Deaminasyon bir molekülden bir amino grubunun çıkarılması. Bu reaksiyonu katalizleyen enzimler deaminaz olarak adlandırılır.
İnsan vücudunda deaminasyon başlıca karaciğerde olur, ancak glutamat ayrıca böbrekler de deamine olur. Aşırı protein alındığında amino asitler deaminasyon yoluyla yıkıma uğrar. Amino asitten amino grubu çıkartıldıktan sonra amonyağa dönüşür. Amino asidin geriye kalanı başlıca karbon ve hidrojenden oluşur veya başka bir moleküle dönüştürülür veya enerji için oksitlenir. Amonyak aşırı miktarda hücrelere zehirli olduğu için üre döngüsü içinde enzimler ona karbondioksit ekleyerek onu üre veya ürik asite dönüştürürler. Üre ve ürik asit kana kolaylıkla geçip idrarla atılabilir.
DNA'da deaminasyon reaksiyonları
Sitozin
Spontan demainasyon, sitozin'in hidroliz yoluyla urasil'e dönüşmesi ve bu süreçte amonyak salmasıdır. DNA'da bu spontan (kendiliğinden olan) deaminasyon, meydana gelen urasil'in çıkartılması ile düzeltilir. Urasil normalde DNA'da bulunmayan bir baz olduğu için enzimi tarafından çıkartılır. DNA zinciirnin o noktasındaki şeker grubunda bir baz takılı olmaması bir tarafından fark edilir, fosfodiester bağı orada kesilir. Meydana gelen hasar oraya bir diğer sitozin eklenmesiyle tamir edilir. A ailesi üyesi bir DNA polimeraz bu değişikliği yapar, bu işlem sırasında 3'-->5' eksonükleaz etkinliği ile DNA'da "çentik" olan yerden bir nükleotit çıkarır, sonra polimeraz etkinliği ile boşluğu gerekli olan nükleotit ile doldurur. DNA ligaz zincirdeki kopukluğu kapatmak için fosfodiester bağını yeniden oluşturur.
Deaminasyon reaksiyonu laboratuvar ortamında kullanılarak da meydana getirilebilir. Bisülfit sitozin'in deamine olmasını sağlar ama 5-metilsitozin'e etki etmez. Bu özellikten yararlanılarak metillenmiş DNA'nın dizilemesinde metillenmemiş sitozin (urasil olarak belirir) ile metillenmiş sitozin (değişime uğramaz) ayırdedilebilir.
5-metilsitozin
5-metilsitozin'in spontan deaminasyonu sonucu timin ve amonyak meydana gelir. Bu, en yaygın olan tek nükleotitli mutasyondur. DNA'da bu reaksiyon tamir edilemez çünkü tamir mekanizması timin bazını (urasil gibi) bir hata sonucu olmuş olarak algılayamaz. Eğer mutasyon bir genin fonksiyonunu etkileyip hücrenin (veya organizmanın) ölümüne yol açmazsa, varlığı devam eder. Tamir mekanizmasının bu yetersizliği, ökaryotik genomlarda ender olmasının nedenlerinden biridir.
Guanin
Guanin'in deaminasyonu sonucu ksantin oluşur. Ksantin, guanin'in enol totomerine benzer şekilde, sitozin yerine timin ile baz eşleşmesi yapar. Bunun sonucu, ikileşme sonrası br transisyon mutasyonudur, orijinal G-C baz çifti bir A-T baz çiftine dönüşür. Bu mutasyonun düzeltilmesi için baz çıkarma tamiri ((baz eksizyon tamiri)) sırasında bir enziminin katılımı gerekir.
