Gammaproteobacteria, Pseudomonadota (Eş anlamlısı Proteobacteria) şubesinde yer alan bir bakteri sınıfıdır. Yaklaşık 250 cins içerir ve böylece Prokaryotların cins açısından en zengin taksonunu oluşturur. Tıbbi, ekolojik ve bilimsel açıdan önemli birçok bakteri grubu bu sınıfta yer alır. Tümü Gram-negatif bakterilerden oluşur ve filogenetik ve fizyolojik olarak en çeşitli Proteobacteria sınıfıdır.
Gammaproteobacteria | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Biyolojik sınıflandırma | |||||||
| |||||||
Takımlar | |||||||
| |||||||
Sinonimler | |||||||
|
Bu mikroorganizmalar, hidrotermal menfezler gibi aşırı ortamlar da dahil olmak üzere çeşitli karasal ve deniz ortamlarında yaşayabilirler. Genellikle farklı şekillere sahiptirler. Çubuklar, kavisli çubuklar, koklar, spirilla ve filamentler ve serbest yaşayan bakteriler, biyofilm oluşturucular, kommensaller ve simbiyotikleri içerir. Bazıları ayrıca biyolüminesan gösterme gibi ayırt edici özelliklere sahiptir. Farklı cinslerde bulunan bakterilerin metabolizmalar çok farklıdır; hem aerobik hem de anaerobik (zorunlu veya fakültatif) türler vardır. Ayrıcakemolitoototrofikler, kemoorganotrofikler, fotoototroflar ve heterotroflar türler de mevcuttur.
Etimoloji
" Gamma " (Yunan alfabesinin üçüncü harfi) öğesi, sınıfın Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (Cilt. II, sayfa 1) kitabına göre Sınıf III olduğunu belirtir. Proteus, şeklini değiştirebilen Yunan deniz tanrısını ifade eder. Bakteriler (Yunanca βακτήριον; "çubuk" "küçük çubuk"), etimolojik tarih açısından Basiller'e (çubuk şeklindeki bakteriler) atıfta bulunur.
Filogeni
Birçok farklı sınıflandırma farklı yaklaşımlara dayanmaktadır. Örneğin genomik temelli Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, İsimlendirmede Yer Alan Prokaryotik İsimler Listesi, ribozomal RNA'ya dayalı ARB-Silva Veritabanı veya bir çoklu protein yaklaşımı sınıflandırmalar vardır. Bu bakteri sınıfının soyoluşunu çözmek hala sorunludur.
Aşağıda, Gammaproteobacteria sınıfı için 356 protein ailesinden oluşan bir diziye dayanan bir sınıflama rapor edilmektedir.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogeny of Gammaproteobacteria after Not all orders are monophyletic, consequently families or genera are shown for the Pseudomonadales, Oceanospirillales, and Alteromonadales. In the case of singleton orders, the genus is shown. (In , orders have the suffix -ales, while families have -aceae.) |
Bazı bakteriler, Gammaproteobacteria'nın üyeleri olarak tanımlanmış ancak henüz bir takım veya aileye atanmamıştır. Bunlar, Alkalimonas, Gallaecimonas, Ignatzschineria, Litorivivens, Marinicella, Plasticicumulans, Pseudohongiella, Sedimenticola, Thiohalobacter, Thiohalorhabdus, Thiolapillus ve Wohlfahrtiimonas cinsi bakterileri içerir.
Patojenler
Gammaproteobacteria, Enterobacteriaceae, Vibrionaceae ve Pseudomonadaceae familyaları gibi tıbbi ve bilimsel açıdan önemli birkaç bakteri grubunu içermektedir. Yersinia pestis, Vibrio cholerae, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli ve bazı Salmonella türleri dahil olmak üzere bir dizi insan patojeni bu sınıftadırlar. Deniz ortamında, bu sınıftan birkaç tür, balıkları, karidesleri, mercanları veya istiridyeleri etkileyen Vibrio cinsi ve gri fokları (Halichoerus grypus ) etkileyen Salmonella türleri gibi farklı deniz organizmalarını enfekte etmektedir.
Kaynakça
- ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn TG. (2005). Class III. Gammaproteobacteria class. nov. In: Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2nd edn, vol. 2 Springer: New York, p 1
- ^ T. Gutierrez – 2019 - Institute of Mechanical, Process and Energy Engineering, School of Engineering and Physical Sciences, Heriot-Watt University, Edinburgh, UK
- ^ "Dense populations of a giant sulfur bacterium in Namibian shelf sediments". Science. 284 (5413): 493-5. April 1999. doi:10.1126/science.284.5413.493. (PMID) 10205058.
