Hesaplamalı biyoloji veya bilişimsel biyoloji, biyolojik, ekolojik, davranışsal ve sosyal sistemlerin araştırılmasında veri analitik ve teorik yöntemlerin, matematiksel modelleme ve hesaplamalı simülasyon tekniklerinin geliştirilmesini ve uygulanmasını içerir. Disiplinlerarası bir alandır ve de farklı disiplinleri kucaklar. Temelinde biyoloji, uygulamalı matematik, istatistik, biyokimya, kimya, biyofizik, moleküler biyoloji, genetik, genomik, bilgisayar bilimi ve evrim yer almaktadır.
Hesaplamalı biyoloji alanı disipliniyle karıştırılmamalıdır. Biyolojik bilgisayar disiplini, bilgisayar bilimleri ve bilgisayar mühendisliği'nin bir alt dalıdır ve bilgisayar inşaası için biyoloji ve biyomühendislik temellerini kullanır. Bir diğer disiplinlerarası alan olan, bilgisayarlarla biyolojik data işlemesi üzerine odaklanan biyoinformatik hesaplamalı biyolojiye daha çok benzerlik gösterir.
Alt dallar
- Hesaplamalı anatomi
- Hesaplamalı biyo-modelleme
- Hesaplamalı genomik
- Hesaplamalı sinirbilim
- Hesaplamalı farmakoloji
- Hesaplamalı evrimsel biyoloji
- Hesaplamalı kanser biyolojisi
- Hesaplamalı nöropsikiyatri
Kullanılan yazılımlar ve veritabanları
Hesaplamalı Biyologlar çeşitli yazılımlar kullanırlar. Bunlar komut satırı programlarından, web tabanlı programlara kadar değişiklik gösterebilir.
Aynı zamanda veritabanları da hesaplamalı biyoloji araştırmalarında çok önemli bir yerer sahiptir. Biyolojik veri, araştırmaların bel kemiğini oluşturmaktadır ve de dünyaca ünlü açık erişim veritabanları sayesinde araştırmalar her isteyen tarafından yapılabilmektedir.
Veritabanlarına ve yazılımlara bazı örnekler olarak şunlar gösterilebilir:
- Kyoto Encylopedia of Genes and Genomes (en:KEGG): Biyolojik yolakların, genlerin, proteinlerin ve de genomların çok fazla tür için bütün detaylarını gösteren bir veritabanıdır.
- en:Multiple EM for Motif Elicitation (MEME): Verilen genetik dizilimde tekrar eden motif paternlerini saptayan açık kaynaklı web-tabanlı yazılım.
- Tomtom: Verilen bir motifi veritabanındaki başka motifler ile karşılaştıran web-tabanlı yazılım.
Konferanslar
Hesaplamalı biyoloji ile ilgili birkaç büyük konferans mevcuttur. Bazı önemli örnekler olarak şunlar verilebilir: en:Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB), en:European Conference on Computational Biology (ECCB) ve en:Research in Computational Molecular Biology (RECOMB).
Bilimsel Dergiler
Hesaplamalı biyolojiye adanmış çok sayıda dergi vardır. Bazı önemli örnekler olarak en:Journal of Computational Biology ve en:PLOS Computational Biology gösterilebilir. PLOS Computational Biology dergisi hakemli bir dergi olup, bu alanda çeşitli önemli projelere öncülük etmektedir. Yazılımlarla ilgili incelemeler, açık kaynaklı yazılım tutorialları sunar ve yaklaşan hesaplamalı biyoloji konferansları hakkında bilgiler verir. Aynı zamanda açık erişimli bir dergidir . Atıfta bulunulduğu süreçte dergideki yayınlar özgürce ve bedelsiz bir şekilde kullanılabilir.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ "Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes". Kanehisa, M. and Goto, S. 25 Temmuz 2003 tarihinde kaynağından .
- ^ "MEME". 19 Nisan 2015 tarihinde kaynağından .
- ^ "Tomtom". 19 Nisan 2015 tarihinde kaynağından .
- ^ "PLOS Computational Biology: A Peer-Reviewed Open-Access Journal". journals.plos.org. 10 Mayıs 2015 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Mayıs 2020.
