Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Litik döngü, viral üremenin iki döngüsünden biridir (bakteriyel virüslere veya bakteriyofajlara atıfta bulunur), diğeri lizojenik döngüdür. Litik döngü, enfekte olmuş hücrenin ve zarının tahrip olmasıyla sonuçlanır. Yalnızca litik döngüden geçebilen bakteriyofajlara virülan fajlar denir (ılıman fajların aksine).
Litik döngüde viral DNA, bakteri hücresi içinde ayrı bir serbest yüzen molekül olarak bulunur ve konakçı bakteri DNA'sından ayrı olarak çoğalır, oysa lizojenik döngüde viral DNA, konakçı genomuna entegre olur.Bu litik ve lizojenik döngüler arasındaki temel farktır. Bununla beraber, iki durumda da virüs/faj, konak DNA mekanizmasını kullanarak replikasyon yapar.
Açıklama
Litik döndü altı aşama olarak ele alınır. Bu altı aşama: ataşment, penetrasyon, transkripsiyon, biyosentez, matürasyon ve liz.
- Ataşment– faj, DNA'sını hücreye enjekte etmek için kendisini konakçı hücrenin yüzeyine bağlar
- Penetrasyon– faj, konak hücreye DNA'sını hücre zarından penetre olarak enjekte eder.
- Transkripsiyon– konak hücrenin DNA'sı bozulur ve hücrenin metabolizması faj biyosentezini başlatmak üzere yönlendirilir
- Biyosentez– faj DNA'sı hücre içinde çoğalarak yeni faj DNA'sı ve proteinleri sentezler
- Matürasyon– kopyalanan materyal, tamamen oluşturulmuş viral fajlara (her biri bir kafa, bir kuyruk ve kuyruk liflerinden oluşan) bir araya gelir.
- Liz - hücre duvarı veya zarı yırtılır, parçalanır ve bu süreçte virüs açığa çıkar
Ataşment ve penetrasyon
Konak hücreyi enfekte etmek için öncelikle virüs, kendi nükleik asitini hücre zarı (ve varsa) hücre duvarı içinden enejkte etmek zorundadır. Virüs bunu ya hücrenin yüzeyindeki bir reseptöre bağlanarak ya da basit mekanik kuvvetle yapıyor. Bağlanma elektrostatik etkileşimlerden kaynaklanır ve pH'tan ve iyonların varlığından etkilenir. Virüs daha sonra genetik materyalini (tek veya çift sarmallı RNA veya DNA) hücreye salar.Bazı virüslerde bu genetik materyal daireseldir ve bakteriyal plazmiti taklit eder. Bu evrede hücre enfekte olur ve immün sistem tarafından hedef alınabilir. Bu genellikle hücre yüzeyindeki reseptörler yardımıyla sağlanır.Bakteriyofaj enfeksiyonunun başlatılması sırasında adsorpsiyondan (bağlanma) viriondan konakçı hücreye DNA ejeksiyonuna (penetrasyon) kadar meydana gelen olayların sırası Molineux tarafından gözden geçirildi.
Transkripsiyon ve biyosentez
Transkripsiyon ve biyosentez aşamalarında virüs, hücrenin replikasyon ve translasyon mekanizmalarını ele geçirerek bunları daha fazla virüs yapmak için kullanır. Virüsün nükleik asidi, büyük miktarlarda viral bileşenler oluşturmak için konakçı hücrenin metabolik mekanizmasını kullanır.
DNA virüsleri durumunda, DNA kendisini haberci RNA (mRNA) moleküllerine kopyalar ve bunlar daha sonra hücrenin ribozomlarını yönlendirmek için kullanılır. Çevrilecek ilk polipeptitlerden biri, konağın DNA'sını yok eder. Retrovirüslerde (bir RNA zincirini enjekte eden), ters transkriptaz adı verilen benzersiz bir enzim, viral RNA'yı DNA'ya kopyalar ve bu daha sonra tekrar RNA'ya kopyalanır. Viral DNA kontrolü ele geçirdiğinde, konakçı hücrenin mekanizmasını viral DNA'yı, proteini sentezlemeye teşvik eder ve çoğalmaya başlar.[][<span title="This claim needs references to reliable sources. (October 2022)">citation needed</span>]
Biyosentez (örneğin T4), mRNA üretiminin üç fazında ve ardından protein üretimi fazında düzenlenir.
