Azərbaycanca AzərbaycancaБеларускі БеларускіDansk DanskDeutsch DeutschEspañola EspañolaFrançais FrançaisIndonesia IndonesiaItaliana Italiana日本語 日本語Қазақ ҚазақLietuvos LietuvosNederlands NederlandsPortuguês PortuguêsРусский Русскийසිංහල සිංහලแบบไทย แบบไทยTürkçe TürkçeУкраїнська Українська中國人 中國人United State United StateAfrikaans Afrikaans
Destek
www.wikipedia.tr-tr.nina.az
  • Vikipedi

Escherichia coli den elde edilen bir kısıtlama enzimi olan EcoRV eco R beş olarak telaffuz edilir en iyi karakterize

EcoRV

EcoRV
www.wikipedia.tr-tr.nina.azhttps://www.wikipedia.tr-tr.nina.az

Escherichia coli' den elde edilen bir kısıtlama enzimi olan EcoRV ("eco R beş" olarak telaffuz edilir), en iyi karakterize edilen endonükleazlardan biri olup palindromik (simetrik) dna dizilerini tanıyan ve genellikle homodimerler veya homotetramerler gibi davranan Tip IIP alt sınıfındadır.

image
EvoRV'in DNA tanıma dizisi. Yeşil çizgi kesme yerini gösteriyor.
image
DNA'yı kesen EcoRV. Protein gevşek şekilde DNA'ya bağlanır ve tanıma dizisini bulmak için taramaya başlar. Dizi bulununca EcoRV DNA'yı 50°'lik bir açı ile büker ve tanıma yerinden onu keser.
image
Çift iplikli DNA ile komplekslenmiş EcoRV'in kristal yapısı. Proteindeki alfa sarmallar kırmızı, beta yapraklar mavi, DNA pembe gösterilmiştir.
image
DNA substratı (kırmızı ve mavi) ile kompleksleşmiş bir EcoRV homodimerinin (yeşil) şematik yapısı. Yukarıdaki resimle aynı olan bu yapı, farklı bir açıdan ve renklendirmeyle gösterilmektedir.

EcoRV enzimi, GATATC hedef bölgesini TA adımında merkezden ve kör uçlu bir şekilde bölen, Mg2 + ' ya bağımlı bir reaksiyonda 5′-fosfat grupları oluşturan dimerik bir tip II kısıtlama endonükleazdır.

EcoRV, DNA boyunca gerçekleşen translokasyonda ATP'ye ihtiyaç duymayan tip II ailesinin en iyi çalışılmış restriksiyon enzimlerden biridir.Kataliz ve özgüllük bakımından bu enzim, DNA bükülmesi öneminin keşfedilmesinde model olarak kullanılmıştır.

EcoRV' nin izoşizomerleri, BstRI, CeqI, Eco32I, Ecol78I, HjaI, NanI, NflAI, NsiCI şeklindedir.

Yapı

EcoRV endonükleaz, 244 amino asit içerir ve “dimerizasyon alt alan” adı verilen küçük alt alan ile “DNA bağlanma alt alanı” adı verilen alanın da bulunduğu daha büyük bir alt alandan oluşan bir dimerdir. EcoRV, normalde kestiği diziyi içeren bir DNA molekülü ile beraber kristalleştirilmiştir. Bu kristal kullanılarak bu protein-DNA kompleksinin yapısı çözülmüştür. Enzimin çekirdek kısmı beş tane beta yaprak, bunların iki yanında da alfa sarmallar bulunmaktadır. Bu çekirdek bölge diğer tip II restriksiyon endonükleazlarına benzer. N-ucunda bir ikilenme (dimerizasyon) bölgesi vardır, bu bölge kısa bir α-sarmal, iki antiparalel β yaprak ve bir uzun α-sarmaldan oluşur. Bu bölge sadece EcoRV ve PvuII'de görülür.

EcoRV, serbest enzim, bir spesifik olmayan ve iki spesifik kompleksle birlikte bir enzim-ürün kompleksinin yapı analizlerinin bulunduğu tek kısıtlama enzimidir.

