Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Protein-protein etkileşimleri (PPE), iki veya daha fazla protein molekülü arasında kurulan yüksek spesifikliğe sahip fiziksel temaslardır. Hidrojen bağı, elektrostatik kuvvetler ve hidrojen bağı gibi etkileşimlerin yönlendirdiği biyokimyasal olaylardır.
Proteinler daha çok düzenleyici işlev gördüğünden nadiren kendi başlarına hareket ettikleri görülür. Bir hücredeki birçok moleküler süreç, kendi PPE'leri tarafından organize edilmiş sayısız proteinden meydana gelen moleküler makineler tarafından gerçekleştirilir. Bu fizyolojik etkileşimler, organizmanın yapısını oluşturuken anormal PPE'ler, Creutzfeldt–Jakob ve Alzheimer gibi protein agregasyonu temelli birçok hastalığın nedenidir.
PPE'ler çeşitli ve farklı bakış açılarıyla çalışılmıştır: biyokimya, kuantum kimyası, moleküler dinamikler, sinyal transdüksiyonu ve dahası. Tüm bu bilgi, büyük protein etkileşim ağlarının (metabolik veya genetik/epigenetik ağlara benzer şekilde) oluşturulmasını sağlar. Bu sayede hastalıkların biyokimyasal kaskadı ve moleküler etiyolojisi hakkındaki halihazırda bilinenler artacak.
Kaynakça
- ^ Titeca, Kevin; Lemmens, Irma; Tavernier, Jan; Eyckerman, Sven (29 Haziran 2018). "Discovering cellular protein-protein interactions: Technological strategies and opportunities". Mass Spectrometry Reviews. 38 (1). ss. 79-111. doi:10.1002/mas.21574. ISSN 0277-7037. (PMID) 29957823.
- ^ Herce HD, Deng W, Helma J, Leonhardt H, Cardoso MC (2013). "Visualization and targeted disruption of protein interactions in living cells". Nature Communications. Cilt 4. s. 2660. Bibcode:2013NatCo...4.2660H. doi:10.1038/ncomms3660. (PMC) 3826628 $2. (PMID) 24154492.
- ^ Isa, Nur Firdaus; Bensaude, Olivier; Murphy, Shona (5 Şubat 2022). "Amber Suppression Technology for Mapping Site-specific Viral-host Protein Interactions in Mammalian Cells". Bio-protocol. 12 (3). ss. e4315. doi:10.21769/bioprotoc.4315. (PMC) 8855090 $2. (PMID) 35284605. 22 Haziran 2022 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 11 Ocak 2024.
- ^ Mashaghi, A.; ve diğerleri. (2004). "Investigation of a protein complex network". European Physical Journal. 41 (1). ss. 113-121. arXiv:cond-mat/0304207 $2. Bibcode:2004EPJB...41..113M. doi:10.1140/epjb/e2004-00301-0.
Ek okuma
- Stark C, Breitkreutz BJ, Reguly T, Boucher L, Breitkreutz A, Tyers M (January 2006). "BioGRID: a general repository for interaction datasets". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue). ss. D535-9. doi:10.1093/nar/gkj109. (PMC) 1347471 $2. (PMID) 16381927.
- Peri S, Navarro JD, Kristiansen TZ, Amanchy R, Surendranath V, Muthusamy B, Gandhi TK, Chandrika KN, Deshpande N, Suresh S, Rashmi BP, Shanker K, Padma N, Niranjan V, Harsha HC, Talreja N, Vrushabendra BM, Ramya MA, Yatish AJ, Joy M, Shivashankar HN, Kavitha MP, Menezes M, Choudhury DR, Ghosh N, Saravana R, Chandran S, Mohan S, Jonnalagadda CK, Prasad CK, Kumar-Sinha C, Deshpande KS, Pandey A (January 2004). "Human protein reference database as a discovery resource for proteomics". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue). ss. D497-501. doi:10.1093/nar/gkh070. (PMC) 308804 $2. (PMID) 14681466.
- Hermjakob H, Montecchi-Palazzi L, Lewington C, Mudali S, Kerrien S, Orchard S, Vingron M, Roechert B, Roepstorff P, Valencia A, Margalit H, Armstrong J, Bairoch A, Cesareni G, Sherman D, Apweiler R (January 2004). "IntAct: an open source molecular interaction database". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue). ss. D452-5. doi:10.1093/nar/gkh052. (PMC) 308786 $2. (PMID) 14681455.
