Moleküler modelleme, moleküllerin davranışını modellemek veya taklit etmek için kullanılan teorik ve bilgisayarlı tüm yöntemleri kapsar. Bu yöntemler, küçük kimya sistemlerinden büyük biyolojik moleküllere ve malzeme gruplarına kadar değişen moleküler sistemleri incelemek için bilgisayarlı kimya, ilaç tasarımı, bilgisayarlı biyoloji ve malzeme bilimi alanlarında kullanılmaktadır. En basit hesaplamalar elle yapılabilir, ancak kaçınılmaz olarak makul büyüklükteki herhangi bir sistemin moleküler modellemesini bilgisayarların yapması gerekir. Moleküler modelleme yöntemlerinin ortak özelliği, moleküler sistemlerin atom düzeyinde tanımlanmasıdır. Bu, atomları en küçük bireysel birim olarak muamele edilmesini (moleküler mekanik yaklaşımı) içerebilir veya protonları ve nötronları kuarkları, kuarkları, gluonlarıyla beraber ve elektronları da fotonlarıyla beraber (kuantum kimyası yaklaşımı) açıkça modellemeyi içerebilir.
Uygulamalar
Moleküler modelleme yöntemleri artık inorganik, biyolojik ve polimerik sistemlerin yapısını, dinamiklerini, yüzey özelliklerini ve termodinamiğini araştırmak için rutin olarak kullanılmaktadır. Moleküler modelleme kullanılarak araştırılan biyolojik aktivite türleri arasında protein katlanması, enzim katalizi, protein stabilitesi, biyomoleküler fonksiyonla ilişkili konformasyonel değişiklikler ve protein, DNA ve membran komplekslerinin moleküler tanınması yer alır.
Notlar
- M. P. Allen, D. J. Tildesley, Computer simulation of liquids, 1989, Oxford University Press, .
- A. R. Leach, Molecular Modelling: Principles and Applications, 2001,
- D. Frenkel, B. Smit, Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications, 1996,
- D. C. Rapaport, The Art of Molecular Dynamics Simulation, 2004,
- R. J. Sadus, Molecular Simulation of Fluids: Theory, Algorithms and Object-Orientation, 2002,
- K.I.Ramachandran, G Deepa and Krishnan Namboori. P.K. Computational Chemistry and Molecular Modeling Principles and Applications 2008 [1]9 Ağustos 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde . Springer-Verlag GmbH
Dış bağlantılar
- Center for Molecular Modeling at the National Institutes of Health (NIH)9 Ekim 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (U.S. Government Agency)
- Molecular Simulation16 Haziran 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde ., details for the Molecular Simulation journal, ISSN 0892-7022 (print), ISSN 1029-0435 (online)
- The eCheminfo3 Ocak 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde . Network and Community of Practice in Informatics and Modeling
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Molekuler modelleme molekullerin davranisini modellemek veya taklit etmek icin kullanilan teorik ve bilgisayarli tum yontemleri kapsar Bu yontemler kucuk kimya sistemlerinden buyuk biyolojik molekullere ve malzeme gruplarina kadar degisen molekuler sistemleri incelemek icin bilgisayarli kimya ilac tasarimi bilgisayarli biyoloji ve malzeme bilimi alanlarinda kullanilmaktadir En basit hesaplamalar elle yapilabilir ancak kacinilmaz olarak makul buyuklukteki herhangi bir sistemin molekuler modellemesini bilgisayarlarin yapmasi gerekir Molekuler modelleme yontemlerinin ortak ozelligi molekuler sistemlerin atom duzeyinde tanimlanmasidir Bu atomlari en kucuk bireysel birim olarak muamele edilmesini molekuler mekanik yaklasimi icerebilir veya protonlari ve notronlari kuarklari kuarklari gluonlariyla beraber ve elektronlari da fotonlariyla beraber kuantum kimyasi yaklasimi acikca modellemeyi icerebilir Bir proteinin molekuler modeli ana atom zinciri dihedral acilarini barindirir Iyonik sivinin modellemesiUygulamalarMolekuler modelleme yontemleri artik inorganik biyolojik ve polimerik sistemlerin yapisini dinamiklerini yuzey ozelliklerini ve termodinamigini arastirmak icin rutin olarak kullanilmaktadir Molekuler modelleme kullanilarak arastirilan biyolojik aktivite turleri arasinda protein katlanmasi enzim katalizi protein stabilitesi biyomolekuler fonksiyonla iliskili konformasyonel degisiklikler ve protein DNA ve membran komplekslerinin molekuler taninmasi yer alir NotlarM P Allen D J Tildesley Computer simulation of liquids 1989 Oxford University Press 0 19 855645 4 A R Leach Molecular Modelling Principles and Applications 2001 0 582 38210 6 D Frenkel B Smit Understanding Molecular Simulation From Algorithms to Applications 1996 0 12 267370 0 D C Rapaport The Art of Molecular Dynamics Simulation 2004 0 521 82568 7 R J Sadus Molecular Simulation of Fluids Theory Algorithms and Object Orientation 2002 0 444 51082 6 K I Ramachandran G Deepa and Krishnan Namboori P K Computational Chemistry and Molecular Modeling Principles and Applications 2008 1 9 Agustos 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde 978 3 540 77302 3 Springer Verlag GmbHDis baglantilarCenter for Molecular Modeling at the National Institutes of Health NIH 9 Ekim 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde U S Government Agency Molecular Simulation16 Haziran 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde details for the Molecular Simulation journal ISSN 0892 7022 print ISSN 1029 0435 online The eCheminfo3 Ocak 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde Network and Community of Practice in Informatics and Modeling