Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Rhodobacter capsulatus, fotosentez yoluyla enerji elde edebilen bir grup bakteri olan mor bakteri türüdür. Adı Latince sıfat "capsulatus" ("bir kafes ile", "kapsüllenmiş"), kendisi türetilmiş olan Latince isim "capsula" ("küçük bir kutu veya kafes" anlamına gelir) ve eril isimler için olan Latin son eki, "-atus" (bir şeyin başka bir şeyle "sağlandığını" belirtir) üzerinden türetilmiştir.
| Rhodobacter capsulatus | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Biyolojik sınıflandırma | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
| İkili adlandırma | |||||||||||||||
| Rhodobacter capsulatus (Molisch 1907) Imhoff et al. 1984 | |||||||||||||||
| Tip suşlar | |||||||||||||||
| ATCC 11166, ATCC 17015, ATH 2.3.1, BCRC 16406, C10, CCRC 16406, CCTM 1913, CCUG 31484, CGMCC 1.2359, CGMCC 1.3366, CIP 104408, DSM 1710, Ewart C10, HMSATH.2.3.1, IAM 14232, IFO 16435, JCM 21090, KCTC 2583, LMG 2962, NBRC 16435, NCIB 8254, NCIMB 8254, van Niel ATH.2.3.1, van Niel ATH.2.3.1. | |||||||||||||||
| Sinonimler | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
Tam genomu dizilenmiştir ve halka açıktır.
Keşif
Rhodobacter capsulatus'un keşfi, Çek-Avusturya botanikçisi atfedilmektedir. Mikroorganizma daha sonralarda Rhodonostoc capsulatum olarak adlandırılmıştır ve 1907 yılında Die Purpurbakterien nach neuen Untersuchungen adlı kitabında tanımlanmıştır. Daha sonra 1944'te Rhodopseudomonas capulata olarak yeniden isimlendirilen türü daha da karakterize etti. Van Niel başlangıçta Kaliforniya ve Küba'da toplanan çamur örneklerinden kültür alabildiği 16 R. capsulata suşunu tanımladı. 1984 yılında türler, Rhodobacter cinsinin tanıtılmasıyla Rhodobacter capsulatus olarak yeniden sınıflandırılmıştır. Bu cins, cinsinin türlerini R. capsulatus ve gibi veziküler intrasitoplazmik membranları (hücrede sıklıkla fotosenteze dahil olan zara bağlı bölmeler) olanlar gibi belirgin morfolojik farklılıklar ile daha iyi ayırt etmek için tanıtıldı.
Ekoloji
Bu bakteri doğal su kaynakları veya kanalizasyon gibi sulu ortamları tercih eder.R. capsulatus ABD ve Küba'dan tecrit edilmiştir. Başlangıçta, bu bakteriler laboratuvardan numunelerini RCVBN (DL-malik asit, amonyum sülfat, biyotin, nikotinik asit, eser elementler ve bazı ilave bileşikler) ortamına yerleştirerek ve anaerobik olarak bol ışıkla inkübasyon ile büyütülebilir. Bu plakalar üzerindeki koloniler daha sonra izole edilebilir, büyütülebilir ve R. capsulatus olarak tanımlanabilir.Genomunun dizilimi ile, RNA ve DNA dizilimi artık bu türü tanımlamak için kullanılabilir.
Önem
Rhodobacter capsulatus, gen aktarım maddesi(GTA, GAM) ürettiği gözlemlenen ilk mikroorganizma idi. Yatay gen transferine yardımcı olmak için, GAM'ı üreten hücrenin kromozomundan küçük miktarlarda DNA aktaran faj benzeri bir partiküldür. Parçacıklarda bulunan DNA da rastgeledir; GAM üretimi için gereken tüm genleri içermez. Bir biraz benzemekle birlikte, bir faj DNA'yı viral partiküllere gönderirken GAM'lar kazara oluşmaz. GAM'lar için genler ve bunların düzenlenmesi, bir faj tarafından değil, hücrenin kendisi tarafından kontrol edilir. Bu parçacıklar ilk olarak, araştırmacılar R. capsulatus'un birkaç farklı antibiyotiğe dirençli suşunu koydukları birlik kültüründe çift dirençli suşlar gözlemlediklerinde tanımlandı. Bu DNA değişimi hücre teması ortadan kaldırıldığında ve konjugasyon, transformasyonu engellenmesinde etkili olan eklendiğinde bile gözlenmiştir. Küçük bir filtrelenebilir madde bu hızlı genetik değişimin kaynağı olarak tanımlandı. Bu maddeleri aşırı üreten bir mutant suş oluştuğunda, parçacıkların bir faj tarafından değil, R. capsulatus tarafından üretildiği kanıtlanmıştır. GAM üretimi için gen diziliminden sonra, GAM'lar ürettiği öğrenilen daha fazla tür bulunması Rhodobacter capsulatus’un gen transfer maddesinin RcGTA olarak kısaltılmasına yol açtı. Hücrenin, sert koşullarda genomik DNA'nın paylaşılmasına izin vereceği ve popülasyonun genel genetik çeşitliliğini artıracak olan GAM üretmeye başlayabileceği öne sürülmüştür.
