Oligonükleotitler, genetik test, araştırma ve adli tıpta geniş bir uygulama alanına sahip olan kısa DNA veya RNA molekülleri, oligomerleridir. Laboratuvarda katı faz kimyasal sentezi ile yaygın olarak yapılan bu küçük nükleik asit bitleri, herhangi bir kullanıcı tanımlı diziye sahip tek sarmallı moleküller olarak üretilebilir ve bu nedenle yapay gen sentezi polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) DNA dizileme moleküler klonlama ve moleküler problar için hayati öneme sahiptir. Doğada oligonükleotitler genellikle gen ekspresyonunun düzenlenmesinde (örneğin mikroRNA) işlev gören küçük RNA molekülleri olarak bulunur veya daha büyük nükleik asit moleküllerinin parçalanmasından türetilen bozunma ara maddeleri olarak bulunur.
Oligonükleotitler, tüm molekülü oluşturan nükleotit artıkları dizisi ile karakterize edilir. Oligonükleotitin uzunluğu genellikle "-mer" ile gösterilir (Yunanca meros'tan "kısım"). Örneğin, altı nükleotitden (nt) oluşan bir oligonükleotit bir heksamer iken 25 nt'den biri genellikle "25-mer" olarak adlandırılır. Oligonükleotitler, daha yüksek sıralı çiftler veya daha az sıklıkla melezler oluşturmak için kendi tamamlayıcı oligonükleotitleri DNA veya RNA'ya sekansa özgü bir şekilde kolayca bağlanır. Bu temel özellik, oligonükleotitlerin spesifik DNA veya RNA sekanslarını tespit etmek için problar olarak kullanılması için bir temel görevi görür. Oligonükleotitleri kullanan prosedürlerin örnekleri arasında DNA mikro dizileri Southern blot ASO analizi floresan in situ hibridizasyon (FISH) PCR ve yapay genlerin sentezi yer alır.
Oligonükleotitler, farklı farmakolojik etkiler elde etmek için omurgada veya 2’ şeker konumunda modifiye edilebilen 2'-deoksiribonükleotitlerden (oligodeoksiribonükleotitler) oluşur. Bu modifikasyonlar, oligonükleotitlere yeni özellikler kazandırır ve onları antisens terapisinde anahtar bir unsur haline getirir.
Sentezi
Oligonükleotitler, doğal veya kimyasal olarak modifiye edilmiş nükleositlerin yapı blokları korumalı fosforamiditleri veya daha az ölçüde nükleozidik olmayan bileşikler kullanılarak kimyasal olarak sentezlenir. Oligonükleotit zincir düzeneği, "sentetik döngü" olarak adlandırılan rutin bir prosedürü takip ederek 3 'ila 5' yönünde ilerler. Tek bir sentetik döngünün tamamlanması, büyüyen zincire bir nükleotit kalıntısının eklenmesi ile sonuçlanır. Her sentetik aşamadan% 100'den az verim ve yan reaksiyonların meydana gelmesi, işlemin verimliliğinin pratik sınırlarını belirler. Genel olarak oligonükleotit dizileri genellikle kısadır (13-25 nükleotit uzunluğunda). Sentetik oligonükleotitlerin maksimum uzunluğu, 200 nükleotit kalıntısını hemen hemen geçmez. Ürünleri istenen sekansla izole etmek için HPLC ve diğer yöntemler kullanılabilir.
Kimyasal modifikasyonlar
Kimyasal olarak kararlı kısa oligonükleotitlerin oluşturulması, ASO tedavilerinin geliştirilmesindeki en erken zorluktu. Doğal olarak oluşan oligonükleotitler, nükleotitleri parçalayan ve her hücre tipinde bol miktarda bulunan bir enzim olan nükleazlar tarafından kolayca parçalanır. Kısa oligonükleotit sekansları ayrıca, in vivo bozunmalarına katkıda bulunan zayıf iç bağlanma afinitelerine sahiptir.
