Proteobakteriler (Proteobacteria), bakteriler üstaleminin ana gruplarından birisini meydana getiren ve önemli cins ve türleri içeren şubesidir. Çeşitli hastalık etmenleri (Escherichia, Salmonella, Vibrio, gibi) ve başka çok bilinen cinsler bu gruba dahildir. Ayrıca doğada serbest yaşayan türleri ve azot fiksasyonundan sorumlu pek çok bakteri türünü de içerir. Bu grup ribozomal RNA (rRNA) dizinlerine göre tanımlanmıştır. Bakteri biçimlerinin çeşitliliğinden dolayı grup, ismini Yunan mitolojisinde yer alan, her şekle girebilen tanrı Proteus'tan almıştır. (Proteus aynı zamanda Proteobakterilerde yer alan bir cinsin de adıdır.)
Proteobacteria | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Biyolojik sınıflandırma | |||||||
| |||||||
Sınıflar | |||||||
Proteobakteriler Gram-negatif özelliklidir, başlıca oluşur. Çoğu flagella ile hareket eder ama bazıları hareketsizdir veya kullanırlar. Bu sonuncu yöntemi kullananlar arasında bulunan , kümeleşerek çok hücreli "meyve gövdeleri" oluştururlar. Metabolizma tipleri bakımından da bu grupta büyük bir çeşitlilik vardır. Çoğu seçmeli veya zorunlu anaerobik ve ama pek çok istisna da mevcuttur. Birbiriyle yakın ilişkisi olmayan bazı cinsler fotosentez yoluyla ışığı enerjiye dönüştürürler. Bunlar kırmızımsı pigmentlerini kullanan mor bakterilerdir.
Bölüm veya sınıflar
"Proteobacteria" filogenetik şeması | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ARB living tree, iTOL, Bergey ve diğer kaynaklara göre hazırlanan Proteobacteria filogenetik ağacı. Acidobacteria şubesi, Proteobacteria şubesine dahil olmayıp dış grup olarak verilmiştir. Acidithiobacillia, Hydrogenophilalia ve Oligoflexia sınıfları şemada gösterilmemiştir. |
Proteobakteriler öncelikli olarak ribozomal RNA dizilimine göre sınıflandırılmıştır. İlk başta yunan harfleri (alfa, beta, delta, epsilon ve gamma) ile isimlendirilen 5 sınıf belirlenmiş, daha sonra (bazıları öncesinde alt sınıf olan) Acidithiobacillia, Oligoflexia, Zetaproteobacteria ve Hydrogenophilalia sınıflarının eklenmesiyle, tamamı monofiletik toplam 9 sınıf olmuştur.
Alfaproteobakteriler çoğunlukla ışığı kullanarak organik madde üreten (fototrof) bakteri cinslerini içerir, ama bunlara ek olarak azot fiksasyonu yapan bakteri türleri, hayvan ve bitki simbiontları (örn. Rhizobia) ve tehlikeli bir patojen grubu olan 'yı da kapsar. Ökaryotik hücrelerdeki mitokondrinin atasının da bu bakteri grubundan kaynaklandığı düşünülmektedir (bkz. endosimbiont teorisi)
Betaproteobakteriler, yıkım yetenekleri bakımından zengin olan aerobik veya seçmeli anaerobik bakteri gruplarından oluşur, ama cinsler (örn. amonyak yükseltgeyen Nitrosomonas) ve bazı fototroflar (Rhodocyclus ve Rubrivivax) de içerir. Çoğu doğada, örneğin atık sularda veya toprakta bulunur. Bu sınıfta yer alan patojen türler familyasındaki (frengi ve meningoensefalit etmenleri) ve cinsindeki türlerdir.
Gammaproteobakteriler arasında, Enterobacteriaceae, Vibrionaceae ve Pseudomonadaceae gibi tıbben ve bilimsel olarak önemli sayılan gruplar bulunur. Çok büyük sayıda patojen bu gruba aittir, örneğin Salmonella ( and tifo etmeni), Yersinia (veba), Vibrio (kolera), Pseudomonas aeruginosa (hastanede yatan veya kistik fibroz hastalarında görülen akciğer enfeksiyonu).
