Su Mikrobiyolojisi suda yaşayan mikroorganizmaları tüm biyolojik yönleriyle inceleyen bilim dalıdır. Fakat su mikrobiyolojisi terimi daha çok insani tüketim amacıyla kullanılan veya insan sağlığı için önem arz eden sularda bulunan mikroorganizmaların özellikleri, tespit edilmesi ve dezenfeksiyonu çalışmaları için kullanılmaktadır. Doğada tatlı sular, nehir ağızları, okyanuslar gibi sucul ortamlardaki mikroorganizmaları ayrıntılı inceleyen bilim dalı ise aquatik mikrobiyolojidir. Yaşamın başlangıç noktası olan sucul ortamlar virüsler, arkeler, bakteriler, protozoalar, funguslar ve algler başta olmak üzere pek çok mikroorganizma barındırırlar.
İçme, pişirme, gıda hazırlama ya da diğer evsel amaçlar için kullanılan bütün sular, insani tüketim amaçlı su olarak tanımlanmaktadır. İnsani tüketim amaçlı sular, su mikrobiyolojisinin ana konusunu oluşturur ve olası kirliliğin tespit edilebilmesi için düzenli olarak analizleri yapılarak takip altında tutulurlar. Bunlardan başka yüzme suları, havuz suları, kaplıca suları gibi insan sağlığı için öneme sahip sularda su mikrobiyolojisinin kapsamına girmektedir.
Sulardan bulaşabilen patojenler
Atıksuların, temiz su kaynaklarını ve kıyı sularını kirletmesi, insani tüketim amaçlı sulara mikroorganizmaların ve dolayısıyla patojenlerin bulaşmasının en yaygın sebebidir ve genel olarak, sulardan kaynaklı en büyük mikrobiyal risk, hayvan veya insan dışkısı ile kontamine olmuş suyun tüketilmesi olarak kabul edilir.
Sularda bulunan patojenler çevresel patojenler ve enterik patojenler olarak 2 grupta incelenebilirler.Legionella spp., Pseudomonas aeruginosa, Nagleria fowleri gibi çevresel patojenler sürekli bu ortamlarda yaşayan, konak organizmaya ihtiyaç duymadan düşük besin ortamında çoğalabilen mikroorganizmalardır. Enterik patojenler ise genellikle enfekte konakların bağırsak sistemlerinde çoğalır ve suya fekal kontaminasyon yoluyla girerler, örneğin: Campylobacter, Salmonella, Cryptosporidium, Giardia ve .
Bakteriler | |
Vibrio cholerae (serotip O1 – O139) | Kolera |
E.coli (Enterotoksik, Enterohemorajik ve Enteroinvaziv tipler) | Gastroenterit, akut kanlı ishal |
Shigella dysenteriae, S. flexneri, S. boydii, S. sonnei | Basilli dizanteri |
Salmonella enterica subsp. enterica | Tifo, paratifo ve tifoid ateş |
Vibrio parahaemolyticus | Gastroenterit |
Campylobacter jejuni | Campylobacteriosis |
Akut ishal, terminal ileitis | |
Helicobacter pylori | Gastrit |
Gastroenterit ve septisemi | |
kompleksi (Mac) | Deri, lenf, solunum ve sindirim sistemi enfeksiyonları |
Legionella pneumophila | Lejyoner hastalığı (şiddetli zatürre) |
Pseudomonas aeruginosa | Kulak enfeksiyonları |
Virüsler | |
Rotavirüs | Gastroenterit |
Enterovirüsler Poliovirüs Hepatit A veE | Felç Herpangina, pleurodynia İnfeksiyöz hepatit |
Adenovirüsler | Akut konjuktivit, gastroenterit |
(Norwalk) | Gastroenterit |
Protozoalar | |
Cryptosporidium sp. | İnatçı ishal (Özellikle immunosupresif bireylerde) |
Giardia lamblia | Giardiazis |
Entamoeba histolytica | Amipli dizanteri |
Meningoensefalit | |
Naegleria fowleri, N. gruberi | Meningoensefalit |
Funguslar | |
Microsporidia | Kronik ishal |
Su sisteminde bulunan biyofilmler çevresel veya enterik kökenli tüm patojenler için tutunma, beslenme ve hayatta kalma ortamı sağlarlar.Biyofilmler, mikroorganizmaların bir yüzeye tutunarak oluşturdukları ve salgıladıkları ekstrasellüler polimerik bir matriks içinde bulundukları ortak yaşam alanlarıdır. Bu dış etmenlere kapalı ortak yaşam mikroorganizmalara daha fazla besin ve çevresel strese ve özellikle dezenfektanlara karşı koruma sağlamaktadır. Ayrıca biyofilm içerisinde çoğalan patojenlerin hastalık yapma ihtimallerinin daha fazla olduğu yönünde görüşler de mevcuttur.
