Azərbaycanca
Беларускі
Dansk
Deutsch
Española
Français
Indonesia
Italiana
日本語
Қазақ
Lietuvos
Nederlands
Português
Русский
සිංහල
แบบไทย
Türkçe
Українська
中國人
United State
Afrikaans
Spartan, Wavefunction'ın moleküler modelleme ve bilgisayarlı kimya uygulamasıdır. Moleküler mekanik, yarı-ampirik yöntemler, ab initio modeller,yoğunluklu fonksiyonel modeller, post Hartree-Fock modeller, G3 (MP2) ve T1 içeren termokimyasal tarifler için kodlar içerir.
 | |
 | |
| Geliştirici(ler) | Wavefunction, Inc. & |
|---|---|
| İlk yayınlanma | 1991 |
| Güncel sürüm | Spartan'18 v.1.4.4 / 2019 |
| Programlama dili | C, , Fortran, Qt |
| İşletim sistemi | Windows, Mac OS X, Linux |
| Platform | x86-64 |
| Erişilebilirlik | İngilizce |
| Tür | Moleküler modelleme, Bilgisayarlı kimya |
| Resmî sitesi | wavefun.com |
Birincil fonksiyonlar yapılar, bağıl kararlılıklar ve izole edilmiş moleküllerin diğer özellikleri hakkında bilgi sağlamaktır. Karmaşık moleküller üzerinde moleküler mekanik hesaplamaları yaygındır. Hartree-Fock yöntemi moleküler orbital hesaplamalarını içeren kuantum kimyasal hesaplamaları, özellikle de elektronik korelasyonu içeren hesaplamalar moleküler mekanikle karşılaştırıldığında daha fazla zaman alır.
Kuantum kimyasal hesaplamalar, kimyasal reaksiyonların mekanizmaları ve ürün dağılımları hakkında bilgi edinmek (doğrudan geçiş durumları üzerindeki hesaplamalarla ya da Hammond'ın varsayımına dayanarak, reaktiflerin sterik ve elektronik taleplerini modelleyerek) için de kullanılabilirler. Doğrudan geçiş durumlarının geometrileri ve genel olarak reaksiyon mekanizmaları hakkında bilgi veren nicel hesaplamalar giderek yaygınlaşırken, daha sıkı işlemlere tabi tutulacak çok büyük sistemler için nitel modellere hala ihtiyaç duyulmaktadır. Kuantum kimyasal hesaplamalar, mevcut deneysel verileri tamamlamak veya bunları tamamen değiştirmek için bilgi sağlayabilir, örneğin, nicel yapı-aktivite ilişkisi (quantitative structure-activity relationship/QSAR) için atomik yüklerin ve moleküller arası potansiyellerin analizleri için moleküler mekanik ve moleküler dinamik hesaplamalarından faydalanılır.
Spartan, moleküler şekil konformasyonu, yapı (denge ve geçiş durumu geometrisi), NMR, IR, Raman ve UV-VIS spektrumu, moleküler (ve atomik) özellikler, reaktivite ve seçiciliğin belirlenmesi için kullanılabilecek bilgisayarlı kimya metodlarını içerir.
Yazılımsal vasıflar
Bu yazılım, moleküler mekanik, Merck Moleküler Kuvvet Alanı (Merck Molecular Force Field/MMFF), uzantılı MMFF ve SYBYL, kuvvet alanı hesaplamaları, Yarı ampirik hesaplamalara [MNDO / MNDO (D), Austin Model 1 (AM1), PM3, Recife Model 1 (RM1) ve PM6] erişim sağlar.