- Chatr-aryamontri A, Ceol A, Palazzi LM, Nardelli G, Schneider MV, Castagnoli L, Cesareni G (January 2007). "MINT: the Molecular INTeraction database". Nucleic Acids Research. 35 (Database issue). ss. D572-4. doi:10.1093/nar/gkl950. (PMC) 1751541 $2. (PMID) 17135203.
- Güldener U, Münsterkötter M, Oesterheld M, Pagel P, Ruepp A, Mewes HW, Stümpflen V (January 2006). "MPact: the MIPS protein interaction resource on yeast". Nucleic Acids Research. 34 (Database issue). ss. D436-41. doi:10.1093/nar/gkj003. (PMC) 1347366 $2. (PMID) 16381906.
- Pagel P, Kovac S, Oesterheld M, Brauner B, Dunger-Kaltenbach I, Frishman G, Montrone C, Mark P, Stümpflen V, Mewes HW, Ruepp A, Frishman D (March 2005). "The MIPS mammalian protein–protein interaction database". Bioinformatics. 21 (6). ss. 832-4. doi:10.1093/bioinformatics/bti115. (PMID) 15531608.
Dış bağlantılar
| Wikimedia Commons'ta Protein-protein etkileşimi ile ilgili ortam dosyaları bulunmaktadır. |
- Protein–Protein Interaction Databases
- Library of Modulators of Protein–Protein Interactions (PPI)
- Curlie'de Proteins and Enzymes (DMOZ tabanlı)
- Casado-Vela J, Matthiesen R, Sellés S, Naranjo JR (May 2013). "Protein–Protein Interactions: Gene Acronym Redundancies and Current Limitations Precluding Automated Data Integration". Proteomes. 1 (1). ss. 3-24. doi:10.3390/proteomes1010003. (PMC) 5314489 $2. (PMID) 28250396.
- Robin V, Bodein A, Scott-Boyer MP, Leclercq M, Périn O, Droit A. Overview of methods for characterization and visualization of a protein–protein interaction network in a multi-omics integration context. Front Mol Biosci. 2022 Sep 8;9:962799. doi:10.3389/fmolb.2022.962799. PMID 36158572; PMCID: PMC9494275.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Protein protein etkilesimleri PPE iki veya daha fazla protein molekulu arasinda kurulan yuksek spesifiklige sahip fiziksel temaslardir Hidrojen bagi elektrostatik kuvvetler ve hidrojen bagi gibi etkilesimlerin yonlendirdigi biyokimyasal olaylardir At nalina benzeyen ribonukleaz inhibitoru tel seklinde gosterilen ribonukleaz proteiniyle bir protein protein etkilesimi gerceklestirmis Iki protein arasindaki temaslar renkli yamalarla gosterilmistir Proteinler daha cok duzenleyici islev gordugunden nadiren kendi baslarina hareket ettikleri gorulur Bir hucredeki bircok molekuler surec kendi PPE leri tarafindan organize edilmis sayisiz proteinden meydana gelen molekuler makineler tarafindan gerceklestirilir Bu fizyolojik etkilesimler organizmanin yapisini olusturuken anormal PPE ler Creutzfeldt Jakob ve Alzheimer gibi protein agregasyonu temelli bircok hastaligin nedenidir PPE ler cesitli ve farkli bakis acilariyla calisilmistir biyokimya kuantum kimyasi molekuler dinamikler sinyal transduksiyonu ve dahasi Tum bu bilgi buyuk protein etkilesim aglarinin metabolik veya genetik epigenetik aglara benzer sekilde olusturulmasini saglar Bu sayede hastaliklarin biyokimyasal kaskadi ve molekuler etiyolojisi hakkindaki halihazirda bilinenler artacak Kaynakca Titeca Kevin Lemmens Irma Tavernier Jan Eyckerman Sven 29 Haziran 2018 Discovering cellular protein protein interactions Technological strategies and opportunities Mass Spectrometry Reviews 38 1 ss 79 111 doi 10 1002 mas 21574 ISSN 0277 7037 PMID 29957823 Herce HD Deng W Helma J Leonhardt H Cardoso MC 2013 Visualization and targeted disruption of protein