Mikrobiyolojik Su Analizleri
Sularda patojen mikroorganizma varlığının araştırılması için yapılan analizlerdir. Bilinen tüm patojenler için test yapılması maliyet ve zaman açısından işlevsel değildir. Bu nedenle rutin analizlerde, belirlenmiş bazı indikatör mikroorganizmalar aranır ve elde edilen sonuçlarla suyun kirliliği hakkında bir yargıya ulaşılır.
İndikatör mikroorganizmalar
Suda analizi yapılan indikatör mikroorganizmalar 3 grupta incelenebilir.
Genel proses indikatörleri, dağıtım hattının genel işleyişi ve dezenfeksiyon durumu hakkında fikir veren göstergelerdir. Mesela toplam koloni sayımı ve total koliform analizi klorla dezenfeksiyon işleminin yeterliliği hakkında fikir verirler.
veya diğer adıyla sayımı, organik besin maddeleri içeren bir ortamda, belli bir sıcaklık ve sürede üreyen tüm mikroorganizmaların sayılması anlamına gelmektedir. Yüksek olması tam anlamıyla bir kirlilik göstergesi olmasa da, su dağıtım sisteminin genel temizlik durumu ve bu durumdaki olası değişiklikler, yapılan dezenfeksiyon işleminin sudaki bakteri varlığına etkileri ve yeterliliği hakkında fikir verdiği düşünülmektedir.
Koliform bakteriler, Enterobacteriaceae familyasına üye pek çok cins ve türü kapsayan bir grubun genel adıdır ve en bilinen üyeleri Escherichia, Enterobacter, Klebsiella, Citrobacter, Serratia, Yersinia ve Hafnia’dır. Ortak özellikleri: aerobik veya fakültatif aerobik, Gram-negatif, spor oluşturmayan, çubuk şekilli, oksidaz negatif olmaları ve laktozu fermente edebilmeleridir. Fekal kaynaklı olabilecekleri gibi, çevresel ortamdan kaynaklı da olabilirler. Çoğu patojen değildir. Su sistemlerinde tespit edilmeleri fekal kirlilik göstergesi sayılmaz. Ancak eğer sisteme koliformlar girebiliyor ve hayatta kalabiliyorsa, bu durum patojenlerin bakterilerin de girebileceği bir kontaminasyon kaynağının var olduğunu ve dezenfeksiyonun yetersiz olduğunu gösterir.Fekal kontaminasyon indikatörleri, insan ve sıcakkanlı hayvan dışkısı kökenli bakterilerin sularda bulunması fekal bir kontaminasyonu gösterir ve patojen mikroorganizmaların da büyük ihtimalle bulunabileceğine işaret eder. En yaygın kullanılan fekal indikatör E.coli’dir. Koliform grubuna ait, gram (-) negatif, laktozu fermente eden ve tüm sıcakkanlı hayvan dışkılarında bulunan bir bakteridir. Su analizlerinde indikatör olarak tercih edilmesinin sebepleri:
- Tüm memelilerin dışkılarında çok yüksek miktarlarda bulunur.