Adenin
Adenin'in deaminasyonu sonucu oluşur. Hipoksantin, adenin'in imin totomerine benzer şekilde timin yerine sitozin ile baz eşleşmesi yapar. Bunun sonucu, ikileşme sonrası br transisyon mutasyonudur, orijinal A-T baz çifti bir G-C baz çiftine dönüşür
Bu işlemi yapan diğer enzimler
(RNA editing) enzimleri bazı mesajcı RNA moleküllerindeki spesifik bazları deamine ederek protein kodlayıcı dizilerini değiştirirler. Örneğin geninin ürünü enzim, 'nin mRNA'sında belli bir sitozin'i urasil'e dönüştürür. ADAR geni tarafında kodlanan Adenozin deaminaz, RNA-spesifik enzimi, çift iplikli RNA moleküllerinde adenozinleri inosin'e dönüştürür. Bazı tRNA moleküllerinde antikodon bölgesindeki bir Adenin inosin'e dönüştürülür.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Deaminasyon bir molekulden bir amino grubunun cikarilmasi Bu reaksiyonu katalizleyen enzimler deaminaz olarak adlandirilir Insan vucudunda deaminasyon baslica karacigerde olur ancak glutamat ayrica bobrekler de deamine olur Asiri protein alindiginda amino asitler deaminasyon yoluyla yikima ugrar Amino asitten amino grubu cikartildiktan sonra amonyaga donusur Amino asidin geriye kalani baslica karbon ve hidrojenden olusur veya baska bir molekule donusturulur veya enerji icin oksitlenir Amonyak asiri miktarda hucrelere zehirli oldugu icin ure dongusu icinde enzimler ona karbondioksit ekleyerek onu ure veya urik asite donustururler Ure ve urik asit kana kolaylikla gecip idrarla atilabilir DNA da deaminasyon reaksiyonlariSitozin Spontan demainasyon sitozin in hidroliz yoluyla urasil e donusmesi ve bu surecte amonyak salmasidir DNA da bu spontan kendiliginden olan deaminasyon meydana gelen urasil in cikartilmasi ile duzeltilir Urasil normalde DNA da bulunmayan bir baz oldugu icin enzimi tarafindan cikartilir DNA zinciirnin o noktasindaki seker grubunda bir baz takili olmamasi bir tarafindan fark edilir fosfodiester bagi orada kesilir Meydana gelen hasar oraya bir diger sitozin eklenmesiyle tamir edilir A ailesi uyesi bir DNA polimeraz bu degisikligi yapar bu islem sirasinda 3 gt 5 eksonukleaz etkinligi ile DNA da centik olan yerden bir nukleotit cikarir sonra polimeraz etkinligi ile boslugu gerekli olan nukleotit ile doldurur DNA ligaz zincirdeki kopuklugu kapatmak icin fosfodiester bagini yeniden olusturur Deaminasyon reaksiyonu laboratuvar ortaminda kullanilarak da meydana getirilebilir Bisulfit sitozin in deamine olmasini saglar ama 5 metilsitozin e etki etmez Bu ozellikten yararlanilarak metillenmis DNA nin dizilemesinde metillenmemis sitozin urasil olarak belirir ile metillenmis sitozin degisime ugramaz ayirdedilebilir 5 metilsitozin 5 metilsitozin in spontan deaminasyonu sonucu timin ve amonyak meydana gelir Bu en yaygin olan tek nukleotitli mutasyondur DNA da bu reaksiyon tamir edilemez cunku tamir mekanizmasi timin bazini urasil gibi bir hata sonucu olmus olarak algilayamaz Eger mutasyon bir genin fonksiyonunu etkileyip hucrenin veya organizmanin olumune yol acmazsa varligi devam eder Tamir mekanizmasinin bu yetersizligi okaryotik genomlarda ender olmasinin nedenlerinden biridir Guanin Guanin in deaminasyonu sonucu ksantin olusur Ksantin guanin in enol totomerine benzer sekilde sitozin yerine timin ile baz eslesmesi yapar Bunun sonucu ikilesme sonrasi br transisyon mutasyonudur orijinal G C baz cifti bir A T baz ciftine donusur Bu mutasyonun duzeltilmesi icin baz cikarma tamiri baz eksizyon tamiri sirasinda bir enziminin katilimi gerekir Adenin Adenin in deaminasyonu sonucu olusur Hipoksantin adenin in imin totomerine benzer sekilde timin yerine sitozin ile baz eslesmesi yapar Bunun sonucu ikilesme sonrasi br transisyon mutasyonudur orijinal A T baz cifti bir G C baz ciftine donusur Bu islemi yapan diger enzimler RNA editing enzimleri bazi mesajci RNA molekullerindeki spesifik bazlari deamine ederek protein kodlayici dizilerini degistirirler Ornegin geninin urunu enzim nin mRNA sinda belli bir sitozin i urasil e donusturur ADAR geni tarafinda kodlanan Adenozin deaminaz RNA spesifik enzimi cift iplikli RNA molekullerinde adenozinleri inosin e donusturur Bazi tRNA molekullerinde antikodon bolgesindeki bir Adenin inosin e donusturulur