Omurga modifikasyonları
nükleotitlerin nükleosit organotiofosfat (PS) analogları, oligonükleotitlere bazı yararlı özellikler verir. PS omurgalarının nükleotitlere verdiği temel yararlı özellikler, her nükleotitin diastereomer tanımlanması ve oligonükleotit sentezinde faydalı olan fosforotioat nükleotitleri içeren reaksiyonları kolayca takip etme kabiliyetidir. Oligonükleotitlere yapılan PS omurga modifikasyonları, onları enzimler tarafından istenmeyen bozunmaya karşı korur. nükleotit omurgasının modifiye edilmesi, çoğu nükleotitde görece kolaylık ve doğrulukla elde edilebildiği için yaygın olarak kullanılmaktadır.
Şeker halkası modifikasyonları
Oligonükleotitlerin tıbbi uygulamaları için yararlı olan başka bir modifikasyon, 2'şeker modifikasyonlarıdır. 2'pozisyonundaki şekerin modifiye edilmesi, oligonükleotitlerin spesifik olarak antisens oligonükleotit terapilerinde hedef bağlanma yeteneklerini geliştirerek oligonükleotitlerin etkinliğini arttırır. Ayrıca spesifik olmayan protein bağlanmasını azaltarak spesifik proteinleri hedeflemenin doğruluğunu artırır. En yaygın kullanılan modifikasyonlardan ikisi 2'-O-metil ve 2'-O-metoksietildir.
Antisens oligonükleotitler
Antisens oligonükleotitler, seçilen bir diziye tamamlayıcı olan tek DNA veya RNA zincirleridir. Antisens RNA durumunda, hibridizasyon adı verilen bir işlemle onlara bağlanarak belirli haberci RNA zincirlerinin protein translasyonunu önlerler. Antisens oligonükleotitler, spesifik bir tamamlayıcı (kodlayan veya kodlamayan) RNA'yı hedeflemek için kullanılabilir. Bağlanma meydana gelirse, bu hibrit, RNaz H enzimi tarafından parçalanabilir. RNaz H, RNA'yı hidrolize eden bir enzimdir ve bir antisens oligonükleotit uygulamasında kullanıldığında, mRNA ifadesinin% 80-95 oranında aşağı regülasyonu ile sonuçlanır.
Morfolino antisens oligonükleotitlerinin, artık gelişimsel biyolojide standart bir teknik olan ve değiştirilmiş gen ekspresyonunu ve gen fonksiyonunu incelemek için kullanılan omurgalılarda gen nakavtları için kullanımı, ilk olarak Janet Heasman tarafından Xenopus kullanılarak geliştirildi. FDA onaylı Morpholino ilaçları arasında eteplirsen ve golodirsen bulunur. Antisens oligonükleotitler, hücre hatlarında influenza virüsü replikasyonunu inhibe etmek için de kullanılmıştır.
Tek bir mutant proteinin sonucu olan nörodejeneratif hastalıklar, yüksek seçicilikle çok spesifik RNA dizilerini hedefleme ve modifiye etme yeteneklerinden dolayı antisens oligonükleotit terapileri için iyi hedeflerdir. Huntington hastalığı, Alzheimer hastalığı, Parkinson hastalığı ve amyotrofik lateral skleroz (ALS) dahil olmak üzere birçok genetik hastalık, yanlış RNA dizilerine neden olan ve toksik fizyolojik etkiye sahip yanlış çevrilmiş proteinlerle sonuçlanan DNA değişiklikleriyle ilişkilendirilmiştir.
Analitik teknikler
Kromatografi
Alkilamidler, kromatografik sabit fazlar olarak kullanılabilir. Bu fazlar, oligonükleotitlerin ayrılması için araştırılmıştır.
Kütle spektrometrisi
MALDI kütle spektrometresinde oligonükleotit analizi için bir matris olarak 5-metoksisalisilik asit ve spermin karışımı kullanılabilir.
