 181 720O doi 10 1016 j cpc 2009 12 002 Dyer D S 1990 A dataflow toolkit for visualization Computer Graphics and Applications 10 4 60 69 doi 10 1109 38 56300 Foulser D 1995 IRIS Explorer A framework for investigation Computer Graphics 29 2 13 16 doi 10 1145 204362 204365 DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft 20 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Ocak 2015 DFG Deutsche Forschungsgemeinschaft 20 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Ocak 2015 Strauss P S 1993 IRIS Inventor a 3D graphics toolkit ACM SIGPLAN Notices 28 10 192 200 doi 10 1145 167962 165889 a b c de Boer B A Soufan A T Hagoort J Mohun T J van den Hoff M J B Hasman A Voorbraak F P J M Moorman A F M Ruijter J M 2011 The interactive presentation of 3D information obtained from reconstructed datasets and 3D placement of single histological sections with the 3D portable document format Development 138 1 159 167 doi 10 1242 dev 051086 PMC 2998169 2 PMID 21138978 Specht M Lebrun R Zollikofer C P E 2007 Visualizing shape transformation between chimpanzee and human braincases PDF The Visual Computer International Journal of Computer Graphics Archive 23 9 743 751 CiteSeerX 10 1 1 108 7163 2 doi 10 1007 s00371 007 0156 1 22 Eylul 2017 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 28 Haziran 2021 a b c Gaemers I C Stallen J M Kunne C Wallner C van Werven J Nederveen A Lamers W H 2011 Lipotoxicity and steatohepatitis in an overfed mouse model for non alcoholic fatty liver disease PDF Biochimica et Biophysica Acta BBA Molecular Basis of Disease 1812 4 447 458 doi 10 1016 j bbadis 2011 01 003 PMID 21216282 28 Haziran 2021 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 28 Haziran 2021 a b Kudryashev Mikhail Cyrklaff Marek Alex Bjorn Lemgruber Leandro Baumeister Wolfgang Wallich Reinhard Frischknecht Friedrich 2011 Evidence of direct cell cell fusion in Borrelia by cryogenic electron tomography Cellular Microbiology Ingilizce 13 5 731 741 doi 10 1111 j 1462 5822 2011 01571 x ISSN 1462 5822 28 Haziran 2021 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Haziran 2021 Meisslitzer Ruppitsch C Rohrl C Ranftler C Neumuller J Vetterlein M Ellinger A Pavelka M 2011 The ceramide enriched trans Golgi compartments reorganize together with other parts of the Golgi apparatus in response to ATP depletion Histochemistry and Cell Biology 135 2 159 171 doi 10 1007 s00418 010 0773 z PMID 21225431 Bevan R L T Sazonov I Saksono P H Nithiarasu P van Loon R Luckraz H Ashral S 2011 Patient specific blood flow simulation through an aneurysmal thoracic aorta with a folded proximal neck Numerical Methods in Biomedical Engineering 27 8 1167 1184 doi 10 1002 cnm 1425 Jiang Y Johnson G A 2010 Microscopic Diffusion Tensor Imaging of the Mouse Brain NeuroImage 50 2 465 471 doi 10 1016 j neuroimage 2009 12 057 PMC 2826147 2 PMID 20034583 Bujotzek A Shan M Haag R Weber M 2011 Towards a rational spacer design for bivalent inhibition of estrogen receptor Journal of Computer Aided Molecular Design 25 3 253 262 Bibcode 2011JCAMD 25 253B doi 10 1007 s10822 011 9417 1 PMID 21331802 a b Cai W Lee E Y Vij A Mahmood S A Yoshida H 2011 MDCT for Computerized Volumetry of Pneumothoraces in Pediatric Patients Academic Radiology 18 3 315 23 doi 10 1016 j acra 2010 11 008 PMC 3072076 2 PMID 21216160 a b Irving S Moore D R Liberman M C Sumner C J 2011 Olivocochlear Efferent Control in Sound Localization and Experience Dependent Learning Journal of Neuroscience 31 7 2493 2501 doi 10 1523 jneurosci 2679 10 2011 PMC 3292219 2 PMID 21325517 Kubel C Voigt A Schoenmakers R Otten M Su D Lee TC Carlsson A Bradley J 2005 Recent Advances in Electron Tomography TEM and HAADF STEM Tomography for Materials Science and Semiconductor Applications Microsc Microanal 11 5 378 400 doi 10 1017 S1431927605050361 888597 PMID 17481320 Chan S Li P Locketz G Salisbury K Blevins N H 2016 High fidelity haptic and visual rendering for patient specific simulation of temporal bone surgery Computer Assisted Surgery 11 1 85 101 doi 10 1080 24699322 2016 1189966 PMID 2797394 a b Obenaus A Hayes P 2011 Drill hole defects induction imaging and analysis in the rodent Methods in Molecular Biology 690 ss 301 314 doi 10 1007 978 1 60761 962 8 20 ISBN 978 1 60761 961 1 PMID 21043001 Erturk A Mauch C P Hellal F Forstner F Keck T Becker K Jahrling N Steffens H Richter M Hubener M Kramer E Kirchhoff F Dodt Bradke F 2011 Nature Medicine 18 1 166 171 doi 10 1038 nm 2600 PMID 22198277 15 Eylul 2020 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Haziran 2021 Carlson K J Wrangham R W Muller M N Sumner D R Morbeck M E Nishida T Yamanaka A Boesch C 2011 Comparisons of Limb Structural Properties in Free ranging Chimpanzees from Kibale Gombe Mahale and Tai Communities Primate Locomotion ss 155 182 doi 10 1007 978 1 4419 1420 0 9 ISBN 978 1 4419 1419 4 Hartwig T Streitparth F Gro C Muller M Perka C Putzier M Strube P 2011 Digital 3 Dimensional Analysis of the Paravertebral Lumbar Muscles After Circumferential Single level Fusion Journal of Spinal Disorders amp Techniques 30 6 E702 E706 doi 10 1097 BSD 0000000000000249 PMID 28632556 Lee J Eddington D K Nadol J B 2011 The Histopathology of Revision Cochlear Implantation Audiology and Neurotology 16 5 336 346 doi 10 1159 000322307 PMC 7265424 2 PMID 21196725 Han M Kim C Mozer P Schafer F Badaan S Vigaru B Tseng K Petrisor D Trock B Stoianovici D 2011 Tandem robot Assisted Laparoscopic Radical Prostatectomy to Improve the Neurovascular Bundle Visualization A Feasibility Study PDF Urology 77 2 502 6 doi 10 1016 j urology 2010 06 064 PMC 3051397 2 PMID 21067797 15 Subat 2020 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 28 Haziran 2021 Ek baglantilarOrijinal web sitesi 28 Haziran 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde Vaka Galerisini Kullan 28 Haziran 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde Surum notlari 28 Haziran 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde