Deoksiadenozin trifosfat (dATP), DNA polimerazın bir substratı olarak DNA replikasyonu için hücrelerde kullanılan bir nükleotittir. Bir adenin ve üç Fosfat grubuna bağlı bir deoksiriboz şeker molekülünden oluşan kimyasal yapısı ile bir pürin nükleozit trifosfat olarak sınıflandırılır. Enerji aktaran bir molekül olan ATP'den tek bir hidroksil grubu (pentoz şekerinin 2' karbonundaki -OH grubu, dATP'deki -H ile değiştirilir) ile farklılık gösterir, bu da bir riboz yerine bir deoksiriboz oluşumu ile sonuçlanır. İki fosfat grubu, daha sonra DNA'yı sentezlemek için kullanılabilen deoksiadenozin monofosfat verecek şekilde hidrolize edilebilir.
Adlandırmalar | |
---|---|
[[(2R,3S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate | |
Diğer adlar dATP, 2'-deoxyadenosine triphosphate | |
Tanımlayıcılar | |
| |
3D model (JSmol) |
|
ChemSpider |
|
ECHA InfoCard | 100.016.058 |
PubChem CID |
|
UNII |
|
CompTox Bilgi Panosu (EPA) |
|
| |
Özellikler | |
Molekül formülü | C10H16N5O12P3 |
Molekül kütlesi | 491.181623 |
Aksi belirtilmediği sürece madde verileri, Standart sıcaklık ve basınç koşullarında belirtilir (25 °C [77 °F], 100 kPa). | |
Bulgular ayrıca, dATP'nin hücre canlılığını korumak için enerji aktaran bir molekül olarak hareket edebileceğini ileri sürmüştür.
Sentezi
Deoksiadenosin trifosfat, deoksiribonükleaz (DNase), nükleaz P1, adenilat kinaz ve piruvat kinaz kullanılarak başlangıç materyali olarak DNA ile enzimatik olarak sentezlenebilir. Sentez, DNA'nın ısıyla denatürasyonu ile başlar, ardından oligomerler üretmek için DNase I ile muamele edilir. Daha sonra çözelti, deoksiribonükleotit monofosfatları oluşturmak için nükleaz P1 ile işlenir. Adenilat kinaz ve piruvat kinaz karışımı kullanılarak deoksiadenozin monofosfat seçici olarak dATP'ye dönüştürülmüştür. Saflaştırmadan sonra, toplam %40 verimle bu sentez yöntemi kullanılarak %90-95 saflık elde edilebilir.
Sağlığa etkileri
Bağışıklığı baskılanmış bireylerde
Vücuttaki yüksek dATP seviyeleri toksik olabilir ve dATP, DNA sentezi enzimi olan ribonükleotid redüktaz için rekabetçi olmayan bir inhibitör olarak hareket ettiğinden, bağışıklık sistemi fonksiyonunun bozulmasına neden olabilir. Adenozin deaminaz eksikliği (ADA) olan hastalarda, hücre içi dATP konsantrasyonları yüksek olma eğilimindedir, çünkü adenozin deaminaz normalde onu inozine dönüştürerek adenozin seviyelerini engeller.
Adenozin deaminaz enziminin eksikliğinin bireylerde immün yetmezliğe neden olduğu bilinmektedir. Araştırmalar, dATP'nin adenozin deaminaz eksikliğinde potansiyel bir toksik metabolit olabileceğini bulmuştur. Çalışmadaki immün yetmezlikli ve adenozin deaminaz eksikliği olan hastaların alyuvarlarında dATP düzeylerinin immün yetmezliği olmayan, adenozin deaminaz eksikliği olan hastalara kıyasla 50 kat daha fazla olduğu bulundu. Bu anormal bir durumdur ve artmış eritrosit dATP düzeylerinin adenozin deaminaz eksikliği olan kişilerde bağışıklık sistemi eksikliğinden sorumlu toksik metabolitler olduğuna dair kanıt sağlar.
