Bakteriyel transkripsiyon, bakterilerdeki genetik materyalin mesajcı RNA transkriptlerinin, protein üretimi için çevrilmesi için üretildiği işlemdir. Ökaryotlardan farklı olarak, bakteriyel transkripsiyon ve translasyon sitoplazmada aynı anda gerçekleşebilir. Bu durum transkripsiyonun membranlı bir çekirdekte gerçekleştiği, translasyonun sitoplazmada çekirdeğin dışında gerçekleştiği ökaryotlarda mümkün değildir (ayrıca bkz. Ökaryotik transkripsiyon). Bakterilerde, genetik materyal, zarla kaplı bir çekirdekle çevrelenmez ve sitoplazmada ribozomlara erişime sahiptir.
Transkripsiyon, RNA polimeraz tarafından gerçekleştirilir ancak spesifikliği, transkripsiyon faktörleri olarak adlandırılan sekansa özgü tarafından kontrol edilir.
Başlama
Transkripsiyon başlatma için aşağıdaki adımlar gerçekleşir:+1 bölgesi (transkripsiyonun başladığı yer) ve sonlandırıcı arasında yer alan kalıp DNA sonraki adımda proteine çevrilecek RNA'ya kopyalanır. Bu aşamada, DNA çift sarmallıdır ("kapalı"). Bu holoenzim/sarılı-DNA yapısına kapalı kompleks denir.
- DNA çözülür ve başlangıç bölgesinin yakınında (+1 olarak tanımlanır) tek iplikli ("açık") hale gelir. Bu holoenzim/çözülmüş DNA yapısına açık kompleks denir.
- RNA polimeraz DNA'yı RNA' ya kopyalar (beta alt birimi sentezi başlatır), ancak çıkış kanalı σ faktörü tarafından engellendiği için RNA polimerazı bırakamayan yaklaşık 10 üretir.
- Sonunda σ faktörü çekirdek enzimden ayrışır ve uzama devam eder.
Uzama
Promotörler "güç", yani bitişik olarak bulunduğu DNA dizilerinin transkripsiyonunu ne kadar aktif olarak teşvik ettikleri, bakımından farklı olabilir. Promöter kuvveti, birçok (ancak tümü değil) durumda, RNA polimerazın ve bununla ilişkili aksesuar proteinlerinin kendi DNA dizilerine ne kadar sıkı bağlandıkları ile ilgilidir. Diziler bir ne kadar benzerse, bağlanma o kadar güçlü olur. Ek transkripsiyon düzenlemesi, başlangıçta holoenzim yapısının stabilitesini etkileyebilen transkripsiyon faktörlerinden gelir.
Transkriptlerin çoğu, adenozin-5'-trifosfat (ATP ) ve daha az bir ölçüde +1 bölgesinde guanozin-5'-trifosfat (GTP) (pürin nükleosit trifosfatlar) kullanımı ile üretilit. Uridin-5'-trifosfat (UTP) ve sitidin-5'-trifosfat (CTP) (pirimidin nükleosit trifosfatlar) başlangıç bölgesinde pek tercih edilmezler.
Sonlanma
İki sonlandırma mekanizması iyi bilinmektedir:
- İçsel sonlandırma ( da bilinir), RNA polimerazının durmasını işaret eden RNA içindeki sonlandırıcı sekansları içerir. Sonlandırıcı dizilim genellikle, RNAP'ın DNA kalıbından ayrışmasına yol açan bir gövde-halka saç tokası yapısı oluşturan bir .
- Rho'ya bağlı sonlandırma, belirli bölgelerde RNA sentezini durduran bir protein olan (rho faktörü) adlı bir kullanır. Bu protein, yeni ortaya çıkan RNA zinciri üzerindeki bir rho kullanım yerine bağlanır ve mRNA boyunca RNAP'a doğru ilerler. Sonlandırıcı bölgenin yukarısındaki bir gövde-halka yapısı RNAP'ı duraklatır, ρ faktörü RNAP'a ulaştığında, RNAP'ın transkripsiyonu sonlandırarak DNA'dan ayrışmasına neden olur.
Bakterilerde DNA transkripsiyonunun sona ermesi, RNA polimerazının bir sonrakine ulaşılıncaya kadar sonlandırıcı diziyi görmezden geleceği belirli mekanizmalarla durdurulabilir. Bu fenomen olarak bilinir ve bazı bakteriyofajlar tarafından kullanılır.
