Excavata, Ökaryot üst alemine ait eski bir tek hücreli organizma üst grubudur. İlk olarak 1999'da Simpson ve Patterson tarafından önerilmiş ve 2002'de Thomas Cavalier-Smith tarafından resmi bir takson olarak tanıtılmıştır. Çeşitli serbest yaşayan ve simbiyotik formlar içerir ve Giardia ve Trichomonas gibi bazı önemli insan parazitlerini de içinde barındırır. Daha önce artık modası geçmiş Protista krallığına dahil olduğu düşünülüyordu. Kamçılı yapılarına göre sınıflandırıldılar ve en temel kamçılı soy olarak kabul edildiler.
Excavata | |||||
---|---|---|---|---|---|
Biyolojik sınıflandırma (parafiletik olarak geçerliliğini yitirmiş) | |||||
| |||||
Filum ve sınıflar |
Filogenomik analizler, Excavata'nın polifiletik olduğunu ve tek bir doğal grup oluşturmadığını gösterir. Bu nedenle Excavata, hepsi yakından ilişkili olmayan üç gruba ayrılmıştır: Discobid, Metamonad ve Malawimonad. Euglenozoa dışında hepsi fotosentetik değildir.
Özellikler
Çoğu excavate tek hücreli, heterotrofik flagellatlardır. Sadece Euglenozoa fotosentetiktir. Bazılarında (özellikle anaerobik bağırsak parazitlerinde), mitokondri büyük ölçüde azalmıştır. Bazılarında "klasik" mitokondri yoktur ve "amitokondriat" olarak adlandırılırlar ancak çoğu büyük ölçüde değiştirilmiş formda (örneğin bir hidrojenozom veya mitozom) bir mitokondriyal organel içerir. Mitokondrili olanlar arasında mitokondriyal cristae ; tübüler, diskoidal veya bazı durumlarda laminer olabilir. Çoğunda iki, dört veya daha fazla flagella bulunur. Birçoğunun, mikrotübüller tarafından desteklenen, karakteristik bir ince yapıya sahip göze çarpan bir ventral besleme oluğu vardır. Organizmalara adını veren bu oluğun "kazılmış" görünümüdür. Bununla birlikte bu özelliklere sahip olmayan çeşitli gruplar, genetik kanıtlara (öncelikle moleküler dizilerin filogenetik ağaçları) dayalı olarak excavate olarak kabul edilebilir.
Acrasidae balçık küfleri, sınırlı çok hücrelilik sergileyen tek excavatedir. Diğer hücresel cıvık mantarlar gibi, hayatlarının çoğunu tek hücreler olarak yaşarlar ancak bazen daha büyük kümeler halinde birleşirler.
Önerilen grup
Excavate ilişkileri her zaman belirsizdi, bu da onların monofiletik bir grup olmadıklarını gösteriyor. Malawimonad'lar genellikle diğer Excavata ile dallanmaz.
Excavatelerin birden çok grubu içerdiği düşünülüyordu:
Krallık/Süperfilum | Dahil olan taksonlar | Temsili cins (örnekler) | Tanım |
---|---|---|---|
Diskoba veya JEH veya Eozoa | Tsukubea | Tsukubamonas | |
Öglenozoa | Euglena,tripanosoma | Birçok önemli parazit, plastidli büyük bir grup (kloroplastlar) | |
heterolobosea (Perkolozoa) | Naegleria, Acrasis | Çoğu kamçılı ve amoeboid formlar arasında değişir | |
Jakobea | Jakoba, Reclinomonas | Serbest yaşayan, bazen çok gen açısından zengin mitokondriyal genomlara sahip loricate kamçılılar | |
Metamonada veya POD | Preaksostyla | Oksimonadlar, Trimastix | Serbest yaşayan (Trimastix, Paratrimastix ) veya böceklerin arka bağırsaklarında yaşayan amitokondriat kamçılılar |
Fornicata | Giardia, Carpediemonas | Amitokondriat, çoğunlukla ortak yaşamlar ve hayvanların parazitleri. | |
Parabasalya | Trichomonas | Amitokondriat flagellatlar, genellikle böceklerin bağırsak kommensalleri. Bazı insan patojenleri. | |
Neolouka | Malawimonadida | Malavimonas |
Soyoluş
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Galeri
- Euglena (Euglenozoa: )
- (Euglenozoa: )
- sp. (Euglenozoa: Kinetoplastida)
- sp. (Percolozoa)
- sp. (Percolozoa)
- Naegleria sp. (: )
- (Percolozoa: Heterolobosea)
- Jakobids ()
-
- sp., left (: : )
- sp. (Metamonada: Fornicata: )
Kaynakça
- ^ Hampl (2009). "Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups"". Proceedings of the National Academy of Sciences. 106 (10): 3859-3864. doi:10.1073/pnas.0807880106. (PMC) 2656170 $2. (PMID) 19237557.