Biyoloji ile ilgili bu madde seviyesindedir. Madde içeriğini genişleterek Vikipedi'ye katkı sağlayabilirsiniz. |
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Hesaplamali biyoloji veya bilisimsel biyoloji biyolojik ekolojik davranissal ve sosyal sistemlerin arastirilmasinda veri analitik ve teorik yontemlerin matematiksel modelleme ve hesaplamali simulasyon tekniklerinin gelistirilmesini ve uygulanmasini icerir Disiplinlerarasi bir alandir ve de farkli disiplinleri kucaklar Temelinde biyoloji uygulamali matematik istatistik biyokimya kimya biyofizik molekuler biyoloji genetik genomik bilgisayar bilimi ve evrim yer almaktadir Bir protein interaksiyon agi Hesaplamali biyoloji alaninda kullanilan metodlar sonucu elde edilmis bir gorsel Hesaplamali biyoloji alani disipliniyle karistirilmamalidir Biyolojik bilgisayar disiplini bilgisayar bilimleri ve bilgisayar muhendisligi nin bir alt dalidir ve bilgisayar insaasi icin biyoloji ve biyomuhendislik temellerini kullanir Bir diger disiplinlerarasi alan olan bilgisayarlarla biyolojik data islemesi uzerine odaklanan biyoinformatik hesaplamali biyolojiye daha cok benzerlik gosterir Alt dallarHesaplamali anatomi Hesaplamali biyo modelleme Hesaplamali genomik Hesaplamali sinirbilim Hesaplamali farmakoloji Hesaplamali evrimsel biyoloji Hesaplamali kanser biyolojisi Hesaplamali noropsikiyatriKullanilan yazilimlar ve veritabanlariHesaplamali Biyologlar cesitli yazilimlar kullanirlar Bunlar komut satiri programlarindan web tabanli programlara kadar degisiklik gosterebilir Ayni zamanda veritabanlari da hesaplamali biyoloji arastirmalarinda cok onemli bir yerer sahiptir Biyolojik veri arastirmalarin bel kemigini olusturmaktadir ve de dunyaca unlu acik erisim veritabanlari sayesinde arastirmalar her isteyen tarafindan yapilabilmektedir Veritabanlarina ve yazilimlara bazi ornekler olarak sunlar gosterilebilir Kyoto Encylopedia of Genes and Genomes en KEGG Biyolojik yolaklarin genlerin proteinlerin ve de genomlarin cok fazla tur icin butun detaylarini gosteren bir veritabanidir en Multiple EM for Motif Elicitation MEME Verilen genetik dizilimde tekrar eden motif paternlerini saptayan acik kaynakli web tabanli yazilim Tomtom Verilen bir motifi veritabanindaki baska motifler ile karsilastiran web tabanli yazilim KonferanslarHesaplamali biyoloji ile ilgili birkac buyuk konferans mevcuttur Bazi onemli ornekler olarak sunlar verilebilir en Intelligent Systems for Molecular Biology ISMB en European Conference on Computational Biology ECCB ve en Research in Computational Molecular Biology RECOMB Bilimsel DergilerHesaplamali biyolojiye adanmis cok sayida dergi vardir Bazi onemli ornekler olarak en Journal of Computational Biology ve en PLOS Computational Biology gosterilebilir PLOS Computational Biology dergisi hakemli bir dergi olup bu alanda cesitli onemli projelere onculuk etmektedir Yazilimlarla ilgili incelemeler acik kaynakli yazilim tutoriallari sunar ve yaklasan hesaplamali biyoloji konferanslari hakkinda bilgiler verir Ayni zamanda acik erisimli bir dergidir Atifta bulunuldugu surecte dergideki yayinlar ozgurce ve bedelsiz bir sekilde kullanilabilir Ayrica bakinizBiyoinformatik Biyoistatistik Hesaplamali kimya Hesaplamali bilim Matematiksel biyoloji Monte Carlo metodu Molekuler modelleme Yapisal biyoloji Sistem biyolojisiKaynakca Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes Kanehisa M and Goto S 25 Temmuz 2003 tarihinde kaynagindan MEME 19 Nisan 2015 tarihinde kaynagindan Tomtom 19 Nisan 2015 tarihinde kaynagindan PLOS Computational Biology A Peer Reviewed Open Access Journal journals plos org 10 Mayis 2015 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Mayis 2020 Biyoloji ile ilgili bu madde taslak seviyesindedir Madde icerigini genisleterek Vikipedi ye katki saglayabilirsiniz