dATP'yi taşıma veya fosforile etme yeteneğinden yoksun hücrelerin, aşırı dATP'nin toksik etkilerine karşı artan direnç gösterdiği gösterilmiştir, bu da dATP'nin toksisitesinin dATP'yi hücre içi fosforile etme yeteneğine bağlı olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, ADA için bazı tedaviler, adenozin kinaz ve deoksisitidin kinaz gibi sorumlu deoksinükleozid kinazların hedeflenen inhibisyonu yoluyla dATP fosforilasyonunu azaltmaya odaklanır.İntravenöz olarak deoksisitidin, bir ADA tedavisi olarak da kullanılmıştır, ancak klinik bir çalışma, deoksisitidinin, bazı hastaların deoksisitidin tedavisine daha önemli yanıt verebileceğini göz ardı etmeden, ADA hastalarının T-hücresi bağışıklığı üzerinde yalnızca sınırlı klinik etkilere sahip olduğunu bulmuştur.
Kalp kasında
Kardiyak miyozinde, dATP'nin kas kasılmasını kolaylaştırmak için bir enerji substratı olarak ATP'ye uygun bir alternatif olduğu gösterilmiştir. Köpeklerde dilate kardiyomiyopatiyi (DCM) içeren bir deneyde, artan kardiyak dATP'nin DCM için potansiyel olarak etkili bir tedavi olduğu bulunmuştur. dATP, yetersiz bir kalpte sistolik basıncın yanı sıra kontraktiliteyi artırabilir ve aynı zamanda kalp pompası işlevini geri kazanmanın yanı sıra kasılmayı da artırabilir. Ayrıca, dATP'nin sadece kardiyovasküler bozukluğu olan hastalarda normal sistolik fonksiyonu geri kazandırmakla kalmayıp, aynı zamanda konjestif kalp yetmezliği olan hastaların kalp kası çapraz köprü oranını ve konjestif kalp yetmezliğini de arttırdığı bulunmuştur.
Ayrıca bakınız
- Adenozin trifosfat (ATP)
- (ADA)
- (DCM)
- (RNR)
Kaynakça
- ^ "A study of the mechanism of T4 DNA polymerase with diastereomeric phosphorothioate analogues of deoxyadenosine triphosphate". The Journal of Biological Chemistry. 257 (13): 7684-8. Haziran 1982. doi:10.1016/S0021-9258(18)34435-1. (PMID) 7045112.
- ^ . pubchem.ncbi.nlm.nih.gov (İngilizce). 6 Mart 2016 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 30 Nisan 2020.
- ^ "Deoxyadenosine triphosphate acting as an energy-transferring molecule in adenosine deaminase inhibited human erythrocytes". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research. 1094 (3): 257-62. Eylül 1991. doi:10.1016/0167-4889(91)90084-b. (PMID) 1911876.
- ^ a b "Enzymic synthesis of deoxyATP using DNA as starting material". The Journal of Organic Chemistry. 50 (7): 1076-1079. 1 Nisan 1985. doi:10.1021/jo00207a032.
- ^ "Effects of deoxyadenosine triphosphate and 9-beta-D-arabinofuranosyl-adenine 5'-triphosphate on human ribonucleotide reductase from Molt-4F cells and the concept of "self-potentiation"". Cancer Research. 40 (10): 3555-8. Ekim 1980. (PMID) 6159965. 21 Ağustos 2017 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 22 Mayıs 2022.
- ^ a b c "Deoxyadenosine triphosphate as a potentially toxic metabolite in adenosine deaminase deficiency". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 75 (1): 472-6. Ocak 1978. doi:10.1073/pnas.75.1.472. (PMC) 411272 $2. (PMID) 272665.
- ^ "Carrier frequency of a nonsense mutation in the adenosine deaminase (ADA) gene implies a high incidence of ADA-deficient severe combined immunodeficiency (SCID) in Somalia and a single, common haplotype indicates common ancestry". Annals of Human Genetics. 71 (Pt 3): 336-47. Mayıs 2007. doi:10.1111/j.1469-1809.2006.00338.x. (PMID) 17181544.
