ChemSpider, kimyasal maddelerin bir veritabanıdır. ChemSpider, Kraliyet Kimya Derneği'ne (Royal Society of Chemistry) aittir.
Tür | Creative Commons Share-alike |
---|---|
Genel merkezi | , |
Hizmet alanları | 100 milyondan fazla yapıya, özelliğe ve ilgili bilgilere hızlı erişim sağlayan kimyasal yapıların veritabanı. |
Önemli kişiler | |
Web sitesi | chemspider.com |
Dipnotlar / referanslar App |
Veri tabanı
Veritabanı, aşağıdakiler dahil 270'ten fazla veri kaynağından 100 milyondan fazla molekül içerir.
- EPA DSSTox
- ABD Gıda ve İlaç Dairesi (FDA)
- İnsan Metabolom Veritabanı
- Heterosiklik Kimya Dergisi
- KEGG
- KUMGM
- LeadScope
- LipidMAPS
- Marinlit
- MDPI
- MICAD
- MLSMR
- MMDB
- MOLI
- MTDP
- Nanojen
- Doğa Kimyasal Biyoloji
- NCGC
- Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü (NIAID)
- Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH)
- NINDS Onaylı İlaç Tarama Programı
- Ulusal Standartlar ve Teknoloji Enstitüsü (NIST)
- NIST Kimya Web Kitabı
- NMMLSC
- NMR Kaydırma DB
- PANACHE
- PCMD
- PDSP
- Peptitler
- Geleceğin Prous Science İlaçları
- QSAR
- Ar-Ge Kimyasalları
- San Diego Kimyasal Genomik Merkezi
- SGCOxCompounds, SGCStoCompounds
- SMID
- Teknik Özellikler
- Yapısal Genomik Konsorsiyumu
- SureChem
- Synthon-Lab
- Thomson Pharma
- Toplam TOSLab Yapı Taşları
- UM-BBD
- UPCMLD
- KullanışlıChem
- Web of Science
- xPharm
Her kimyasala, karşılık gelen bir URL'nin parçasını oluşturan benzersiz tanıtıcı (unique identifier) verilir. Örneğin, aseton 175'tir ve bu nedenle http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.175.html 25 Ocak 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde . URL'sine sahiptir.
Kitle kaynak kullanımı
ChemSpider veritabanı, kimyasal yapı biriktirme, spektrum biriktirme ve kullanıcı küratörlüğü dahil olmak üzere kullanıcı katkılarıyla güncellenebilmektedir. Bu, çevrimiçi bir kimya veritabanı geliştirmek için kitle kaynaklı bir yaklaşımdır. Verilerin kitle kaynaklı küratörlüğü, biyomedikal ve kimya literatürünün metin madenciliği uygulamalarında kullanılan kimyasal yapılarla ilişkili bir kimyasal isim sözlüğü üretti.
Ancak, veritabanı haklarından feragat edilmez ve veri indirme olanağı mevcut değildir; Aslında, SSS yalnızca sınırlı indirmelere izin verildiğini bile belirtilmiştir: Bu nedenle çatallama hakkı garanti edilmez ve proje özgür / açık olarak değerlendirilemez.
Araştırma
Bir dizi mevcut arama modülü sağlanmıştır:
- Standart arama, sistematik isimler, ticari isimler, eşanlamlılar ve kayıt numaraları için sorgulamaya izin verir.
- Gelişmiş arama, moleküler formül ve moleküler ağırlık aralığı, CAS Kayıt Numaraları (Chemical Abstracts Service), tedarikçiler vb. kullanarak kimyasal yapıya, kimyasal altyapıya göre etkileşimli aramaya izin verir. Arama, bulunan sonuçları genişletmek veya kısıtlamak için kullanılabilir.
- Mobil cihazlarda yapı araması, iOS (iPhone / iPod / iPad) ve Android işletim sistemleri için ücretsiz uygulamalar kullanılarak yapılabilir.
