Biyo-bilişimde, bir peptid kütle parmak izi veya peptid kütle haritası, analiz edilen sindirilmiş bir proteinden gelen bir peptit karışımının bir kütle spektrumudur. Kütle spektrumu, proteini tanımlamaya hizmet edebilecek bir model olması anlamında bir parmak izi görevi görür. 1993 yılında geliştirilen peptid kütle parmak izi oluşturma yöntemi, bir proteinin izole edilmesinden, onu tek tek peptitlere ayrıştırılmasından ve bir tür kütle spektrometresi aracılığıyla peptitlerin kütlelerinin belirlenmesi adımlarından oluşur. Bir kez oluşturulduktan sonra, bir peptit-kütle parmak izi, ilgili protein ve hatta genomik diziler için veri tabanlarında arama yapmak için kullanılabilir. Bu da ilgili proteini kodlayan genlerin açıklanması için bu tekniği güçlü bir araç haline getirir.
Kitle parmak izinin önemli bir avantajı, gerçekleştirilmesinin peptit dizilemesine göre önemli ölçüde daha hızlı olması ve sonuçların eşit derecede faydalı olmasıdır. Dezavantajlar arasında analiz için yalnızca tek bir proteine ihtiyaç duyulması ve protein dizisinin bir veri tabanında en azından önemli bir homoloji ile yer alması gerekliliği bulunmaktadır. Tek tek peptitlerin kütlesi bir parmak izi oluştururken ölçüldüğünden, farklı protein karışımları güvenilmez sonuçlar verebilir. Bu nedenle numune hazırlama, süreçte önemli bir adımdır. Şayet ki, güvenilir sonuçlar elde edilirse, sonuçların yararlı olması için aranılan veri tabanında eşleşen bir peptid dizisi bulunmalıdır.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ Mass spectrometry in the biological sciences[]
- ^ James (31 Ağustos 1993). "Protein identification by mass profile fingerprinting". Biochemical and Biophysical Research Communications. 195 (1): 58-64. doi:10.1006/bbrc.1993.2009. ISSN 0006-291X. (PMID) 8363627.
- ^ Cottrell (1 Haziran 1994). "Protein identification by peptide mass fingerprinting". Peptide Research. 7 (3): 115-124. ISSN 1040-5704. (PMID) 8081066.
- ^ Pappin (1 Haziran 1993). "Rapid identification of proteins by peptide-mass fingerprinting". Current Biology. 3 (6): 327-332. doi:10.1016/0960-9822(93)90195-t. ISSN 0960-9822. (PMID) 15335725.
- ^ Henzel (1 Eylül 2003). "Protein identification: the origins of peptide mass fingerprinting". Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 14 (9): 931-942. doi:10.1016/S1044-0305(03)00214-9. (PMID) 12954162.
Dış bağlantılar
- https://www.bruker.com/fileadmin/user_upload/8-PDF-Docs/Separations_MassSpectrometry/InstructionForUse/8702557_IFU_Bruker_Guide_MALDI_Sample_Preparation_Revision_E.pdf 8 Mayıs 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- http://www.matrixscience.com/help/pmf_help.html 24 Şubat 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- http://www.matrixscience.com/cgi/search_form.pl? 19 Ocak 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde . FORMVER = 2 & ARA = PMF 19 Ocak 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- https://www.youtube.com/watch?v=xh8GGzsc2r4
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Biyo bilisimde bir peptid kutle parmak izi veya peptid kutle haritasi analiz edilen sindirilmis bir proteinden gelen bir peptit karisiminin bir kutle spektrumudur Kutle spektrumu proteini tanimlamaya hizmet edebilecek bir model olmasi anlaminda bir parmak izi gorevi gorur 1993 yilinda gelistirilen peptid kutle parmak izi olusturma yontemi bir proteinin izole edilmesinden onu tek tek peptitlere ayristirilmasindan ve bir tur kutle spektrometresi araciligiyla peptitlerin kutlelerinin belirlenmesi adimlarindan olusur Bir kez olusturulduktan sonra bir peptit kutle parmak izi ilgili protein ve hatta genomik diziler icin veri tabanlarinda arama yapmak icin kullanilabilir Bu da ilgili proteini kodlayan genlerin aciklanmasi icin bu teknigi guclu bir arac haline getirir Kitle parmak izinin onemli bir avantaji gerceklestirilmesinin peptit dizilemesine gore onemli olcude daha hizli olmasi ve sonuclarin esit derecede faydali olmasidir Dezavantajlar arasinda analiz icin yalnizca tek bir proteine ihtiyac duyulmasi ve protein dizisinin bir veri tabaninda en azindan onemli bir homoloji ile yer almasi gerekliligi bulunmaktadir Tek tek peptitlerin kutlesi bir parmak izi olustururken olculdugunden farkli protein karisimlari guvenilmez sonuclar verebilir Bu nedenle numune hazirlama surecte onemli bir adimdir Sayet ki guvenilir sonuclar elde edilirse sonuclarin yararli olmasi icin aranilan veri tabaninda eslesen bir peptid dizisi bulunmalidir Ayrica bakinizDe novo peptid dizileme Protein kutle spektrometresi Peptid kutle parmak izi alma ProteomikKaynakca Mass spectrometry in the biological sciences olu kirik baglanti James 31 Agustos 1993 Protein identification by mass profile fingerprinting Biochemical and Biophysical Research Communications 195 1 58 64 doi 10 1006 bbrc 1993 2009 ISSN 0006 291X PMID 8363627 Cottrell 1 Haziran 1994 Protein identification by peptide mass fingerprinting Peptide Research 7 3 115 124 ISSN 1040 5704 PMID 8081066 Pappin 1 Haziran 1993 Rapid identification of proteins by peptide mass fingerprinting Current Biology 3 6 327 332 doi 10 1016 0960 9822 93 90195 t ISSN 0960 9822 PMID 15335725 Henzel 1 Eylul 2003 Protein identification the origins of peptide mass fingerprinting Journal of the American Society for Mass Spectrometry 14 9 931 942 doi 10 1016 S1044 0305 03 00214 9 PMID 12954162 Dis baglantilarhttps www bruker com fileadmin user upload 8 PDF Docs Separations MassSpectrometry InstructionForUse 8702557 IFU Bruker Guide MALDI Sample Preparation Revision E pdf 8 Mayis 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde http www matrixscience com help pmf help html 24 Subat 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde http www matrixscience com cgi search form pl 19 Ocak 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde FORMVER 2 amp ARA PMF 19 Ocak 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde https www youtube com watch v xh8GGzsc2r4