- ^ "Deoxyadenosine metabolism and cytotoxicity in cultured mouse T lymphoma cells: a model for immunodeficiency disease". Cell (İngilizce). 14 (2): 365-75. Haziran 1978. doi:10.1016/0092-8674(78)90122-8. (PMID) 208780.
- ^ "Restoration of adenosine deaminase-deficient human thymocyte development in vitro by inhibition of deoxynucleoside kinases". Journal of Immunology. 181 (11): 8153-61. Aralık 2008. doi:10.4049/jimmunol.181.11.8153. (PMC) 2673198 $2. (PMID) 19018008.
- ^ "Deoxycytidine therapy in two patients with adenosine deaminase deficiency and severe immunodeficiency disease". Clinical Immunology and Immunopathology. 37 (1): 30-6. Ekim 1985. doi:10.1016/0090-1229(85)90132-1. (PMID) 3161676.
- ^ "2-Deoxyadenosine triphosphate restores the contractile function of cardiac myofibril from adult dogs with naturally occurring dilated cardiomyopathy". American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiology. 310 (1): H80-91. Ocak 2016. doi:10.1152/ajpheart.00530.2015. (PMC) 4796460 $2. (PMID) 26497964.
- ^ "Cardiac myosin activation with 2-deoxy-ATP via increased electrostatic interactions with actin". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (23): 11502-11507. Haziran 2019. doi:10.1073/pnas.1905028116. (PMC) 6561254 $2. (PMID) 31110001.
- ^ Kolwicz (Ekim 2019). "Gene Therapy Rescues Cardiac Dysfunction in Duchenne Muscular Dystrophy Mice by Elevating Cardiomyocyte Deoxy-Adenosine Triphosphate". JACC. Basic to Translational Science. 4 (7): 778-791. doi:10.1016/j.jacbts.2019.06.006. (PMC) 6978556 $2. (PMID) 31998848.
- ^ Moussavi-Harami (Şubat 2015). "2-Deoxy adenosine triphosphate improves contraction in human end-stage heart failure". Journal of Molecular and Cellular Cardiology. 79: 256-263. doi:10.1016/j.yjmcc.2014.12.002. (PMC) 4301986 $2. (PMID) 25498214.
Dış bağlantılar
- dATp 22 Mayıs 2022 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Deoksiadenozin trifosfat dATP DNA polimerazin bir substrati olarak DNA replikasyonu icin hucrelerde kullanilan bir nukleotittir Bir adenin ve uc Fosfat grubuna bagli bir deoksiriboz seker molekulunden olusan kimyasal yapisi ile bir purin nukleozit trifosfat olarak siniflandirilir Enerji aktaran bir molekul olan ATP den tek bir hidroksil grubu pentoz sekerinin 2 karbonundaki OH grubu dATP deki H ile degistirilir ile farklilik gosterir bu da bir riboz yerine bir deoksiriboz olusumu ile sonuclanir Iki fosfat grubu daha sonra DNA yi sentezlemek icin kullanilabilen deoksiadenozin monofosfat verecek sekilde hidrolize edilebilir Deoksiadenozin trifosfat AdlandirmalarIUPAC adi 2R 3S 5R 5 6 aminopurin 9 yl 3 hydroxyoxolan 2 yl methoxy hydroxyphosphoryl phosphono hydrogen phosphateDiger adlardATP 2 deoxyadenosine triphosphateTanimlayicilarCAS numarasi 1927 31 73D model JSmol Etkilesimli goruntuChemSpider 15194ECHA InfoCard 100 016 058PubChem CID 15993UNII K8KCC8SH6NCompTox Bilgi Panosu EPA DTXSID10895848SMILES O P O O OP O O OP O O OC C H 3O C H n2cnc1c ncnc12 N C C H 3OOzelliklerMolekul formulu C10H16N5O12P3Molekul kutlesi 491 181623Aksi belirtilmedigi surece madde verileri Standart sicaklik ve basinc kosullarinda belirtilir 25 C 77 F 100 kPa Bilgi kutusu kaynaklari Bulgular ayrica dATP nin hucre canliligini korumak icin enerji aktaran bir molekul olarak hareket edebilecegini ileri surmustur