Kimyada istiflenme, genelde aromatik olan moleküllerin atomlar arası etkileşerek deste şeklinde üst üst üste gelmesidir. İstiflenmiş bir sistemin en yaygın bilinen örneği DNA molekülünde birbirini takibeden bazlarda görülür. İstiflenme proteinlerde, non-polar iki halkanın örtüşmesi halinde de meydana gelir. Hangi moleküllerarası kuvvetlerin istiflenmeye neden olduğu hâlen tartışma konusudur.
Etkileyici kuvvetler
İstiflenmeye genelde π-π etkileşimi dense de, π-orbitalinin varlığı nedeniyle olan etkiler bu etkileşimin yalnızca bir kayanğıdır ve çoğu durumda baskın neden olmadığı gösterilmiştir.
Üçten az halkalı halka sistemlerinde, ab initio teorik hesaplamalarla gösterilmiştir ki aromatiklik istifleme kuvvetlerine az katkıda bulunmaktadır. İstiflenmiş biçimi stabilize eden bu kuvvetlerin büyüklüğü, benzer moleküllerin istiflendikleri zaman maruz oldukları van der Waals kuvvetlerinden çok fark etmez. Dolayısıyla DNA nükleobazları aromatik olmalarından dolayı DNA'nın istiflenmiş yapısını stabilize etmezler; bu stabilizasyon tüm kapalı kabuklu nötür moleküllerin hissettiği intermoleküler kuvvetlerden kaynaklanır.
Supramileküler kimyada istiflenme
Supramoleküler kimyada bir aromatik etkileşim veya (π-π etkileşimi) aromatik kısımlar içeren organik bileşikler arasındaki nonkovalent etkileşimlerdir. π-konjüge systemlerde p-orbitallerin moleküller arasında örtüşmesi π-π etkileşimlerine neden olur, dolayısıyla π-elektron sayısı arttıkça etkileşimler de daha güçlü olur. Diğer nonkovalent etkileşimler arasında hidrojen bağları, van der Waals kuvvetleri, ve dipol-dipol etkileşimleri sayılabilir.
π-π etkileşimleri, çok sayıda olan delokalize π-elektronları bulunmasından dolayı , ve gibi yassı polisiklik aromatik hidrokarbonlarda etkir. Diğer nonkovalent etkileşimlerden biraz daha güçlü olan bu etkileşim supramoleküler kimyanın çeşitli sahalarında önemli rol oynar. Örneğin, π-π etkileşimleri aromatik bileşiklerin kristal içindeki molekül yapılarında büyük etkisi vardır.
İstiflenmenin iyi bir gösterisi, aşağıda resmi görülen buckycatcher 'de bulunabilir. Bu moleküler cımbız, bir molekülü ile aynı eğriliğe sahip olan iki içbükey "bucky-kâse" (İng. buckybowl)'den oluşmaktadır. Çözelti içinde, bu ikisi arasında 8600 M−1 değerinde bir ölçülmüştür.
Biyolojide istiflenme
DNA'da komşu nükleotitler arasında pi istiflenmesi oluşur ve molekül yapısının stabilitesine katkıda bulunur. Nükleotitlerdeki bazlar pürin veya pirimidin halkalardan oluşur. DNA molekülündeki aromatik halkalar, iplikçiklere neredeyse dikey olarak yerleşmişlerdir. Dolayısıyla aromatik halkalar birbirlerine paraleldirler ve aralarında aromatik etkileşimler olabilir. Çifte bağları meydana getiren atomlardan uzanan pi bağları, komşu bağlardaki pi bağları ile örtüşürler. Kovalen olmayan bir bağ, kovalent bir bağdan daha kuvvetli olmasına rağmen, DNA molekülündeki tüm pi istiflenme etkileşimlerinin toplamı büyük bir stabilizasyon enerjisi yaratır.
Malzemelerde kullanımı
Çoğu sıvı kristal bileşikleri π-π etkileşimleri ile sütunsal yapılar oluştururlar. Ayrıca, π-π etkileşimleri nanoteknolojide kullanılan moleküler montaj tekniklerinde önemli bir unsurdur.
Aromatik istiflenme etkileşimleri
Aromatik istiflenme etkileşimleri (bunlar bazen fenil istiflenmesi olarak da adlandırılır) organik kimyada aromatik bileşikleri ve onların fonksiyonel gruplarını etkileyen bir olgudur. Yassı aromatik halkalar arasındaki kuvvetli yüzünden, farklı moleküller arasındaki bu aromatik gruplar, madenî para destesi gibi düzenlenirler. Bu bağlanma pek çok farklı polimerin özelliklerine etki eder: aramidler, polistiren, DNA, RNA, proteinler ve peptitler. Gaz sensorlarında aromatik bileşiklerin teşhisinde bu etkiden yararlanılır.
T istiflenmesi
İlgili bir etki T-istiflenmesi olarak adlandırılır, proteinlerde, bir aromatik sitemdeki pozitif yüklü bir hidrojen atomunun başka bir aromatik sistemin aromatik düzleminin ortasına doğru uzanması durumunda görülür.
Ayrica bakınız
Dış bağlantılar
- The physical basis of nucleic acid base stacking in water.30 Haziran 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
Kaynakça
- ^ A. Petitjean, R. G. Khoury, N. Kyritsakas and J. M. Lehn (2004). "Dynamic Devices. Shape Switching and Substrate Binding in Ion-Controlled Nanomechanical Molecular Tweezers". J. Am. Chem. Soc. 126 (21). ss. 6637-6647. doi:10.1021/ja031915r.