- Konak canlılar olmadan, doğada nadiren çoğalabilir.
- Tespit metotları ucuz, basit, hassas ve duyarlıdır.
- İçme suyu dağıtım hatlarında hayatta kalma süresi, rutin bir numune alma programı ile tespit edilebilmesi için yeterlidir.
- E.coli için düzenli olarak analiz yapılması, sistemin düşük maliyetle, etkin bir şekilde işletilerek, halk sağlığının korunması düzeyinin arttırılmasını sağlar.
Diğer yaygın kullanılan fekal indikatörler, Fekal Streptokoklar ve Clostridium perfringens’tir.
Fekal streptokoklar veya diğer adıyla enterokoklar gram (+), kok şeklinde bakterilerdir. En yaygın türleri ve Enterococcus faecalis'tir. Su ortamına ve özellikle tuzlu sulara koliformlara ve E.coli’ye nispeten daha dayanıklıdırlar. Bu açıdan fekal virüslerle paralellik gösterirler. Özellikle yüzme sularında indikatör olarak kullanılırlar.
C.perfringens, gram (+), anaerob, sporlu bir bakteri türüdür. İndikatör olarak tercih edilmesindeki başlıca etken, spor oluşturması sayesinde çevresel şartlara ve biyosidlere dayanıklılığının fazla olması ve sularda diğer bakterilerden çok daha uzun süre hayatta kalabilmesidir. Ancak memeli hayvan bağırsaklarında bulunma oranı E.coli ve Enterokoklara göre daha düşüktür, bu nedenle fekal indikatör olarak etkinliği tartışmalıdır.
-
Escherichia coli
CCA agar besiyeri -
Enterococcus faecalis
Slanetz bartley besiyeri -
Clostridium perfringens
mCP agar besiyeri
İndikatör | Fekal kaynak | Hayatta kalma süresi | Analiz yeterliliği | İçme sularında bulunmasına izin verilen sınır |
Escherichia coli | İnsan dışkısında 109/L | 1 hafta – 1 ay | İyi | 0 kob/100 mL |
Enterokok | İnsan dışkısında 107/L | Haftalarca | İyi | 0 kob/100 mL |
C.perfringens | İnsan dışkısında 106/L | 1 ay – 1 yıl | İyi | 0 kob/100 mL |
Model organizmalar, patojenlere varlıkları veya hareket tarzlarındaki benzerlikleri yönünden gösterge olarak kullanılan mikroorganizma gruplarıdır. Örneğin E.coli, Salmonella türleri için bir belirteç ve model olarak kabul edilmektedir.
Analiz Yöntemleri
Sularda mikroorganizmalarının tespit edilmesi ve yoğunluklarının belirlenmesi için çeşitli analiz yöntemleri mevcuttur. Bu yöntemleri öncelikle mikrobiyolojik kültür ve moleküler yöntemler olarak iki gruba ayırarak incelemek mümkündür. Mikrobiyolojik kültür, mikroorganizmaların laboratuvar ortamında, kontrollü şartlar altında ve belirli besin maddeleri içeren bir ortamda, gelişmelerinin ve üreyerek çoğalmalarının sağlanmasıdır. Moleküler analizde ise DNA, RNA gibi nükleik asit molekülleri hedeflenerek mikroorganizmaların varlığı tespit edilir.
Kültür metotları daha zaman alıcı fakat maliyeti az iken, moleküler yöntemler tersine daha hızlı fakat yüksek maliyetlidir. Ayrıca kültür yöntemleri sadece üreme yeteneğine sahip canlı mikroorganizmaları tespit edebilirken, moleküler yöntemler ölü veya inaktif organizmalara ait genetik molekülleri de tespit edeceğinden, özellikle dezenfeksiyon işlemi sonrası alınan numuneler için tartışmalı sonuçlar elde edilebilir. Bazı durumlarda birlikte kullanımları da söz konusu olabilir.