Etki mekanizması

EcoRI gibi EcoRV de bir homodimer (ikili) oluşturduktan sonra DNA'ya bağlanır ve tanıma dizisini keser. Enzim önce DNA'da herhangi bir yere zayıf şekilde bağlanır, sonra DNA üzerinde rastgele yürür, spesifik tanıma dizisini bulana kadar. Proteindeki rastgele bağlanma yeri ile kesme yeri farklıdır. EcoRV kendi tanıma dizisi için yüksek bir spesifiteye sahiptir. Enzim DNA üzerinde kayarken önce tanıma dizisinin dıştaki iki bazını (GAxxTC) tanır ve DNA'ya daha sıkı bağlanır, sonra eğer dizinin ortasındaki bazlar da doğruysa DNA eğrilir, proteinin bağlanması daha da sıkılaşır ve kesme meydana gelir.

Enzimin dizisine bağlanması DNA'da şekilsel bir değişime yol açar, DNA 50° bükülür. Proteinin C -ucundaki pozitif yükler bu bükülmeyi sağlamaktadır. DNA bölgesinde meydana gelen keskin bir bükülme ile fosfat, katalitik yan zincir (Asp90, Asp74, Lys92) ve iki değerlikli metal iyonların uygun bir şekilde yan yana gelmesi kolaylaşır. Aynı zamanda bükülmeyle DNA' nın TA aşamasındaki ana oluğun daralmasına sebep olarak enzimin fonksiyonel gruplarının bazlarla hidrojen bağları yapmasını engeller. DNA'nın bükülmesi bazların istiflenmesini bozar, küçük oluk açılır, büyük oluk sıkışır. Bu durum kesilecek fosfodiester bağını enzimin aktif bölgesine yaklaştırıp orada kesilmesini sağlar. Kesilme tanıma dizisi içinde gerçekleşir ve ATP gerektirmez.

Enzimin aktif bölgesinde üç tane divalent metal iyonu bulunur. Bunlardan ikisi nükleofilik bir hidroksit iyonunu oluşturmaya yarar.

EcoRV, protein etkisiyle DNA'da şekilsel bir değişiklik yapan tek tip II restriksiyon endonükleazdır.

EcoRI ve EcoRV' nin spesifik komplekslerinin kristalografik analizi, bu iki enzimin katalitik bölgelerini tanımladı. Analiz sonucunda katalitik bölgeleri karşılaştırıldığında, yapı ve davranış açısından iki enzimin benzer olduğu bulundu.

Kullanım

EcoRV çoğunlukla gen klonlaması sırasında bir plazmid vektörü kesip içine araştırma konusu olan bir geni yerleştirmek için kullanılır.

Moleküler klonlama, Restriksiyon bölgesi haritalama, Genotipleme, Southern lekeleme tekniği, Restriksiyon fragman uzunluğu polimorfizmi (RFLP), SNP (Tek nükleotid polimorfizm) analizi uygulamalarında kullanılır.

EcoRV, DNA' nın GAT^ATC bölgelerini uygun bir tamponda 37 °C 'de keser. Bu enzim, pek çok imalatçı tarafından temin edilir, gerektiği biçimde çalışması için, enzimin stabilitesini artıran ve DNA preparasyonlarında bulunabilecek kontaminantları bağlayan inek serum albümini (BSA) ile birlikte kullanılır. BSA tampon yerine Rekombinant Albümin (rAlbumin) içeren tamponla birlikte de kullanılmaktadır.

Bu enzim temin edildikten sonra saklama koşulları oldukça önemlidir. -20 °C sıcaklığında donmayan dondurucularda saklanması gerekir.

Genetik

EcoRV endonükleazının geni ve EcoRV ile aynı DNA dizisini tanıyan EcoRV metilazın genleri kromozomda birbirine bitişiktir, transkripsiyonları aynı bölgeden zıt yönlere doğru yapılır.

Ayrıca bakınız

  • EcoRI, E. coli'ye ait bir diğer endonükleaz.
  • EcoRII, E. coli'ye ait başka bir endonükleaz..
  • FokI, Flavobacterium okeanokoites'e ait bir nükleaz.
  • BamHI, Bacillus amyloliquefaciens' e ait bir endonükleaz.
  • , Proteus vulgaris' e ait bir endonükleaz.

Kaynakça

  1. ^ Zahran, Mai; Daidone, Isabella; Smith, Jeremy C.; Imhof, Petra (2010). "Mechanism of DNA Recognition by the Restriction Enzyme EcoRV". Journal of Molecular Biology (İngilizce). 401 (3): 415-432. doi:10.1016/j.jmb.2010.06.026. 14 Haziran 2018 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 9 Ocak 2023. 
  2. ^ Pingoud, Alfred; Wilson, Geoffrey G.; Wende, Wolfgang (8 Temmuz 2014). "Type II restriction endonucleases—a historical perspective and more". Nucleic Acids Research (İngilizce). 42 (12): 7489-7527. doi:10.1093/nar/gku447. ISSN 0305-1048. (PMC) 4081073 $2. (PMID) 24878924. 14 Kasım 2022 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 25 Ocak 2023. KB1 bakım: PMC biçimi ()
  3. ^ a b c . www.bionity.com (İngilizce). 24 Ocak 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2023. 
  4. ^ Horton, Nancy C; Perona, John J (1998). "Role of protein-induced bending in the specificity of DNA recognition: crystal structure of Eco RV endonuclease complexed with d(AAAGAT) + d(ATCTT) 1 1Edited by P. E. Wright". Journal of Molecular Biology (İngilizce). 277 (4): 779-787. doi:10.1006/jmbi.1998.1655. 4 Haziran 2018 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 9 Ocak 2023. 
  5. ^ Dikić, Jasmina; Menges, Carolin; Clarke, Samuel; Kokkinidis, Michael; Pingoud, Alfred; Wende, Wolfgang; Desbiolles, Pierre (2012). "The rotation-coupled sliding of EcoRV". Nucleic Acids Research (İngilizce). 40 (9): 4064-4070. doi:10.1093/nar/gkr1309. ISSN 1362-4962. (PMC) 3351190 $2. (PMID) 22241781. 14 Ağustos 2022 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 25 Ocak 2023. KB1 bakım: PMC biçimi ()
  6. ^ David A. Hiller and John J. Perona. . doi:10.1021/bi0606400. 13 Ocak 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  7. ^ Roberts, R. J. (25 Nisan 1990). "Restriction enzymes and their isoschizomers". Nucleic Acids Research (İngilizce). 18 (suppl): 2331-2365. doi:10.1093/nar/18.suppl.2331. ISSN 0305-1048. (PMC) 331877 $2. (PMID) 2159140. KB1 bakım: PMC biçimi ()
  8. ^ a b Winkler FK, Banner DW, Oefner C; ve diğerleri. (Mayıs 1993). "The crystal structure of EcoRV endonuclease and of its complexes with cognate and non-cognate DNA fragments". EMBO J. 12 (5). ss. 1781-95. (PMC) 413397 $2. (PMID) 8491171. KB1 bakım: Diğerlerinin yanlış kullanımı () KB1 bakım: Birden fazla ad: yazar listesi ()
  9. ^ . Protein Data Bank. 5 Şubat 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 4 Ocak 2011. 
  10. ^ a b c d Pingoud A, Jeltsch A (2001). "Structure and functions of type II restriction endonucleases". Nucleic Acids Research. 29 (18). ss. 3705-3727. doi:10.1093/nar/29.18.3705. (PMC) 55916 $2. (PMID) 11557805. 
  11. ^ Pingoud, Alfred; Jeltsch, Albert (15 Mayıs 1997). "Recognition and Cleavage of DNA by Type-II Restriction Endonucleases". European Journal of Biochemistry (İngilizce). 246 (1): 1-22. doi:10.1111/j.1432-1033.1997.t01-6-00001.x. ISSN 0014-2956. 
  12. ^ Schulze, C; Jeltsch, A; Franke, I; Urbanke, C; Pingoud, A (1998). "Crosslinking the EcoRV restriction endonuclease across the DNA-binding site reveals transient intermediates and conformational changes of the enzyme during DNA binding and catalytic turnover". EMBO J. Cilt 17. ss. 6757-66. doi:10.1093/emboj/17.22.6757. (PMC) 1171021 $2. (PMID) 9822618. 
  13. ^ Zahran M, Daidone I, Smith JC, Imhof P (2010). "Mechanism of DNA recognition by the restriction enzyme EcoRV". J. Mol. Biol. Cilt 401. ss. 415-32. doi:10.1016/j.jmb.2010.06.026. (PMID) 20600128. KB1 bakım: Birden fazla ad: yazar listesi ()
  14. ^ PMID 16981705
  15. ^ a b Hiller, David A.; Perona, John J. (1 Eylül 2006). "Positively Charged C-Terminal Subdomains of EcoRV Endonuclease: Contributions to DNA Binding, Bending, and Cleavage". Biochemistry (İngilizce). 45 (38): 11453-11463. doi:10.1021/bi0606400. ISSN 0006-2960. (PMC) 2515858 $2. (PMID) 16981705. 13 Ocak 2023 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 13 Ocak 2023. KB1 bakım: PMC biçimi ()
  16. ^ Horton NC, Perona JJ (2004). "DNA cleavage by EcoRV endonuclease: two metal ions in three metal ion binding sites". Biochemistry. Cilt 43. ss. 6841-57. doi:10.1021/bi0499056. (PMID) 15170321. 
  17. ^ Horton, Nancy C.; Newberry, Kate Juliet; Perona, John J. (10 Kasım 1998). "Metal ion-mediated substrate-assisted catalysis in type II restriction endonucleases". Proceedings of the National Academy of Sciences (İngilizce). 95 (23): 13489-13494. doi:10.1073/pnas.95.23.13489. ISSN 0027-8424. (PMC) 24846 $2. (PMID) 9811827. 25 Ocak 2023 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 25 Ocak 2023. KB1 bakım: PMC biçimi ()
  18. ^ a b Pingoud, Alfred; Wilson, Geoffrey G.; Wende, Wolfgang (30 Mayıs 2014). "Type II restriction endonucleases—a historical perspective and more". Nucleic Acids Research. 42 (12): 7489-7527. doi:10.1093/nar/gku447. ISSN 0305-1048. (PMC) 4081073 $2. (PMID) 24878924. KB1 bakım: PMC biçimi ()
  19. ^ a b c . www.thermofisher.com (İngilizce). 10 Şubat 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Ocak 2023. 
  20. ^ . 23 Ocak 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. 
  21. ^ a b c . www.addgene.org. 30 Ekim 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 25 Ocak 2023. 
  22. ^ . www.neb.com. 30 Temmuz 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2023. 
  23. ^ . www.neb.com. 18 Nisan 2021 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 24 Ocak 2023. 
  24. ^ (PDF). 24 Ocak 2023 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. 
  25. ^ Bougueleret L, Schwarzstein M, Tsugita A, Zabeau M (1984). "Characterization of the genes coding for the Eco RV restriction and modification system of Escherichia coli". Nucleic Acids Res. Cilt 12. ss. 3659-76. (PMC) 318777 $2. (PMID) 6328432. KB1 bakım: Birden fazla ad: yazar listesi ()

wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar

Escherichia coli den elde edilen bir kisitlama enzimi olan EcoRV eco R bes olarak telaffuz edilir en iyi karakterize edilen endonukleazlardan biri olup palindromik simetrik dna dizilerini taniyan ve genellikle homodimerler veya homotetramerler gibi davranan Tip IIP alt sinifindadir EvoRV in DNA tanima dizisi Yesil cizgi kesme yerini gosteriyor DNA yi kesen EcoRV Protein gevsek sekilde DNA ya baglanir ve tanima dizisini bulmak icin taramaya baslar Dizi bulununca EcoRV DNA yi 50 lik bir aci ile buker ve tanima yerinden onu keser Cift iplikli DNA ile komplekslenmis EcoRV in kristal yapisi Proteindeki alfa sarmallar kirmizi beta yapraklar mavi DNA pembe gosterilmistir DNA substrati kirmizi ve mavi ile komplekslesmis bir EcoRV homodimerinin yesil sematik yapisi Yukaridaki resimle ayni olan bu yapi farkli bir acidan ve renklendirmeyle gosterilmektedir EcoRV enzimi GATATC hedef bolgesini TA adiminda merkezden ve kor uclu bir sekilde bolen Mg2 ya bagimli bir reaksiyonda 5 fosfat gruplari olusturan dimerik bir tip II kisitlama endonukleazdir EcoRV DNA boyunca gerceklesen translokasyonda ATP ye ihtiyac duymayan tip II ailesinin en iyi calisilmis restriksiyon enzimlerden biridir Kataliz ve ozgulluk bakimindan bu enzim DNA bukulmesi oneminin kesfedilmesinde model olarak kullanilmistir EcoRV nin izosizomerleri BstRI CeqI Eco32I Ecol78I HjaI NanI NflAI NsiCI seklindedir YapiEcoRV endonukleaz 244 amino asit icerir ve dimerizasyon alt alan adi verilen kucuk alt alan ile DNA baglanma alt alani adi verilen alanin da bulundugu daha buyuk bir alt alandan olusan bir dimerdir EcoRV normalde kestigi diziyi iceren bir DNA molekulu ile beraber kristallestirilmistir Bu kristal kullanilarak bu protein DNA kompleksinin yapisi cozulmustur Enzimin cekirdek kismi bes tane beta yaprak bunlarin iki yaninda da alfa sarmallar bulunmaktadir Bu cekirdek bolge diger tip II restriksiyon endonukleazlarina benzer N ucunda bir ikilenme dimerizasyon bolgesi vardir bu bolge kisa bir a sarmal iki antiparalel b yaprak ve bir uzun a sarmaldan olusur Bu bolge sadece EcoRV ve PvuII de gorulur EcoRV serbest enzim bir spesifik olmayan ve iki spesifik kompleksle birlikte bir enzim urun kompleksinin yapi analizlerinin bulundugu tek kisitlama enzimidir Etki mekanizmasiEcoRI gibi EcoRV de bir homodimer ikili olusturduktan sonra DNA ya baglanir ve tanima dizisini keser Enzim once DNA da herhangi bir yere zayif sekilde baglanir sonra DNA uzerinde rastgele yurur spesifik tanima dizisini bulana kadar Proteindeki rastgele baglanma yeri ile kesme yeri farklidir EcoRV kendi tanima dizisi icin yuksek bir spesifiteye sahiptir Enzim DNA uzerinde kayarken once tanima dizisinin distaki iki bazini GAxxTC tanir ve DNA ya daha siki baglanir sonra eger dizinin ortasindaki bazlar da dogruysa DNA egrilir proteinin baglanmasi daha da sikilasir ve kesme meydana gelir Enzimin dizisine baglanmasi DNA da sekilsel bir degisime yol acar DNA 50 bukulur Proteinin C ucundaki pozitif yukler bu bukulmeyi saglamaktadir DNA bolgesinde meydana gelen keskin bir bukulme ile fosfat katalitik yan zincir Asp90 Asp74 Lys92 ve iki degerlikli metal iyonlarin uygun bir sekilde yan yana gelmesi kolaylasir Ayni zamanda bukulmeyle DNA nin TA asamasindaki ana olugun daralmasina sebep olarak enzimin fonksiyonel gruplarinin bazlarla hidrojen baglari yapmasini engeller DNA nin bukulmesi bazlarin istiflenmesini bozar kucuk oluk acilir buyuk oluk sikisir Bu durum kesilecek fosfodiester bagini enzimin aktif bolgesine yaklastirip orada kesilmesini saglar Kesilme tanima dizisi icinde gerceklesir ve ATP gerektirmez Enzimin aktif bolgesinde uc tane divalent metal iyonu bulunur Bunlardan ikisi nukleofilik bir hidroksit iyonunu olusturmaya yarar EcoRV protein etkisiyle DNA da sekilsel bir degisiklik yapan tek tip II restriksiyon endonukleazdir EcoRI ve EcoRV nin spesifik komplekslerinin kristalografik analizi bu iki enzimin katalitik bolgelerini tanimladi Analiz sonucunda katalitik bolgeleri karsilastirildiginda yapi ve davranis acisindan iki enzimin benzer oldugu bulundu KullanimEcoRV cogunlukla gen klonlamasi sirasinda bir plazmid vektoru kesip icine arastirma konusu olan bir geni yerlestirmek icin kullanilir Molekuler klonlama Restriksiyon bolgesi haritalama Genotipleme Southern lekeleme teknigi Restriksiyon fragman uzunlugu polimorfizmi RFLP SNP Tek nukleotid polimorfizm analizi uygulamalarinda kullanilir EcoRV DNA nin GAT ATC bolgelerini uygun bir tamponda 37 C de keser Bu enzim pek cok imalatci tarafindan temin edilir gerektigi bicimde calismasi icin enzimin stabilitesini artiran ve DNA preparasyonlarinda bulunabilecek kontaminantlari baglayan inek serum albumini BSA ile birlikte kullanilir BSA tampon yerine Rekombinant Albumin rAlbumin iceren tamponla birlikte de kullanilmaktadir Bu enzim temin edildikten sonra saklama kosullari oldukca onemlidir 20 C sicakliginda donmayan dondurucularda saklanmasi gerekir GenetikEcoRV endonukleazinin geni ve EcoRV ile ayni DNA dizisini taniyan EcoRV metilazin genleri kromozomda birbirine bitisiktir transkripsiyonlari ayni bolgeden zit yonlere dogru yapilir Ayrica bakinizEcoRI E coli ye ait bir diger endonukleaz EcoRII E coli ye ait baska bir endonukleaz FokI Flavobacterium okeanokoites e ait bir nukleaz BamHI Bacillus amyloliquefaciens e ait bir endonukleaz Proteus vulgaris e ait bir endonukleaz Kaynakca Zahran Mai Daidone Isabella Smith Jeremy C Imhof Petra 2010 Mechanism of DNA Recognition by the Restriction Enzyme EcoRV Journal of Molecular Biology Ingilizce 401 3 415 432 doi 10 1016 j jmb 2010 06 026 14 Haziran 2018 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 9 Ocak 2023 Pingoud Alfred Wilson Geoffrey G Wende Wolfgang 8 Temmuz 2014 Type II restriction endonucleases a historical perspective and more Nucleic Acids Research Ingilizce 42 12 7489 7527 doi 10 1093 nar gku447 ISSN 0305 1048 PMC 4081073 2 PMID 24878924 14 Kasim 2022 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 25 Ocak 2023 KB1 bakim PMC bicimi link a b c www bionity com Ingilizce 24 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 24 Ocak 2023 Horton Nancy C Perona John J 1998 Role of protein induced bending in the specificity of DNA recognition crystal structure of Eco RV endonuclease complexed with d AAAGAT d ATCTT 1 1Edited by P E Wright Journal of Molecular Biology Ingilizce 277 4 779 787 doi 10 1006 jmbi 1998 1655 4 Haziran 2018 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 9 Ocak 2023 Dikic Jasmina Menges Carolin Clarke Samuel Kokkinidis Michael Pingoud Alfred Wende Wolfgang Desbiolles Pierre 2012 The rotation coupled sliding of EcoRV Nucleic Acids Research Ingilizce 40 9 4064 4070 doi 10 1093 nar gkr1309 ISSN 1362 4962 PMC 3351190 2 PMID 22241781 14 Agustos 2022 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 25 Ocak 2023 KB1 bakim PMC bicimi link David A Hiller and John J Perona doi 10 1021 bi0606400 13 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan arsivlendi Roberts R J 25 Nisan 1990 Restriction enzymes and their isoschizomers Nucleic Acids Research Ingilizce 18 suppl 2331 2365 doi 10 1093 nar 18 suppl 2331 ISSN 0305 1048 PMC 331877 2 PMID 2159140 KB1 bakim PMC bicimi link a b Winkler FK Banner DW Oefner C ve digerleri Mayis 1993 The crystal structure of EcoRV endonuclease and of its complexes with cognate and non cognate DNA fragments EMBO J 12 5 ss 1781 95 PMC 413397 2 PMID 8491171 KB1 bakim Digerlerinin yanlis kullanimi link KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link Protein Data Bank 5 Subat 