Kaynakça
Dış bağlantılar
- Bakteriyel Transkripsiyon20 Temmuz 2013 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi. - animasyon
- Süreci özetleyen video animasyonu18 Mayıs 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Bakteriyel transkripsiyon bakterilerdeki genetik materyalin mesajci RNA transkriptlerinin protein uretimi icin cevrilmesi icin uretildigi islemdir Okaryotlardan farkli olarak bakteriyel transkripsiyon ve translasyon sitoplazmada ayni anda gerceklesebilir Bu durum transkripsiyonun membranli bir cekirdekte gerceklestigi translasyonun sitoplazmada cekirdegin disinda gerceklestigi okaryotlarda mumkun degildir ayrica bkz Okaryotik transkripsiyon Bakterilerde genetik materyal zarla kapli bir cekirdekle cevrelenmez ve sitoplazmada ribozomlara erisime sahiptir Transkripsiyon DNA yi RNA ya genellikle mRNA ya kopyalama islemidir Transkripsiyon RNA polimeraz tarafindan gerceklestirilir ancak spesifikligi transkripsiyon faktorleri olarak adlandirilan sekansa ozgu tarafindan kontrol edilir BaslamaTranskripsiyon baslatma icin asagidaki adimlar gerceklesir 1 bolgesi transkripsiyonun basladigi yer ve sonlandirici arasinda yer alan kalip DNA sonraki adimda proteine cevrilecek RNA ya kopyalanir Bu asamada DNA cift sarmallidir kapali Bu holoenzim sarili DNA yapisina kapali kompleks denir DNA cozulur ve baslangic bolgesinin yakininda 1 olarak tanimlanir tek iplikli acik hale gelir Bu holoenzim cozulmus DNA yapisina acik kompleks denir RNA polimeraz DNA yi RNA ya kopyalar beta alt birimi sentezi baslatir ancak cikis kanali s faktoru tarafindan engellendigi icin RNA polimerazi birakamayan yaklasik 10 uretir Sonunda s faktoru cekirdek enzimden ayrisir ve uzama devam eder UzamaPromotorler guc yani bitisik olarak bulundugu DNA dizilerinin transkripsiyonunu ne kadar aktif olarak tesvik ettikleri bakimindan farkli olabilir Promoter kuvveti bircok ancak tumu degil durumda RNA polimerazin ve bununla iliskili aksesuar proteinlerinin kendi DNA dizilerine ne kadar siki baglandiklari ile ilgilidir Diziler bir ne kadar benzerse baglanma o kadar guclu olur Ek transkripsiyon duzenlemesi baslangicta holoenzim yapisinin stabilitesini etkileyebilen transkripsiyon faktorlerinden gelir Transkriptlerin cogu adenozin 5 trifosfat ATP ve daha az bir olcude 1 bolgesinde guanozin 5 trifosfat GTP purin nukleosit trifosfatlar kullanimi ile uretilit Uridin 5 trifosfat UTP ve sitidin 5 trifosfat CTP pirimidin nukleosit trifosfatlar baslangic bolgesinde pek tercih edilmezler SonlanmaIki sonlandirma mekanizmasi iyi bilinmektedir Icsel sonlandirma da bilinir RNA polimerazinin durmasini isaret eden RNA icindeki sonlandirici sekanslari icerir Sonlandirici dizilim genellikle RNAP in DNA kalibindan ayrismasina yol acan bir govde halka sac tokasi yapisi olusturan bir Rho ya bagli sonlandirma belirli bolgelerde RNA sentezini durduran bir protein olan rho faktoru adli bir kullanir Bu protein yeni ortaya cikan RNA zinciri uzerindeki bir rho kullanim yerine baglanir ve mRNA boyunca RNAP a dogru ilerler Sonlandirici bolgenin yukarisindaki bir govde halka yapisi RNAP i duraklatir r faktoru RNAP a ulastiginda RNAP in transkripsiyonu sonlandirarak DNA dan ayrismasina neden olur Bakterilerde DNA transkripsiyonunun sona ermesi RNA polimerazinin bir sonrakine ulasilincaya kadar sonlandirici diziyi gormezden gelecegi belirli mekanizmalarla durdurulabilir Bu fenomen olarak bilinir ve bazi bakteriyofajlar tarafindan kullanilir Kaynakca Lewin Benjamin 2006 Essential genes Internat bas New Jersey Pearson Prentice Hall u a ISBN 0 13 148988 7 Dis baglantilarBakteriyel Transkripsiyon20 Temmuz 2013 tarihinde Wayback Machine sitesinde arsivlendi animasyon Sureci ozetleyen video animasyonu18 Mayis 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde arsivlendi