- Erken faz
- Enzimler, konakçının transkripsiyonel sürecini RNA polimeraz ile değiştirir. Diğer modifikasyonların yanı sıra, T4 virüsü, bir anti-sigma faktörü üreterek konağın sigma faktörünü değiştirir, böylece konakçı promotorları artık tanınmaz, ancak artık T4 orta proteinlerini tanır. Protein sentezi için Shine-Dalgarno alt dizisi GAGG, erken gen çevirisine hakimdir.
- Orta faz
- Virüs nükleik asidi (virüs türüne bağlı olarak DNA veya RNA). [<span title="This claim needs references to reliable sources. (October 2022)">citation needed</span>]
- Son faz
- Baş ve kuyruktakiler dahil yapısal proteinler.[][<span title="This claim needs references to reliable sources. (October 2022)">citation needed</span>]
Matürasyon ve liz
İlk enfeksiyondan yaklaşık 25 dakika sonra yaklaşık 200 yeni virion (viral cisimcik) oluşur. Yeterli virion olgunlaşıp biriktiğinde, hücrelerin duvarlarını çözmek için özel viral proteinler kullanılır. Artık hücre duvarı tarafından sınırlandırılamayan yüksek iç ozmotik basınç (su basıncı) nedeniyle hücre patlar (yani parçalanmaya maruz kalır). Bu, yeni nesil viryonları çevredeki ortama salar, burada diğer hücreleri enfekte edebilirler ve başka bir litik döngü başlar. Konağın parçalanmasına neden olan faj, litik veya virülan faj olarak adlandırılır.
Gen regülasyonu ve biyokimya
Faj genomunda litik döngülerin mi yoksa lizojenik döngülerin mi ortaya çıkacağını düzenleyen üç gen sınıfı vardır. Birinci sınıf doğrudan erken genler, ikincisi gecikmiş erken genler ve üçüncüsü geç genlerdir. Aşağıda E. coli'nin iyi çalışılmış ılıman faj lambdası kastedilmektedir.. [<span title="This claim needs references to reliable sources. (October 2022)">citation needed</span>]
- Ani erken genler: Bu genler, konakçı RNA polimeraz tarafından tanınan promotörlerden eksprese edilir ve Cro, cII ve N'yi içerir. CII, ana lizojenik baskılayıcı gen olan cI'nin ekspresyonunu uyaran bir transkripsiyon faktörüdür, oysa Cro, cl için bir baskılayıcıdır. ifade. Lizis-lizojen kararı temel olarak Cro ve CII arasındaki rekabetten etkilenir ve yeterli CI baskılayıcının yapılıp yapılmadığının belirlenmesiyle sonuçlanır. Eğer öyleyse, CI erken promotörleri baskılar ve enfeksiyon lizojenik yola yönlendirilir. N, gecikmiş erken genlerin transkripsiyonu için gerekli olan bir anti-sonlandırma faktörüdür.
- Gecikmiş erken genler: Bunlar, tüm geç genlerin transkripsiyonundan sorumlu anti-sonlandırıcıyı kodlayan O ve P replikasyon genlerini ve ayrıca Q'yu içerir.
- Geç genler
Litik yol seçilirse, geç transkripsiyonun Q aracılı açılması enfeksiyondan yaklaşık 6-8 dakika sonra başlar. Tek geç promoterden 25'ten fazla gen eksprese edilir ve bu da dört paralel biyosentetik yola yol açar. Yollardan üçü, viryonun üç bileşeninin üretimi içindir: DNA ile dolu kafa, kuyruk ve yan kuyruk lifleri. Virionlar bu bileşenlerden kendiliğinden bir araya gelir ve ilk virion enfeksiyondan yaklaşık 20 dakika sonra ortaya çıkar. Dördüncü yol lizis içindir. Lambda 5 proteinleri lizise katılır: S geninden holin ve antiholin, R geninden endolizin ve Rz ve Rz1 genlerinden spanin proteinleri. Yabani tip lambdada, lizis yaklaşık 50 dakikada meydana gelir ve yaklaşık 100 tamamlanmış viryonu serbest bırakır. Parçalanmanın zamanlaması holin ve antiholin proteinleri tarafından belirlenir ve ikincisi birincisini inhibe eder. Genel olarak holin proteini, aniden mikron ölçekli delikler oluşturana kadar sitoplazmik membranda birikir ve bu da lizizi tetikler. Endolizin R, peptidoglikana saldırdığı periplazmaya salınır. Spanin proteinleri Rz ve Rz1 sırasıyla sitoplazmik ve dış membranlarda birikir ve peptidoglikan ağı boyunca periplazmayı kapsayan bir kompleks oluşturur. Endolizin peptidoglikanı parçaladığında, spanin kompleksleri serbest kalır ve dış zarın bozulmasına neden olur. Lambda enfeksiyonlarında lizis için peptidoglikanın endolizin tarafından yok edilmesi ve dış zarın spanin kompleksi tarafından parçalanması gerekir.
