5-metilsitozin | |
---|---|
Kimyasal Adı | 4-amino-5-metil-3H-pirimidin-2-on |
CAS numarası | 554-01-8 |
PubChem | 65040 |
SMILES | CC1=C(NC(=O)N=C1)N |
MeSH adı | 5-Methylcytosine |
Kimyasal formül | C5H7N3O |
Molekül ağırlığı | 125,129 |
5-Metilsitozin sitozin'in 5 numaralı karbonuna bir metil grubunun eklenmiş halidir. Sitozinin bu metillenmiş hali onun baz eşleşme özelliklerini etkilemez.
In vivo
5-Metilsitozin, etkisiyle meydana gelen bir epigenetik değişimdir. DNA metilasyonunun en sık görülen ürünüdür. Canlılardaki işlevi büyük çeşitlilik gösterir:
- Bakterilerde 5-metilsitozin pek çok DNA dizisinde bulunabilir, genelde DNA'nın metilasyona duyarlı restriksiyon enzimleri tarafından kesilmesine karşı korur.
- Bitkilerde 5-metilsitozin CpG, CpNpG and CpNpN dizilerinde görülür (N = A, C veya T)
- Mantar ve hayvanlarda 5-metilsitozin başlıca dinükleotitlerinde bulunur. Çoğu ökaryotta bu bölgelerin ufak bir yüzdesini metillense de, omurgalılarda CpG sitozinlerinin %70,80'i metillenir.
Sitozinin spontan deaminasyonu sonucu urasil meydana getirir, bu urasil DNA tamir enzimleri tarafından tanınır ve DNA'dan çıkartılır; buna karşın 5-metilsitozin deaminasyonu timin oluşturur. DNA'daki bir sitozinin (C) timine (T) dönüşmesi bir neden olur.
In vitro
5-metilsitozin, nitröz asit gibi reaktifler aracılığıyla deamine olup timin meydana getirir; benzer şartlarda sitozin deamine olup urasil oluşturur.
etkisiyle sitozin deamine olur ama 5-metilsitozin bisülfit etkisiyle deaminasyona dayanıklıdır; bu özellik ile DNA sitozin metilasyon örüntülerini analizinde kullanılır.
Ek resimler
Notlar
- ^ Colot V, Rossignol JL (1999). "Eukaryotic DNA methylation as an evolutionary device". Bioessays. 21 (5). ss. 402-11. doi:10.1002/(SICI)1521-1878(199905)21:5<402::AID-BIES7>3.0.CO;2-B. (PMID) 10376011.
- ^ Clark SJ, Harrison J, Paul CL, Frommer M (1994). "High sensitivity mapping of methylated cytosines". Nucleic Acids Res. 22 (15). ss. 2990-7. doi:10.1093/nar/22.15.2990. (PMID) 8065911.
Kaynakça
- Griffiths, Anthony J. F. (1999). An Introduction to genetic analysis. San Francisco: W.H. Freeman. ss. Chapter 15: Gene Mutation. ISBN . 5 Şubat 2005 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 5 Ağustos 2009.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
5 metilsitozinKimyasal Adi 4 amino 5 metil 3H pirimidin 2 onCAS numarasi 554 01 8PubChem 65040SMILES CC1 C NC O N C1 NMeSH adi 5 MethylcytosineKimyasal formul C5H7N3OMolekul agirligi 125 129Kaynakca ve sorumluluk reddi 5 Metilsitozin sitozin in 5 numarali karbonuna bir metil grubunun eklenmis halidir Sitozinin bu metillenmis hali onun baz eslesme ozelliklerini etkilemez In vivo5 Metilsitozin etkisiyle meydana gelen bir epigenetik degisimdir DNA metilasyonunun en sik gorulen urunudur Canlilardaki islevi buyuk cesitlilik gosterir Bakterilerde 5 metilsitozin pek cok DNA dizisinde bulunabilir genelde DNA nin metilasyona duyarli restriksiyon enzimleri tarafindan kesilmesine karsi korur Bitkilerde 5 metilsitozin CpG CpNpG and CpNpN dizilerinde gorulur N A C veya T Mantar ve hayvanlarda 5 metilsitozin baslica dinukleotitlerinde bulunur Cogu okaryotta bu bolgelerin ufak bir yuzdesini metillense de omurgalilarda CpG sitozinlerinin 70 80 i metillenir Sitozinin spontan deaminasyonu sonucu urasil meydana getirir bu urasil DNA tamir enzimleri tarafindan taninir ve DNA dan cikartilir buna karsin 5 metilsitozin deaminasyonu timin olusturur DNA daki bir sitozinin C timine T donusmesi bir neden olur In vitro5 metilsitozin nitroz asit gibi reaktifler araciligiyla deamine olup timin meydana getirir benzer sartlarda sitozin deamine olup urasil olusturur etkisiyle sitozin deamine olur ama 5 metilsitozin bisulfit etkisiyle deaminasyona dayaniklidir bu ozellik ile DNA sitozin metilasyon oruntulerini analizinde kullanilir Ek resimlerSitozinNotlar Colot V Rossignol JL 1999 Eukaryotic DNA methylation as an evolutionary device Bioessays 21 5 ss 402 11 doi 10 1002 SICI 1521 1878 199905 21 5 lt 402 AID BIES7 gt 3 0 CO 2 B PMID 10376011 Clark SJ Harrison J Paul CL Frommer M 1994 High sensitivity mapping of methylated cytosines Nucleic Acids Res 22 15 ss 2990 7 doi 10 1093 nar 22 15 2990 PMID 8065911 KB1 bakim Birden fazla ad yazar listesi link KaynakcaGriffiths Anthony J F 1999 An Introduction to genetic analysis San Francisco W H Freeman ss Chapter 15 Gene Mutation ISBN 0 7167 3520 2 5 Subat 2005 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 5 Agustos 2009