Alt-üst proteomik, kütle spektrometresi ile analizden önce proteinlerin proteolitik sindirim aracılığı ile proteinleri tanımlamak, amino asit dizilerini ve translasyon sonrası modifikasyonlarını karakterize etmek için yaygın kullanılan bir yöntemdir.Proteomikte kullanılan bu yönteme alternatif olarak mevcüt başlıca iş akışına üst-alt proteomik denir; bu yöntemde yekpare haldeki proteinler sindirim ve/veya parçalanmadan önce kütle spektrometresi içinde veya 2D elektroforez ile saflaştırılır. Esasen, alt-üst proteomik, belirli bir hücre, doku vb. numunenin protein yapısını belirlemenin nispeten basit ve güvenilir bir yoludur.
Alt-üst proteomikte, ham protein özütü enzimatik olarak sindirilir ve ardından, kütle spektrometrisine bağlanan sıvı kromatografi ile peptitlerin bir veya daha fazla boyutta ayrılır. Proteolitik peptitlerin kütlelerini veya bunların ardışık kütle spektrumlarını, bir peptit spektral kitaplığındaki bir dizi veri tabanından veya annote edilmiş peptit spektralinden tahmin edilenlerle karşılaştırarak, peptitler tanımlanabilir ve çoklu peptit tanımlamaları bir protein tanımlaması halinde birleştirilebilir.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ "Mass spectrometry-based proteomics". Nature. 422 (6928): 198-207. Mart 2003. doi:10.1038/nature01511. (PMID) 12634793.
- ^ Chait BT (2006). "Chemistry. Mass spectrometry: bottom-up or top-down?". Science. 314 (5796): 65-6. doi:10.1126/science.1133987. (PMID) 17023639.
- ^ "Top-down proteomics: Enhancing 2D gel electrophoresis from tissue processing to high-sensitivity protein detection". Proteomics. 14 (7–8): 872-889. 2014. doi:10.1002/pmic.201300424. (PMID) 24452924.
- ^ . PlanetOrbitrap. Thermo Fisher Scientific. 15 Eylül 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 20 Kasım 2017.
- ^ "Large-scale analysis of the yeast proteome by multidimensional protein identification technology". Nat. Biotechnol. 19 (3): 242-247. 2001. doi:10.1038/85686. (PMID) 11231557.
- ^ "An automated multidimensional protein identification technology for shotgun proteomics". Anal. Chem. 73 (23): 5683-5690. 2001. doi:10.1021/ac010617e. (PMID) 11774908.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Alt ust proteomik kutle spektrometresi ile analizden once proteinlerin proteolitik sindirim araciligi ile proteinleri tanimlamak amino asit dizilerini ve translasyon sonrasi modifikasyonlarini karakterize etmek icin yaygin kullanilan bir yontemdir Proteomikte kullanilan bu yonteme alternatif olarak mevcut baslica is akisina ust alt proteomik denir bu yontemde yekpare haldeki proteinler sindirim ve veya parcalanmadan once kutle spektrometresi icinde veya 2D elektroforez ile saflastirilir Esasen alt ust proteomik belirli bir hucre doku vb numunenin protein yapisini belirlemenin nispeten basit ve guvenilir bir yoludur Alt ust proteomikte ham protein ozutu enzimatik olarak sindirilir ve ardindan kutle spektrometrisine baglanan sivi kromatografi ile peptitlerin bir veya daha fazla boyutta ayrilir Proteolitik peptitlerin kutlelerini veya bunlarin ardisik kutle spektrumlarini bir peptit spektral kitapligindaki bir dizi veri tabanindan veya annote edilmis peptit spektralinden tahmin edilenlerle karsilastirarak peptitler tanimlanabilir ve coklu peptit tanimlamalari bir protein tanimlamasi halinde birlestirilebilir Ayrica bakinizProtein kutle spektrometresi Ust alt proteomikKaynakca Mass spectrometry based proteomics Nature 422 6928 198 207 Mart 2003 doi 10 1038 nature01511 PMID 12634793 Chait BT 2006 Chemistry Mass spectrometry bottom up or top down Science 314 5796 65 6 doi 10 1126 science 1133987 PMID 17023639 Top down proteomics Enhancing 2D gel electrophoresis from tissue processing to high sensitivity protein detection Proteomics 14 7 8 872 889 2014 doi 10 1002 pmic 201300424 PMID 24452924 PlanetOrbitrap Thermo Fisher Scientific 15 Eylul 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 20 Kasim 2017 Large scale analysis of the yeast proteome by multidimensional protein identification technology Nat Biotechnol 19 3 242 247 2001 doi 10 1038 85686 PMID 11231557 An automated multidimensional protein identification technology for shotgun proteomics Anal Chem 73 23 5683 5690 2001 doi 10 1021 ac010617e PMID 11774908