Kaynakça
- ^ . StrainInfo. 16 Aralık 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Aralık 2015.
- ^ Imhoff, J. F.; Truper, H. G.; Pfennig, N. (1 Temmuz 1984). "Rearrangement of the Species and Genera of the Phototrophic "Purple Nonsulfur Bacteria"". International Journal of Systematic Bacteriology. 34 (3). ss. 340-343. doi:10.1099/00207713-34-3-340.
- ^ "Rhodobacter capsulatus (Rhodopseudomonas capsulata)". UniProt. 4 Mayıs 2013 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Aralık 2015.
- ^ Strnad, H.; Lapidus, A.; Paces, J.; Ulbrich, P.; Vlcek, C.; Paces, V.; Haselkorn, R. (23 Nisan 2010). "Complete Genome Sequence of the Photosynthetic Purple Nonsulfur Bacterium Rhodobacter capsulatus SB 1003". Journal of Bacteriology. 192 (13). ss. 3545-3546. doi:10.1128/JB.00366-10. (PMC) 2897665 $2. (PMID) 20418398.
- ^ a b "KEGG GENOME: Rhodobacter capsulatus". Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. 12 Mayıs 2012 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Aralık 2015.
- ^ a b Molisch H (1907). Die Purpurbakterien nach neuen Untersuchungen.
- ^ van Niel CB (Mart 1944). "The Culture, General Physiology, Morphology, and Classification of the Non-Sulfur Purple and Brown Bacteria". Bacteriological Reviews. 8 (1). ss. 1-118. doi:10.1128/MMBR.8.1.1-118.1944. (PMC) 440875 $2. (PMID) 16350090.
- ^ LaSarre B, Kysela DT, Stein BD, Ducret A, Brun YV, McKinlay JB (Temmuz 2018). "Restricted Localization of Photosynthetic Intracytoplasmic Membranes (ICMs) in Multiple Genera of Purple Nonsulfur Bacteria". mBio. 9 (4). doi:10.1128/mbio.00780-18. (PMC) 6030561 $2. (PMID) 29970460.
- ^ a b Weaver PF, Wall JD, Gest H (Kasım 1975). "Characterization of Rhodopseudomonas capsulata". Archives of Microbiology. 105 (3). ss. 207-16. doi:10.1007/BF00447139. (PMID) 1103769.
- ^ Pujalte MJ, Lucena T, Ruvira MA, Arahal DR, Macián MC (2014). "The Family Rhodobacteraceae". The Prokaryotes. Springer Berlin Heidelberg. ss. 439-512. doi:10.1007/978-3-642-30197-1_377. ISBN .
- ^ Strnad H, Lapidus A, Paces J, Ulbrich P, Vlcek C, Paces V, Haselkorn R (Temmuz 2010). . Journal of Bacteriology. 192 (13). ss. 3545-6. doi:10.1128/JB.00366-10. (PMID) 20418398. 13 Nisan 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 11 Mayıs 2020.
- ^ a b Lang AS, Zhaxybayeva O, Beatty JT (Haziran 2012). "Gene transfer agents: phage-like elements of genetic exchange". Nature Reviews. Microbiology. 10 (7). ss. 472-82. doi:10.1038/nrmicro2802. (PMC) 3626599 $2. (PMID) 22683880.
- ^ Marrs B (Mart 1974). "Genetic recombination in Rhodopseudomonas capsulata". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 71 (3). ss. 971-3. Bibcode:1974PNAS...71..971M. doi:10.1073/pnas.71.3.971. (PMC) 388139 $2. (PMID) 4522805.
- ^ Yen HC, Hu NT, Marrs BL (Haziran 1979). "Characterization of the gene transfer agent made by an overproducer mutant of Rhodopseudomonas capsulata". Journal of Molecular Biology. 131 (2). ss. 157-68. doi:10.1016/0022-2836(79)90071-8. (PMID) 490646.