- ^ a b "Phylogeny of gammaproteobacteria". Journal of Bacteriology. 192 (9): 2305-14. May 2010. doi:10.1128/JB.01480-09. (PMC) 2863478 $2. (PMID) 20207755.
- ^ Marine Microbiology: Ecology & Applications (İngilizce). CRC Press. 26 Kasım 2019. ISBN .
- ^ . 20 Eylül 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi.
- ^ Stackebrandt (1988). "Proteobacteria classis nov., a Name for the Phylogenetic Taxon That Includes the "Purple Bacteria and Their Relatives"". International Journal of Systematic Bacteriology. 38 (3): 321-325. doi:10.1099/00207713-38-3-321. ISSN 0020-7713.
- ^ . www.arb-silva.de. 10 Mart 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 22 Kasım 2020.
- ^ Williams KP, Gillespie JJ, Sobral BW, Nordberg EK, Snyder EE, Shallom JM, Dickerman AW (May 2010). "Phylogeny of gammaproteobacteria". Journal of Bacteriology. 192 (9). ss. 2305-14. doi:10.1128/JB.01480-09. (PMC) 2863478 $2. (PMID) 20207755.
- ^ . List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature. 3 Aralık 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 13 Ocak 2017.
- ^ "Ecology of type II secretion in marine gammaproteobacteria". Environmental Microbiology. 10 (5): 1101-7. May 2008. doi:10.1111/j.1462-2920.2007.01545.x. (PMID) 18218035.
- ^ "Salmonella infection in grey seals (Halichoerus grypus), a marine mammal sentinel species: pathogenicity and molecular typing of Salmonella strains compared with human and livestock isolates". Environmental Microbiology. 18 (3): 1078-87. March 2016. doi:10.1111/1462-2920.13219. (PMID) 26768299.
- ^ "Vibrio parahaemolyticus infections in the United States, 1973-1998". The Journal of Infectious Diseases. 181 (5): 1661-6. May 2000. doi:10.1086/315459. (PMID) 10823766.
Dış bağlantılar
- Medical Subject Headings Gammaproteobacteria
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Gammaproteobacteria Pseudomonadota Es anlamlisi Proteobacteria subesinde yer alan bir bakteri sinifidir Yaklasik 250 cins icerir ve boylece Prokaryotlarin cins acisindan en zengin taksonunu olusturur Tibbi ekolojik ve bilimsel acidan onemli bircok bakteri grubu bu sinifta yer alir Tumu Gram negatif bakterilerden olusur ve filogenetik ve fizyolojik olarak en cesitli Proteobacteria sinifidir GammaproteobacteriaVibrio choleraeBiyolojik siniflandirmaUst alem BacteriaSube ProteobacteriaSinif Gammaproteobacteria Garrity et al 2005TakimlarKojima et al 2015 Martin Carnahan and Joseph 2005 Bowman and McMeekin 2005 Teramoto et al 2015 Garrity et al 2005 Spring et al 2015 Imhoff 2005 Enterobacterales Adeolu et al 2016 Corteselli et al 2017 Garrity et al 2005 Christensen and Cook 1978 Approved Lists 1980 Bowman 2005 Naushad et al 2015 Garrity et al 2005 Kwong and Moran 2013 Garrity et al 2005 Pseudomonadales Orla Jensen 1921 Approved Lists 1980 Garrity et al 2005 Vibrionales Garrity and Holt 2001 Familyaincertae sedis Kampfer et al 2015 Cins incertae sedis Schmidt et al 2016 Candidatus Graf et al 2021 Park et al 2015 Jiang et al 2011Sinonimler Chromatiia Cavalier Smith 2020 Bu mikroorganizmalar hidrotermal menfezler gibi asiri ortamlar da dahil olmak uzere cesitli karasal ve deniz ortamlarinda yasayabilirler Genellikle farkli sekillere sahiptirler Cubuklar kavisli cubuklar koklar spirilla ve filamentler ve serbest yasayan bakteriler biyofilm olusturucular kommensaller ve simbiyotikleri icerir Bazilari ayrica biyoluminesan gosterme gibi ayirt edici ozelliklere sahiptir Farkli cinslerde bulunan bakterilerin metabolizmalar cok farklidir hem aerobik hem de anaerobik zorunlu veya fakultatif turler vardir Ayricakemolitoototrofikler kemoorganotrofikler fotoototroflar ve heterotroflar turler de mevcuttur Etimoloji Gamma Yunan alfabesinin ucuncu harfi ogesi sinifin Bergey s Manual of Systematic Bacteriology Cilt II sayfa 1 kitabina gore Sinif III oldugunu belirtir Proteus seklini degistirebilen Yunan deniz tanrisini ifade eder Bakteriler Yunanca bakthrion cubuk kucuk cubuk etimolojik tarih acisindan Basiller e cubuk seklindeki bakteriler