Faj gösterimi, proteinleri kodlayan genetik bilgilerle proteinleri birbirine bağlamak için bakteriyofajları (bakterileri enfekte eden virüsler) kullanan protein-protein, protein-peptit ve protein-DNA etkileşimlerinin incelenmesi için bir laboratuvar tekniğidir. Bu teknikte, ilgilenilen bir proteini kodlayan bir gen, bir faj kapsit proteini genine eklenir. Bu durumda faj, proteinin genini içeride barındırırken, proteini dış tarafında da "gösterir". Böylece genotip ile fenotip arasında bir bağlantı kurulmuş olur. Proteini görüntüleyen fajlar daha sonra, görüntülenen protein ile diğer moleküller arasındaki etkileşimi saptamak için diğer proteinlere, peptidlere veya DNA dizilerine karşı taranabilir. Bu şekilde, büyük protein kütüphaneleri, doğal seçilim ile benzer olan in vitro seçilim adı verilen bir süreçte taranabilir ve çoğaltılabilir.
Faj gösteriminde kullanılan en yaygın bakteriyofajlar M13 ve fd filamentli fajdır, ancak T4, T7 ve λ faj da kullanılmıştır.
Kaynakça
- ^ Smith GP (Haziran 1985). "Filamentous fusion phage: novel expression vectors that display cloned antigens on the virion surface". Science. 228 (4705): 1315-7. doi:10.1126/science.4001944. (PMID) 4001944.
- ^ "Phage Display". Chemical Reviews. 97 (2): 391-410. Nisan 1997. doi:10.1021/cr960065d. (PMID) 11848876.
- ^ "Filamentous phage display in the new millennium". Chem. Rev. 105 (11): 4056-72. Kasım 2005. doi:10.1021/cr000261r. (PMID) 16277371.
- ^ "A bipartite bacteriophage T4 SOC and HOC randomized peptide display library: detection and analysis of phage T4 terminase (gp17) and late sigma factor (gp55) interaction". J Mol Biol. 319 (2): 289-304. 2002. doi:10.1016/S0022-2836(02)00298-X. (PMID) 12051907.
Konuyla ilgili yayınlar
- Ledsgaard L, Kilstrup M, Karatt-Vellatt A, McCafferty J, Laustsen AH (2018). "Basics of antibody phage display technology" (PDF). Toxins. 10 (6): 236. doi:10.3390/toxins10060236. (PMC) 6024766 $2. (PMID) 29890762. 4 Eylül 2019 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 16 Ekim 2020.
- Selection Versus Design in Chemical Engineering
- The ETH-2 human antibody phage library 15 Temmuz 2011 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Sidhu SS, Lowman HB, Cunningham BC, Wells JA (2000). "Phage display for selection of novel binding peptides". Meth. Enzymol. Methods in Enzymology. 328: 333-63. doi:10.1016/S0076-6879(00)28406-1. ISBN . (PMID) 11075354.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Faj gosterimi proteinleri kodlayan genetik bilgilerle proteinleri birbirine baglamak icin bakteriyofajlari bakterileri enfekte eden virusler kullanan protein protein protein peptit ve protein DNA etkilesimlerinin incelenmesi icin bir laboratuvar teknigidir Bu teknikte ilgilenilen bir proteini kodlayan bir gen bir faj kapsit proteini genine eklenir Bu durumda faj proteinin genini iceride barindirirken proteini dis tarafinda da gosterir Boylece genotip ile fenotip arasinda bir baglanti kurulmus olur Proteini goruntuleyen fajlar daha sonra goruntulenen protein ile diger molekuller arasindaki etkilesimi saptamak icin diger proteinlere peptidlere veya DNA dizilerine karsi taranabilir Bu sekilde buyuk protein kutuphaneleri dogal secilim ile benzer olan in vitro secilim adi verilen bir surecte taranabilir ve cogaltilabilir Faj goruntuleme dongusu 1 Bir viral kilif proteini evrimlestirilecek gen tipik olarak bir antikor fragmani ile beraber fuzyon proteinleri halinde bakteriyofajda ifade edilir 2 Faj kitapligi hareketsizlestirilmis bir hedef uzerinde yikanir 3 Kalan yuksek afiniteli baglayicilar bakterileri enfekte etmek icin kullanilir 4 Yuksek afiniteli baglayicilari kodlayan genler izole edilir 5 Bu genler rastgele mutasyonlara sahip olabilir ve baska bir evrim turu gerceklestirmek icin kullanilmis olabilir Secim ve amplifikasyon adimlari daha yuksek afiniteli baglayicilari izole etmek icin daha yuksek siklikta bircok kez gerceklestirilebilir Faj gosteriminde kullanilan en yaygin bakteriyofajlar M13 ve fd filamentli fajdir ancak T4 T7 ve l faj da kullanilmistir Kaynakca Smith GP Haziran 1985 Filamentous fusion phage novel expression vectors that display cloned antigens on the virion surface Science 228 4705 1315 7 doi 10 1126 science 4001944 PMID 4001944 Phage Display Chemical Reviews 97 2 391 410 Nisan 1997 doi 10 1021 cr960065d PMID 11848876 Filamentous phage display in the new millennium Chem Rev 105 11 4056 72 Kasim 2005 doi 10 1021 cr000261r PMID 16277371 A bipartite bacteriophage T4 SOC and HOC randomized peptide display library detection and analysis of phage T4 terminase gp17 and late sigma factor gp55 interaction J Mol Biol 319 2 289 304 2002 doi 10 1016 S0022 2836 02 00298 X PMID 12051907 Konuyla ilgili yayinlarLedsgaard L Kilstrup M Karatt Vellatt A McCafferty J Laustsen AH 2018 Basics of antibody phage display technology PDF Toxins 10 6 236 doi 10 3390 toxins10060236 PMC 6024766 2 PMID 29890762 4 Eylul 2019 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 16 Ekim 2020 Selection Versus Design in Chemical Engineering The ETH 2 human antibody phage library 15 Temmuz 2011 tarihinde Wayback Machine sitesinde Sidhu SS Lowman HB Cunningham BC Wells JA 2000 Phage display for selection of novel binding peptides Meth Enzymol Methods in Enzymology 328 333 63 doi 10 1016 S0076 6879 00 28406 1 ISBN 9780121822293 PMID 11075354