Arkeogenetik, çeşitli moleküler genetik yöntemleri ve DNA kaynaklarını kullanarak antik DNA'yı inceleyen bir bilim dalıdır. Bu genetik analizler insan, hayvan ve bitki örnekleri üzerinde uygulanabilir. Antik DNA, kemikler, yumurta kabukları ve insan ile hayvan örneklerinde yapay olarak korunmuş dokular dahil olmak üzere çeşitli fosilleşmiş örneklerden elde edilebilir. Bitkilerde ise antik DNA, tohumlardan, dokulardan ve bazı durumlarda dışkıdan elde edilebilir. Arkeogenetik, eski nüfus grubu göçlerinin, evcilleştirmenin ve bitki ile hayvan evriminin genetik kanıtlarını sunar. Modern genetik popülasyonların DNA'sı ile antik DNA karşılaştırılabilir.
Arkeogenetik, adını "eski" anlamına gelen Yunanca arkhaios ve "kalıtım bilimi" anlamına gelen genetik teriminden alır. Arkeogenetik terimi, arkeolog Colin Renfrew tarafından tasarlanmıştır.
Metodlar
Antik DNA'yı kontamine etmekten kaçınmak için fosiller eldivenle tutulur ve bulunduktan hemen sonra -20 °C'de muhafaza edilir. Fosil numunesinin, diğer DNA analizleri için kullanılmamış bir laboratuvarda analiz edilmesini sağlamak, kontaminasyonu da önleyebilir. Kemikler toz oluncaya kadar öğütülür ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) işleminden önce bir çözelti ile muamele edilir.DNA amplifikasyonu için örnekler fosil kemikler olmak zorunda değildir. Korunmuş deri örnekleri de bazı durumlarda kullanılabilir.
Silika bazlı DNA ekstraksiyonu, arkeolojik kemik numunelerinden DNA elde etmek için bir saflaştırma adımı olarak kullanılan bir yöntemdir. Bu işlem, DNA'yı bağlamak ve PCR amplifikasyonunu inhibe eden fosil içindeki bileşenleri ayırmak için bir araç olarak silika kullanarak çalışır. Bununla birlikte, silisin kendisi de güçlü bir PCR inhibitörüdür, bu nedenle silika'nın ekstraksiyondan sonra DNA'dan ayrılmasını sağlamak için dikkatli önlemler alınmalıdır.
Polimeraz zincir reaksiyonu, sıklıkla antik DNA'yı çoğaltmak için kullanılan bir işlemdir. Üç ana adımı vardır: denatürasyon, tavlama ve uzatma. Denatürasyon, DNA'yı yüksek sıcaklıklarda iki tek zincire ayırır. Tavlama, Taq polimerazın DNA'ya bağlanmasına izin veren primer ipliklerinin DNA'nın tekli şeritlerine tutturulmasını içerir. Uzatma numuneye Taq polimeraz eklendiğinde meydana gelir ve iki tek şeridin iki tam çift şeride dönüştürmesi için baz çiftlerinin eşleşmesinden oluşur. Bu işlem birçok kez tekrarlanır ve genellikle antik DNA için kullanıldığında daha yüksek sayılarda tekrarlanması gerekmektedir.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ Bouwman, Abigail; Rühli, Frank (2016). "Archaeogenetics in evolutionary medicine". Journal of Molecular Medicine. 94 (9). ss. 971-77. doi:10.1007/s00109-016-1438-8. (PMID) 27289479.
- ^ Soares, Pedro; Achilli, Alessandro; Semino, Ornella; Davies, William; Macaulay, Vincent; Bandelt, Hans-Jürgen; Torroni, Antonio; Richards, Martin B. (23 Şubat 2010). "The Archaeogenetics of Europe". Current Biology (İngilizce). 20 (4). ss. R174-83. doi:10.1016/j.cub.2009.11.054. ISSN 0960-9822. (PMID) 20178764.
- ^ Csákyová, Veronika; Szécsényi-Nagy, Anna; Csősz, Aranka; Nagy, Melinda; Fusek, Gabriel; Langó, Péter; Bauer, Miroslav; Mende, Balázs Gusztáv; Makovický, Pavol (10 Mart 2016). "Maternal Genetic Composition of a Medieval Population from a Hungarian-Slavic Contact Zone in Central Europe". PLoS ONE. 11 (3). ss. e0151206. Bibcode:2016PLoSO..1151206C. doi:10.1371/journal.pone.0151206. ISSN 1932-6203. (PMC) 4786151 $2. (PMID) 26963389.
- ^ "Online Etymology Dictionary". www.etymonline.com (İngilizce). 8 Ağustos 2017 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Ağustos 2017.
- ^ Sokal, Robert R. (Temmuz 2001). "Archaeogenetics: DNA and the Population Prehistory of Europe". American Journal of Human Genetics. 69 (1). ss. 243-44. doi:10.1086/321274. ISSN 0002-9297. (PMC) 1226043 $2.