Kimya belgesi işaretlemesi
ChemSpider veritabanı, kimya belgesi işaretlemesinin temeli olarak metin madenciliği ile birlikte kullanılmıştır. ChemMantis, Kimya İşaretleme ve İsimlendirme Dönüşümü Entegre Sistemi, belgelerden ve web sayfalarından kimyasal isimleri tanımlamak ve çıkarmak için algoritmalar kullanır ve ChemSpider veri tabanındaki isim-yapı dönüştürme algoritmalarını ve sözlük aramalarını kullanarak kimyasal isimleri kimyasal yapılara dönüştürür. Sonuç olarak, ChemSpider aracılığıyla 150'den fazla veri kaynağında kimya dokümanları üzerine bilgi arama sağlayan entegre bir sistem oluşturulmuştur.
Tarihçe
ChemSpider, Royal Society of Chemistry (RSC) tarafından Mayıs 2009'da satın alındı. RSC tarafından satın alınmadan önce, ChemSpider özel bir şirket olan ChemZoo Inc. tarafından kontrol ediliyordu. Sistem ilk olarak Mart 2007'de beta sürüm şeklinde piyasaya sürüldü ve Mart 2008'de piyasaya asıl sürümünü gerçekleştirdi. ChemSpider, bir kimya veritabanının genel desteğini, WiChempedia uygulaması aracılığıyla Vikipedi kimyasal yapı koleksiyonunun desteğini içerecek şekilde genişletti.
Hizmetler
Sistemin bir dizi hizmeti çevrimiçi olarak sunulur. Bunlar arasında kimyasal adların kimyasal yapılara dönüştürülmesi, SMILES ve InChI dizilerinin oluşturulması ve birçok fiziksel kimya parametresinin tahmin edilmesi ve Nükleer manyetik rezonans (NMR) tahminine izin veren bir web hizmetine entegrasyon yer alır.
Sentetik Sayfalar
SyntheticPages, Royal Society of Chemistry tarafından işletilen sentetik kimya prosedürlerinin ücretsiz, etkileşimli bir veritabanıdır.
Kullanıcılar kendi yaptıkları sentetik prosedürleri sitede yayınlanmak üzere sunarlar. Bu prosedürler orijinal çalışmalar olabilir, ancak daha çok literatüre dayanmaktadır. Orijinal yayınlanmış prosedüre atıflar uygun olduğunda yapılır. Yayınlanmadan önce bilimsel bir editör tarafından kontrol edilirler. Sayfalar, bilimsel bir dergi makalesi gibi resmî hakem incelemesinden geçmez, ancak oturum açmış kullanıcılar tarafından yorum yapılabilir. Yorumlar ayrıca bilimsel editörler tarafından yönetilmektedir. Amaç, laboratuvarda yararlı kimyasal sentezin nasıl yapılacağına dair pratik deneyim toplamaktır. Sıradan bir akademik dergide yayınlanan deneysel yöntemler resmî olarak kısaca listelenirken, ChemSpider SyntheticPages'deki prosedürler daha pratik ayrıntılarla verilmektedir. Kayıt dışılık teşvik edilir. Gönderenlerin yorumları da buna dahildir. Karşılaştırılabilir miktarda ayrıntıya sahip diğer yayınlar arasında Organik Sentezler ve İnorganik Sentezler sayılabilir. SyntheticPages sitesi ilk olarak Profesörler (Bristol Üniversitesi), (University College London), (Warwick Üniversitesi) ve Dr tarafından kurulmuştur.
Şubat 2010'da ChemSpider | SyntheticPages (CS | SP) oluşumuyla birleşme duyuruldu.
OpenPHACTS
ChemSpider, bir Yenilikçi İlaç Girişimi olan OpenPHACTS projesinin bir parçası olarak kimyasal bileşik deposu olarak da hizmet vermektedir. Open PHACTS, küçük moleküllü ilaç keşiflerindeki -farklı bilgi kaynakları, standartların eksikliği ve aşırı bilgi yüklemesi gibi- darboğazları ele almak için açık standartlar, açık erişim, anlamsal ağ yaklaşımı uygulamaktadır.
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ . www.chemspider.com (İngilizce). 2 Nisan 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 21 Mart 2014.
- ^ Van Noorden, R. (2012). "Chemistry's web of data expands". Nature (İngilizce). 483 (7391): 524. Bibcode:2012Natur.483..524V. doi:10.1038/483524a . (PMID) 22460877.
- ^ Antony John Williams (Ocak–Şubat 2008). "ChemSpider and Its Expanding Web: Building a Structure-Centric Community for Chemists". Chemistry International (İngilizce). 30 (1). 25 Mayıs 2011 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 20 Nisan 2021.
- ^ Williams (2008). "Public chemical compound databases". Current Opinion in Drug Discovery & Development (İngilizce). 11 (3): 393-404. (PMID) 18428094.
- ^ Brumfiel (2008). "Chemists spin a web of data". Nature (İngilizce). 453 (7192): 139. doi:10.1038/453139a. (PMID) 18464701.
- ^ "Chemspider: A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases". Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research (İngilizce). 2011. ss. 363-386. doi:10.1002/9781118026038.ch22. ISBN .
- ^ Pence (2010). "ChemSpider: An Online Chemical Information Resource". Journal of Chemical Education (İngilizce). 87 (11): 1123. doi:10.1021/ed100697w.
- ^ . ChemSpider (İngilizce). 5 Mayıs 2007 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 16 Mayıs 2019.
- ^ (İngilizce). ChemSpider. 23 Ağustos 2008. 7 Kasım 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 7 Kasım 2017.
- ^ Hettne (2010). "Automatic vs. Manual curation of a multi-source chemical dictionary: The impact on text mining". Journal of Cheminformatics (İngilizce). 2 (1): 3. doi:10.1186/1758-2946-2-3. (PMC) 2848622 $2. (PMID) 20331846.
- ^ . www.chemspider.com (İngilizce). 24 Eylül 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 18 Nisan 2014.
- ^ . App Store (İngilizce). 13 Kasım 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi.
- ^ . play.google.com (İngilizce). 13 Mayıs 2013 tarihinde kaynağından arşivlendi.
- ^ "RSC acquires ChemSpider" (İngilizce). Royal Society of Chemistry. 11 Mayıs 2009. 22 Aralık 2014 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 11 Mayıs 2009.
- ^ . ChemSpider SyntheticPages (İngilizce). Royal Society of Chemistry. 18 Şubat 2010 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Haziran 2012.
- ^ . RSC Publishing (İngilizce). Royal Society of Chemistry. 5 Şubat 2010. 26 Temmuz 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Haziran 2012.
- ^ Williams (2012). "Open PHACTS: Semantic interoperability for drug discovery". (İngilizce). 17 (21-22): 1188-1198. doi:10.1016/j.drudis.2012.05.016. (PMID) 22683805.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
ChemSpider kimyasal maddelerin bir veritabanidir ChemSpider Kraliyet Kimya Dernegi ne Royal Society of Chemistry aittir ChemSpiderTurCreative Commons Share alikeGenel merkeziRaleigh Kuzey Karolina ABDHizmet alanlari100 milyondan fazla yapiya ozellige ve ilgili bilgilere hizli erisim saglayan kimyasal yapilarin veritabani Onemli kisilerRoyal Society of ChemistryWeb sitesichemspider comDipnotlar referanslar AppVeri tabaniVeritabani asagidakiler dahil 270 ten fazla veri kaynagindan 100 milyondan fazla molekul icerir EPA DSSTox ABD Gida ve Ilac Dairesi FDA Insan Metabolom Veritabani Heterosiklik Kimya Dergisi KEGG KUMGM LeadScope LipidMAPS Marinlit MDPI MICAD MLSMR MMDB MOLI MTDP Nanojen Doga Kimyasal Biyoloji NCGC Ulusal Alerji ve Bulasici Hastaliklar Enstitusu NIAID Ulusal Saglik Enstituleri NIH NINDS Onayli Ilac Tarama Programi Ulusal Standartlar ve Teknoloji Enstitusu NIST NIST Kimya Web Kitabi NMMLSC NMR Kaydirma DB PANACHE PCMD PDSP Peptitler Gelecegin Prous Science Ilaclari QSAR Ar Ge Kimyasallari San Diego Kimyasal Genomik Merkezi SGCOxCompounds SGCStoCompounds SMID Teknik Ozellikler Yapisal Genomik Konsorsiyumu SureChem Synthon Lab Thomson Pharma Toplam TOSLab Yapi Taslari UM BBD UPCMLD