atifta bulunur FilogeniBircok farkli siniflandirma farkli yaklasimlara dayanmaktadir Ornegin genomik temelli Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi Isimlendirmede Yer Alan Prokaryotik Isimler Listesi ribozomal RNA ya dayali ARB Silva Veritabani veya bir coklu protein yaklasimi siniflandirmalar vardir Bu bakteri sinifinin soyolusunu cozmek hala sorunludur Asagida Gammaproteobacteria sinifi icin 356 protein ailesinden olusan bir diziye dayanan bir siniflama rapor edilmektedir Gammaproteobacteria Oceanospirillaceae Pseudomonadaceae Pseudoalteromonadaceae Idiomarinaceae Shewanellaceae Psychromonadaceae Vibrionales Enterobacterales Phylogeny of Gammaproteobacteria after Not all orders are monophyletic consequently families or genera are shown for the Pseudomonadales Oceanospirillales and Alteromonadales In the case of singleton orders the genus is shown In orders have the suffix ales while families have aceae Bazi bakteriler Gammaproteobacteria nin uyeleri olarak tanimlanmis ancak henuz bir takim veya aileye atanmamistir Bunlar Alkalimonas Gallaecimonas Ignatzschineria Litorivivens Marinicella Plasticicumulans Pseudohongiella Sedimenticola Thiohalobacter Thiohalorhabdus Thiolapillus ve Wohlfahrtiimonas cinsi bakterileri icerir PatojenlerGammaproteobacteria Enterobacteriaceae Vibrionaceae ve Pseudomonadaceae familyalari gibi tibbi ve bilimsel acidan onemli birkac bakteri grubunu icermektedir Yersinia pestis Vibrio cholerae Pseudomonas aeruginosa Escherichia coli ve bazi Salmonella turleri dahil olmak uzere bir dizi insan patojeni bu siniftadirlar Deniz ortaminda bu siniftan birkac tur baliklari karidesleri mercanlari veya istiridyeleri etkileyen Vibrio cinsi ve gri foklari Halichoerus grypus etkileyen Salmonella turleri gibi farkli deniz organizmalarini enfekte etmektedir Kaynakca Garrity GM Bell JA Lilburn TG 2005 Class III Gammaproteobacteria class nov In Brenner DJ Krieg NR Staley JT Garrity GM eds Bergey s Manual of Systematic Bacteriology 2nd edn vol 2 Springer New York p 1 T Gutierrez 2019 Institute of Mechanical Process and Energy Engineering School of Engineering and Physical Sciences Heriot Watt University Edinburgh UK Dense populations of a giant sulfur bacterium in Namibian shelf sediments Science 284 5413 493 5 April 1999 doi 10 1126 science 284 5413 493 PMID 10205058 a b Phylogeny of gammaproteobacteria Journal of Bacteriology 192 9 2305 14 May 2010 doi 10 1128 JB 01480 09 PMC 2863478 2 PMID 20207755 Marine Microbiology Ecology amp Applications Ingilizce CRC Press 26 Kasim 2019 ISBN 978 0 429 59236 2 20 Eylul 2020 tarihinde kaynagindan arsivlendi Stackebrandt 1988 Proteobacteria classis nov a Name for the Phylogenetic Taxon That Includes the Purple Bacteria and Their Relatives International Journal of Systematic Bacteriology 38 3 321 325 doi 10 1099 00207713 38 3 321 ISSN 0020 7713 www arb silva de 10 Mart 2007 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 22 Kasim 2020 Williams KP Gillespie JJ Sobral BW Nordberg EK Snyder EE Shallom JM Dickerman AW May 2010 Phylogeny of gammaproteobacteria Journal of Bacteriology 192 9 ss 2305 14 doi 10 1128 JB 01480 09 PMC 2863478 2 PMID 20207755 List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature 3 Aralik 2013 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 13 Ocak 2017 Ecology of type II secretion in marine gammaproteobacteria Environmental Microbiology 10 5 1101 7 May 2008 doi 10 1111 j 1462 2920 2007 01545 x PMID 18218035 Salmonella infection in grey seals Halichoerus grypus a marine mammal sentinel species pathogenicity and molecular typing of Salmonella strains compared with human and livestock isolates Environmental Microbiology 18 3 1078 87 March 2016 doi 10 1111 1462 2920 13219 PMID 26768299 KB1 bakim goster yazarlar link Vibrio parahaemolyticus infections in the United States 1973 1998 The Journal of Infectious Diseases 181 5 1661 6 May 2000 doi 10 1086 315459 PMID 10823766 Dis baglantilarMedical Subject Headings Gammaproteobacteria