Seçici süpürme (İngilizce: selective sweep), yakın bir geçmişte, yararlı ve güçlü bir doğal seçilim sonucu oluşmuş bir DNA mutasyonun yakınlarında yer alan nükleotitler içindeki varyasyonların azaltılması veya ortadan kaldırılmasıdır.
Seçici bir süpürme, popülasyonun diğer üyelerine nazaran taşıyıcılarının seçilim değerini ve uyum başarısını artıran yeni bir mutasyon oluştuğunda ortaya çıkabilir. Burada, doğal seçilim, daha yüksek uyum başarısı gösteren bireyler lehine olacaktır ve zamanla yeni mutasyona uğramış varyantların (aleller) frekans ve görülme sıklıkları diğer alellere göre artacaktır. Yaygınlık derecesi arttığı için, bu yeni mutasyona bağlanmış olan nötral veya hemen hemen nötral diğer bir genetik varyasyon da, onunla birlikte daha yaygın hale gelecektir. Bu olguya, genetik otostop denir. Güçlü bir seçici süpürme, genomun, pozitif ve olumlu olarak seçilen haplotipin (mutasyona uğramış alel ile onun komşuları) popülasyonda var olan tek haplotip olduğu bir bölgesinde oluşur ve bu kromozom bölgesinin toplam genetik varyasyonlarının büyük bir azalması ile sonuçlanır.
Seçici süpürmenin tespit edilmesi
Seçici bir süpürmenin oluşup oluşmadığı, çeşitli şekillerde incelenerek tespit edilebilir. Bir yöntem, bağlantı dengesizliğini, yani belli bir haplotipin, o popülasyonda olması gerektiğinden fazla temsil edilip edilmediğini ölçmektir. Nötr evrim altında, genetik rekombinasyon, bir haplotip içindeki farklı alellerin birbirleriyle yeniden karışması ile sonuçlanacaktır ve bu durumda hiçbir alel, tek başına popülasyona hakim olmayacaktır. Ancak, seçici süpürme sırasında, olumlu olarak seçilen bir gen varyantının seçilimi, komşu alellerin de birlikte seçilmesi ve rekombinasyonların daha az fırsat bulması ile sonuçlanacaktır. Bu nedenle, güçlü bir bağlantı dengesizliğinin var olması, yeni bir seçici süpürmenin meydana gelmiş olmasının bir göstergesi olabilir ve yakın zamanda seçilim altında kalan bölgeleri tanımlamada kullanılabilir.
Toplam 269 kişinin genetik varyasyonlarının incelediği bir araştırmada, 1, 2, 4, 8, 12 ve 22 numaralı kromozomlarda, insanlarda da seçici süpürmenin meydana gelmiş olduğuna dair kanıtlar bulunmuştur.
Bir tarım bitkisi olan mısırda, Y1'i çevreleyen sarı ve beyaz mısır genotiplerinin son bir karşılaştırılması (fiton sentaz genleri (İng: phytoene synthase) sarı renkli endospermden sorumludur), aynı lokus içindeki çeşitliliği ve çevre bölgelerdeki bağlantı dengesizliğini azaltan sarı germ plasması (irsiyet plasması) içinde, seçici süpürmeye dair güçlü kanıtlar göstermektedir. Beyaz mısır ise, artan bir çeşitliliğe sahip olup böylece, seçici süpürme ile ilişkili herhangi bir bağlantı dengesizliği göstermemektedir.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ "A haplotype map of the human genome". Nature. 437 (7063). Ekim 2005. ss. 1299-320. doi:10.1038/nature04226. (PMC) 1880871 $2. (PMID) 16255080.
- ^ Palaisa K, Morgante M, Tingey S, Rafalski A (Haziran 2004). "Long-range patterns of diversity and linkage disequilibrium surrounding the maize Y1 gene are indicative of an asymmetric selective sweep". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101 (26). ss. 9885-90. doi:10.1073/pnas.0307839101. (PMC) 470768 $2. (PMID) 15161968. 19 Eylül 2019 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 21 Ekim 2011.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Secici supurme Ingilizce selective sweep yakin bir gecmiste yararli ve guclu bir dogal secilim sonucu olusmus bir DNA mutasyonun yakinlarinda yer alan nukleotitler icindeki varyasyonlarin azaltilmasi veya ortadan kaldirilmasidir Secici bir supurme populasyonun diger uyelerine nazaran tasiyicilarinin secilim degerini ve uyum basarisini artiran yeni bir mutasyon olustugunda ortaya cikabilir Burada dogal secilim daha yuksek uyum basarisi gosteren bireyler lehine olacaktir ve zamanla yeni mutasyona ugramis varyantlarin aleller frekans ve gorulme sikliklari diger alellere gore artacaktir Yayginlik derecesi arttigi icin bu yeni mutasyona baglanmis olan notral veya hemen hemen notral diger bir genetik varyasyon da onunla birlikte daha yaygin hale gelecektir Bu olguya genetik otostop denir Guclu bir secici supurme genomun pozitif ve olumlu olarak secilen haplotipin mutasyona ugramis alel ile onun komsulari populasyonda var olan tek haplotip oldugu bir bolgesinde olusur ve bu kromozom bolgesinin toplam genetik varyasyonlarinin buyuk bir azalmasi ile sonuclanir Secici supurmenin tespit edilmesiSecici bir supurmenin olusup olusmadigi cesitli sekillerde incelenerek tespit edilebilir Bir yontem baglanti dengesizligini yani belli bir haplotipin o populasyonda olmasi gerektiginden fazla temsil edilip edilmedigini olcmektir Notr evrim altinda genetik rekombinasyon bir haplotip icindeki farkli alellerin birbirleriyle yeniden karismasi ile sonuclanacaktir ve bu durumda hicbir alel tek basina populasyona hakim olmayacaktir Ancak secici supurme sirasinda olumlu olarak secilen bir gen varyantinin secilimi komsu alellerin de birlikte secilmesi ve rekombinasyonlarin daha az firsat bulmasi ile sonuclanacaktir Bu nedenle guclu bir baglanti dengesizliginin var olmasi yeni bir secici supurmenin meydana gelmis olmasinin bir gostergesi olabilir ve yakin zamanda secilim altinda kalan bolgeleri tanimlamada kullanilabilir Toplam 269 kisinin genetik varyasyonlarinin inceledigi bir arastirmada 1 2 4 8 12 ve 22 numarali kromozomlarda insanlarda da secici supurmenin meydana gelmis olduguna dair kanitlar bulunmustur Bir tarim bitkisi olan misirda Y1 i cevreleyen sari ve beyaz misir genotiplerinin son bir karsilastirilmasi fiton sentaz genleri Ing phytoene synthase sari renkli endospermden sorumludur ayni lokus icindeki cesitliligi ve cevre bolgelerdeki baglanti dengesizligini azaltan sari germ plasmasi irsiyet plasmasi icinde secici supurmeye dair guclu kanitlar gostermektedir Beyaz misir ise artan bir cesitlilige sahip olup boylece secici supurme ile iliskili herhangi bir baglanti dengesizligi gostermemektedir Ayrica bakinizUluslararasi HapMap Projesi Hill Robertson etkisiKaynakca A haplotype map of the human genome Nature 437 7063 Ekim 2005 ss 1299 320 doi 10 1038 nature04226 PMC 1880871 2 PMID 16255080 Palaisa K Morgante M Tingey S Rafalski A Haziran 2004 Long range patterns of diversity and linkage disequilibrium surrounding the maize Y1 gene are indicative of an asymmetric selective sweep Proc Natl Acad Sci U S A 101 26 ss 9885 90 doi 10 1073 pnas 0307839101 PMC 470768 2 PMID 15161968 19 Eylul 2019 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 21 Ekim 2011 KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link