KullanisliChem Web of Science xPharm Her kimyasala karsilik gelen bir URL nin parcasini olusturan benzersiz tanitici unique identifier verilir Ornegin aseton 175 tir ve bu nedenle http www chemspider com Chemical Structure 175 html 25 Ocak 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde URL sine sahiptir Kitle kaynak kullanimiChemSpider veritabani kimyasal yapi biriktirme spektrum biriktirme ve kullanici kuratorlugu dahil olmak uzere kullanici katkilariyla guncellenebilmektedir Bu cevrimici bir kimya veritabani gelistirmek icin kitle kaynakli bir yaklasimdir Verilerin kitle kaynakli kuratorlugu biyomedikal ve kimya literaturunun metin madenciligi uygulamalarinda kullanilan kimyasal yapilarla iliskili bir kimyasal isim sozlugu uretti Ancak veritabani haklarindan feragat edilmez ve veri indirme olanagi mevcut degildir Aslinda SSS yalnizca sinirli indirmelere izin verildigini bile belirtilmistir Bu nedenle catallama hakki garanti edilmez ve proje ozgur acik olarak degerlendirilemez ArastirmaBir dizi mevcut arama modulu saglanmistir Standart arama sistematik isimler ticari isimler esanlamlilar ve kayit numaralari icin sorgulamaya izin verir Gelismis arama molekuler formul ve molekuler agirlik araligi CAS Kayit Numaralari Chemical Abstracts Service tedarikciler vb kullanarak kimyasal yapiya kimyasal altyapiya gore etkilesimli aramaya izin verir Arama bulunan sonuclari genisletmek veya kisitlamak icin kullanilabilir Mobil cihazlarda yapi aramasi iOS iPhone iPod iPad ve Android isletim sistemleri icin ucretsiz uygulamalar kullanilarak yapilabilir Kimya belgesi isaretlemesiChemSpider veritabani kimya belgesi isaretlemesinin temeli olarak metin madenciligi ile birlikte kullanilmistir ChemMantis Kimya Isaretleme ve Isimlendirme Donusumu Entegre Sistemi belgelerden ve web sayfalarindan kimyasal isimleri tanimlamak ve cikarmak icin algoritmalar kullanir ve ChemSpider veri tabanindaki isim yapi donusturme algoritmalarini ve sozluk aramalarini kullanarak kimyasal isimleri kimyasal yapilara donusturur Sonuc olarak ChemSpider araciligiyla 150 den fazla veri kaynaginda kimya dokumanlari uzerine bilgi arama saglayan entegre bir sistem olusturulmustur TarihceChemSpider Royal Society of Chemistry RSC tarafindan Mayis 2009 da satin alindi RSC tarafindan satin alinmadan once ChemSpider ozel bir sirket olan ChemZoo Inc tarafindan kontrol ediliyordu Sistem ilk olarak Mart 2007 de beta surum seklinde piyasaya suruldu ve Mart 2008 de piyasaya asil surumunu gerceklestirdi ChemSpider bir kimya veritabaninin genel destegini WiChempedia uygulamasi araciligiyla Vikipedi kimyasal yapi koleksiyonunun destegini icerecek sekilde genisletti HizmetlerSistemin bir dizi hizmeti cevrimici olarak sunulur Bunlar arasinda kimyasal adlarin kimyasal yapilara donusturulmesi SMILES ve InChI dizilerinin olusturulmasi ve bircok fiziksel kimya parametresinin tahmin edilmesi ve Nukleer manyetik rezonans NMR tahminine izin veren bir web hizmetine entegrasyon yer alir Sentetik Sayfalar SyntheticPages Royal Society of Chemistry tarafindan isletilen sentetik kimya prosedurlerinin ucretsiz etkilesimli bir veritabanidir Kullanicilar kendi yaptiklari sentetik prosedurleri sitede yayinlanmak uzere sunarlar Bu prosedurler orijinal calismalar olabilir ancak daha cok literature dayanmaktadir Orijinal yayinlanmis prosedure atiflar uygun oldugunda yapilir Yayinlanmadan once bilimsel bir editor tarafindan kontrol edilirler Sayfalar bilimsel bir dergi makalesi gibi resmi hakem incelemesinden gecmez ancak oturum acmis kullanicilar tarafindan yorum yapilabilir Yorumlar