T7 RNA Polymeraz T7 bakteriyofaja ait bir RNA polimerazdır. Bu enzim, faj genlerindeki genetik bilginin mesajcı RNA molekülü şeklinde transkripsiyonunu katalizler.
Etkinlik
T7 RNA polimeraz sadece T7 promotörünün akış aşağısının transkripsiyonunu yapar. RNA oluşturmak için T7 polimerazının bir DNA kalıba, ayrıca kofaktör olarak Mg2+ iyonuna gereği vardır. RNA'yı 5'→ 3' yönünde oluşturur. Hata oranı çok düşüktür. Moleküler ağırlığı 99 kDa'dır.
Nükleaz etkinliği
T7 RNA polimeraz, polimeraz özelliğinin yanı sıra tek iplikli DNA ve RNA üzerinde eksonükleaz etkinliğine de sahiptir. Bu etkinlik çift iplikli DNA üzerinde bir promotörden başlamış polimerizasyon sırasında görünmez ama transkripsiyonun durdurulması halinde nükleaz etkinliği gözlemlenebilir. Nükleaz etkinliği sonucu geriye 3′-OH uç kalacak şekilde bir veya iki nükleotitlik parçalar nükleik asidin 3' ucundan kırpılır. rNTP moleküllerinin varlığında bu nükleaz etkinliği maskelenir ve yerine polimeraz aktivitesi gelir.
İlişkili proteinler
Aynı evrimsel aileye ait ilişkili proteinler arasında T3 ve ve mitokondrial RNA polimerazlar sayılabilir. T7 RNA polimeraz ailesi, yapısal ve evrimsel olarak çok altbirimli RNA polimerazlar ailesinden (bakteriyel ve ökaryotik RNA polimeraz alt-birimleri de dahil olmak üzere) farklıdır. Bakteriyel RNA polimerazlara tezat olarak, T7 polimeraz rifampisin antibiyotiği tarafından inhibe olmaz. Buna rağmen, bu enzim ile daha kompleks yapılı diğer RNA polimerazlar pek çok ortak özelliklere sahiptir.
Uygulama
Biyoteknoloji uygulamalarında, T7 RNA polimeraz vektör içine klonlanmış DNA'nın transkripsiyonu için kullanılır. Bu vektörlerde genelde birbirine ters yönde iki farklı faj promotörü bulunur (örneğin T7 ve T3 veya T7 ve Sp6). Böylece farklı polimerazlar kullanılarak vektöre sokulmuş DNA'nın iki ipliğinden de RNA elde edilebilir. veya kullanılması enzimin aktivitesini artırır. Bu sistem ile homojen işaretlenmiş tek iplikli RNA elde edilebilir.
Kaynakça
- ^ McAllister WT (1993). "Structure and function of the bacteriophage T7 RNA polymerase (or, the virtues of simplicity)". Cell. Mol. Biol. Res. 39 (4). ss. 385-91. (PMID) 8312975.
- ^ Sastry SS, Ross BM (Mart 1997). . J. Biol. Chem. 272 (13). ss. 8644-52. doi:10.1074/jbc.272.13.8644. (PMID) 9079696. 25 Eylül 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 19 Şubat 2011.
- ^ Sousa R, Mukherjee S (2003). "T7 RNA polymerase". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Cilt 73. ss. 1-41. doi:10.1016/S0079-6603(03)01001-8. (PMID) 12882513.
- ^ Martin CT, Esposito EA, Theis K, Gong P (2005). "Structure and function in promoter escape by T7 RNA polymerase". Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. Cilt 80. ss. 323-47. doi:10.1016/S0079-6603(05)80008-X. (PMID) 16164978.
- ^ "T7 RNA Polymerase" (PDF). 21 Kasım 2004 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 18 Şubat 2011.
Dış bağlantılar
- T7 RNA Polymeraz Enzimolojisi7 Eylül 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
- OpenWetWare5 Ocak 2011 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
T7 RNA Polymeraz T7 bakteriyofaja ait bir RNA polimerazdir Bu enzim faj genlerindeki genetik bilginin mesajci RNA molekulu seklinde transkripsiyonunu katalizler Cift iplikli bir DNA kaliptan turuncu mRNA yesil ureten bir T7 RNA Polimeraz mavi EtkinlikT7 RNA polimeraz sadece T7 promotorunun akis asagisinin transkripsiyonunu yapar RNA olusturmak icin T7 polimerazinin bir DNA kaliba ayrica kofaktor olarak Mg2 iyonuna geregi vardir RNA yi 5 3 yonunde olusturur Hata orani cok dusuktur Molekuler agirligi 99 kDa dir Nukleaz etkinligiT7 RNA polimeraz polimeraz ozelliginin yani sira tek iplikli DNA ve RNA uzerinde eksonukleaz etkinligine de sahiptir Bu etkinlik cift iplikli DNA uzerinde bir promotorden baslamis polimerizasyon sirasinda gorunmez ama transkripsiyonun durdurulmasi halinde nukleaz etkinligi gozlemlenebilir Nukleaz etkinligi sonucu geriye 3 OH uc kalacak sekilde bir veya iki nukleotitlik parcalar nukleik asidin 3 ucundan kirpilir rNTP molekullerinin varliginda bu nukleaz etkinligi maskelenir ve yerine polimeraz aktivitesi gelir Iliskili proteinlerAyni evrimsel aileye ait iliskili proteinler arasinda T3 ve ve mitokondrial RNA polimerazlar sayilabilir T7 RNA polimeraz ailesi yapisal ve evrimsel olarak cok altbirimli RNA polimerazlar ailesinden bakteriyel ve okaryotik RNA polimeraz alt birimleri de dahil olmak uzere farklidir Bakteriyel RNA polimerazlara tezat olarak T7 polimeraz rifampisin antibiyotigi tarafindan inhibe olmaz Buna ragmen bu enzim ile daha kompleks yapili diger RNA polimerazlar pek cok ortak ozelliklere sahiptir UygulamaBiyoteknoloji uygulamalarinda T7 RNA polimeraz vektor icine klonlanmis DNA nin transkripsiyonu icin kullanilir Bu vektorlerde genelde birbirine ters yonde iki farkli faj promotoru bulunur ornegin T7 ve T3 veya T7 ve Sp6 Boylece farkli polimerazlar kullanilarak vektore sokulmus DNA nin iki ipliginden de RNA elde edilebilir veya kullanilmasi enzimin aktivitesini artirir Bu sistem ile homojen isaretlenmis tek iplikli RNA elde edilebilir Kaynakca McAllister WT 1993 Structure and function of the bacteriophage T7 RNA polymerase or the virtues of simplicity Cell Mol Biol Res 39 4 ss 385 91 PMID 8312975 Sastry SS Ross BM Mart 1997 J Biol Chem 272 13 ss 8644 52 doi 10 1074 jbc 272 13 8644 PMID 9079696 25 Eylul 2019 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 19 Subat 2011 Sousa R Mukherjee S 2003 T7 RNA polymerase Prog Nucleic Acid Res Mol Biol Cilt 73 ss 1 41 doi 10 1016 S0079 6603 03 01001 8 PMID 12882513 Martin CT Esposito EA Theis K Gong P 2005 Structure and function in promoter escape by T7 RNA polymerase Prog Nucleic Acid Res Mol Biol Cilt 80 ss 323 47 doi 10 1016 S0079 6603 05 80008 X PMID 16164978 KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link T7 RNA Polymerase PDF 21 Kasim 2004 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 18 Subat 2011 Dis baglantilarT7 RNA Polymeraz Enzimolojisi7 Eylul 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce OpenWetWare5 Ocak 2011 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce