Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) biyoinformatik çalışmalarda kullanılan GenBank veri tabanına ait, nükleik asit ve protein sekanslarının analizini yapmaya yarayan bir hizalama arama motorudur.
Nükleik asit ve protein veri tabanında yüklü olan tüm sekanslarla, dizisi bilinen ama tanımlı olmayan gen dizilerini karşılaştırır ve benzerlik oranlarına göre gen bölgelerini yüksekten başlayarak listeler. Bu genler listelenirken GenBank erişim numaraları ile gösterilir. Bunlara ait protein ve nükleik asit sekansları ise gösterilir ve analizler bu format kullanılarak yapılır.
Değişik BLAST uygulamalarıyla değişik organizmalarda gen hizalama çalışmaları yapılabilir. Bunun sonucunda önce analizi yapılan proteine ait sekansın protein ailesi, daha sonra ise hizalama skorlarına göre değişiklik gösteren bir renk skalası görülür. Benzeme oranı kırmızı renkte maksimum olacak şekilde (200 baz çiftinin üzerinde), kırmızıdan siyaha doğru gösterilir ve bu sayede benzerlik oranları aranılan gende incelenebilir. Sayfanın altında ise benzerlik oranlarına göre erişim numaraları ile listelenmiş olan sekanslar en yüksek benzerlik oranından düşüğe doğru listelenir ve listelenmiş olan her bir sekansın aynı zamanda açıklaması, E değeri ve benzeme yüzdesi de gösterilir.
Kaynakça
- ^ Biyoinformatik, M. C. Baloğlu, A.T. Bayraç, G. Sadi, C. Bayraç, Moleküler Biyoloji, Editörler: M. Karataş, Basım: Nobel Akademik Yayıncılık, 2012, , sayfalar: 721 - 748
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
BLAST Basic Local Alignment Search Tool biyoinformatik calismalarda kullanilan GenBank veri tabanina ait nukleik asit ve protein sekanslarinin analizini yapmaya yarayan bir hizalama arama motorudur Nukleik asit ve protein veri tabaninda yuklu olan tum sekanslarla dizisi bilinen ama tanimli olmayan gen dizilerini karsilastirir ve benzerlik oranlarina gore gen bolgelerini yuksekten baslayarak listeler Bu genler listelenirken GenBank erisim numaralari ile gosterilir Bunlara ait protein ve nukleik asit sekanslari ise gosterilir ve analizler bu format kullanilarak yapilir Degisik BLAST uygulamalariyla degisik organizmalarda gen hizalama calismalari yapilabilir Bunun sonucunda once analizi yapilan proteine ait sekansin protein ailesi daha sonra ise hizalama skorlarina gore degisiklik gosteren bir renk skalasi gorulur Benzeme orani kirmizi renkte maksimum olacak sekilde 200 baz ciftinin uzerinde kirmizidan siyaha dogru gosterilir ve bu sayede benzerlik oranlari aranilan gende incelenebilir Sayfanin altinda ise benzerlik oranlarina gore erisim numaralari ile listelenmis olan sekanslar en yuksek benzerlik oranindan dusuge dogru listelenir ve listelenmis olan her bir sekansin ayni zamanda aciklamasi E degeri ve benzeme yuzdesi de gosterilir Kaynakca Biyoinformatik M C Baloglu A T Bayrac G Sadi C Bayrac Molekuler Biyoloji Editorler M Karatas Basim Nobel Akademik Yayincilik 2012 ISBN 978 605 88012 7 1 sayfalar 721 748