DNA mikrodizisi
DNA mikro dizileri, oligonükleotitlerin yararlı bir analitik uygulamasıdır. Standart cDNA mikrodizileriyle karşılaştırıldığında, oligonükleotit bazlı mikrodiziler, hibridizasyona göre daha kontrollü özgüllüğe ve alternatif olarak eklenmiş veya poliadenile dizilerin varlığını ve yaygınlığını ölçme kabiliyetine sahiptir. DNA mikrodizilerinin bir alt tipi, oligonükleotitlerin yüksek yoğunlukta bağlandığı substratlar (naylon, cam vb.) Olarak tanımlanabilir. Yaşam bilimleri içinde DNA mikrodizilerinin bir dizi uygulaması vardır.
Kaynakça
- ^ Yang J, Stolee JA, Jiang H, Xiao L, Kiesman WF, Antia FD, Fillon YA, Ng A, Shi X (Ekim 2018). "Solid-Phase Synthesis of Phosphorothioate Oligonucleotides Using Sulfurization Byproducts for in Situ Capping". The Journal of Organic Chemistry. 83 (19): 11577-11585. doi:10.1021/acs.joc.8b01553. (PMID) 30179468.
- ^ Weiss, B., ed. (1997). Antisense Oligodeoxynucleotides and Antisense RNA : Novel Pharmacological and Therapeutic Agents. Boca Raton, Florida: CRC Press
- ^ Weiss B, Davidkova G, Zhou LW (1999). "Antisense RNA gene therapy for studying and modulating biological processes". Cellular and Molecular Life Sciences. 55 (3): 334-58. doi:10.1007/s000180050296. (PMID) 10228554.
- ^ a b c Dias N, Stein CA (Mart 2002). "Antisense oligonucleotides: basic concepts and mechanisms". Molecular Cancer Therapeutics. 1 (5): 347-55. (PMID) 12489851. 5 Ağustos 2020 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 16 Kasım 2020.
- ^ Frazier KS (Ocak 2015). "Antisense oligonucleotide therapies: the promise and the challenges from a toxicologic pathologist's perspective". Toxicologic Pathology. 43 (1): 78-89. doi:10.1177/0192623314551840. (PMID) 25385330.
- ^ a b DeVos SL, Miller TM (Temmuz 2013). "Antisense oligonucleotides: treating neurodegeneration at the level of RNA". Neurotherapeutics. 10 (3): 486-97. doi:10.1007/s13311-013-0194-5. (PMC) 3701770 $2. (PMID) 23686823.
- ^ a b Eckstein F (Nisan 2000). "Phosphorothioate oligodeoxynucleotides: what is their origin and what is unique about them?". Antisense & Nucleic Acid Drug Development. 10 (2): 117-21. doi:10.1089/oli.1.2000.10.117. (PMID) 10805163.
- ^ Stein CA, Subasinghe C, Shinozuka K, Cohen JS (Nisan 1988). "Physicochemical properties of phosphorothioate oligodeoxynucleotides". Nucleic Acids Research. 16 (8): 3209-21. doi:10.1093/nar/16.8.3209. (PMC) 336489 $2. (PMID) 2836790.
- ^ a b Crooke ST (Nisan 2017). "Molecular Mechanisms of Antisense Oligonucleotides". Nucleic Acid Therapeutics. 27 (2): 70-77. doi:10.1089/nat.2016.0656. (PMC) 5372764 $2. (PMID) 28080221.
- ^ Heasman J, Kofron M, Wylie C (Haziran 2000). "Beta-catenin signaling activity dissected in the early Xenopus embryo: a novel antisense approach". Developmental Biology. 222 (1): 124-34. doi:10.1006/dbio.2000.9720. (PMID) 10885751.