- ^ "Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups"". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (10): 3859-64. 2009. doi:10.1073/pnas.0807880106. (PMC) 2656170 $2. (PMID) 19237557.
- ^ Simpson, Ag (2006). "Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes". Molecular Biology and Evolution. 23 (3): 615-25. doi:10.1093/molbev/msj068. (PMID) 16308337.
- ^ a b Simpson (Dec 1999). "The ultrastructure of Carpediemonas membranifera (Eukaryota) with reference to the 'excavate hypothesis'". European Journal of Protistology. 35 (4): 353-370. doi:10.1016/S0932-4739(99)80044-3.
- ^ a b c "Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota)". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (6): 1759-1777. 1 Kasım 2003. doi:10.1099/ijs.0.02578-0. (PMID) 14657103. Birden fazla yazar-name-list parameters kullanıldı (); Yazar
|ad1=
eksik|soyadı1=
() - ^ a b The Ancestor's Tale. 2016. ISBN .
- ^ a b c Cavalier-Smith (2002). "The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (2): 297-354. doi:10.1099/00207713-52-2-297. (PMID) 11931142.
- ^ Dawson (2013). "Alternative cytoskeletal landscapes: cytoskeletal novelty and evolution in basal excavate protists". Current Opinion in Cell Biology. 25 (1): 134-141. doi:10.1016/j.ceb.2012.11.005. (PMC) 4927265 $2. (PMID) 23312067.
- ^ "Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes". The Journal of Eukaryotic Microbiology. 66 (1): 4-119. January 2019. doi:10.1111/jeu.12691. (PMC) 6492006 $2. (PMID) 30257078.
- ^ Brown (1 Şubat 2018). "Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group". Genome Biology and Evolution. 10 (2): 427-433. doi:10.1093/gbe/evy014. (PMC) 5793813 $2. (PMID) 29360967.
- ^ Heiss (4 Nisan 2018). "Combined morphological and phylogenomic re-examination of malawimonads, a critical taxon for inferring the evolutionary history of eukaryotes". Royal Society Open Science. 5 (4): 171707. doi:10.1098/rsos.171707. (PMC) 5936906 $2. (PMID) 29765641.
- ^ Keeling (19 Ağustos 2019). "Progress towards the Tree of Eukaryotes". Current Biology. 29 (16): R808-R817. doi:10.1016/j.cub.2019.07.031. (PMID) 31430481.
- ^ Laura Wegener Parfrey; Erika Barbero; Elyse Lasser; Micah Dunthorn; Debashish Bhattacharya; David J. Patterson; Laura A. Katz (Aralık 2006), "Evaluating support for the current classification of eukaryotic diversity", PLOS Genetik, 2 (12), doi:10.1371/JOURNAL.PGEN.0020220, (PMC) 1713255 $2, (PMID) 17194223, Wikidata Q21090155
- ^ Tice (2021). "PhyloFisher: A phylogenomic package for resolving eukaryotic relationships". PLOS Biology. 19 (8): e3001365. doi:10.1371/journal.pbio.3001365. (PMC) 8345874 $2. (PMID) 34358228.