Deltaproteobakteriler büyük oranda aerobik cinslerden, meyve gövdesi oluşturan ve zorunlu anaerobik cinslerin bir dalından oluşur. Bu gruba ait zorunlu anaeroblar arasında sülfat indirgeyici (, , , , vs.) ve kükürt indirgeyici (örn., ) bakteriler ve farklı fizyolojileri olan bazı başka anaerobik bakteriler (örn., demir-III indirgeyici ve ve türleri) bulunur.
Epsilonproteobakteriler yalnızca birkaç cinsten oluşurlar bunlar başlıca burgulu , ve Campylobacter 'dir. Bunlarin hepsi insan ve hayvan sindirim sisteminde ya simbiont olarak (ineklerde Wollinella) ya da patojen olarak (midede Helicobacter, duodenumda Campilobacter) yaşarlar.
Demir oksitleyen, nötrofilik, kemoototrof, tüm tatlı su ve deniz ekosistemlerinde yaygın bulunan bakterilerdir. Tip ordosu 'dir.
Zorunlu termofildirler. Heterotrof veya ototrof olabilirler. Tip ordosu 'dir.
Sülfür, demir ve uranyumu oksitleyebilen ototrof bakterilerdir. gibi ekonomik olarak önemli mikroorganizmaları içeren tip ordosudur.
Filamentöz aeroblardır. Tip ordosu , tip cinsi 'dur.
Kaynakça
- ^ "Phylum "Proteobacteria"". LPSN. 19 Nisan 2021 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 12 Temmuz 2021.
- ^ Garrity GM, Bell JA, Lilburn T. (2005). "Phylum XIV. Proteobacteria phyl. nov.". In: Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM, (Ed.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd edn, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria),. Springer, New York,. s. 1.
- ^ Madigan, M. and J. Martinko. (eds.) (2005). Brock Biology of Microorganisms. Prentice Hall. ISBN .
- ^ Williams KP, Kelly DP. (2013). "Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria, Acidithiobacillia classis nov., with the type order Acidithiobacillales, and emended description of the class Gammaproteobacteria". Int J Syst Evol Microbiol. 63: 2901-2906.
- ^ Nakai R, Nishijima M, Tazato N, Handa Y, Karray F, Sayadi S, Isoda H, Naganuma T. (2014). "Oligoflexus tunisiensis gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, filamentous bacterium of a novel proteobacterial lineage, and description of Oligoflexaceae fam. nov., Oligoflexales ord. nov. and Oligoflexia classis nov". Int J Syst Evol Microbiol. 64: 3353-3359.
- ^ Makita H, Tanaka E, Mitsunobu S, Miyazaki M, Nunoura T, Uematsu K, Takaki Y, Nishi S, Shimamura S, Takai K. (2017). "Mariprofundus micogutta sp. nov., a novel iron-oxidizing zetaproteobacterium isolated from a deep-sea hydrothermal field at the Bayonnaise knoll of the Izu-Ogasawara arc, and a description of Mariprofundales ord. nov. and Zetaproteobacteria classis nov". Arch Microbiol. 199: 335-346.
- ^ Boden R, Hutt LP, Rae AW. (2017). "Reclassification of Thiobacillus aquaesulis (Wood & Kelly, 1995) as Annwoodia aquaesulis gen. nov., comb. nov., transfer of Thiobacillus (Beijerinck, 1904) from the Hydrogenophilales to the Nitrosomonadales, proposal of Hydrogenophilalia class. nov. within the 'Proteobacteria', and four new families within the orders Nitrosomonadales and Rhodocyclales". Int J Syst Evol Microbiol. 67: 1191-1205.
- ^ Noel R. Krieg, Don J. Brenner, James T. Staley (2005). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: The Proteobacteria. Springer. ISBN .
- ^ Ciccarelli FD, Doerks T, Von Mering C, Creevey CJ, Snel B, Bork P (2006). "Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life". Science. 311: 1283-1287. doi:10.1126/science.1123061. (PMID) 16513982.
- ^ Roger AJ, Muñoz-Gómez SA, Kamikawa R (2017). "The origin and diversification of mitochondria". Current Biology. 27 (21): R1177-R1192. doi:10.1016/j.cub.2017.09.015. (PMID) 29112874.