Lizis inhibisyonu: T4 benzeri fajlar, eğer enfekte hücre başka bir T4 (veya yakından ilişkili) viryon tarafından süper enfeksiyona maruz kalırsa T4 holini inhibe eden rI ve rIII olmak üzere iki gene sahiptir. Tekrarlanan süper enfeksiyon, T4 enfeksiyonunun saatlerce parçalanmadan devam etmesine neden olabilir ve bu da viryonların normalden 10 kat daha yüksek seviyelerde birikmesine yol açabilir.
Kaynakça
- ^ Molineux, Ian J. (January 2006). "Fifty-three years since Hershey and Chase; much ado about pressure but which pressure is it?". Virology. 344 (1): 221-229. doi:10.1016/j.virol.2005.09.014.
- ^ "Ebola - Lytic or Lysogenic". Ebola-Cases.com. 26 Ocak 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Ocak 2023.
- ^ Martinko, John M., (Ed.) (2006). Brock biology of microorganisms. 11. Prentice Hall. ISBN . r eksik
|soyadı1=() - ^ Malys, N (2012). "Shine-Dalgarno sequence of bacteriophage T4: GAGG prevails in early genes". Molecular Biology Reports. 39 (1): 33-9. doi:10.1007/s11033-011-0707-4. (PMID) 21533668.
- ^ Gummalla, Vimathi S.; Zhang, Yujie; Liao, Yen-Te; Wu, Vivian C. H. (21 Şubat 2023). "The Role of Temperate Phages in Bacterial Pathogenicity". Microorganisms. 11 (3): 541. doi:10.3390/microorganisms11030541. Tarih değerini gözden geçirin:
|erişimtarihi=(); - ^ "The Lytic Cycle of the T-Even Bacteriophage". nemetoadreviews.com. 10 Ocak 2018 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 9 Ocak 2018.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Litik dongu viral uremenin iki dongusunden biridir bakteriyel viruslere veya bakteriyofajlara atifta bulunur digeri lizojenik dongudur Litik dongu enfekte olmus hucrenin ve zarinin tahrip olmasiyla sonuclanir Yalnizca litik donguden gecebilen bakteriyofajlara virulan fajlar denir iliman fajlarin aksine Litik dongu ve lizojenik dongu karsilastirilmasi Litik dongude viral DNA bakteri hucresi icinde ayri bir serbest yuzen molekul olarak bulunur ve konakci bakteri DNA sindan ayri olarak cogalir oysa lizojenik dongude viral DNA konakci genomuna entegre olur Bu litik ve lizojenik donguler arasindaki temel farktir Bununla beraber iki durumda da virus faj konak DNA mekanizmasini kullanarak replikasyon yapar AciklamaLitik dondu alti asama olarak ele alinir Bu alti asama atasment penetrasyon transkripsiyon biyosentez maturasyon ve liz Atasment faj DNA sini hucreye enjekte etmek icin kendisini konakci hucrenin yuzeyine baglar Penetrasyon faj konak hucreye DNA sini hucre zarindan penetre olarak enjekte eder Transkripsiyon konak hucrenin DNA si bozulur ve hucrenin metabolizmasi faj biyosentezini baslatmak uzere yonlendirilir Biyosentez faj DNA si hucre icinde cogalarak yeni faj DNA si ve proteinleri sentezler Maturasyon kopyalanan materyal tamamen olusturulmus viral fajlara her biri bir kafa bir kuyruk ve kuyruk liflerinden olusan bir araya gelir Liz hucre duvari veya zari yirtilir parcalanir ve bu surecte virus aciga cikarAtasment ve penetrasyonKonak hucreyi enfekte etmek icin oncelikle virus kendi nukleik asitini hucre zari ve varsa hucre duvari icinden enejkte etmek zorundadir Virus bunu ya hucrenin yuzeyindeki bir reseptore baglanarak ya da basit mekanik kuvvetle yapiyor Baglanma elektrostatik etkilesimlerden kaynaklanir ve pH tan ve iyonlarin varligindan etkilenir Virus daha sonra genetik materyalini tek veya cift sarmalli RNA veya DNA hucreye salar