- Örtük çözücü (SM8) ile kullanılabilen Hartree-Fock, kendi kendine tutarlı alan (self-consistent field /SCF) yöntemleri:
- Sınırlı, sınırsız ve kısıtlı açık kabuk Hartree – Fock
- Örtük çözücü (SM8) ile kullanılabilen fonksiyonel yoğunluk teorisi (DFT) yöntemleri:
- Standart fonksiyoneller: BP, BLYP, B3LYP, EDF1, EDF2, M06, ω97B97X-D
- Değişim İşlevselleri : HF, Slater-Dirac, Becke88, Gill96, GG99, B (EDF1), PW91
- Korelasyon fonksiyonları : VWN, LYP, PW91, P86, PZ81, PBE
- Kombinasyon veya hibrit fonksiyoneller: B3PW91, B3LYP, B3LYP5, EDF1, EDF2, BMK
- Truhlar grubu fonksiyonelleri: M05, M05-2X, M06, M06-L M06-2X, M06-HF
- Head-Gordon grubu fonksiyonları: 97B97, ωB97X, 97B97X-D
- Eşleşmiş küme yöntemleri:
- CCSD, CCSD (T), CCSD (2), OD, OD (T), OD (2), QCCD, VOD, VOD (2), VQCCD
- Møller - Plesset yöntemleri:
- MP2, MP3, MP4, RI-MP2
- Uyarılmış hâl yöntemleri:
- Zamana bağlı yoğunluk fonksiyonel teorisi (Time-dependent density functional theory/TDDFT)
- Konfigürasyon etkileşimi: CIS, CIS (D), QCIS (D), kuadratik konfigürasyon etkileşimi (QCISD (T)), RI-CIS (D)
- Kuantum kimyası bileşik yöntemleri, termokimyasal tarifler:
- T1, G2, G3, G3 (MP2)
Görevler
Mevcut yazılım modelleri moleküler, termodinamik, QSAR, atomik, grafiksel ve spektral özellikler sunar.
- Enerji - Belirli bir geometri için, bir molekül veya sistemin enerji ve ilgili özellikleri hakkında bilgi sağlar. Kuantum kimyasal modeller kullanılıyorsa, dalga fonksiyonu hesaplanır.
- Denge moleküler geometrisi - En yakın yerel minimumun yerini belirler ve enerji ve ilgili özellikler hakkında bilgi sağlar.
- Geçiş durumu geometrisi - En yakın birinci dereceden eyer noktasını (tek boyutta bir maksimum ve diğer boyutlarda minimum) tespit eder ve enerji ve ilgili özellikler hakkında bilgi sağlar.
- Denge konformer - En düşük enerji konformasyonunu bulur. Çoğunlukla bir kuantum kimyasal model kullanılarak yapı hesaplanmadan önce gerçekleştirilir.
- Konformer dağılımı - Düşük enerjili konformerler seçimi elde eder. Belirli bir molekülün şekillerini tanımlamak ve ortalama moleküler özelliklerin hesaplanması için bir Boltzmann dağılımı belirlemek amacıyla yaygın olarak kullanılır.
- Konformer kütüphanesi - En düşük enerjili konformeri bulur ve bunu enerjiden bağımsız olarak moleküle erişilebilen tüm şekilleri kapsayan bir dizi konformer ile ilişkilendirir. Benzerlik analizi için kütüphaneler oluşturmak için kullanılır.
- Enerji profili - Bir molekülü veya sistemi, her basamak için denge geometrileri sağlayan (kullanıcı tarafından belirlenen kısıtlamalara tabi) kullanıcı tanımlı bir koordinat seti boyunca basamaklandırır.
- Benzerlik analizi - yapı veya kimyasal fonksiyona (Hidrojen bağı alıcılar-donörler, pozitif-negatif iyonlaştırıcılar, hidrofoblar, aromatikler) dayalı olarak moleküllerin (ve isteğe bağlı olarak onların konformerlerinin) benzerliğini ölçmektedir. Bir molekülün (ve isteğe bağlı olarak konformerlerinin) bir farmakoforla benzerliğini belirler.
