Protein dizileme, bir protein veya peptidin tamamının veya bir kısmının amino asit dizisini belirlemenin pratik işlemidir. Bu işlem, proteini tanımlamayı veya onun translasyon sonrası modifikasyonlarını karakterize etmeyi sağlayabilir. Tipik olarak, bir proteinin kısmi dizilimi, genlerin kavramsal çevirisinden türetilen protein dizilerinin veri tabanlarına referansla onu tanımlamak için yeterli bilgi (bir veya daha fazla dizi etiketi) sağlar.
Protein dizilemesinin iki ana doğrudan yöntemi, kütle spektrometrisi ve bir protein dizileyici kullanarak Edman bozunmasının uygulanmasıdır. Kütle spektrometrisi yöntemleri şu anda protein dizileme ve tanımlamada en yaygın kullanılan yöntemdir, ancak Edman bozunması bir proteinin <i id="mwEw">N-</i> sonunu karakterize etmek için değerli bir araç olmaya devam etmektedir.
Biyoinformatik araçlar
Kütle spektrumlarının yorumlanmasına (bkz. De novo peptid dizileme ), protein dizilerini karşılaştırmaya veya analiz etmeye (bkz. Dizi analizi) veya peptit veya protein dizilerini kullanarak veri tabanlarını araştırmaya (bkz. BLAST) yardımcı olmak amacıyla çeşitli biyoinformatik araçlar mevcuttur.
Kaynakça
Konuyla ilgili yayınlar
- Steen H, Mann M (Eylül 2004). "The ABC's (and XYZ's) of peptide sequencing". Nature Reviews Molecular Cell Biology. 5 (9): 699-711. doi:10.1038/nrm1468. (PMID) 15340378.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Protein dizileme bir protein veya peptidin tamaminin veya bir kisminin amino asit dizisini belirlemenin pratik islemidir Bu islem proteini tanimlamayi veya onun translasyon sonrasi modifikasyonlarini karakterize etmeyi saglayabilir Tipik olarak bir proteinin kismi dizilimi genlerin kavramsal cevirisinden turetilen protein dizilerinin veri tabanlarina referansla onu tanimlamak icin yeterli bilgi bir veya daha fazla dizi etiketi saglar Beckman Spinco Protein Peptid dizileyeci 1970 Protein dizilemesinin iki ana dogrudan yontemi kutle spektrometrisi ve bir protein dizileyici kullanarak Edman bozunmasinin uygulanmasidir Kutle spektrometrisi yontemleri su anda protein dizileme ve tanimlamada en yaygin kullanilan yontemdir ancak Edman bozunmasi bir proteinin lt i id mwEw gt N lt i gt sonunu karakterize etmek icin degerli bir arac olmaya devam etmektedir Biyoinformatik araclarKutle spektrumlarinin yorumlanmasina bkz De novo peptid dizileme protein dizilerini karsilastirmaya veya analiz etmeye bkz Dizi analizi veya peptit veya protein dizilerini kullanarak veri tabanlarini arastirmaya bkz BLAST yardimci olmak amaciyla cesitli biyoinformatik araclar mevcuttur KaynakcaKonuyla ilgili yayinlarSteen H Mann M Eylul 2004 The ABC s and XYZ s of peptide sequencing Nature Reviews Molecular Cell Biology 5 9 699 711 doi 10 1038 nrm1468 PMID 15340378