Ti plazmit Agrobacterium tumefaciens bakterisinin genetik materyalini bitki hücrelerini enfekte edip bir tümör (taç uru) oluşturmasını ve genetik materyalini bitki hücrelerine aktarmasını sağlayan dairesel bir plazmittir.
Plazmit, 195 protein kodlayan 196 gene sahiptir. Ti plazmid yapısal RNA bulundurmaz ve 206,479 nükleotid uzunluktadır. GC içeriği %56'dır genetik ve materyalin %81'i gen kodlar, bulundurmaz.
Bu plazmidin değiştirilmesi transgenik bitki üretilmesinde çok önemlidir fakat bu sadece dikotiledon bitkilerde gerçekleştirilebilir.
Ti Plazmid Yapısı
Ti plazmit genel olarak bitki genomuna entegre olan bir ya da daha fazla bölgesi, bir vir bölgesi, bir , konjugatif transferin gerçekleşmesini sağlayan bir bölge ve opin katabolizması için gerekli olan genleri içerirler (Şekil 1).
Herhangi bir Ti plazmitinin T-DNA bölgesi sağ ve sol sınır dizilerinin varlığıyla tanımlanır. Bu sınır dizileri 24 bazlık rastgele tekrarlardır. Sınır dizileri arasında kalan herhangi bir DNA, konak bitki genomuna transfer edilecektir. Ti plazmitlerinin nopalin ırkları yaklaşık 20kb büyüklüğünde bir T-DNA bölgesine sahipken, oktopin ırkları 2 T-DNA bölgesi, TL (14kb) ve TR (7kb) içerirler. Sadece TL bölgesi tümör oluşturur, TR bölgesi opin biyosentezi için gerekli genleri taşır (Şekil 2).
Nopalin Ti plazmitlerinin T-DNA’sı 13 (ORF) sahipken, oktopin plazmitlerinin TL T-DNA’sı 8 içerir. Nopalin ve oktopin TL T-DNA’sı merkez bölge olarak bilinen bölgede çok yoğun benzerlik gösterirler. Bu bölge hormon biyosentezinde görevli proteinleri, opin sentezinde görevli proteinleri ve tümör büyüklüğünü belirleyen proteinleri kodlar.
T-DNA Yapısı
T-DNA bölgesi yaklaşık 12–24 kb büyüklüğündedir. Oksin ve sitokinin sentezinde görevli enzimleri kodlayan genleri, ayrıca opin ve agropin olarak bilinen bitki metabolitlerinin sentezinden sorumlu enzimleri kodlayan genleri içerir. Oksin ve sitokinin hormonları, bitki hücresinde büyüme ve gelişmeyi düzenledikleri gibi fazla salgılandıklarında da bitkide tümöre benzeyen oluşumlara sebep olurlar. Opin ve taç uru içinde sentezlenir ve hücre dışına salgılanır. Bakteri bunları bazen karbon bazen azot kaynağı olarak kullanır (Şekil 1).
Ti plazmit üzerinde bulunan opin katabolizması genleri, bakteriye opin alınımı ve parçalanmasında görev alırlar. Bu genler T-DNA bölgesinde bulunmaz, dolayısıyla bitki genomuna aktarılmaz. Ti plazmit üzerinde bulunan vir (virulans) genlerinin ürünleri T-DNA bölgesinin bitki genomuna transferi ve entegrasyonu için mutlaka gereklidir. En az 9 vir-gen operonu bulunmaktadır. Ori bölgesi ise, plazmitin Agrobacterium içinde çoğalması (replikasyonu) için gereklidir.
Biyoloji ile ilgili bu madde seviyesindedir. Madde içeriğini genişleterek Vikipedi'ye katkı sağlayabilirsiniz. |
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Ti plazmit Agrobacterium tumefaciens bakterisinin genetik materyalini bitki hucrelerini enfekte edip bir tumor tac uru olusturmasini ve genetik materyalini bitki hucrelerine aktarmasini saglayan dairesel bir plazmittir Sekil 1 Ti Plazmit yapisi Plazmit 195 protein kodlayan 196 gene sahiptir Ti plazmid yapisal RNA bulundurmaz ve 206 479 nukleotid uzunluktadir GC icerigi 56 dir genetik ve materyalin 81 i gen kodlar bulundurmaz Bu plazmidin degistirilmesi transgenik bitki uretilmesinde cok onemlidir fakat bu sadece dikotiledon bitkilerde gerceklestirilebilir Ti Plazmid YapisiTi plazmit genel olarak bitki genomuna entegre olan bir ya da daha fazla bolgesi bir vir bolgesi bir konjugatif transferin gerceklesmesini saglayan bir bolge ve opin katabolizmasi icin gerekli olan genleri icerirler Sekil 1 Herhangi bir Ti plazmitinin T DNA bolgesi sag ve sol sinir dizilerinin varligiyla tanimlanir Bu sinir dizileri 24 bazlik rastgele tekrarlardir Sinir dizileri arasinda kalan herhangi bir DNA konak bitki genomuna transfer edilecektir Ti plazmitlerinin nopalin irklari yaklasik 20kb buyuklugunde bir T DNA bolgesine sahipken oktopin irklari 2 T DNA bolgesi TL 14kb ve TR 7kb icerirler Sadece TL bolgesi tumor olusturur TR bolgesi opin biyosentezi icin gerekli genleri tasir Sekil 2 Nopalin Ti plazmitlerinin T DNA si 13 ORF sahipken oktopin plazmitlerinin TL T DNA si 8 icerir Nopalin ve oktopin TL T DNA si merkez bolge olarak bilinen bolgede cok yogun benzerlik gosterirler Bu bolge hormon biyosentezinde gorevli proteinleri opin sentezinde gorevli proteinleri ve tumor buyuklugunu belirleyen proteinleri kodlar T DNA YapisiT DNA bolgesi yaklasik 12 24 kb buyuklugundedir Oksin ve sitokinin sentezinde gorevli enzimleri kodlayan genleri ayrica opin ve agropin olarak bilinen bitki metabolitlerinin sentezinden sorumlu enzimleri kodlayan genleri icerir Oksin ve sitokinin hormonlari bitki hucresinde buyume ve gelismeyi duzenledikleri gibi fazla salgilandiklarinda da bitkide tumore benzeyen olusumlara sebep olurlar Opin ve tac uru icinde sentezlenir ve hucre disina salgilanir Bakteri bunlari bazen karbon bazen azot kaynagi olarak kullanir Sekil 1 Ti plazmit uzerinde bulunan opin katabolizmasi genleri bakteriye opin alinimi ve parcalanmasinda gorev alirlar Bu genler T DNA bolgesinde bulunmaz dolayisiyla bitki genomuna aktarilmaz Ti plazmit uzerinde bulunan vir virulans genlerinin urunleri T DNA bolgesinin bitki genomuna transferi ve entegrasyonu icin mutlaka gereklidir En az 9 vir gen operonu bulunmaktadir Ori bolgesi ise plazmitin Agrobacterium icinde cogalmasi replikasyonu icin gereklidir Biyoloji ile ilgili bu madde taslak seviyesindedir Madde icerigini genisleterek Vikipedi ye katki saglayabilirsiniz