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 4 Ocak 2011 a b c d Pingoud A Jeltsch A 2001 Structure and functions of type II restriction endonucleases Nucleic Acids Research 29 18 ss 3705 3727 doi 10 1093 nar 29 18 3705 PMC 55916 2 PMID 11557805 Pingoud Alfred Jeltsch Albert 15 Mayis 1997 Recognition and Cleavage of DNA by Type II Restriction Endonucleases European Journal of Biochemistry Ingilizce 246 1 1 22 doi 10 1111 j 1432 1033 1997 t01 6 00001 x ISSN 0014 2956 Schulze C Jeltsch A Franke I Urbanke C Pingoud A 1998 Crosslinking the EcoRV restriction endonuclease across the DNA binding site reveals transient intermediates and conformational changes of the enzyme during DNA binding and catalytic turnover EMBO J Cilt 17 ss 6757 66 doi 10 1093 emboj 17 22 6757 PMC 1171021 2 PMID 9822618 Zahran M Daidone I Smith JC Imhof P 2010 Mechanism of DNA recognition by the restriction enzyme EcoRV J Mol Biol Cilt 401 ss 415 32 doi 10 1016 j jmb 2010 06 026 PMID 20600128 KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link PMID 16981705 a b Hiller David A Perona John J 1 Eylul 2006 Positively Charged C Terminal Subdomains of EcoRV Endonuclease Contributions to DNA Binding Bending and Cleavage Biochemistry Ingilizce 45 38 11453 11463 doi 10 1021 bi0606400 ISSN 0006 2960 PMC 2515858 2 PMID 16981705 13 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 13 Ocak 2023 KB1 bakim PMC bicimi link Horton NC Perona JJ 2004 DNA cleavage by EcoRV endonuclease two metal ions in three metal ion binding sites Biochemistry Cilt 43 ss 6841 57 doi 10 1021 bi0499056 PMID 15170321 Horton Nancy C Newberry Kate Juliet Perona John J 10 Kasim 1998 Metal ion mediated substrate assisted catalysis in type II restriction endonucleases Proceedings of the National Academy of Sciences Ingilizce 95 23 13489 13494 doi 10 1073 pnas 95 23 13489 ISSN 0027 8424 PMC 24846 2 PMID 9811827 25 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 25 Ocak 2023 KB1 bakim PMC bicimi link a b Pingoud Alfred Wilson Geoffrey G Wende Wolfgang 30 Mayis 2014 Type II restriction endonucleases a historical perspective and more Nucleic Acids Research 42 12 7489 7527 doi 10 1093 nar gku447 ISSN 0305 1048 PMC 4081073 2 PMID 24878924 KB1 bakim PMC bicimi link a b c www thermofisher com Ingilizce 10 Subat 2016 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 23 Ocak 2023 23 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan arsivlendi a b c www addgene org 30 Ekim 2016 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 25 Ocak 2023 www neb com 30 Temmuz 2013 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 24 Ocak 2023 www neb com 18 Nisan 2021 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 24 Ocak 2023 PDF 24 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan PDF arsivlendi Bougueleret L Schwarzstein M Tsugita A Zabeau M 1984 Characterization of the genes coding for the Eco RV restriction and modification system of Escherichia coli Nucleic Acids Res Cilt 12 ss 3659 76 PMC 318777 2 PMID 6328432 KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link

Yayın tarihi: Haziran 27, 2024, 12:02 pm
En çok okunan
  • Kasım 11, 2024

    Sezen Aksu'nun kazandığı ve aday gösterildiği ödüller listesi

  • Kasım 04, 2024

    Seyyid Talib Bey

  • Kasım 17, 2024

    Seyyid Kasım Gubarî

  • Kasım 05, 2024

    Seyrânî

  • Kasım 05, 2024

    Seyrantepe, Bismil

Günlük

  • Türkçe

  • Chicago

  • Chicago

  • John F. Kennedy

  • Dallas

  • İspanya

  • I. Juan Carlos

  • Turuncu Devrim

  • Mustafa Kemal Atatürk

  • Kanada

NiNa.Az - Stüdyo

  • Vikipedi

Bültene üye ol

Mail listemize abone olarak bizden her zaman en son haberleri alacaksınız.
Temasta ol
Bize Ulaşın
DMCA Sitemap Feeds
© 2019 nina.az - Her hakkı saklıdır.
Telif hakkı: Dadaş Mammedov
Üst