- ^ Kumar P, Kumar B, Rajput R, Saxena L, Banerjea AC, Khanna M (Kasım 2013). "Cross-protective effect of antisense oligonucleotide developed against the common 3' NCR of influenza A virus genome". Molecular Biotechnology. 55 (3): 203-11. doi:10.1007/s12033-013-9670-8. (PMID) 23729285.
- ^ Kumar B, Khanna M, Kumar P, Sood V, Vyas R, Banerjea AC (Mayıs 2012). "Nucleic acid-mediated cleavage of M1 gene of influenza A virus is significantly augmented by antisense molecules targeted to hybridize close to the cleavage site". Molecular Biotechnology. 51 (1): 27-36. doi:10.1007/s12033-011-9437-z. (PMID) 21744034.
- ^ Smith RA, Miller TM, Yamanaka K, Monia BP, Condon TP, Hung G, Lobsiger CS, Ward CM, McAlonis-Downes M, Wei H, Wancewicz EV, Bennett CF, Cleveland DW (Ağustos 2006). "Antisense oligonucleotide therapy for neurodegenerative disease". The Journal of Clinical Investigation. 116 (8): 2290-6. doi:10.1172/JCI25424 . (PMC) 1518790 $2. (PMID) 16878173.
- ^ Buszewski B, Kasturi P, Gilpin RK, Gangoda ME, Jaroniec M (Ağustos 1994). "Chromatographic and related studies of alkylamide phases". Chromatographia. 39 (3–4): 155-61. doi:10.1007/BF02274494.
- ^ Buszewski B, Safaei Z, Studzińska S (Ocak 2015). "Analysis of oligonucleotides by liquid chromatography with alkylamide stationary phase". Open Chemistry. 13 (1). doi:10.1515/chem-2015-0141 .
- ^ Distler AM, Allison J (Nisan 2001). "5-Methoxysalicylic acid and spermine: a new matrix for the matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry analysis of oligonucleotides". Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 12 (4): 456-62. doi:10.1016/S1044-0305(01)00212-4. (PMID) 11322192.
- ^ Relógio A, Schwager C, Richter A, Ansorge W, Valcárcel J (Haziran 2002). "Optimization of oligonucleotide-based DNA microarrays". Nucleic Acids Research. 30 (11): e51. doi:10.1093/nar/30.11.e51. (PMC) 117213 $2. (PMID) 12034852.
- ^ Gong P, Harbers GM, Grainger DW (Nisan 2006). "Multi-technique comparison of immobilized and hybridized oligonucleotide surface density on commercial amine-reactive microarray slides". Analytical Chemistry. 78 (7): 2342-51. doi:10.1021/ac051812m. (PMID) 16579618.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Oligonukleotitler genetik test arastirma ve adli tipta genis bir uygulama alanina sahip olan kisa DNA veya RNA molekulleri oligomerleridir Laboratuvarda kati faz kimyasal sentezi ile yaygin olarak yapilan bu kucuk nukleik asit bitleri herhangi bir kullanici tanimli diziye sahip tek sarmalli molekuller olarak uretilebilir ve bu nedenle yapay gen sentezi polimeraz zincir reaksiyonu PCR DNA dizileme molekuler klonlama ve molekuler problar icin hayati oneme sahiptir Dogada oligonukleotitler genellikle gen ekspresyonunun duzenlenmesinde ornegin mikroRNA islev goren kucuk RNA molekulleri olarak bulunur veya daha buyuk nukleik asit molekullerinin parcalanmasindan turetilen bozunma ara maddeleri olarak bulunur Oligonukleotitler tum molekulu olusturan nukleotit artiklari dizisi ile karakterize edilir Oligonukleotitin uzunlugu genellikle mer ile gosterilir Yunanca meros tan kisim Ornegin alti nukleotitden nt olusan bir oligonukleotit bir heksamer iken 25 nt den biri genellikle 25 mer olarak adlandirilir