- ^ Lang AS, Beatty JT (Ocak 2000). "Genetic analysis of a bacterial genetic exchange element: the gene transfer agent of Rhodobacter capsulatus". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 97 (2). ss. 859-64. Bibcode:2000PNAS...97..859L. doi:10.1073/pnas.97.2.859. (PMC) 15421 $2. (PMID) 10639170.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Rhodobacter capsulatus fotosentez yoluyla enerji elde edebilen bir grup bakteri olan mor bakteri turudur Adi Latince sifat capsulatus bir kafes ile kapsullenmis kendisi turetilmis olan Latince isim capsula kucuk bir kutu veya kafes anlamina gelir ve eril isimler icin olan Latin son eki atus bir seyin baska bir seyle saglandigini belirtir uzerinden turetilmistir Rhodobacter capsulatusBiyolojik siniflandirmaUst alem BacteriaSube ProteobacteriaSinif AlphaproteobacteriaTakim Familya Cins RhodobacterTur R capsulatusIkili adlandirmaRhodobacter capsulatus Molisch 1907 Imhoff et al 1984Tip suslarATCC 11166 ATCC 17015 ATH 2 3 1 BCRC 16406 C10 CCRC 16406 CCTM 1913 CCUG 31484 CGMCC 1 2359 CGMCC 1 3366 CIP 104408 DSM 1710 Ewart C10 HMSATH 2 3 1 IAM 14232 IFO 16435 JCM 21090 KCTC 2583 LMG 2962 NBRC 16435 NCIB 8254 NCIMB 8254 van Niel ATH 2 3 1 van Niel ATH 2 3 1 SinonimlerRhodonostoc capsulatum Rhodopseudomonas capsulata Tam genomu dizilenmistir ve halka aciktir KesifRhodobacter capsulatus un kesfi Cek Avusturya botanikcisi atfedilmektedir Mikroorganizma daha sonralarda Rhodonostoc capsulatum olarak adlandirilmistir ve 1907 yilinda Die Purpurbakterien nach neuen Untersuchungen adli kitabinda tanimlanmistir Daha sonra 1944 te Rhodopseudomonas capulata olarak yeniden isimlendirilen turu daha da karakterize etti Van Niel baslangicta Kaliforniya ve Kuba da toplanan camur orneklerinden kultur alabildigi 16 R capsulata susunu tanimladi 1984 yilinda turler Rhodobacter cinsinin tanitilmasiyla Rhodobacter capsulatus olarak yeniden siniflandirilmistir Bu cins cinsinin turlerini R capsulatus ve gibi vezikuler intrasitoplazmik membranlari hucrede siklikla fotosenteze dahil olan zara bagli bolmeler olanlar gibi belirgin morfolojik farkliliklar ile daha iyi ayirt etmek icin tanitildi EkolojiBu bakteri dogal su kaynaklari veya kanalizasyon gibi sulu ortamlari tercih eder R capsulatus ABD ve Kuba dan tecrit edilmistir Baslangicta bu bakteriler laboratuvardan numunelerini RCVBN DL malik asit amonyum sulfat biyotin nikotinik asit eser elementler ve bazi ilave bilesikler ortamina yerlestirerek ve anaerobik olarak bol isikla inkubasyon ile buyutulebilir Bu plakalar uzerindeki koloniler daha sonra izole edilebilir buyutulebilir ve R capsulatus olarak tanimlanabilir Genomunun dizilimi ile RNA ve DNA dizilimi artik bu turu tanimlamak icin kullanilabilir OnemRhodobacter capsulatus gen aktarim maddesi GTA GAM urettigi gozlemlenen ilk mikroorganizma idi Yatay gen transferine yardimci olmak icin GAM i ureten hucrenin kromozomundan kucuk miktarlarda DNA aktaran faj benzeri bir partikuldur Parcaciklarda bulunan DNA da rastgeledir GAM uretimi icin gereken tum genleri icermez Bir biraz benzemekle birlikte bir faj DNA yi viral partikullere gonderirken GAM lar kazara olusmaz GAM lar icin genler ve bunlarin duzenlenmesi bir faj tarafindan degil hucrenin kendisi tarafindan kontrol edilir Bu parcaciklar ilk olarak arastirmacilar R capsulatus un birkac farkli antibiyotige direncli susunu koyduklari birlik kulturunde cift direncli suslar gozlemlediklerinde tanimlandi Bu DNA degisimi hucre temasi ortadan kaldirildiginda ve konjugasyon transformasyonu engellenmesinde etkili olan eklendiginde bile gozlenmistir