- Madigan, Michael; Martinko, John (editors) (2005). Brock Biology of Microorganisms, 11th ed., Prentice Hall
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Proteobakteriler Proteobacteria bakteriler ustaleminin ana gruplarindan birisini meydana getiren ve onemli cins ve turleri iceren subesidir Cesitli hastalik etmenleri Escherichia Salmonella Vibrio gibi ve baska cok bilinen cinsler bu gruba dahildir Ayrica dogada serbest yasayan turleri ve azot fiksasyonundan sorumlu pek cok bakteri turunu de icerir Bu grup ribozomal RNA rRNA dizinlerine gore tanimlanmistir Bakteri bicimlerinin cesitliliginden dolayi grup ismini Yunan mitolojisinde yer alan her sekle girebilen tanri Proteus tan almistir Proteus ayni zamanda Proteobakterilerde yer alan bir cinsin de adidir ProteobacteriaEscherichia coliBiyolojik siniflandirmaUst alem BacteriaAlt alem Sube Proteobacteria Garrity et al 2005SiniflarAlphaproteobacteria Gammaproteobacteria Proteobakteriler Gram negatif ozelliklidir baslica olusur Cogu flagella ile hareket eder ama bazilari hareketsizdir veya kullanirlar Bu sonuncu yontemi kullananlar arasinda bulunan kumeleserek cok hucreli meyve govdeleri olustururlar Metabolizma tipleri bakimindan da bu grupta buyuk bir cesitlilik vardir Cogu secmeli veya zorunlu anaerobik ve ama pek cok istisna da mevcuttur Birbiriyle yakin iliskisi olmayan bazi cinsler fotosentez yoluyla isigi enerjiye donustururler Bunlar kirmizimsi pigmentlerini kullanan mor bakterilerdir Bolum veya siniflar Proteobacteria filogenetik semasi Sube Alphaproteobacteria Gammaproteobacteria ARB living tree iTOL Bergey ve diger kaynaklara gore hazirlanan Proteobacteria filogenetik agaci Acidobacteria subesi Proteobacteria subesine dahil olmayip dis grup olarak verilmistir Acidithiobacillia Hydrogenophilalia ve Oligoflexia siniflari semada gosterilmemistir Proteobakteriler oncelikli olarak ribozomal RNA dizilimine gore siniflandirilmistir Ilk basta yunan harfleri alfa beta delta epsilon ve gamma ile isimlendirilen 5 sinif belirlenmis daha sonra bazilari oncesinde alt sinif olan Acidithiobacillia Oligoflexia Zetaproteobacteria ve Hydrogenophilalia siniflarinin eklenmesiyle tamami monofiletik toplam 9 sinif olmustur Alphaproteobacteria Alfaproteobakteriler cogunlukla isigi kullanarak organik madde ureten fototrof bakteri cinslerini icerir ama bunlara ek olarak azot fiksasyonu yapan bakteri turleri hayvan ve bitki simbiontlari orn Rhizobia ve tehlikeli bir patojen grubu olan yi da kapsar Okaryotik hucrelerdeki mitokondrinin atasinin da bu bakteri grubundan kaynaklandigi dusunulmektedir bkz endosimbiont teorisi Bordetella bronchiseptica Betaproteobakteriler yikim yetenekleri bakimindan zengin olan aerobik veya secmeli anaerobik bakteri gruplarindan olusur ama cinsler orn amonyak yukseltgeyen Nitrosomonas ve bazi fototroflar Rhodocyclus ve Rubrivivax de icerir Cogu dogada ornegin atik sularda veya toprakta bulunur Bu sinifta yer alan patojen turler familyasindaki frengi ve meningoensefalit etmenleri ve cinsindeki turlerdir Vibrio choleraeGammaproteobacteria Gammaproteobakteriler arasinda Enterobacteriaceae Vibrionaceae ve Pseudomonadaceae gibi tibben ve bilimsel olarak onemli sayilan gruplar bulunur Cok buyuk sayida patojen bu gruba aittir ornegin Salmonella and tifo etmeni Yersinia veba Vibrio kolera Pseudomonas aeruginosa hastanede yatan veya kistik fibroz hastalarinda gorulen akciger enfeksiyonu Deltaproteobakteriler buyuk oranda aerobik cinslerden meyve