Mikrobiyolojik Kültür
Kültürü en kolay mikroorganizmalar bakteriler iken, virüs kültürü zor ve zaman alıcıdır. Rutin su analizlerinde mikrobiyolojik kültür yöntemleri indikatör bakteriler için kullanılmaktadır ve başlıca 3 analiz türü mevcuttur:
Dökme / yayma plak yöntemi: Toplam koloni sayımı için kullanılır. Belirli bir hacimdeki numunenin, maya ekstrakt agar gibi genel üretici tarzda agarlı bir besiyerine aşılama veya üzerine yayma ile aerobik inkübasyonu sonucunda oluşan kolonilerin sayılması yöntemidir. Üreyen mikroorganizmalara doğrulama testleri yapılmaz, tüm üreyen koloniler sayılır. Genellikle 1 mL numune ilave edilir ve inkübasyon sıcaklığı 36 °C ve 22 °C olarak seçilebilir. Yeraltı suyu kaynaklarının durumunu ve su arıtım işlemlerinin etkinliğini tayin etmek için yararlı bir yöntemdir ve sonuçlar su dağıtım sistemlerinin durumu ve temizliğinin göstergesi olarak da kullanılabilir.
Çoklu Tüp - En Muhtemel Sayı (EMS) Yöntemi: Sıvı besiyeri içeren tüplere, farklı konsantrasyon serilerinde 3’er tekrar numune ekimi yapılarak, üreme olan tüplerin sayılması yöntemidir. Üreme besiyerindeki bulanıklık değişimi, gaz oluşumu veya renk değişimi gibi kriterlerle belirlenir ve gerekirse doğrulama testleri uygulanır. Üreme tespit edilen konsantrasyonlar EMS istatistik tablosu ile karşılaştırılarak sonuçlar belirlenir. Mikroorganizma sayıları kesin değil, konsantrasyona dayalı tahminidir, bu nedenle şeklinde rapor edilir. Rutin su analizlerinde özellikle Total Koliform ve E.coli analizi için uzun yıllar kullanılmış, ancak günümüzde yerini yöntemine bırakmıştır. Filtre edilemeyecek kadar yoğun partiküllü ve bulanık sularda veya gıda analizlerinde kullanılmaktadır.
Membran Filtrasyon Yöntemi: Analiz edilecek su numunesinin, selülozik bir membran filtreden vakum pompası ile süzülmesine dayalı bir yöntemdir. Membran filtre genellikle 0.45 mikron çapında porlara sahiptir ve süzülen sudaki mikroorganizmalar bu porlardan geçemeyerek membranın üstünde kalırlar. Membran uygun bir agarlı besiyerine yerleştirilerek inkübe edilir ve gelişen koloniler sayılarak sonuç elde edilir. Gerekli ise kolonilere doğrulama testleri de yapılabilir. Üreyen her koloninin suda bulunan bir bakteriden veya bakteri kümesinden meydana geldiği kabul edilir ve bu nedenle sonuçlar koloni oluşturan birim (kob) cinsinden ifade edilir. Hedeflenen mikroorganizmaya uygun, farklı por çapına sahip filtreler kullanılabilir. Oluşan koloniler direkt sayılabildiği için EMS yöntemine göre daha hızlı ve kesin sonuç vermektedir. Ancak porların tıkanmasına ve yeterli suyun filtre edilememesine neden olacağından, çok fazla partikül ve askıda katı madde içeren, aşırı çamurlu ve bulanık sular için uygun bir yöntem değildir.