ayrica bilimsel editorler tarafindan yonetilmektedir Amac laboratuvarda yararli kimyasal sentezin nasil yapilacagina dair pratik deneyim toplamaktir Siradan bir akademik dergide yayinlanan deneysel yontemler resmi olarak kisaca listelenirken ChemSpider SyntheticPages deki prosedurler daha pratik ayrintilarla verilmektedir Kayit disilik tesvik edilir Gonderenlerin yorumlari da buna dahildir Karsilastirilabilir miktarda ayrintiya sahip diger yayinlar arasinda Organik Sentezler ve Inorganik Sentezler sayilabilir SyntheticPages sitesi ilk olarak Profesorler Bristol Universitesi University College London Warwick Universitesi ve Dr tarafindan kurulmustur Subat 2010 da ChemSpider SyntheticPages CS SP olusumuyla birlesme duyuruldu OpenPHACTS ChemSpider bir Yenilikci Ilac Girisimi olan OpenPHACTS projesinin bir parcasi olarak kimyasal bilesik deposu olarak da hizmet vermektedir Open PHACTS kucuk molekullu ilac kesiflerindeki farkli bilgi kaynaklari standartlarin eksikligi ve asiri bilgi yuklemesi gibi darbogazlari ele almak icin acik standartlar acik erisim anlamsal ag yaklasimi uygulamaktadir Ayrica bakinizUlusal Standartlar ve Teknoloji Enstitusu NIST PubChem DrugBankKaynakca www chemspider com Ingilizce 2 Nisan 2015 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 21 Mart 2014 Van Noorden R 2012 Chemistry s web of data expands Nature Ingilizce 483 7391 524 Bibcode 2012Natur 483 524V doi 10 1038 483524a PMID 22460877 Antony John Williams Ocak Subat 2008 ChemSpider and Its Expanding Web Building a Structure Centric Community for Chemists Chemistry International Ingilizce 30 1 25 Mayis 2011 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 20 Nisan 2021 Williams 2008 Public chemical compound databases Current Opinion in Drug Discovery amp Development Ingilizce 11 3 393 404 PMID 18428094 Brumfiel 2008 Chemists spin a web of data Nature Ingilizce 453 7192 139 doi 10 1038 453139a PMID 18464701 Chemspider A Platform for Crowdsourced Collaboration to Curate Data Derived from Public Compound Databases Collaborative Computational Technologies for Biomedical Research Ingilizce 2011 ss 363 386 doi 10 1002 9781118026038 ch22 ISBN 978 1 11802 603 8 Pence 2010 ChemSpider An Online Chemical Information Resource Journal of Chemical Education Ingilizce 87 11 1123 doi 10 1021 ed100697w ChemSpider Ingilizce 5 Mayis 2007 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 16 Mayis 2019 Ingilizce ChemSpider 23 Agustos 2008 7 Kasim 2017 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 7 Kasim 2017 Hettne 2010 Automatic vs Manual curation of a multi source chemical dictionary The impact on text mining Journal of Cheminformatics Ingilizce 2 1 3 doi 10 1186 1758 2946 2 3 PMC 2848622 2 PMID 20331846 www chemspider com Ingilizce 24 Eylul 2015 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 18 Nisan 2014 App Store Ingilizce 13 Kasim 2011 tarihinde kaynagindan arsivlendi play google com Ingilizce 13 Mayis 2013 tarihinde kaynagindan arsivlendi RSC acquires ChemSpider Ingilizce Royal Society of Chemistry 11 Mayis 2009 22 Aralik 2014 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 11 Mayis 2009 ChemSpider SyntheticPages Ingilizce Royal Society of Chemistry 18 Subat 2010 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 26 Haziran 2012 RSC Publishing Ingilizce Royal Society of Chemistry 5 Subat 2010 26 Temmuz 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 26 Haziran 2012 Williams 2012 Open PHACTS Semantic interoperability for drug discovery Ingilizce 17 21 22 1188 1198 doi 10 1016 j drudis 2012 05 016 PMID 22683805