Grafiksel kullanıcı arayüzü
Yazılım entegre bir Grafiksel kullanıcı arayüzü içerir. Windows 7 ve 8 aygıtlarında dokunmatik ekran işlemleri destekleniyor. Moleküllerin 3D olarak oluşturulması, molekül inşa edicileri ile kolaylaştırılmıştır (organik, inorganik, peptid, nükleotit ve inşa edicileri dahil). 2D yapı, 2D çizim paleti bulunan organik moleküller için desteklenir. Windows sürüm arayüzü ChemDraw'a erişebilir; 9.0 ve sonraki sürümleri 2D olarak molekül oluşturmak için de kullanılabilir. Hesaplama diyalogu, görevin ve hesaplama yönteminin belirtilmesi için kullanılır. Hesaplamalardan gelen veriler diyaloglarda veya metin çıktısı olarak görüntülenir. Doğrusal regresyon dahil ek veri analizi, dahili bir elektronik tablodan mümkündür.
Ana sürüm geçmişi
- 1991 Spartan sürüm 1 Unix
- 1993 Spartan sürüm 2 Unix
- 1994 Mac Spartan Macintosh
- 1995 Spartan sürüm 3 Unix
- 1995 PC Spartan Windows
- 1996 Mac Spartan Plus Macintosh
- 1997 Spartan sürüm 4 Unix
- 1997 PC Spartan Plus, Windows
- 1999 Spartan sürüm 5 Unix
- 1999 PC Spartan Pro Windows
- 2000 Mac Spartan Pro Macintosh
- 2002 Spartan'02 Unix, Linux, Windows, Mac
Windows, Macintosh, Linux sürümleri
- 2004 Spartan'04
- 2006 Spartan'06
- 2008 Spartan'08
- 2010 Spartan'10
- 2013 Spartan'14
- 2016 Spartan'16
- 2018 Spartan'18
Ayrıca bakınız
Kaynakça
- ^ "Wavefunction, Inc". 11 Kasım 2020 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Kasım 2019.
- ^ Computational Chemistry, David Young, Wiley-Interscience, 2001. Appendix A. A.1.6 pg 330, Spartan
- ^ Warren J.. Hehre; Warren J. Hehre; Leo Radom; Paul von R. Schleyer; John Pople (24 Mart 1986). AB INITIO Molecular Orbital Theory (İngilizce). Wiley-Interscience. ISBN .
- ^ Christopher J. Cramer (15 Kasım 2004). Essentials of Computational Chemistry (İngilizce). Wiley-Blackwell. ISBN .
- ^ Andrew R. Leach; Leach AR. (2001). Molecular Modelling (İngilizce). Pearson Education. ISBN .
- ^ . 20 Temmuz 2011 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Kasım 2019.
- ^ "Head-Gordon Group". 19 Aralık 2019 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 28 Kasım 2019.
- ^ [1] 6 Mart 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde . An assessment of most computational models is available. Warren J. Hehre; Alan J. Shusterman; Janet E. Nelson (1998). The Molecular Modeling Workbook for Organic Chemistry (İngilizce). ISBN .
Dış bağlantılar
- Resmî site, Wavefunction, Inc
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Spartan Wavefunction in molekuler modelleme ve bilgisayarli kimya uygulamasidir Molekuler mekanik yari ampirik yontemler ab initio modeller yogunluklu fonksiyonel modeller post Hartree Fock modeller G3 MP2 ve T1 iceren termokimyasal tarifler icin kodlar icerir SpartanGelistirici ler Wavefunction Inc amp Ilk yayinlanma1991Guncel surumSpartan 18 v 1 4 4 2019Programlama diliC C Fortran QtIsletim sistemiWindows Mac OS X LinuxPlatformx86 64ErisilebilirlikIngilizceTurMolekuler modelleme Bilgisayarli kimyaResmi sitesiwavefun com Birincil fonksiyonlar yapilar bagil kararliliklar ve izole edilmis molekullerin diger ozellikleri hakkinda bilgi saglamaktir Karmasik molekuller uzerinde molekuler mekanik hesaplamalari yaygindir Hartree Fock yontemi molekuler orbital hesaplamalarini iceren kuantum kimyasal hesaplamalari ozellikle