Transkripsiyon faktörleri çoğu zaman DNA bağlanma bölgelerindeki benzerliğe göre sınıflandırılırlar:
- 1 Üst sınıf: Bazik bölgeler ()
- 1.1 Sınıf: faktörleri ()
- 1.1.1 Aile: (-türü) bileşkeler; (/) dahildir
- 1.1.2 Aile: CREB
- 1.1.3 Aile: -türü faktörler
- 1.1.4 Aile: bZIP / PAR
- 1.1.5 Aile: Bitki G-kutusuna bağlanan faktörler
- 1.1.6 Aile: sade ZIP
- 1.2 Sınıf: sarmal-halka-sarmal faktörler ()
- 1.2.1 Aile: Her yerde bulunan (Ubiquitous) (Sınıf A) faktörler
- 1.2.2 Aile: Myojenik transkipsiyon faktörleri ()
- 1.2.3 Aile: Achaete-Scute
- 1.2.4 Aile: Tal/Twist/Atonal/Hen
- 1.3 Sınıf: sarmal-halka-sarmal / Lösin fermuar faktörler ()
- 1.3.1 Aile: Her yerde bulunan bHLH-ZIP faktörleri; (USF1, USF2); SREBP) dahildir
- 1.3.2 Aile: Hücre döngüsü kontrol faktörleri; dahildir
- 1.4 Sınıf: NF-1
- 1.4.1 Aile: NF-1 (NFIC)
- 1.5 Sınıf: RF-X
- 1.5.1 Aile: RF-X (NFX2, NFX3, NFX5)
- 1.6 Sınıf: bHSH
- 1.1 Sınıf: faktörleri ()
- 2 Üst sınıf: Çinko koordinasyonu yapan DNA bağlanma bölgeleri
- 2.1 Sınıf: Cys4 tipi
- 2.1.1 Aile:
- 2.1.2 Aile: -gibi faktörler
- 2.2 Sınıf: dçeşitli Cys4 çinko parmakları
- 2.2.1 Aile:
- 2.3 Sınıf: Cys2His2 çinko parmağı bölgesi
- 2.3.1 Aile: Her yerde bulunan faktörler, , dahil
- 2.3.2 Aile: DGelişimsel / hücre döngüsü düzenleyicileri; dahildir
- 2.3.4 Aile: NF-6B-gibi bağlanma özelliği olan büyük faktörler
- 2.4 Sınıf: Cys6 sistein-çinko öbekli
- 2.5 Sınıf: Dönüşümlü içerikli çinko parmaklar
- 2.1 Sınıf: Cys4 tipi
- 3 Üst sınıf:
- 3.1 Sınıf:
- 3.1.1 Aile: Sadece Homeo bölgesi; dahildir
- 3.1.2 Aile: faktörleri; (Oct) dahildir
- 3.1.3 Aile: LIM bölgeli Homeo bölgesi
- 3.1.4 Aile: Homeo bölgesi ile çinko parmak motifleri
- 3.2 Sınıf: Eşli kutu (paired box)
- 3.2.1 Aile: Eşli ile homeo bölgesi
- 3.2.2 Aile: Yalnızca Eşli bölge
- 3.3 Sınıf: /
- 3.3.1 Aile: Gelişimsel düzenleyiciler; dahildir
- 3.3.2 Aile: Doku-spesifik düzenleyiciler
- 3.3.3 Aile: Hücre döngüsü kontrol faktörleri
- 3.3.0 Aile: diğer düzenleyiciler
- 3.4 Sınıf:
- 3.4.1 Aile: HSF
- 3.5 Sınıf: Tryptofan öbekleri
- 3.5.1 Aile: Myb
- 3.5.2 Aile: Ets-benzeri
- 3.5.3 Aile:
- 3.6 Sınıf: TEA bölgesi
- 3.6.1 Aile: TEA (TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4)
- 3.1 Sınıf:
- 4 Üst sınıf: küçük oluk temaslı beta-iskele faktörleri
- 4.1 Sınıf: RHR (Rel homoloji bölgesi)
- 4.1.1 Aile: Rel/;
- 4.1.2 Aile: yalnızca ankyrin
- 4.1.3 Aile: NF-AT (NFATC1,NFATC2)
- 4.2 Sınıf: STAT
- 4.2.1 Aile:
- 4.3 Sınıf: p53
- 4.3.1 Aile: p53
- 4.4 Sınıf:
- 4.4.1 Aile: Gelişim düzenleyicileri; () dahildir
- 4.4.2 Aile: Dış sinyal tepki verenler, SRF (serum tepki faktörü)
- 4.4.1 Aile: Gelişim düzenleyicileri; () dahildir
