Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Peptid kütle parmak izi alma (Peptide mass fingerprinting-PMF), protein tanımlama için analitik bir tekniktir, burada ilgilenilen bilinmeyen protein ilk olarak daha küçük peptitlere bölünür ve bunların mutlak kütleleri (MALDI-TOF) veya ESI-TOF gibi bir kütle spektrometresi ile doğru bir şekilde ölçülebilir. Yöntem, 1993 yılında birkaç grup tarafından bağımsız olarak geliştirildi. Peptit kütleleri, bilinen protein dizilerini içeren bir veritabanı veya hatta genom ile karşılaştırılır. Bu, organizmanın bilinen genomunu proteinlere çeviren, daha sonra teorik olarak proteinleri peptidlere ayıran ve her bir proteinden peptidlerin mutlak kütlelerini hesaplayan bilgisayar programları kullanılarak sağlanır. Daha sonra, bilinmeyen proteinin peptitlerinin kütleleri, genomda kodlanmış her bir proteinin teorik peptit kütleleri ile karşılaştırılır. En iyi eşleşmeyi bulmak için sonuçlar istatistiksel olarak analiz edilir.
Bu yöntemin avantajı, sadece peptitlerin kütlelerinin bilinmesinin gerekmesidir. Zaman alıcı de novo peptid dizilimi bu durumda gereksizdir. Yöntemin bir dezavantajı ise, protein dizisinin ilgili veri tabanında bulunması gerekliliğidir. Ek olarak çoğu PMF algoritması, peptitlerin tek bir proteinden geldiğini varsayar. Bir karışımın varlığı, analizi önemli ölçüde karmaşıklaştırabilir ve sonuçları potansiyel olarak tehlikeye atabilir. PMF bazlı protein tanımlaması için tipik olan, izole edilmiş bir proteine olan gerekliliktir. 2-3 proteini aşan karışımlar, tipik olarak yeterli tanımlama spesifikliğine ulaşmak için MS/MS bazlı protein tanımlamasının ek kullanımını gerektirir (6). Bu nedenle, tipik PMF örnekleri, iki boyutlu jel elektroforezinden (2D jeller) veya SDS-PAGE bantlarından izole edilmiş proteinlerdir.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ "Role of accurate mass measurement (+/- 10 ppm) in protein identification strategies employing MS or MS/MS and database searching". Anal. Chem. 71 (14): 2871-82. 1999. doi:10.1021/ac9810516. (PMID) 10424174.
- ^ "Rapid identification of proteins by peptide-mass fingerprinting". Curr. Biol. 3 (6): 327-32. 1993. doi:10.1016/0960-9822(93)90195-T. (PMID) 15335725.
- ^ "Identifying proteins from two-dimensional gels by molecular mass searching of peptide fragments in protein sequence databases". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (11): 5011-5. 1993. doi:10.1073/pnas.90.11.5011. (PMC) 46643 $2. (PMID) 8506346.
- ^ "Use of mass spectrometric molecular weight information to identify proteins in sequence databases". Biological Mass Spectrometry. 22 (6): 338-45. 1993. doi:10.1002/bms.1200220605. (PMID) 8329463.
- ^ "Protein identification by mass profile fingerprinting". Biochem. Biophys. Res. Commun. 195 (1): 58-64. 1993. doi:10.1006/bbrc.1993.2009. (PMID) 8363627.
- ^ "Peptide mass maps: a highly informative approach to protein identification". Anal. Biochem. 214 (2): 397-408. 1993. doi:10.1006/abio.1993.1514. (PMID) 8109726.
- ^ "Linking genome and proteome by mass spectrometry: large-scale identification of yeast proteins from two dimensional gels". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (25): 14440-5. 1996. doi:10.1073/pnas.93.25.14440. (PMC) 26151 $2. (PMID) 8962070.