- ^ Kaynak hatası: Geçersiz
<ref>
etiketi;Eme 2023
isimli refler için metin sağlanmadı (Bkz: )
Dış bağlantılar
- Açık Hayat Ağacı 6 Nisan 2023 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- taksonomikon 6 Şubat 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Hayat Ağacı Ökaryotlar 29 Ocak 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Hayat Ağacı: Jakobida 7 Şubat 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Hayat Ağacı: Fornicata 7 Şubat 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Excavata Okaryot ust alemine ait eski bir tek hucreli organizma ust grubudur Ilk olarak 1999 da Simpson ve Patterson tarafindan onerilmis ve 2002 de Thomas Cavalier Smith tarafindan resmi bir takson olarak tanitilmistir Cesitli serbest yasayan ve simbiyotik formlar icerir ve Giardia ve Trichomonas gibi bazi onemli insan parazitlerini de icinde barindirir Daha once artik modasi gecmis Protista kralligina dahil oldugu dusunuluyordu Kamcili yapilarina gore siniflandirildilar ve en temel kamcili soy olarak kabul edildiler ExcavataGiardia lambliaBiyolojik siniflandirma parafiletik olarak gecerliligini yitirmis Ust alem Eukaryota sirasiz Excavata Cavalier Smith 2002Filum ve siniflarUc tip excavata hucresi Ust Jakobida 1 cekirdek 2 on kamci 3 karin arka kamci 4 karin besleme olugu Orta Euglenozoa 1 cekirdekli 2 kamcili cep hazne 3 sirt on kamci 4 karin arka kamci 5 sitostom besleme aparati Altta Metamonada 1 on kamci 2 parabazal govde 3 dalgali zar 4 arka kamci 5 cekirdek 6 aksostil Filogenomik analizler Excavata nin polifiletik oldugunu ve tek bir dogal grup olusturmadigini gosterir Bu nedenle Excavata hepsi yakindan iliskili olmayan uc gruba ayrilmistir Discobid Metamonad ve Malawimonad Euglenozoa disinda hepsi fotosentetik degildir OzelliklerCogu excavate tek hucreli heterotrofik flagellatlardir Sadece Euglenozoa fotosentetiktir Bazilarinda ozellikle anaerobik bagirsak parazitlerinde mitokondri buyuk olcude azalmistir Bazilarinda klasik mitokondri yoktur ve amitokondriat olarak adlandirilirlar ancak cogu buyuk olcude degistirilmis formda ornegin bir hidrojenozom veya mitozom bir mitokondriyal organel icerir Mitokondrili olanlar arasinda mitokondriyal cristae tubuler diskoidal veya bazi durumlarda laminer olabilir Cogunda iki dort veya daha fazla flagella bulunur Bircogunun mikrotubuller tarafindan desteklenen karakteristik bir ince yapiya sahip goze carpan bir ventral besleme olugu vardir Organizmalara adini veren bu olugun kazilmis gorunumudur Bununla birlikte bu ozelliklere sahip olmayan cesitli gruplar genetik kanitlara oncelikle molekuler dizilerin filogenetik agaclari dayali olarak excavate olarak kabul edilebilir Acrasidae balcik kufleri sinirli cok hucrelilik sergileyen tek excavatedir Diger hucresel civik mantarlar gibi hayatlarinin cogunu tek hucreler olarak yasarlar ancak bazen daha buyuk kumeler halinde birlesirler Onerilen grupExcavate iliskileri her zaman belirsizdi bu da onlarin monofiletik bir grup olmadiklarini gosteriyor Malawimonad lar genellikle diger Excavata ile dallanmaz Excavatelerin birden cok grubu icerdigi dusunuluyordu Krallik Superfilum Dahil olan taksonlar Temsili cins ornekler TanimDiskoba veya JEH veya Eozoa Tsukubea TsukubamonasOglenozoa Euglena tripanosoma Bircok onemli parazit plastidli buyuk bir grup kloroplastlar heterolobosea Perkolozoa Naegleria Acrasis Cogu kamcili ve amoeboid formlar arasinda degisirJakobea Jakoba Reclinomonas Serbest yasayan bazen cok gen acisindan zengin mitokondriyal genomlara sahip loricate kamcililarMetamonada veya POD Preaksostyla Oksimonadlar Trimastix Serbest yasayan Trimastix Paratrimastix veya boceklerin arka bagirsaklarinda yasayan amitokondriat kamcililarFornicata Giardia Carpediemonas Amitokondriat cogunlukla ortak