interactions in living cells Nature Communications Cilt 4 s 2660 Bibcode 2013NatCo 4 2660H doi 10 1038 ncomms3660 PMC 3826628 2 PMID 24154492 Isa Nur Firdaus Bensaude Olivier Murphy Shona 5 Subat 2022 Amber Suppression Technology for Mapping Site specific Viral host Protein Interactions in Mammalian Cells Bio protocol 12 3 ss e4315 doi 10 21769 bioprotoc 4315 PMC 8855090 2 PMID 35284605 22 Haziran 2022 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 11 Ocak 2024 Mashaghi A ve digerleri 2004 Investigation of a protein complex network European Physical Journal 41 1 ss 113 121 arXiv cond mat 0304207 2 Bibcode 2004EPJB 41 113M doi 10 1140 epjb e2004 00301 0 Ek okumaStark C Breitkreutz BJ Reguly T Boucher L Breitkreutz A Tyers M January 2006 BioGRID a general repository for interaction datasets Nucleic Acids Research 34 Database issue ss D535 9 doi 10 1093 nar gkj109 PMC 1347471 2 PMID 16381927 Peri S Navarro JD Kristiansen TZ Amanchy R Surendranath V Muthusamy B Gandhi TK Chandrika KN Deshpande N Suresh S Rashmi BP Shanker K Padma N Niranjan V Harsha HC Talreja N Vrushabendra BM Ramya MA Yatish AJ Joy M Shivashankar HN Kavitha MP Menezes M Choudhury DR Ghosh N Saravana R Chandran S Mohan S Jonnalagadda CK Prasad CK Kumar Sinha C Deshpande KS Pandey A January 2004 Human protein reference database as a discovery resource for proteomics Nucleic Acids Research 32 Database issue ss D497 501 doi 10 1093 nar gkh070 PMC 308804 2 PMID 14681466 Hermjakob H Montecchi Palazzi L Lewington C Mudali S Kerrien S Orchard S Vingron M Roechert B Roepstorff P Valencia A Margalit H Armstrong J Bairoch A Cesareni G Sherman D Apweiler R January 2004 IntAct an open source molecular interaction database Nucleic Acids Research 32 Database issue ss D452 5 doi 10 1093 nar gkh052 PMC 308786 2 PMID 14681455 Chatr aryamontri A Ceol A Palazzi LM Nardelli G Schneider MV Castagnoli L Cesareni G January 2007 MINT the Molecular INTeraction database Nucleic Acids Research 35 Database issue ss D572 4 doi 10 1093 nar gkl950 PMC 1751541 2 PMID 17135203 Guldener U Munsterkotter M Oesterheld M Pagel P Ruepp A Mewes HW Stumpflen V January 2006 MPact the MIPS protein interaction resource on yeast Nucleic Acids Research 34 Database issue ss D436 41 doi 10 1093 nar gkj003 PMC 1347366 2 PMID 16381906 Pagel P Kovac S Oesterheld M Brauner B Dunger Kaltenbach I Frishman G Montrone C Mark P Stumpflen V Mewes HW Ruepp A Frishman D March 2005 The MIPS mammalian protein protein interaction database Bioinformatics 21 6 ss 832 4 doi 10 1093 bioinformatics bti115 PMID 15531608 Dis baglantilarWikimedia Commons ta Protein protein etkilesimi ile ilgili ortam dosyalari bulunmaktadir Protein Protein Interaction Databases Library of Modulators of Protein Protein Interactions PPI Curlie de Proteins and Enzymes DMOZ tabanli Casado Vela J Matthiesen R Selles S Naranjo JR May 2013 Protein Protein Interactions Gene Acronym Redundancies and Current Limitations Precluding Automated Data Integration Proteomes 1 1 ss 3 24 doi 10 3390 proteomes1010003 PMC 5314489 2 PMID 28250396 Robin V Bodein A Scott Boyer MP Leclercq M Perin O Droit A Overview of methods for characterization and visualization of a protein protein interaction network in a multi omics integration context Front Mol Biosci 2022 Sep 8 9 962799 doi 10 3389 fmolb 2022 962799 PMID 36158572 PMCID PMC9494275