- ^ "Protein identification from two-dimensional gel electrophoresis analysis of Klebsiella pneumoniae by combined use of mass spectrometry data and raw genome sequences". Proteome Science. 1 (1): 6. 2003. doi:10.1186/1477-5956-1-6. (PMC) 317362 $2. (PMID) 14653859.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Peptid kutle parmak izi alma Peptide mass fingerprinting PMF protein tanimlama icin analitik bir tekniktir burada ilgilenilen bilinmeyen protein ilk olarak daha kucuk peptitlere bolunur ve bunlarin mutlak kutleleri MALDI TOF veya ESI TOF gibi bir kutle spektrometresi ile dogru bir sekilde olculebilir Yontem 1993 yilinda birkac grup tarafindan bagimsiz olarak gelistirildi Peptit kutleleri bilinen protein dizilerini iceren bir veritabani veya hatta genom ile karsilastirilir Bu organizmanin bilinen genomunu proteinlere ceviren daha sonra teorik olarak proteinleri peptidlere ayiran ve her bir proteinden peptidlerin mutlak kutlelerini hesaplayan bilgisayar programlari kullanilarak saglanir Daha sonra bilinmeyen proteinin peptitlerinin kutleleri genomda kodlanmis her bir proteinin teorik peptit kutleleri ile karsilastirilir En iyi eslesmeyi bulmak icin sonuclar istatistiksel olarak analiz edilir Bir peptit kutle parmak izi alma deneyinin tipik bir is akisi Bu yontemin avantaji sadece peptitlerin kutlelerinin bilinmesinin gerekmesidir Zaman alici de novo peptid dizilimi bu durumda gereksizdir Yontemin bir dezavantaji ise protein dizisinin ilgili veri tabaninda bulunmasi gerekliligidir Ek olarak cogu PMF algoritmasi peptitlerin tek bir proteinden geldigini varsayar Bir karisimin varligi analizi onemli olcude karmasiklastirabilir ve sonuclari potansiyel olarak tehlikeye atabilir PMF bazli protein tanimlamasi icin tipik olan izole edilmis bir proteine olan gerekliliktir 2 3 proteini asan karisimlar tipik olarak yeterli tanimlama spesifikligine ulasmak icin MS MS bazli protein tanimlamasinin ek kullanimini gerektirir 6 Bu nedenle tipik PMF ornekleri iki boyutlu jel elektroforezinden 2D jeller veya SDS PAGE bantlarindan izole edilmis proteinlerdir Ayrica bakinizPeptid kutle parmak izi Alt ust proteomik Ust alt proteomikKaynakca Role of accurate mass measurement 10 ppm in protein identification strategies employing MS or MS MS and database searching Anal Chem 71 14 2871 82 1999 doi 10 1021 ac9810516 PMID 10424174 Rapid identification of proteins by peptide mass fingerprinting Curr Biol 3 6 327 32 1993 doi 10 1016 0960 9822 93 90195 T PMID 15335725 Identifying proteins from two dimensional gels by molecular mass searching of peptide fragments in protein sequence databases Proc Natl Acad Sci U S A 90 11 5011 5 1993 doi 10 1073 pnas 90 11 5011 PMC 46643 2 PMID 8506346 Use of mass spectrometric molecular weight information to identify proteins in sequence databases Biological Mass Spectrometry 22 6 338 45 1993 doi 10 1002 bms 1200220605 PMID 8329463 Protein identification by mass profile fingerprinting Biochem Biophys Res Commun 195 1 58 64 1993 doi 10 1006 bbrc 1993 2009 PMID 8363627 Peptide mass maps a highly informative approach to protein identification Anal Biochem 214 2 397 408 1993 doi 10 1006 abio 1993 1514 PMID 8109726 Linking genome and proteome by mass spectrometry large scale identification of yeast proteins from two dimensional gels Proc Natl Acad Sci U S A 93 25 14440 5 1996 doi 10 1073 pnas 93 25 14440 PMC 26151 2 PMID 8962070 Protein identification from two dimensional gel electrophoresis analysis of Klebsiella pneumoniae by combined use of mass spectrometry data and raw genome sequences Proteome Science 1 1 6 2003 doi 10 1186 1477 5956 1 6 PMC 317362 2 PMID 14653859