- ^ Brothwell, Don R. (1981). Digging Up Bones: The Excavation, Treatment, and Study of Human Skeletal Remains. Cornell University Press. ss. 2-3. ISBN .
- ^ a b Scholz, Michael; Bachmann, Lutz; Nicholson, Graeme J.; Bachmann, Jutta; Giddings, Ian; Rüschoff-Thale, Barbara; Czarnetzki, Alfred; Pusch, Carsten M. (1 Haziran 2000). "Genomic Differentiation of Neanderthals and Anatomically Modern Man Allows a Fossil–DNA-Based Classification of Morphologically Indistinguishable Hominid Bones". The American Journal of Human Genetics. 66 (6). ss. 1927-32. doi:10.1086/302949. (PMC) 1378053 $2. (PMID) 10788336.
- ^ Yang, H.; Golenberg, E.M.; Shoshani, J. (Haziran 1997). "Proboscidean DNA from museum and fossil specimens: an assessment of ancient DNA extraction and amplification techniques" (PDF). Biochemical Genetics. 35 (5–6). ss. 165-79. doi:10.1023/A:1021902125382. hdl:2027.42/44162. ISSN 0006-2928. (PMID) 9332711.
- ^ Höss, M; Pääbo, S (11 Ağustos 1993). "DNA extraction from Pleistocene bones by a silica-based purification method". Nucleic Acids Research. 21 (16). ss. 3913-3914. doi:10.1093/nar/21.16.3913. ISSN 0305-1048. (PMC) 309938 $2. (PMID) 8396242.
- ^ Yang, Dongya Y.; Eng, Barry; Waye, John S.; Dudar, J. Christopher; Saunders, Shelley R. (1 Nisan 1998). "Improved DNA extraction from ancient bones using silica-based spin columns". American Journal of Physical Anthropology (İngilizce). 105 (4). ss. 539-43. doi:10.1002/(sici)1096-8644(199804)105:4<539::aid-ajpa10>3.0.co;2-1. ISSN 1096-8644. (PMID) 9584894.
- ^ ; Clegg, J.B. (22 Nisan 1991). "Isolation and Characterization of DNA from Archaeological Bone". Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences (İngilizce). 244 (1309). ss. 45-50. doi:10.1098/rspb.1991.0049. ISSN 0962-8452. (PMID) 1677195.
- ^ Bouwman, Abigail; Rühli, Frank (1 Eylül 2016). "Archaeogenetics in evolutionary medicine". Journal of Molecular Medicine (İngilizce). 94 (9). ss. 971-77. doi:10.1007/s00109-016-1438-8. ISSN 0946-2716. (PMID) 27289479.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Arkeogenetik cesitli molekuler genetik yontemleri ve DNA kaynaklarini kullanarak antik DNA yi inceleyen bir bilim dalidir Bu genetik analizler insan hayvan ve bitki ornekleri uzerinde uygulanabilir Antik DNA kemikler yumurta kabuklari ve insan ile hayvan orneklerinde yapay olarak korunmus dokular dahil olmak uzere cesitli fosillesmis orneklerden elde edilebilir Bitkilerde ise antik DNA tohumlardan dokulardan ve bazi durumlarda diskidan elde edilebilir Arkeogenetik eski nufus grubu goclerinin evcillestirmenin ve bitki ile hayvan evriminin genetik kanitlarini sunar Modern genetik populasyonlarin DNA si ile antik DNA karsilastirilabilir 4 000 senelik Antik Misirli bir rahibin karacigerinden elde edilmis antik DNA Arkeogenetik adini eski anlamina gelen Yunanca arkhaios ve kalitim bilimi anlamina gelen genetik teriminden alir Arkeogenetik terimi arkeolog Colin Renfrew tarafindan tasarlanmistir MetodlarAntik DNA yi kontamine etmekten kacinmak icin fosiller eldivenle tutulur ve bulunduktan hemen sonra 20 C de muhafaza edilir Fosil numunesinin diger DNA analizleri icin kullanilmamis bir laboratuvarda analiz edilmesini saglamak kontaminasyonu da onleyebilir Kemikler toz oluncaya kadar ogutulur ve polimeraz zincir reaksiyonu PCR isleminden once bir cozelti ile muamele edilir DNA amplifikasyonu icin ornekler fosil kemikler olmak zorunda degildir Korunmus deri ornekleri de bazi durumlarda kullanilabilir Silika bazli DNA ekstraksiyonu arkeolojik kemik numunelerinden DNA elde etmek icin bir saflastirma adimi olarak kullanilan bir yontemdir Bu islem DNA yi baglamak ve PCR amplifikasyonunu inhibe eden fosil icindeki bilesenleri ayirmak icin bir arac olarak silika kullanarak calisir Bununla birlikte silisin kendisi