Çinko parmak, ait olduğu proteindeki katlanmayı stabilize etmek için bir veya daha fazla çinko iyonunun (Zn2+) koordinasyonu ile karakterize edilen küçük bir protein yapısal motifidir. Genellikle çok domainli proteinlerde metal bağlayıcı bir alan olarak görülür.
Çinko parmakları içeren proteinler (çinko parmak proteinleri) birkaç farklı yapısal familyada sınıflandırılır. Yunan anahtarları veya β saç tokaları gibi açıkça tanımlanmış diğer ikincil yapıların aksine, her biri benzersiz bir üç boyutlu mimariye sahip bir dizi çinko parmak türü vardır. Belirli bir çinko parmak proteininin sınıfı bu üç boyutlu yapı tarafından belirlenir, ancak proteinin birincil yapısına veya çinko iyonunu koordine eden ligandların kimliğine dayanarak da tanınabilir. Bununla birlikte, bu proteinlerin büyük çeşitliliğine rağmen, büyük çoğunluk tipik olarak DNA, RNA, proteinler veya diğer küçük, faydalı molekülleri bağlayan etkileşim modülleri olarak işlev görür ve yapıdaki varyasyonlar öncelikle belirli bir proteinin bağlanma spesifitesini değiştirmeye yarar.
Orijinal keşifleri ve yapılarının aydınlatılmasından bu yana, bu etkileşim modülleri biyolojik dünyada her yerde bulunduğu ve insan genomunun genlerinin % 3'ünde yer aldığı kanıtlandı. Ek olarak, çinko parmaklar çeşitli terapötik ve araştırma kapasitelerinde son derece yararlı hale gelmiştir. Çinko parmakların belirli bir sekans için afiniteye sahip olmasını sağlamak aktif bir araştırma alanıdır ve çinko parmak nükleazları ve çinko parmak transkripsiyon faktörleri, bugüne kadar gerçekleştirilmiş en önemli çinko parmak uygulamalarından ikisidir.
Kaynakça
- ^ "Zinc fingers: a novel protein fold for nucleic acid recognition". Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. Cilt 52. 1987. ss. 473-82.
- ^ "The discovery of zinc fingers and their applications in gene regulation and genome manipulation". Annual Review of Biochemistry. Cilt 79. 2010. ss. 213-31. – via Annual Reviews (abonelik gereklidir)
Dış bağlantılar
- C2H2 family15 Şubat 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde . at PlantTFDB: Plant Transcription Factor Database22 Nisan 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- . European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). 5 Eylül 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 13 Ocak 2008.
- . Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB) Protein Data Bank (PDB). 31 Mayıs 2008 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 13 Ocak 2008.
- The double helix between the zinc finger5 Mayıs 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Zinc finger C2H2-type domain13 Nisan 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde . in PROSITE
- Entry for zinc finger class C2H2 in the SMART database5 Mayıs 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- The Zinc Finger Consortium14 Ocak 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Zinc Finger Consortium Materials from Addgene5 Eylül 2008 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Predicting DNA-binding Specificities for C2H2 Zinc Finger Proteins15 Mayıs 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Cinko parmak ait oldugu proteindeki katlanmayi stabilize etmek icin bir veya daha fazla cinko iyonunun Zn2 koordinasyonu ile karakterize edilen kucuk bir protein yapisal motifidir Genellikle cok domainli proteinlerde metal baglayici bir alan olarak gorulur Bir a sarmal ve bir anti paralel b yapraktan olusan Cys2His2 cinko parmak motifi Cinko iyonu yesil iki histidin ve iki sistein tarafindan koordine edilir DNA turuncu ile kompleks halinde uc cinko parmak iceren Zif268 proteini mavi Koordine edici amino asit kalintilari ve cinko iyonlari yesil vurgulanmistir Cinko parmaklari iceren proteinler cinko parmak proteinleri birkac farkli yapisal familyada siniflandirilir Yunan anahtarlari veya b sac tokalari gibi acikca tanimlanmis diger ikincil yapilarin aksine her biri benzersiz bir uc boyutlu mimariye sahip bir dizi cinko parmak turu vardir Belirli bir cinko parmak proteininin sinifi bu uc boyutlu yapi tarafindan belirlenir ancak proteinin birincil yapisina veya cinko iyonunu koordine eden ligandlarin kimligine dayanarak da taninabilir Bununla birlikte bu proteinlerin buyuk cesitliligine ragmen buyuk cogunluk tipik olarak DNA RNA proteinler veya diger kucuk faydali molekulleri baglayan etkilesim modulleri olarak islev gorur ve yapidaki varyasyonlar oncelikle belirli bir proteinin baglanma spesifitesini degistirmeye yarar Orijinal kesifleri ve yapilarinin aydinlatilmasindan bu yana bu etkilesim modulleri biyolojik dunyada her yerde bulundugu ve insan genomunun genlerinin 3 unde yer aldigi kanitlandi Ek olarak cinko parmaklar cesitli terapotik ve arastirma kapasitelerinde son derece yararli hale gelmistir Cinko parmaklarin belirli bir sekans icin afiniteye sahip olmasini saglamak aktif bir arastirma alanidir ve cinko parmak nukleazlari ve cinko parmak transkripsiyon faktorleri bugune kadar gerceklestirilmis en onemli cinko parmak uygulamalarindan ikisidir Kaynakca Zinc fingers a novel protein fold for nucleic acid recognition Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology Cilt 52 1987 ss 473 82 The discovery of zinc fingers and their applications in gene regulation and genome manipulation Annual Review of Biochemistry Cilt 79 2010 ss 213 31 via Annual Reviews abonelik gereklidir Dis baglantilarC2H2 family15 Subat 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde at PlantTFDB Plant Transcription Factor Database22 Nisan 2016 tarihinde Wayback Machine sitesinde European Molecular Biology Laboratory European Bioinformatics Institute EMBL EBI 5 Eylul 2007 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 13 Ocak 2008 Research Collaboratory for Structural Bioinformatics RCSB Protein Data Bank PDB 31 Mayis 2008 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 13 Ocak 2008 The double helix between the zinc finger5 Mayis 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde Zinc finger C2H2 type domain13 Nisan 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde in PROSITE Entry for zinc finger class C2H2 in the SMART database5 Mayis 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde The Zinc Finger Consortium14 Ocak 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde Zinc Finger Consortium Materials from Addgene5 Eylul 2008 tarihinde Wayback Machine sitesinde Predicting DNA binding Specificities for C2H2 Zinc Finger Proteins15 Mayis 2020 tarihinde Wayback Machine sitesinde