- ^ a b A. Sygula, F. R. Fronczek, R. Sygula, P. W. Rabideau and M. M. Olmstead (2007). "A Double Concave Hydrocarbon Buckycatcher". J. Am. Chem. Soc. 129 (13). ss. 3842-3843. doi:10.1021/ja070616p.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Kimyada istiflenme genelde aromatik olan molekullerin atomlar arasi etkileserek deste seklinde ust ust uste gelmesidir Istiflenmis bir sistemin en yaygin bilinen ornegi DNA molekulunde birbirini takibeden bazlarda gorulur Istiflenme proteinlerde non polar iki halkanin ortusmesi halinde de meydana gelir Hangi molekullerarasi kuvvetlerin istiflenmeye neden oldugu halen tartisma konusudur Aromatik etkilesimler yoluyla bir tarafindan baglanmis bir molekulunun kristal yapisi Aromatik etkilesimler yoluyla bir tarafindan baglanmis bir fulleren molekulunun kristal yapisi Etkileyici kuvvetlerIstiflenmeye genelde p p etkilesimi dense de p orbitalinin varligi nedeniyle olan etkiler bu etkilesimin yalnizca bir kayangidir ve cogu durumda baskin neden olmadigi gosterilmistir Ucten az halkali halka sistemlerinde ab initio teorik hesaplamalarla gosterilmistir ki aromatiklik istifleme kuvvetlerine az katkida bulunmaktadir Istiflenmis bicimi stabilize eden bu kuvvetlerin buyuklugu benzer molekullerin istiflendikleri zaman maruz olduklari van der Waals kuvvetlerinden cok fark etmez Dolayisiyla DNA nukleobazlari aromatik olmalarindan dolayi DNA nin istiflenmis yapisini stabilize etmezler bu stabilizasyon tum kapali kabuklu notur molekullerin hissettigi intermolekuler kuvvetlerden kaynaklanir Supramilekuler kimyada istiflenmeSupramolekuler kimyada bir aromatik etkilesim veya p p etkilesimi aromatik kisimlar iceren organik bilesikler arasindaki nonkovalent etkilesimlerdir p konjuge systemlerde p orbitallerin molekuller arasinda ortusmesi p p etkilesimlerine neden olur dolayisiyla p elektron sayisi arttikca etkilesimler de daha guclu olur Diger nonkovalent etkilesimler arasinda hidrojen baglari van der Waals kuvvetleri ve dipol dipol etkilesimleri sayilabilir p p etkilesimleri cok sayida olan delokalize p elektronlari bulunmasindan dolayi ve gibi yassi polisiklik aromatik hidrokarbonlarda etkir Diger nonkovalent etkilesimlerden biraz daha guclu olan bu etkilesim supramolekuler kimyanin cesitli sahalarinda onemli rol oynar Ornegin p p etkilesimleri aromatik bilesiklerin kristal icindeki molekul yapilarinda buyuk etkisi vardir Istiflenmenin iyi bir gosterisi asagida resmi gorulen buckycatcher de bulunabilir Bu molekuler cimbiz bir molekulu ile ayni egrilige sahip olan iki icbukey bucky kase Ing buckybowl den olusmaktadir Cozelti icinde bu ikisi arasinda 8600 M 1 degerinde bir olculmustur Biyolojide istiflenmeDNA da komsu nukleotitler arasinda pi istiflenmesi olusur ve molekul yapisinin stabilitesine katkida bulunur Nukleotitlerdeki bazlar purin veya pirimidin halkalardan olusur DNA molekulundeki aromatik halkalar iplikciklere neredeyse dikey olarak yerlesmislerdir Dolayisiyla aromatik halkalar birbirlerine paraleldirler ve aralarinda aromatik etkilesimler olabilir Cifte baglari meydana getiren atomlardan uzanan pi baglari komsu baglardaki pi baglari ile ortusurler Kovalen olmayan bir bag kovalent bir bagdan daha kuvvetli olmasina ragmen DNA molekulundeki tum pi istiflenme etkilesimlerinin toplami buyuk bir stabilizasyon enerjisi yaratir Malzemelerde kullanimiCogu sivi kristal bilesikleri p p etkilesimleri ile sutunsal yapilar olustururlar Ayrica p p etkilesimleri nanoteknolojide kullanilan molekuler montaj tekniklerinde onemli bir unsurdur Aromatik istiflenme etkilesimleriAromatik istiflenme etkilesimleri bunlar bazen fenil istiflenmesi olarak da adlandirilir organik kimyada aromatik bilesikleri ve onlarin fonksiyonel gruplarini etkileyen bir olgudur Yassi aromatik halkalar arasindaki kuvvetli yuzunden farkli molekuller arasindaki bu aromatik gruplar madeni para destesi gibi duzenlenirler Bu baglanma pek cok farkli polimerin ozelliklerine etki eder aramidler polistiren DNA RNA proteinler ve peptitler Gaz sensorlarinda aromatik bilesiklerin teshisinde bu etkiden yararlanilir T istiflenmesiIlgili bir etki T istiflenmesi olarak adlandirilir proteinlerde bir aromatik sitemdeki pozitif yuklu bir hidrojen atomunun baska bir aromatik sistemin aromatik duzleminin ortasina dogru uzanmasi durumunda gorulur Ayrica bakinizEnterkalasyonDis baglantilarThe physical basis of nucleic acid base stacking in water 30 Haziran 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce Kaynakca A Petitjean R G Khoury N Kyritsakas and J M Lehn 2004 Dynamic Devices Shape Switching and Substrate Binding in Ion Controlled Nanomechanical Molecular Tweezers J Am Chem Soc 126 21 ss 6637 6647 doi 10 1021 ja031915r KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link a b A Sygula F R Fronczek R Sygula P W Rabideau and M M Olmstead 2007 A Double Concave Hydrocarbon Buckycatcher J Am Chem Soc 129 13 ss 3842 3843 doi 10 1021 ja070616p KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link