Kucuk bir filtrelenebilir madde bu hizli genetik degisimin kaynagi olarak tanimlandi Bu maddeleri asiri ureten bir mutant sus olustugunda parcaciklarin bir faj tarafindan degil R capsulatus tarafindan uretildigi kanitlanmistir GAM uretimi icin gen diziliminden sonra GAM lar urettigi ogrenilen daha fazla tur bulunmasi Rhodobacter capsulatus un gen transfer maddesinin RcGTA olarak kisaltilmasina yol acti Hucrenin sert kosullarda genomik DNA nin paylasilmasina izin verecegi ve populasyonun genel genetik cesitliligini artiracak olan GAM uretmeye baslayabilecegi one surulmustur Kaynakca StrainInfo 16 Aralik 2013 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 8 Aralik 2015 Imhoff J F Truper H G Pfennig N 1 Temmuz 1984 Rearrangement of the Species and Genera of the Phototrophic Purple Nonsulfur Bacteria International Journal of Systematic Bacteriology 34 3 ss 340 343 doi 10 1099 00207713 34 3 340 Rhodobacter capsulatus Rhodopseudomonas capsulata UniProt 4 Mayis 2013 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Aralik 2015 Strnad H Lapidus A Paces J Ulbrich P Vlcek C Paces V Haselkorn R 23 Nisan 2010 Complete Genome Sequence of the Photosynthetic Purple Nonsulfur Bacterium Rhodobacter capsulatus SB 1003 Journal of Bacteriology 192 13 ss 3545 3546 doi 10 1128 JB 00366 10 PMC 2897665 2 PMID 20418398 a b KEGG GENOME Rhodobacter capsulatus Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes 12 Mayis 2012 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Aralik 2015 a b Molisch H 1907 Die Purpurbakterien nach neuen Untersuchungen van Niel CB Mart 1944 The Culture General Physiology Morphology and Classification of the Non Sulfur Purple and Brown Bacteria Bacteriological Reviews 8 1 ss 1 118 doi 10 1128 MMBR 8 1 1 118 1944 PMC 440875 2 PMID 16350090 LaSarre B Kysela DT Stein BD Ducret A Brun YV McKinlay JB Temmuz 2018 Restricted Localization of Photosynthetic Intracytoplasmic Membranes ICMs in Multiple Genera of Purple Nonsulfur Bacteria mBio 9 4 doi 10 1128 mbio 00780 18 PMC 6030561 2 PMID 29970460 a b Weaver PF Wall JD Gest H Kasim 1975 Characterization of Rhodopseudomonas capsulata Archives of Microbiology 105 3 ss 207 16 doi 10 1007 BF00447139 PMID 1103769 Pujalte MJ Lucena T Ruvira MA Arahal DR Macian MC 2014 The Family Rhodobacteraceae The Prokaryotes Springer Berlin Heidelberg ss 439 512 doi 10 1007 978 3 642 30197 1 377 ISBN 978 3 642 30196 4 Strnad H Lapidus A Paces J Ulbrich P Vlcek C Paces V Haselkorn R Temmuz 2010 Journal of Bacteriology 192 13 ss 3545 6 doi 10 1128 JB 00366 10 PMID 20418398 13 Nisan 2020 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 11 Mayis 2020 a b Lang AS Zhaxybayeva O Beatty JT Haziran 2012 Gene transfer agents phage like elements of genetic exchange Nature Reviews Microbiology 10 7 ss 472 82 doi 10 1038 nrmicro2802 PMC 3626599 2 PMID 22683880 Marrs B Mart 1974 Genetic recombination in Rhodopseudomonas capsulata Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 71 3 ss 971 3 Bibcode 1974PNAS 71 971M doi 10 1073 pnas 71 3 971 PMC 388139 2 PMID 4522805 Yen HC Hu NT Marrs BL Haziran 1979 Characterization of the gene transfer agent made by an overproducer mutant of Rhodopseudomonas capsulata Journal of Molecular Biology 131 2 ss 157 68 doi 10 1016 0022 2836 79 90071 8 PMID 490646 Lang AS Beatty JT Ocak 2000 Genetic analysis of a bacterial genetic exchange element the gene transfer agent of Rhodobacter capsulatus Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 97 2 ss 859 64 Bibcode 2000PNAS 97 859L doi 10 1073 pnas 97 2 859 PMC 15421 2 PMID 10639170