de elektronik korelasyonu iceren hesaplamalar molekuler mekanikle karsilastirildiginda daha fazla zaman alir Kuantum kimyasal hesaplamalar kimyasal reaksiyonlarin mekanizmalari ve urun dagilimlari hakkinda bilgi edinmek dogrudan gecis durumlari uzerindeki hesaplamalarla ya da Hammond in varsayimina dayanarak reaktiflerin sterik ve elektronik taleplerini modelleyerek icin de kullanilabilirler Dogrudan gecis durumlarinin geometrileri ve genel olarak reaksiyon mekanizmalari hakkinda bilgi veren nicel hesaplamalar giderek yayginlasirken daha siki islemlere tabi tutulacak cok buyuk sistemler icin nitel modellere hala ihtiyac duyulmaktadir Kuantum kimyasal hesaplamalar mevcut deneysel verileri tamamlamak veya bunlari tamamen degistirmek icin bilgi saglayabilir ornegin nicel yapi aktivite iliskisi quantitative structure activity relationship QSAR icin atomik yuklerin ve molekuller arasi potansiyellerin analizleri icin molekuler mekanik ve molekuler dinamik hesaplamalarindan faydalanilir Spartan molekuler sekil konformasyonu yapi denge ve gecis durumu geometrisi NMR IR Raman ve UV VIS spektrumu molekuler ve atomik ozellikler reaktivite ve seciciligin belirlenmesi icin kullanilabilecek bilgisayarli kimya metodlarini icerir Yazilimsal vasiflarBu yazilim molekuler mekanik Merck Molekuler Kuvvet Alani Merck Molecular Force Field MMFF uzantili MMFF ve SYBYL kuvvet alani hesaplamalari Yari ampirik hesaplamalara MNDO MNDO D Austin Model 1 AM1 PM3 Recife Model 1 RM1 ve PM6 erisim saglar Ortuk cozucu SM8 ile kullanilabilen Hartree Fock kendi kendine tutarli alan self consistent field SCF yontemleri Sinirli sinirsiz ve kisitli acik kabuk Hartree Fock Ortuk cozucu SM8 ile kullanilabilen fonksiyonel yogunluk teorisi DFT yontemleri Standart fonksiyoneller BP BLYP B3LYP EDF1 EDF2 M06 w97B97X D Degisim Islevselleri HF Slater Dirac Becke88 Gill96 GG99 B EDF1 PW91 Korelasyon fonksiyonlari VWN LYP PW91 P86 PZ81 PBE Kombinasyon veya hibrit fonksiyoneller B3PW91 B3LYP B3LYP5 EDF1 EDF2 BMK Truhlar grubu fonksiyonelleri M05 M05 2X M06 M06 L M06 2X M06 HF Head Gordon grubu fonksiyonlari 97B97 wB97X 97B97X D Eslesmis kume yontemleri CCSD CCSD T CCSD 2 OD OD T OD 2 QCCD VOD VOD 2 VQCCD Moller Plesset yontemleri MP2 MP3 MP4 RI MP2 Uyarilmis hal yontemleri Zamana bagli yogunluk fonksiyonel teorisi Time dependent density functional theory TDDFT Konfigurasyon etkilesimi CIS CIS D QCIS D kuadratik konfigurasyon etkilesimi QCISD T RI CIS D Kuantum kimyasi bilesik yontemleri termokimyasal tarifler T1 G2 G3 G3 MP2 GorevlerMevcut yazilim modelleri molekuler termodinamik QSAR atomik grafiksel ve spektral ozellikler sunar Enerji Belirli bir geometri icin bir molekul veya sistemin enerji ve ilgili ozellikleri hakkinda bilgi saglar Kuantum kimyasal modeller kullaniliyorsa dalga fonksiyonu hesaplanir Denge molekuler geometrisi En yakin yerel minimumun yerini belirler ve enerji ve ilgili ozellikler hakkinda bilgi saglar Gecis durumu geometrisi En yakin birinci dereceden eyer noktasini tek boyutta bir maksimum ve diger boyutlarda minimum tespit eder ve enerji ve ilgili ozellikler hakkinda bilgi saglar Denge konformer En dusuk enerji konformasyonunu bulur Cogunlukla bir kuantum kimyasal model kullanilarak yapi hesaplanmadan once gerceklestirilir Konformer dagilimi Dusuk enerjili konformerler