SenteziDeoksiadenozin trifosfat kimyasal yapisi Deoksiadenosin trifosfat deoksiribonukleaz DNase nukleaz P1 adenilat kinaz ve piruvat kinaz kullanilarak baslangic materyali olarak DNA ile enzimatik olarak sentezlenebilir Sentez DNA nin isiyla denaturasyonu ile baslar ardindan oligomerler uretmek icin DNase I ile muamele edilir Daha sonra cozelti deoksiribonukleotit monofosfatlari olusturmak icin nukleaz P1 ile islenir Adenilat kinaz ve piruvat kinaz karisimi kullanilarak deoksiadenozin monofosfat secici olarak dATP ye donusturulmustur Saflastirmadan sonra toplam 40 verimle bu sentez yontemi kullanilarak 90 95 saflik elde edilebilir Sagliga etkileriBagisikligi baskilanmis bireylerde Vucuttaki yuksek dATP seviyeleri toksik olabilir ve dATP DNA sentezi enzimi olan ribonukleotid reduktaz icin rekabetci olmayan bir inhibitor olarak hareket ettiginden bagisiklik sistemi fonksiyonunun bozulmasina neden olabilir Adenozin deaminaz eksikligi ADA olan hastalarda hucre ici dATP konsantrasyonlari yuksek olma egilimindedir cunku adenozin deaminaz normalde onu inozine donusturerek adenozin seviyelerini engeller Adenozin deaminaz enziminin eksikliginin bireylerde immun yetmezlige neden oldugu bilinmektedir Arastirmalar dATP nin adenozin deaminaz eksikliginde potansiyel bir toksik metabolit olabilecegini bulmustur Calismadaki immun yetmezlikli ve adenozin deaminaz eksikligi olan hastalarin alyuvarlarinda dATP duzeylerinin immun yetmezligi olmayan adenozin deaminaz eksikligi olan hastalara kiyasla 50 kat daha fazla oldugu bulundu Bu anormal bir durumdur ve artmis eritrosit dATP duzeylerinin adenozin deaminaz eksikligi olan kisilerde bagisiklik sistemi eksikliginden sorumlu toksik metabolitler olduguna dair kanit saglar dATP yi tasima veya fosforile etme yeteneginden yoksun hucrelerin asiri dATP nin toksik etkilerine karsi artan direnc gosterdigi gosterilmistir bu da dATP nin toksisitesinin dATP yi hucre ici fosforile etme yetenegine bagli oldugunu gostermektedir Bu nedenle ADA icin bazi tedaviler adenozin kinaz ve deoksisitidin kinaz gibi sorumlu deoksinukleozid kinazlarin hedeflenen inhibisyonu yoluyla dATP fosforilasyonunu azaltmaya odaklanir Intravenoz olarak deoksisitidin bir ADA tedavisi olarak da kullanilmistir ancak klinik bir calisma deoksisitidinin bazi hastalarin deoksisitidin tedavisine daha onemli yanit verebilecegini goz ardi etmeden ADA hastalarinin T hucresi bagisikligi uzerinde yalnizca sinirli klinik etkilere sahip oldugunu bulmustur Kalp kasinda Kardiyak miyozinde dATP nin kas kasilmasini kolaylastirmak icin bir enerji substrati olarak ATP ye uygun bir alternatif oldugu gosterilmistir Kopeklerde dilate kardiyomiyopatiyi DCM iceren bir deneyde artan kardiyak dATP nin DCM icin potansiyel olarak etkili bir tedavi oldugu bulunmustur dATP yetersiz bir kalpte sistolik basincin yani sira kontraktiliteyi artirabilir ve ayni zamanda kalp pompasi islevini geri kazanmanin yani sira kasilmayi da artirabilir Ayrica dATP nin sadece kardiyovaskuler bozuklugu olan hastalarda normal sistolik fonksiyonu geri kazandirmakla kalmayip ayni zamanda konjestif kalp yetmezligi olan hastalarin kalp kasi capraz kopru oranini ve konjestif kalp yetmezligini de arttirdigi bulunmustur Ayrica bakinizAdenozin trifosfat ATP ADA DCM RNR Kaynakca A study of the mechanism of T4 DNA polymerase