de guclu bir PCR inhibitorudur bu nedenle silika nin ekstraksiyondan sonra DNA dan ayrilmasini saglamak icin dikkatli onlemler alinmalidir Polimeraz zincir reaksiyonu siklikla antik DNA yi cogaltmak icin kullanilan bir islemdir Uc ana adimi vardir denaturasyon tavlama ve uzatma Denaturasyon DNA yi yuksek sicakliklarda iki tek zincire ayirir Tavlama Taq polimerazin DNA ya baglanmasina izin veren primer ipliklerinin DNA nin tekli seritlerine tutturulmasini icerir Uzatma numuneye Taq polimeraz eklendiginde meydana gelir ve iki tek seridin iki tam cift seride donusturmesi icin baz ciftlerinin eslesmesinden olusur Bu islem bircok kez tekrarlanir ve genellikle antik DNA icin kullanildiginda daha yuksek sayilarda tekrarlanmasi gerekmektedir Ayrica bakinizDNA dizileme Genetik soybilim HomininaeKaynakca Bouwman Abigail Ruhli Frank 2016 Archaeogenetics in evolutionary medicine Journal of Molecular Medicine 94 9 ss 971 77 doi 10 1007 s00109 016 1438 8 PMID 27289479 Soares Pedro Achilli Alessandro Semino Ornella Davies William Macaulay Vincent Bandelt Hans Jurgen Torroni Antonio Richards Martin B 23 Subat 2010 The Archaeogenetics of Europe Current Biology Ingilizce 20 4 ss R174 83 doi 10 1016 j cub 2009 11 054 ISSN 0960 9822 PMID 20178764 Csakyova Veronika Szecsenyi Nagy Anna Csosz Aranka Nagy Melinda Fusek Gabriel Lango Peter Bauer Miroslav Mende Balazs Gusztav Makovicky Pavol 10 Mart 2016 Maternal Genetic Composition of a Medieval Population from a Hungarian Slavic Contact Zone in Central Europe PLoS ONE 11 3 ss e0151206 Bibcode 2016PLoSO 1151206C doi 10 1371 journal pone 0151206 ISSN 1932 6203 PMC 4786151 2 PMID 26963389 Online Etymology Dictionary www etymonline com Ingilizce 8 Agustos 2017 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Agustos 2017 Sokal Robert R Temmuz 2001 Archaeogenetics DNA and the Population Prehistory of Europe American Journal of Human Genetics 69 1 ss 243 44 doi 10 1086 321274 ISSN 0002 9297 PMC 1226043 2 Brothwell Don R 1981 Digging Up Bones The Excavation Treatment and Study of Human Skeletal Remains Cornell University Press ss 2 3 ISBN 978 0801498756 a b Scholz Michael Bachmann Lutz Nicholson Graeme J Bachmann Jutta Giddings Ian Ruschoff Thale Barbara Czarnetzki Alfred Pusch Carsten M 1 Haziran 2000 Genomic Differentiation of Neanderthals and Anatomically Modern Man Allows a Fossil DNA Based Classification of Morphologically Indistinguishable Hominid Bones The American Journal of Human Genetics 66 6 ss 1927 32 doi 10 1086 302949 PMC 1378053 2 PMID 10788336 Yang H Golenberg E M Shoshani J Haziran 1997 Proboscidean DNA from museum and fossil specimens an assessment of ancient DNA extraction and amplification techniques PDF Biochemical Genetics 35 5 6 ss 165 79 doi 10 1023 A 1021902125382 hdl 2027 42 44162 ISSN 0006 2928 PMID 9332711 Hoss M Paabo S 11 Agustos 1993 DNA extraction from Pleistocene bones by a silica based purification method Nucleic Acids Research 21 16 ss 3913 3914 doi 10 1093 nar 21 16 3913 ISSN 0305 1048 PMC 309938 2 PMID 8396242 Yang Dongya Y Eng Barry Waye John S Dudar J Christopher Saunders Shelley R 1 Nisan 1998 Improved DNA extraction from ancient bones using silica based spin columns American Journal of Physical Anthropology Ingilizce 105 4 ss 539 43 doi 10 1002 sici 1096 8644 199804 105 4 lt 539 aid ajpa10 gt 3 0 co 2 1 ISSN 1096 8644 PMID 9584894 Clegg J B 22 Nisan 1991 Isolation and Characterization of DNA from Archaeological Bone Proceedings of the Royal Society of London B Biological Sciences Ingilizce 244 1309 ss 45 50 doi 10 1098 rspb 1991 0049 ISSN 0962 8452 PMID 1677195 Bouwman Abigail Ruhli Frank 1 Eylul 2016 Archaeogenetics in evolutionary medicine Journal of Molecular Medicine Ingilizce 94 9 ss 971 77 doi 10 1007 s00109 016 1438 8 ISSN 0946 2716 PMID 27289479