secimi elde eder Belirli bir molekulun sekillerini tanimlamak ve ortalama molekuler ozelliklerin hesaplanmasi icin bir Boltzmann dagilimi belirlemek amaciyla yaygin olarak kullanilir Konformer kutuphanesi En dusuk enerjili konformeri bulur ve bunu enerjiden bagimsiz olarak molekule erisilebilen tum sekilleri kapsayan bir dizi konformer ile iliskilendirir Benzerlik analizi icin kutuphaneler olusturmak icin kullanilir Enerji profili Bir molekulu veya sistemi her basamak icin denge geometrileri saglayan kullanici tarafindan belirlenen kisitlamalara tabi kullanici tanimli bir koordinat seti boyunca basamaklandirir Benzerlik analizi yapi veya kimyasal fonksiyona Hidrojen bagi alicilar donorler pozitif negatif iyonlastiricilar hidrofoblar aromatikler dayali olarak molekullerin ve istege bagli olarak onlarin konformerlerinin benzerligini olcmektedir Bir molekulun ve istege bagli olarak konformerlerinin bir farmakoforla benzerligini belirler Grafiksel kullanici arayuzuYazilim entegre bir Grafiksel kullanici arayuzu icerir Windows 7 ve 8 aygitlarinda dokunmatik ekran islemleri destekleniyor Molekullerin 3D olarak olusturulmasi molekul insa edicileri ile kolaylastirilmistir organik inorganik peptid nukleotit ve insa edicileri dahil 2D yapi 2D cizim paleti bulunan organik molekuller icin desteklenir Windows surum arayuzu ChemDraw a erisebilir 9 0 ve sonraki surumleri 2D olarak molekul olusturmak icin de kullanilabilir Hesaplama diyalogu gorevin ve hesaplama yonteminin belirtilmesi icin kullanilir Hesaplamalardan gelen veriler diyaloglarda veya metin ciktisi olarak goruntulenir Dogrusal regresyon dahil ek veri analizi dahili bir elektronik tablodan mumkundur Ana surum gecmisi1991 Spartan surum 1 Unix 1993 Spartan surum 2 Unix 1994 Mac Spartan Macintosh 1995 Spartan surum 3 Unix 1995 PC Spartan Windows 1996 Mac Spartan Plus Macintosh 1997 Spartan surum 4 Unix 1997 PC Spartan Plus Windows 1999 Spartan surum 5 Unix 1999 PC Spartan Pro Windows 2000 Mac Spartan Pro Macintosh 2002 Spartan 02 Unix Linux Windows MacWindows Macintosh Linux surumleri 2004 Spartan 04 2006 Spartan 06 2008 Spartan 08 2010 Spartan 10 2013 Spartan 14 2016 Spartan 16 2018 Spartan 18Ayrica bakinizMolekul editoru Kuantum kimyasi ve kati hal fizigi yazilimlari listesiKaynakca Wavefunction Inc 11 Kasim 2020 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Kasim 2019 Computational Chemistry David Young Wiley Interscience 2001 Appendix A A 1 6 pg 330 Spartan Warren J Hehre Warren J Hehre Leo Radom Paul von R Schleyer John Pople 24 Mart 1986 AB INITIO Molecular Orbital Theory Ingilizce Wiley Interscience ISBN 0 471 81241 2 Christopher J Cramer 15 Kasim 2004 Essentials of Computational Chemistry Ingilizce Wiley Blackwell ISBN 978 0 470 09182 1 Andrew R Leach Leach AR 2001 Molecular Modelling Ingilizce Pearson Education ISBN 0 582 38210 6 20 Temmuz 2011 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Kasim 2019 Head Gordon Group 19 Aralik 2019 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 28 Kasim 2019 1 6 Mart 2021 tarihinde Wayback Machine sitesinde An assessment of most computational models is available Warren J Hehre Alan J Shusterman Janet E Nelson 1998 The Molecular Modeling Workbook for Organic Chemistry Ingilizce ISBN 1 890661 06 6 Dis baglantilarResmi site Wavefunction Inc