- 4.5 Sınıf: beta-fıçı alpha-sarmal transkripsiyon faktörleri
- 4.6 Sınıf:
- 4.6.1 Aile: TBP
- 4.7.1 Aile: ,
- 4.7.2 Aile: TCF-1
- 4.7.3 Aile: HMG2-benzeri, SSRP1
- 4.7.5 Aile: MATA
- 4.8 Sınıf: Heteromerik CCAAT faktörler
- 4.8.1 Aile: Heteromeric CCAAT faktörleri
- 4.9 Sınıf: Grainyhead
- 4.9.1 Aile: Grainyhead
- 4.10 Sınıf: Soğuk şoku bölgesi faktörleri
- 4.10.1 Aile: csd
- 4.11 Sınıf: Runt
- 4.11.1 Aile: Runt
- 4.1 Sınıf: RHR (Rel homoloji bölgesi)
- 0 Üst sınıf: Diğer transcription Faktörleri
- 0.1 Sınıf: Bakır yumruk proteinleri
- 0.2 Sınıf: HMGI(Y)
- 0.2.1 Aile: HMGI(Y)
- 0.3 Sınıf: Cep bölgesi
- 0.4 Sınıf: E1A-benzeri faktörler
- 0.5 Sınıf: /EREBP-ilişkili faktörler
Kaynakça
- ^ Stegmaier P, Kel AE, Wingender E (2004). . Genome informatics. International Conference on Genome Informatics. 15 (2). ss. 276-86. (PMID) 15706513. 19 Haziran 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 10 Ocak 2008.
- ^ Matys V, Kel-Margoulis OV, Fricke E, Liebich I, Land S, Barre-Dirrie A, Reuter I, Chekmenev D, Krull M, Hornischer K, Voss N, Stegmaier P, Lewicki-Potapov B, Saxel H, Kel AE, Wingender E (2006). "TRANSFAC® and its module TRANSCompel:® transcriptional gene regulation in eukaryotes". Nucleic Acids Res. 34 (Database issue). ss. D108-10. doi:10.1093/nar/gkj143. (PMID) 16381825.
- ^ . 3 Mart 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 10 Ocak 2008.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Transkripsiyon faktorleri cogu zaman DNA baglanma bolgelerindeki benzerlige gore siniflandirilirlar 1 Ust sinif Bazik bolgeler AP 1 DNA kompleksinin yapisi AP 1 Jun ve Fos transkripsiyon faktorlerinden olusmus bir ikilidir ikisinin birlestigi yerde bir losin fermuar bolgesi mavi olusur iki alfa sarmal arasinda bulunan losin kalintilari bir fermuarin disleri gibi birbirlerine gecerler c Myc transkripsiyon faktorunun DNA ya baglanmis hali semtaik gosterim1 1 Sinif faktorleri 1 1 1 Aile turu bileskeler dahildir 1 1 2 Aile CREB 1 1 3 Aile turu faktorler 1 1 4 Aile bZIP PAR 1 1 5 Aile Bitki G kutusuna baglanan faktorler 1 1 6 Aile sade ZIP 1 2 Sinif sarmal halka sarmal faktorler 1 2 1 Aile Her yerde bulunan Ubiquitous Sinif A faktorler 1 2 2 Aile Myojenik transkipsiyon faktorleri 1 2 3 Aile Achaete Scute 1 2 4 Aile Tal Twist Atonal Hen 1 3 Sinif sarmal halka sarmal Losin fermuar faktorler 1 3 1 Aile Her yerde bulunan bHLH ZIP faktorleri USF1 USF2 SREBP dahildir 1 3 2 Aile Hucre dongusu kontrol faktorleri dahildir 1 4 Sinif NF 1 1 4 1 Aile NF 1 NFIC 1 5 Sinif RF X 1 5 1 Aile RF X NFX2 NFX3 NFX5 1 6 Sinif bHSHDNA ya baglanmis bir cinko parmagi bolgesinin sematik resmi2 Ust sinif Cinko koordinasyonu yapan