govdesi olusturan ve zorunlu anaerobik cinslerin bir dalindan olusur Bu gruba ait zorunlu anaeroblar arasinda sulfat indirgeyici vs ve kukurt indirgeyici orn bakteriler ve farkli fizyolojileri olan bazi baska anaerobik bakteriler orn demir III indirgeyici ve ve turleri bulunur Helicobacter pylori Epsilonproteobakteriler yalnizca birkac cinsten olusurlar bunlar baslica burgulu ve Campylobacter dir Bunlarin hepsi insan ve hayvan sindirim sisteminde ya simbiont olarak ineklerde Wollinella ya da patojen olarak midede Helicobacter duodenumda Campilobacter yasarlar Demir oksitleyen notrofilik kemoototrof tum tatli su ve deniz ekosistemlerinde yaygin bulunan bakterilerdir Tip ordosu dir Zorunlu termofildirler Heterotrof veya ototrof olabilirler Tip ordosu dir Sulfur demir ve uranyumu oksitleyebilen ototrof bakterilerdir gibi ekonomik olarak onemli mikroorganizmalari iceren tip ordosudur Filamentoz aeroblardir Tip ordosu tip cinsi dur Kaynakca Phylum Proteobacteria LPSN 19 Nisan 2021 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 12 Temmuz 2021 Garrity GM Bell JA Lilburn T 2005 Phylum XIV Proteobacteria phyl nov In Brenner DJ Krieg NR Staley JT Garrity GM Ed Bergey s Manual of Systematic Bacteriology 2nd edn vol 2 The Proteobacteria part B The Gammaproteobacteria Springer New York s 1 KB1 bakim Editorler parametresini kullanan link Madigan M and J Martinko eds 2005 Brock Biology of Microorganisms Prentice Hall ISBN 978 0 13 144329 7 KB1 bakim Fazladan yazi yazar listesi link Williams KP Kelly DP 2013 Proposal for a new class within the phylum Proteobacteria Acidithiobacillia classis nov with the type order Acidithiobacillales and emended description of the class Gammaproteobacteria Int J Syst Evol Microbiol 63 2901 2906 Nakai R Nishijima M Tazato N Handa Y Karray F Sayadi S Isoda H Naganuma T 2014 Oligoflexus tunisiensis gen nov sp nov a Gram negative aerobic filamentous bacterium of a novel proteobacterial lineage and description of Oligoflexaceae fam nov Oligoflexales ord nov and Oligoflexia classis nov Int J Syst Evol Microbiol 64 3353 3359 Makita H Tanaka E Mitsunobu S Miyazaki M Nunoura T Uematsu K Takaki Y Nishi S Shimamura S Takai K 2017 Mariprofundus micogutta sp nov a novel iron oxidizing zetaproteobacterium isolated from a deep sea hydrothermal field at the Bayonnaise knoll of the Izu Ogasawara arc and a description of Mariprofundales ord nov and Zetaproteobacteria classis nov Arch Microbiol 199 335 346 Boden R Hutt LP Rae AW 2017 Reclassification of Thiobacillus aquaesulis Wood amp Kelly 1995 as Annwoodia aquaesulis gen nov comb nov transfer of Thiobacillus Beijerinck 1904 from the Hydrogenophilales to the Nitrosomonadales proposal of Hydrogenophilalia class nov within the Proteobacteria and four new families within the orders Nitrosomonadales and Rhodocyclales Int J Syst Evol Microbiol 67 1191 1205 Noel R Krieg Don J Brenner James T Staley 2005 Bergey s Manual of Systematic Bacteriology The Proteobacteria Springer ISBN 978 0 387 95040 2 Ciccarelli FD Doerks T Von Mering C Creevey CJ Snel B Bork P 2006 Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life Science 311 1283 1287 doi 10 1126 science 1123061 PMID 16513982 Roger AJ Munoz Gomez SA Kamikawa R 2017 The origin and diversification of mitochondria Current Biology 27 21 R1177 R1192 doi 10 1016 j cub 2017 09 015 PMID 29112874 Madigan Michael Martinko John editors 2005 Brock Biology of Microorganisms 11th ed Prentice Hall ISBN 0 13 144329 1