Moleküler modelleme alanında, yanaştırma, bir molekülün ikinci bir moleküle kararlı bir kompleks oluşturmak için birbirine bağlandığında bağlandığında tercih ettiği oryantasyonu tahmin eden bir yöntemdir. Tercih edilen oryantasyon bilgisi iki molekül arasındaki birleşme veya bağlanma afinitesini tahmin etmek için kullanılabilir.
Proteinler, peptitler, nükleik asitler, karbonhidratlar ve lipitler gibi biyolojik açıdan alakalı moleküller arasındaki ilişkiler sinyal iletiminde merkezi bir rol oynar. Ayrıca, etkileşen iki partnerin nispi oryantasyonu üretilen sinyalin türünü etkileyebilir (örn. Agonizm ve antagonizm). Bu nedenle yanaştırma, üretilen sinyalin hem kuvvetini hem de tipini tahmin etmek için yararlıdır.
Moleküler yanaştırma, küçük moleküllü ligandların uygun hedef bağlanma bölgesine bağlanma-konformasyonunu tahmin etme kabiliyeti nedeniyle yapıya dayalı ilaç tasarımında en sık kullanılan yöntemlerden biridir. Bağlanma davranışının karakterizasyonu, ilaçların rasyonel tasarımında ve temel biyokimyasal süreçlerin aydınlatılmasında önemli bir rol oynamaktadır.
Kaynakça
Dış bağlantılar
- Bikadi Z, Kovacs S, Demko L, Hazai E. . Virtua Drug Ltd. 20 Kasım 2008 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Temmuz 2008.
Internet service that calculates the site, geometry and energy of small molecules interacting with proteins
- Malinauskas T. . 4 Haziran 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 15 Temmuz 2008.
- Docking@GRID31 Aralık 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde . Project of Conformational Sampling and Docking on Grids : one aim is to deploy some intrinsic distributed docking algorithms on computational Grids, download
- - Directory of computational drug design tools.
- with MOE (Molecular Operating Environment)
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Molekuler modelleme alaninda yanastirma bir molekulun ikinci bir molekule kararli bir kompleks olusturmak icin birbirine baglandiginda baglandiginda tercih ettigi oryantasyonu tahmin eden bir yontemdir Tercih edilen oryantasyon bilgisi iki molekul arasindaki birlesme veya baglanma afinitesini tahmin etmek icin kullanilabilir Kararli bir kompleks ureten bir protein hedefine siyah kucuk bir molekul ligandinin yesil yanastirilmasinin sematik gosterimi source source source source source source source source Kucuk bir molekulun yesil beta 2 adrenerjik G protein bagli reseptorunun PDB 3SN6 kristal yapisina yanastirilmasi Proteinler peptitler nukleik asitler karbonhidratlar ve lipitler gibi biyolojik acidan alakali molekuller arasindaki iliskiler sinyal iletiminde merkezi bir rol oynar Ayrica etkilesen iki partnerin nispi oryantasyonu uretilen sinyalin turunu etkileyebilir orn Agonizm ve antagonizm Bu nedenle yanastirma uretilen sinyalin hem kuvvetini hem de tipini tahmin etmek icin yararlidir Molekuler yanastirma kucuk molekullu ligandlarin uygun hedef baglanma bolgesine baglanma konformasyonunu tahmin etme kabiliyeti nedeniyle yapiya dayali ilac tasariminda en sik kullanilan yontemlerden biridir Baglanma davranisinin karakterizasyonu ilaclarin rasyonel tasariminda ve temel biyokimyasal sureclerin aydinlatilmasinda onemli bir rol oynamaktadir KaynakcaDis baglantilarBikadi Z Kovacs S Demko L Hazai E Virtua Drug Ltd 20 Kasim 2008 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 15 Temmuz 2008 Internet service that calculates the site geometry and energy of small molecules interacting with proteins Malinauskas T 4 Haziran 2011 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 15 Temmuz 2008 Docking GRID31 Aralik 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde Project of Conformational Sampling and Docking on Grids one aim is to deploy some intrinsic distributed docking algorithms on computational Grids download Directory of computational drug design tools with MOE Molecular Operating Environment