Oligonukleotitler daha yuksek sirali ciftler veya daha az siklikla melezler olusturmak icin kendi tamamlayici oligonukleotitleri DNA veya RNA ya sekansa ozgu bir sekilde kolayca baglanir Bu temel ozellik oligonukleotitlerin spesifik DNA veya RNA sekanslarini tespit etmek icin problar olarak kullanilmasi icin bir temel gorevi gorur Oligonukleotitleri kullanan prosedurlerin ornekleri arasinda DNA mikro dizileri Southern blot ASO analizi floresan in situ hibridizasyon FISH PCR ve yapay genlerin sentezi yer alir Oligonukleotitler farkli farmakolojik etkiler elde etmek icin omurgada veya 2 seker konumunda modifiye edilebilen 2 deoksiribonukleotitlerden oligodeoksiribonukleotitler olusur Bu modifikasyonlar oligonukleotitlere yeni ozellikler kazandirir ve onlari antisens terapisinde anahtar bir unsur haline getirir SenteziOligonukleotitler dogal veya kimyasal olarak modifiye edilmis nukleositlerin yapi bloklari korumali fosforamiditleri veya daha az olcude nukleozidik olmayan bilesikler kullanilarak kimyasal olarak sentezlenir Oligonukleotit zincir duzenegi sentetik dongu olarak adlandirilan rutin bir proseduru takip ederek 3 ila 5 yonunde ilerler Tek bir sentetik dongunun tamamlanmasi buyuyen zincire bir nukleotit kalintisinin eklenmesi ile sonuclanir Her sentetik asamadan 100 den az verim ve yan reaksiyonlarin meydana gelmesi islemin verimliliginin pratik sinirlarini belirler Genel olarak oligonukleotit dizileri genellikle kisadir 13 25 nukleotit uzunlugunda Sentetik oligonukleotitlerin maksimum uzunlugu 200 nukleotit kalintisini hemen hemen gecmez Urunleri istenen sekansla izole etmek icin HPLC ve diger yontemler kullanilabilir Kimyasal modifikasyonlarKimyasal olarak kararli kisa oligonukleotitlerin olusturulmasi ASO tedavilerinin gelistirilmesindeki en erken zorluktu Dogal olarak olusan oligonukleotitler nukleotitleri parcalayan ve her hucre tipinde bol miktarda bulunan bir enzim olan nukleazlar tarafindan kolayca parcalanir Kisa oligonukleotit sekanslari ayrica in vivo bozunmalarina katkida bulunan zayif ic baglanma afinitelerine sahiptir Omurga modifikasyonlari nukleotitlerin nukleosit organotiofosfat PS analoglari oligonukleotitlere bazi yararli ozellikler verir PS omurgalarinin nukleotitlere verdigi temel yararli ozellikler her nukleotitin diastereomer tanimlanmasi ve oligonukleotit sentezinde faydali olan fosforotioat nukleotitleri iceren reaksiyonlari kolayca takip etme kabiliyetidir Oligonukleotitlere yapilan PS omurga modifikasyonlari onlari enzimler tarafindan istenmeyen bozunmaya karsi korur nukleotit omurgasinin modifiye edilmesi cogu nukleotitde gorece kolaylik ve dogrulukla elde edilebildigi icin yaygin olarak kullanilmaktadir Seker halkasi modifikasyonlari Oligonukleotitlerin tibbi uygulamalari icin yararli olan baska bir modifikasyon 2 seker modifikasyonlaridir 2 pozisyonundaki sekerin modifiye edilmesi oligonukleotitlerin spesifik olarak antisens oligonukleotit terapilerinde hedef baglanma yeteneklerini gelistirerek oligonukleotitlerin etkinligini arttirir Ayrica spesifik olmayan protein baglanmasini azaltarak spesifik proteinleri hedeflemenin dogrulugunu artirir En yaygin kullanilan modifikasyonlardan ikisi 2 O metil ve 2 O metoksietildir Antisens oligonukleotitlerAntisens oligonukleotitler secilen bir diziye tamamlayici olan tek DNA veya RNA zincirleridir Antisens RNA durumunda hibridizasyon adi verilen bir islemle onlara baglanarak belirli haberci RNA zincirlerinin protein translasyonunu onlerler Antisens oligonukleotitler spesifik bir tamamlayici kodlayan veya kodlamayan RNA yi hedeflemek icin kullanilabilir Baglanma meydana gelirse bu hibrit RNaz H enzimi tarafindan parcalanabilir RNaz H RNA yi hidrolize eden bir enzimdir ve bir antisens oligonukleotit uygulamasinda kullanildiginda mRNA ifadesinin 80 95 oraninda asagi regulasyonu ile sonuclanir Morfolino antisens oligonukleotitlerinin artik gelisimsel biyolojide standart bir teknik olan ve degistirilmis gen ekspresyonunu ve gen fonksiyonunu incelemek icin kullanilan omurgalilarda gen nakavtlari icin kullanimi ilk olarak Janet Heasman tarafindan Xenopus kullanilarak gelistirildi FDA onayli Morpholino ilaclari arasinda eteplirsen ve golodirsen bulunur Antisens oligonukleotitler hucre hatlarinda influenza virusu replikasyonunu inhibe etmek icin de kullanilmistir Tek bir mutant proteinin sonucu olan norodejeneratif hastaliklar yuksek secicilikle cok spesifik RNA dizilerini hedefleme ve modifiye etme yeteneklerinden dolayi antisens oligonukleotit terapileri icin iyi hedeflerdir Huntington hastaligi Alzheimer hastaligi Parkinson hastaligi ve amyotrofik lateral skleroz ALS dahil olmak uzere bircok genetik hastalik yanlis RNA dizilerine neden olan ve toksik fizyolojik etkiye sahip yanlis cevrilmis proteinlerle sonuclanan DNA degisiklikleriyle iliskilendirilmistir Analitik tekniklerKromatografi Alkilamidler kromatografik sabit fazlar olarak kullanilabilir Bu fazlar oligonukleotitlerin ayrilmasi icin arastirilmistir Kutle spektrometrisi MALDI kutle spektrometresinde oligonukleotit analizi icin bir matris olarak 5 metoksisalisilik asit ve spermin karisimi kullanilabilir DNA mikrodizisi DNA mikro dizileri oligonukleotitlerin yararli bir analitik uygulamasidir Standart cDNA mikrodizileriyle karsilastirildiginda oligonukleotit bazli mikrodiziler hibridizasyona gore daha kontrollu ozgulluge ve alternatif olarak eklenmis veya poliadenile dizilerin varligini ve yayginligini olcme kabiliyetine sahiptir DNA mikrodizilerinin bir alt tipi oligonukleotitlerin yuksek yogunlukta baglandigi substratlar naylon cam vb Olarak tanimlanabilir Yasam bilimleri icinde DNA mikrodizilerinin bir dizi uygulamasi vardir Kaynakca Yang J Stolee JA Jiang H Xiao L Kiesman WF Antia FD Fillon YA Ng A Shi X Ekim 2018 Solid Phase Synthesis of Phosphorothioate Oligonucleotides Using Sulfurization Byproducts for in Situ Capping The Journal of Organic Chemistry 83 19 11577 11585 doi 10 1021 acs joc 8b01553 PMID 30179468 Weiss B ed 1997 Antisense Oligodeoxynucleotides and Antisense RNA Novel Pharmacological and Therapeutic Agents Boca Raton Florida CRC Press Weiss B Davidkova G Zhou LW 1999 Antisense RNA gene therapy for studying and modulating biological processes Cellular and Molecular Life Sciences 55 3 334 58 doi 10 1007 s000180050296 PMID 10228554 a b c Dias N Stein CA Mart 2002 Antisense oligonucleotides basic concepts and mechanisms Molecular Cancer Therapeutics 1 5 347 55 PMID 12489851 5 Agustos 2020 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 16 Kasim 2020 Frazier KS Ocak 2015 Antisense oligonucleotide therapies the promise and the challenges from a toxicologic pathologist s perspective Toxicologic Pathology 43 1 78 89 doi 10 1177 0192623314551840 PMID 25385330 a b DeVos SL Miller TM Temmuz 2013 Antisense oligonucleotides treating neurodegeneration at the level of RNA Neurotherapeutics 10 3 486 97 doi 10 1007 s13311 013 0194 5 PMC 3701770 2 PMID 23686823 a b Eckstein F Nisan 2000 Phosphorothioate oligodeoxynucleotides what is their origin and what is unique about them Antisense amp Nucleic Acid Drug Development 10 2 117 21 doi 10 1089 oli 1 2000 10 117 PMID 10805163 Stein CA Subasinghe C Shinozuka K Cohen JS Nisan 1988 Physicochemical properties of phosphorothioate oligodeoxynucleotides Nucleic Acids Research 16 8 3209 21 doi 10 1093 nar 16 8 3209 PMC 336489 2 PMID 2836790 a b Crooke ST Nisan 2017 Molecular Mechanisms of Antisense Oligonucleotides Nucleic Acid Therapeutics 27 2 70 77 doi 10 1089 nat 2016 0656 PMC 5372764 2 PMID 28080221 Heasman J Kofron M Wylie C Haziran 2000 Beta catenin signaling activity dissected in the early Xenopus embryo a novel antisense approach Developmental Biology 222 1 124 34 doi 10 1006 dbio 2000 9720 PMID 10885751 Kumar P Kumar B Rajput R Saxena L Banerjea AC Khanna M Kasim 2013 Cross protective effect of antisense oligonucleotide developed against the common 3 NCR of influenza A virus genome Molecular Biotechnology 55 3 203 11 doi 10 1007 s12033 013 9670 8 PMID 23729285 Kumar B Khanna M Kumar P Sood V Vyas R Banerjea AC Mayis 2012 Nucleic acid mediated cleavage of M1 gene of influenza A virus is significantly augmented by antisense molecules targeted to hybridize close to the cleavage site Molecular Biotechnology 51 1 27 36 doi 10 1007 s12033 011 9437 z PMID 21744034 Smith RA Miller TM Yamanaka K Monia BP Condon TP Hung G Lobsiger CS Ward CM McAlonis Downes M Wei H Wancewicz EV Bennett CF Cleveland DW Agustos 2006 Antisense oligonucleotide therapy for neurodegenerative disease The Journal of Clinical Investigation 116 8 2290 6 doi 10 1172 JCI25424 PMC 1518790 2 PMID 16878173 Buszewski B Kasturi P Gilpin RK Gangoda ME Jaroniec M Agustos 1994 Chromatographic and related studies of alkylamide phases Chromatographia 39 3 4 155 61 doi 10 1007 BF02274494 Buszewski B Safaei Z Studzinska S Ocak 2015 Analysis of oligonucleotides by liquid chromatography with alkylamide stationary phase Open Chemistry 13 1 doi 10 1515 chem 2015 0141 Distler AM Allison J Nisan 2001 5 Methoxysalicylic acid and spermine a new matrix for the matrix assisted laser desorption ionization mass spectrometry analysis of oligonucleotides Journal of the American Society for Mass Spectrometry 12 4 456 62 doi 10 1016 S1044 0305 01 00212 4 PMID 11322192 Relogio A Schwager C Richter A Ansorge W Valcarcel J Haziran 2002 Optimization of oligonucleotide based DNA microarrays Nucleic Acids Research 30 11 e51 doi 10 1093 nar 30 11 e51 PMC 117213 2 PMID 12034852 Gong P Harbers GM Grainger DW Nisan 2006 Multi technique comparison of immobilized and hybridized oligonucleotide surface density on commercial amine reactive microarray slides Analytical Chemistry 78 7 2342 51 doi 10 1021 ac051812m PMID 16579618