with diastereomeric phosphorothioate analogues of deoxyadenosine triphosphate The Journal of Biological Chemistry 257 13 7684 8 Haziran 1982 doi 10 1016 S0021 9258 18 34435 1 PMID 7045112 pubchem ncbi nlm nih gov Ingilizce 6 Mart 2016 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 30 Nisan 2020 Deoxyadenosine triphosphate acting as an energy transferring molecule in adenosine deaminase inhibited human erythrocytes Biochimica et Biophysica Acta BBA Molecular Cell Research 1094 3 257 62 Eylul 1991 doi 10 1016 0167 4889 91 90084 b PMID 1911876 a b Enzymic synthesis of deoxyATP using DNA as starting material The Journal of Organic Chemistry 50 7 1076 1079 1 Nisan 1985 doi 10 1021 jo00207a032 Effects of deoxyadenosine triphosphate and 9 beta D arabinofuranosyl adenine 5 triphosphate on human ribonucleotide reductase from Molt 4F cells and the concept of self potentiation Cancer Research 40 10 3555 8 Ekim 1980 PMID 6159965 21 Agustos 2017 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 22 Mayis 2022 a b c Deoxyadenosine triphosphate as a potentially toxic metabolite in adenosine deaminase deficiency Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 75 1 472 6 Ocak 1978 doi 10 1073 pnas 75 1 472 PMC 411272 2 PMID 272665 Carrier frequency of a nonsense mutation in the adenosine deaminase ADA gene implies a high incidence of ADA deficient severe combined immunodeficiency SCID in Somalia and a single common haplotype indicates common ancestry Annals of Human Genetics 71 Pt 3 336 47 Mayis 2007 doi 10 1111 j 1469 1809 2006 00338 x PMID 17181544 Deoxyadenosine metabolism and cytotoxicity in cultured mouse T lymphoma cells a model for immunodeficiency disease Cell Ingilizce 14 2 365 75 Haziran 1978 doi 10 1016 0092 8674 78 90122 8 PMID 208780 Restoration of adenosine deaminase deficient human thymocyte development in vitro by inhibition of deoxynucleoside kinases Journal of Immunology 181 11 8153 61 Aralik 2008 doi 10 4049 jimmunol 181 11 8153 PMC 2673198 2 PMID 19018008 Deoxycytidine therapy in two patients with adenosine deaminase deficiency and severe immunodeficiency disease Clinical Immunology and Immunopathology 37 1 30 6 Ekim 1985 doi 10 1016 0090 1229 85 90132 1 PMID 3161676 2 Deoxyadenosine triphosphate restores the contractile function of cardiac myofibril from adult dogs with naturally occurring dilated cardiomyopathy American Journal of Physiology Heart and Circulatory Physiology 310 1 H80 91 Ocak 2016 doi 10 1152 ajpheart 00530 2015 PMC 4796460 2 PMID 26497964 Cardiac myosin activation with 2 deoxy ATP via increased electrostatic interactions with actin Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 116 23 11502 11507 Haziran 2019 doi 10 1073 pnas 1905028116 PMC 6561254 2 PMID 31110001 Kolwicz Ekim 2019 Gene Therapy Rescues Cardiac Dysfunction in Duchenne Muscular Dystrophy Mice by Elevating Cardiomyocyte Deoxy Adenosine Triphosphate JACC Basic to Translational Science 4 7 778 791 doi 10 1016 j jacbts 2019 06 006 PMC 6978556 2 PMID 31998848 Moussavi Harami Subat 2015 2 Deoxy adenosine triphosphate improves contraction in human end stage heart failure Journal of Molecular and Cellular Cardiology 79 256 263 doi 10 1016 j yjmcc 2014 12 002 PMC 4301986 2 PMID 25498214 Dis baglantilardATp 22 Mayis 2022 tarihinde Wayback Machine sitesinde