yasamlar ve hayvanlarin parazitleri Parabasalya Trichomonas Amitokondriat flagellatlar genellikle boceklerin bagirsak kommensalleri Bazi insan patojenleri Neolouka Malawimonadida MalavimonasSoyolus Eukaryota Euglenozoa and allies Amorphea inc animals fungi Archaeplastida inc plants alphaproteobacterium GaleriEuglena Euglenozoa Euglenozoa sp Euglenozoa Kinetoplastida sp Percolozoa sp Percolozoa Naegleria sp Percolozoa Heterolobosea Jakobids Trichomonas vaginalis sp left sp Metamonada Fornicata Kaynakca Hampl 2009 Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic supergroups Proceedings of the National Academy of Sciences 106 10 3859 3864 doi 10 1073 pnas 0807880106 PMC 2656170 2 PMID 19237557 Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic supergroups Proc Natl Acad Sci U S A 106 10 3859 64 2009 doi 10 1073 pnas 0807880106 PMC 2656170 2 PMID 19237557 Simpson Ag 2006 Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of primitive eukaryotes Molecular Biology and Evolution 23 3 615 25 doi 10 1093 molbev msj068 PMID 16308337 a b Simpson Dec 1999 The ultrastructure of Carpediemonas membranifera Eukaryota with reference to the excavate hypothesis European Journal of Protistology 35 4 353 370 doi 10 1016 S0932 4739 99 80044 3 a b c Cytoskeletal organization phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata Eukaryota International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53 6 1759 1777 1 Kasim 2003 doi 10 1099 ijs 0 02578 0 PMID 14657103 Birden fazla yazar name list parameters kullanildi yardim Yazar ad1 eksik soyadi1 yardim a b The Ancestor s Tale 2016 ISBN 978 0544859937 a b c Cavalier Smith 2002 The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52 2 297 354 doi 10 1099 00207713 52 2 297 PMID 11931142 Dawson 2013 Alternative cytoskeletal landscapes cytoskeletal novelty and evolution in basal excavate protists Current Opinion in Cell Biology 25 1 134 141 doi 10 1016 j ceb 2012 11 005 PMC 4927265 2 PMID 23312067 Revisions to the Classification Nomenclature and Diversity of Eukaryotes The Journal of Eukaryotic Microbiology 66 1 4 119 January 2019 doi 10 1111 jeu 12691 PMC 6492006 2 PMID 30257078 KB1 bakim goster yazarlar link Brown 1 Subat 2018 Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super Group Genome Biology and Evolution 10 2 427 433 doi 10 1093 gbe evy014 PMC 5793813 2 PMID 29360967 Heiss 4 Nisan 2018 Combined morphological and phylogenomic re examination of malawimonads a critical taxon for inferring the evolutionary history of eukaryotes Royal Society Open Science 5 4 171707 doi 10 1098 rsos 171707 PMC 5936906 2 PMID 29765641 Keeling 19 Agustos 2019 Progress towards the Tree of Eukaryotes Current Biology 29 16 R808 R817 doi 10 1016 j cub 2019 07 031 PMID 31430481 Laura Wegener Parfrey Erika Barbero Elyse Lasser Micah Dunthorn Debashish Bhattacharya David J Patterson Laura A Katz Aralik 2006 Evaluating support for the current classification of eukaryotic diversity PLOS Genetik 2 12 doi 10 1371 JOURNAL PGEN 0020220 PMC 1713255 2 PMID 17194223 Wikidata Q21090155 Tice 2021 PhyloFisher A phylogenomic package for resolving eukaryotic relationships PLOS Biology 19 8 e3001365 doi 10 1371 journal pbio 3001365 PMC 8345874 2 PMID 34358228 Kaynak hatasi Gecersiz lt ref gt etiketi Eme 2023 isimli refler icin metin saglanmadi Bkz Kaynak gosterme Dis baglantilarAcik Hayat Agaci 6 Nisan 2023 tarihinde Wayback Machine sitesinde taksonomikon 6 Subat 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde Hayat Agaci Okaryotlar 29 Ocak 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde Hayat Agaci Jakobida 7 Subat 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde Hayat Agaci Fornicata 7 Subat 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde