Obelisk ilk olarak Ocak 2024 tarihli bir makale çıktısında tanımlanan bir tür viroid benzeri elementtir ve makalen

Obelisk, ilk olarak Ocak 2024 tarihli bir makale çıktısında tanımlanan bir tür “viroid benzeri elementtir” ve makalenin yazarları, bilgisayar destekli metatranskriptomik ile keşfedilen RNA dizilerinin başka hiçbir yaşam formunun genetik koduyla homolog olmaması nedeniyle “Obelisklerin kendi farklı filogenetik gruplarını oluşturduğunu” söylemektedir

Diğer organizmalarla ilişkileri bilinmediğinden, bunlar incertae sedis veya "esrarengiz taksonlar"ın bir örneğidir.

Dağılım ve patoloji

Streptococcus sanguinis'in x 4000 büyütülmesinde Gram Boyaması.

İnsan dışkı örneklerinde ve insan ağzından alınan bir bakteri türü olan Streptococcus sanguinis örneklerinin içinde obeliskler bulunmuştur. Bazı insan denekleri obeliskleri 300 günden fazla barındırdı. İlk çalışma, tüm kıtalarda yaşayan bireylerin dışkı örneklerinin yaklaşık yüzde 7'sinde ve tükürük örneklerinin yaklaşık yüzde 50'sinde obelisklerin varlığını gösterdi.

Obelisklerin insan sağlığı üzerindeki etkisi (eğer varsa) ve yaşam döngüleri, çoğalmalarının hangi faktörlere bağlı olduğu gibi konular belirlenmemiştir.

Genetik ve biyokimya

Obelisklerin özellikleri arasında yaklaşık 1000 baz çiftine sahip dairesel RNA genom düzenekleri ve tüm genomu kapsayan çubuk benzeri ikincil yapılar bulunmaktadır. Viroidlerin aksine, RNA'ları ön baskıda geçici olarak “oblinler” olarak adlandırılan proteinlere çevrilir. Burada listelenen iki protein Oblin-1 ve Oblin-2 olarak adlandırılmıştır.

İlk yapısal tahminler, Oblin-1'in metal iyonlarını bağlayabildiğini ve dolayısıyla hücre sinyalizasyonuna dahil olabileceğini söylüyor. Oblin-2, protein kompleksleri için tipik olan bir bağlanma bölgesine sahiptir ve bu nedenle konakçı hücresinin enzimlerine bağlanabilir.

Ad

Ön baskı şöyle diyor: "Güçlü bir şekilde tahmin edilen çubuk benzeri ikincil yapı nedeniyle, bu RNA grubunu Obelisk-alfa olarak adlandırıyoruz."... "1164 nt uzunluğunda, çubuk benzeri ikincil yapı dikkat çekiciydi..." (Dairesel montaj yapısına göre ikincil.)

Kaynakça

^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire (21 Ocak 2024), "Viroid-like colonists of human microbiomes", bioRxiv, doi:10.1101/2024.01.20.576352, (PMC) 10827157 $2, (PMID) 38293115 , Wikidata Q124389714 Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "Zheludev-preprint" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: )
^ ^a ^b ^c Sidik, Saima (29 Ocak 2024). . Nature. CiteSeerX live $2 |citeseerx= değerini kontrol edin (). doi:10.1038/d41586-024-00266-7. (PMID) 38291328. 30 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 31 Ocak 2024.
^ Pennisi, Elizabeth (26 Ocak 2024). . Science. CiteSeerX live $2 |citeseerx= değerini kontrol edin (). doi:10.1126/science.znxt3dk. 30 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 31 Ocak 2024.

[Zheludev-preprint-1] ^ ^a ^b ^c ^d ^e ^f Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire (21 Ocak 2024), "Viroid-like colonists of human microbiomes", bioRxiv, doi:10.1101/2024.01.20.576352, (PMC) 10827157 $2, (PMID) 38293115 , Wikidata Q124389714 Kaynak hatası: Geçersiz <ref> etiketi: "Zheludev-preprint" adı farklı içerikte birden fazla tanımlanmış (Bkz: )

[Sidik-2] Sidik, Saima (29 Ocak 2024). . Nature. CiteSeerX live $2 |citeseerx= değerini kontrol edin (). doi:10.1038/d41586-024-00266-7. (PMID) 38291328. 30 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 31 Ocak 2024.

[Pennisi-3] Pennisi, Elizabeth (26 Ocak 2024). . Science. CiteSeerX live $2 |citeseerx= değerini kontrol edin (). doi:10.1126/science.znxt3dk. 30 Ocak 2024 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 31 Ocak 2024.