Bazi viruslerde bu genetik materyal daireseldir ve bakteriyal plazmiti taklit eder Bu evrede hucre enfekte olur ve immun sistem tarafindan hedef alinabilir Bu genellikle hucre yuzeyindeki reseptorler yardimiyla saglanir Bakteriyofaj enfeksiyonunun baslatilmasi sirasinda adsorpsiyondan baglanma viriondan konakci hucreye DNA ejeksiyonuna penetrasyon kadar meydana gelen olaylarin sirasi Molineux tarafindan gozden gecirildi Transkripsiyon ve biyosentezTranskripsiyon ve biyosentez asamalarinda virus hucrenin replikasyon ve translasyon mekanizmalarini ele gecirerek bunlari daha fazla virus yapmak icin kullanir Virusun nukleik asidi buyuk miktarlarda viral bilesenler olusturmak icin konakci hucrenin metabolik mekanizmasini kullanir DNA virusleri durumunda DNA kendisini haberci RNA mRNA molekullerine kopyalar ve bunlar daha sonra hucrenin ribozomlarini yonlendirmek icin kullanilir Cevrilecek ilk polipeptitlerden biri konagin DNA sini yok eder Retroviruslerde bir RNA zincirini enjekte eden ters transkriptaz adi verilen benzersiz bir enzim viral RNA yi DNA ya kopyalar ve bu daha sonra tekrar RNA ya kopyalanir Viral DNA kontrolu ele gecirdiginde konakci hucrenin mekanizmasini viral DNA yi proteini sentezlemeye tesvik eder ve cogalmaya baslar kaynak belirtilmeli lt span title This claim needs references to reliable sources October 2022 gt citation needed lt span gt Biyosentez ornegin T4 mRNA uretiminin uc fazinda ve ardindan protein uretimi fazinda duzenlenir Erken faz Enzimler konakcinin transkripsiyonel surecini RNA polimeraz ile degistirir Diger modifikasyonlarin yani sira T4 virusu bir anti sigma faktoru ureterek konagin sigma faktorunu degistirir boylece konakci promotorlari artik taninmaz ancak artik T4 orta proteinlerini tanir Protein sentezi icin Shine Dalgarno alt dizisi GAGG erken gen cevirisine hakimdir Orta faz Virus nukleik asidi virus turune bagli olarak DNA veya RNA lt span title This claim needs references to reliable sources October 2022 gt citation needed lt span gt Son faz Bas ve kuyruktakiler dahil yapisal proteinler kaynak belirtilmeli lt span title This claim needs references to reliable sources October 2022 gt citation needed lt span gt Maturasyon ve lizIlk enfeksiyondan yaklasik 25 dakika sonra yaklasik 200 yeni virion viral cisimcik olusur Yeterli virion olgunlasip biriktiginde hucrelerin duvarlarini cozmek icin ozel viral proteinler kullanilir Artik hucre duvari tarafindan sinirlandirilamayan yuksek ic ozmotik basinc su basinci nedeniyle hucre patlar yani parcalanmaya maruz kalir Bu yeni nesil viryonlari cevredeki ortama salar burada diger hucreleri enfekte edebilirler ve baska bir litik dongu baslar Konagin parcalanmasina neden olan faj litik veya virulan faj olarak adlandirilir Gen regulasyonu ve biyokimyaFaj genomunda litik dongulerin mi yoksa lizojenik dongulerin mi ortaya cikacagini duzenleyen uc gen sinifi vardir Birinci sinif dogrudan erken genler ikincisi gecikmis erken genler ve ucuncusu gec genlerdir Asagida E coli nin iyi calisilmis iliman faj lambdasi kastedilmektedir lt span title This claim needs references to reliable sources October 2022 gt citation needed lt span gt Ani erken genler Bu genler konakci RNA polimeraz tarafindan taninan promotorlerden eksprese edilir ve Cro cII ve N yi icerir CII ana lizojenik baskilayici gen olan cI nin ekspresyonunu uyaran bir transkripsiyon faktorudur oysa Cro cl icin bir baskilayicidir ifade Lizis lizojen karari temel olarak Cro ve CII arasindaki rekabetten etkilenir ve yeterli CI baskilayicinin yapilip yapilmadiginin belirlenmesiyle sonuclanir Eger oyleyse CI erken promotorleri baskilar ve enfeksiyon lizojenik yola yonlendirilir N gecikmis erken genlerin transkripsiyonu icin gerekli olan bir anti sonlandirma faktorudur Gecikmis erken genler Bunlar tum gec genlerin transkripsiyonundan sorumlu anti sonlandiriciyi kodlayan O ve P replikasyon genlerini ve ayrica Q yu icerir Gec genler Litik yol secilirse gec transkripsiyonun Q aracili acilmasi enfeksiyondan yaklasik 6 8 dakika sonra baslar Tek gec promoterden 25 ten fazla gen eksprese edilir ve bu da dort paralel biyosentetik yola yol acar Yollardan ucu viryonun uc bileseninin uretimi icindir DNA ile dolu kafa kuyruk ve yan kuyruk lifleri Virionlar bu bilesenlerden kendiliginden bir araya gelir ve ilk virion enfeksiyondan yaklasik 20 dakika sonra ortaya cikar Dorduncu yol lizis icindir Lambda 5 proteinleri lizise katilir S geninden holin ve antiholin R geninden endolizin ve Rz ve Rz1 genlerinden spanin proteinleri Yabani tip lambdada lizis yaklasik 50 dakikada meydana gelir ve yaklasik 100 tamamlanmis viryonu serbest birakir Parcalanmanin zamanlamasi holin ve antiholin proteinleri tarafindan belirlenir ve ikincisi birincisini inhibe eder Genel olarak holin proteini aniden mikron olcekli delikler olusturana kadar sitoplazmik membranda birikir ve bu da lizizi tetikler Endolizin R peptidoglikana saldirdigi periplazmaya salinir Spanin proteinleri Rz ve Rz1 sirasiyla sitoplazmik ve dis membranlarda birikir ve peptidoglikan agi boyunca periplazmayi kapsayan bir kompleks olusturur Endolizin peptidoglikani parcaladiginda spanin kompleksleri serbest kalir ve dis zarin bozulmasina neden olur Lambda enfeksiyonlarinda lizis icin peptidoglikanin endolizin tarafindan yok edilmesi ve dis zarin spanin kompleksi tarafindan parcalanmasi gerekir Lizis inhibisyonu T4 benzeri fajlar eger enfekte hucre baska bir T4 veya yakindan iliskili viryon tarafindan super enfeksiyona maruz kalirsa T4 holini inhibe eden rI ve rIII olmak uzere iki gene sahiptir Tekrarlanan super enfeksiyon T4 enfeksiyonunun saatlerce parcalanmadan devam etmesine neden olabilir ve bu da viryonlarin normalden 10 kat daha yuksek seviyelerde birikmesine yol acabilir Kaynakca Molineux Ian J January 2006 Fifty three years since Hershey and Chase much ado about pressure but which pressure is it Virology 344 1 221 229 doi 10 1016 j virol 2005 09 014 Ebola Lytic or Lysogenic Ebola Cases com 26 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 26 Ocak 2023 Martinko John M Ed 2006 Brock biology of microorganisms 11 Prentice Hall ISBN 978 0 13 144329 7 r eksik soyadi1 yardim Malys N 2012 Shine Dalgarno sequence of bacteriophage T4 GAGG prevails in early genes Molecular Biology Reports 39 1 33 9 doi 10 1007 s11033 011 0707 4 PMID 21533668 Gummalla Vimathi S Zhang Yujie Liao Yen Te Wu Vivian C H 21 Subat 2023 The Role of Temperate Phages in Bacterial Pathogenicity Microorganisms 11 3 541 doi 10 3390 microorganisms11030541 Tarih degerini gozden gecirin erisimtarihi yardim erisim tarihi kullanmak icin url gerekiyor yardim The Lytic Cycle of the T Even Bacteriophage nemetoadreviews com 10 Ocak 2018 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 9 Ocak 2018