Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Kütle spektrometrisinde, de novo peptid dizilimi, bir peptid amino asit dizisinin ardışık kütle spektrometrisinden belirlendiği yöntemdir.
Protein sindiriminden peptitlerin amino asit dizisini bilmek, proteinin biyolojik işlevini incelemek için çok önemlidir. Eski günlerde bu, Edman'ın bozulma prosedürü ile gerçekleştiriliyordu. Günümüzde, bir ardışık kütle spektrometresi ile analiz, peptitlerin dizilimini çözmek için daha yaygın bir yöntemdir. Genellikle iki yaklaşım vardır: veritabanı arama ve de novo dizileme. Veritabanı araması, bilinmeyen peptidin kütle spektrum verileri gönderildiği ve bilinen bir peptit sekansı ile bir eşleşme bulmak için çalıştırıldığı için basit bir versiyondur, en yüksek eşleşen puana sahip peptit seçilecektir. Bu yaklaşım, yalnızca veri tabanındaki mevcut dizilerle eşleşebildiği için yeni peptitleri tanımada başarısız olur. De novo dizileme, bir kütle spektrumundan gelen parça iyonlarının tespitidir. Yorumlama için farklı algoritmalar kullanılır ve çoğu cihaz de novo dizilime programları ile birlikte gelir.
Kaynakça
- ^ Edman (Mart 1967). "A Protein Sequenator". European Journal of Biochemistry. 1 (1): 80-91. doi:10.1111/j.1432-1033.1967.tb00047.x. (PMID) 6059350.
- ^ Webb-Robertson (20 Haziran 2007). "Current trends in computational inference from mass spectrometry-based proteomics" (PDF). Briefings in Bioinformatics. 8 (5): 304-317. doi:10.1093/bib/bbm023. (PMID) 17584764. 24 Temmuz 2018 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 15 Ekim 2020.
- ^ Lu (Mart 2004). "Algorithms for de novo peptide sequencing using tandem mass spectrometry". Drug Discovery Today: BIOSILICO. 2 (2): 85-90. doi:10.1016/S1741-8364(04)02387-X.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Kutle spektrometrisinde de novo peptid dizilimi bir peptid amino asit dizisinin ardisik kutle spektrometrisinden belirlendigi yontemdir Protein sindiriminden peptitlerin amino asit dizisini bilmek proteinin biyolojik islevini incelemek icin cok onemlidir Eski gunlerde bu Edman in bozulma proseduru ile gerceklestiriliyordu Gunumuzde bir ardisik kutle spektrometresi ile analiz peptitlerin dizilimini cozmek icin daha yaygin bir yontemdir Genellikle iki yaklasim vardir veritabani arama ve de novo dizileme Veritabani aramasi bilinmeyen peptidin kutle spektrum verileri gonderildigi ve bilinen bir peptit sekansi ile bir eslesme bulmak icin calistirildigi icin basit bir versiyondur en yuksek eslesen puana sahip peptit secilecektir Bu yaklasim yalnizca veri tabanindaki mevcut dizilerle eslesebildigi icin yeni peptitleri tanimada basarisiz olur De novo dizileme bir kutle spektrumundan gelen parca iyonlarinin tespitidir Yorumlama icin farkli algoritmalar kullanilir ve cogu cihaz de novo dizilime programlari ile birlikte gelir Kaynakca Edman Mart 1967 A Protein Sequenator European Journal of Biochemistry 1 1 80 91 doi 10 1111 j 1432 1033 1967 tb00047 x PMID 6059350 Webb Robertson 20 Haziran 2007 Current trends in computational inference from mass spectrometry based proteomics PDF Briefings in Bioinformatics 8 5 304 317 doi 10 1093 bib bbm023 PMID 17584764 24 Temmuz 2018 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 15 Ekim 2020 Lu Mart 2004 Algorithms for de novo peptide sequencing using tandem mass spectrometry Drug Discovery Today BIOSILICO 2 2 85 90 doi 10 1016 S1741 8364 04 02387 X