DNA baglanma bolgeleri 2 1 Sinif Cys4 tipi 2 1 1 Aile 2 1 2 Aile gibi faktorler 2 2 Sinif dcesitli Cys4 cinko parmaklari 2 2 1 Aile 2 3 Sinif Cys2His2 cinko parmagi bolgesi 2 3 1 Aile Her yerde bulunan faktorler dahil 2 3 2 Aile DGelisimsel hucre dongusu duzenleyicileri dahildir 2 3 4 Aile NF 6B gibi baglanma ozelligi olan buyuk faktorler 2 4 Sinif Cys6 sistein cinko obekli 2 5 Sinif Donusumlu icerikli cinko parmaklar 3 Ust sinif Antennapedia homeobolge proteinin DNA ya baglanmis hali3 1 Sinif 3 1 1 Aile Sadece Homeo bolgesi dahildir 3 1 2 Aile faktorleri Oct dahildir 3 1 3 Aile LIM bolgeli Homeo bolgesi 3 1 4 Aile Homeo bolgesi ile cinko parmak motifleri 3 2 Sinif Esli kutu paired box 3 2 1 Aile Esli ile homeo bolgesi 3 2 2 Aile Yalnizca Esli bolge 3 3 Sinif 3 3 1 Aile Gelisimsel duzenleyiciler dahildir 3 3 2 Aile Doku spesifik duzenleyiciler 3 3 3 Aile Hucre dongusu kontrol faktorleri 3 3 0 Aile diger duzenleyiciler 3 4 Sinif 3 4 1 Aile HSF 3 5 Sinif Tryptofan obekleri 3 5 1 Aile Myb 3 5 2 Aile Ets benzeri 3 5 3 Aile 3 6 Sinif TEA bolgesi 3 6 1 Aile TEA TEAD1 TEAD2 TEAD3 TEAD4 4 Ust sinif kucuk oluk temasli beta iskele faktorleri 4 1 Sinif RHR Rel homoloji bolgesi 4 1 1 Aile Rel 4 1 2 Aile yalnizca ankyrin 4 1 3 Aile NF AT NFATC1 NFATC2 4 2 Sinif STAT 4 2 1 Aile 4 3 Sinif p53 4 3 1 Aile p53 4 4 Sinif 4 4 1 Aile Gelisim duzenleyicileri dahildir 4 4 2 Aile Dis sinyal tepki verenler SRF serum tepki faktoru 4 5 Sinif beta fici alpha sarmal transkripsiyon faktorleri 4 6 Sinif 4 6 1 Aile TBP 4 7 1 Aile 4 7 2 Aile TCF 1 4 7 3 Aile HMG2 benzeri SSRP1 4 7 5 Aile MATA 4 8 Sinif Heteromerik CCAAT faktorler 4 8 1 Aile Heteromeric CCAAT faktorleri 4 9 Sinif Grainyhead 4 9 1 Aile Grainyhead 4 10 Sinif Soguk soku bolgesi faktorleri 4 10 1 Aile csd 4 11 Sinif Runt 4 11 1 Aile Runt 0 Ust sinif Diger transcription Faktorleri 0 1 Sinif Bakir yumruk proteinleri 0 2 Sinif HMGI Y 0 2 1 Aile HMGI Y 0 3 Sinif Cep bolgesi 0 4 Sinif E1A benzeri faktorler 0 5 Sinif EREBP iliskili faktorlerKaynakca Stegmaier P Kel AE Wingender E 2004 Genome informatics International Conference on Genome Informatics 15 2 ss 276 86 PMID 15706513 19 Haziran 2013 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 10 Ocak 2008 Matys V Kel Margoulis OV Fricke E Liebich I Land S Barre Dirrie A Reuter I Chekmenev D Krull M Hornischer K Voss N Stegmaier P Lewicki Potapov B Saxel H Kel AE Wingender E 2006 TRANSFAC and its module TRANSCompel transcriptional gene regulation in eukaryotes Nucleic Acids Res 34 Database issue ss D108 10 doi 10 1093 nar gkj143 PMID 16381825 3 Mart 2016 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 10 Ocak 2008