Moleküler metodlar
Rutin su analizlerinde moleküler metotlar pek kullanılmazlar. Bunun başlıca nedenleri kullanılan cihaz ve ekipmanların yaygın bulunmayışı ve yüksek maliyetli oluşudur. Moleküler metotlar nükleik asitlerin hibridizasyonu (çapraz eşleşme), restriksiyonu (kesme), amplifikasyonu (kopyalayarak çoğaltma) ve sekanslaması (dizilim) gibi teknikleri kullanırlar. En bilinen yöntem Polimeraz zincir reaksiyonudur (PCR). Hedef mikroorganizmaya ait nükleik asit molekülünün DNA polimeraz enzimi ile amplifikasyonu prensibi ile çalışır. Ayrıca Floresan in situ hibridizasyon (FISH), Revers trankriptaz PCR, Laser scanning, DNA çipleri gibi bazıları yeni ortaya çıkmış pek çok farklı metot mevcuttur.
Analiz Standartları
Analizlerin standartize edilmesi amacıyla TSEK, ISO, CEN gibi kuruluşların yaptığı çalışmalar neticesinde analiz standartları oluşturulmuştur. Türkiye'de en fazla kullanılan su mikrobiyolojisi analiz standartları şunlardır:
E.coli ve koliformlar | TS ISO EN 9308-1 membran filtrasyon TS ISO EN 9308-2 EMS |
Fekal Stretokok | TS EN ISO 7899-2 membran filtrasyon |
C.perfringens | 98/83/EC 31 Mayıs 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde . |
Toplam Koloni Sayımı | TS EN ISO 6222 |
P.aeruginosa | TS EN ISO 16266 |
Legionella sp. | TS EN ISO 11731 |
Salmonella sp. | TS EN ISO 19250 |
Clostridia sporları | TS 8020 EN 26461-2 |
Kaynakça
- ^ . www.nature.com. 14 Temmuz 2014 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ . www.frontiersin.org (İngilizce). 5 Ekim 2017 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ a b "İnsani Tüketim Amaçlı Sular Hakkında Yönetmelik". www.mevzuat.gov.tr. T.C.Sağlık Bakanlığı. 1 Aralık 2020 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ a b Cabral, João P. S. (15 Ekim 2010). "Water Microbiology. Bacterial Pathogens and Water". International Journal of Environmental Research and Public Health (İngilizce). 7 (10): 3657-3703. doi:10.3390/ijerph7103657. ISSN 1660-4601. (PMC) 2996186 $2. (PMID) 21139855. 15 Ağustos 2020 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ a b Microbiology of waterborne diseases : microbiological aspects and risks. Second edition. Steven L. Percival, M. V. Yates, David W. Williams, Rachel Chalmers, N. F. Gray. Amsterdam. 2014. ISBN . OCLC 864708751.
- ^ Sharma, S.; Sachdeva, P.; Virdi, J. S. (2003). "Emerging water-borne pathogens". Applied Microbiology and Biotechnology (İngilizce). 61 (5-6): 424-428. doi:10.1007/s00253-003-1302-y. ISSN 0175-7598.
- ^ a b Bitton, Gabriel (2014). Microbiology of drinking water production and distribution. Hoboken, New Jersey. ISBN . OCLC 886382400.
- ^ Wingender, Jost; Flemming, Hans-Curt (2011). "Biofilms in drinking water and their role as reservoir for pathogens". International Journal of Hygiene and Environmental Health (İngilizce). 214 (6): 417-423. doi:10.1016/j.ijheh.2011.05.009. 25 Haziran 2018 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ O'Toole, George; Kaplan, Heidi B.; Kolter, Roberto (2000). "Biofilm Formation as Microbial Development". Annual Review of Microbiology (İngilizce). 54 (1): 49-79. doi:10.1146/annurev.micro.54.1.49. ISSN 0066-4227. 27 Ocak 2021 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ Hall-Stoodley, Luanne; Stoodley, Paul (2005). "Biofilm formation and dispersal and the transmission of human pathogens". Trends in Microbiology (İngilizce). 13 (1): 7-10. doi:10.1016/j.tim.2004.11.004. 12 Şubat 2021 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ RAE Barrell, PR Hunter, G Nichols (2000). "Microbiological standards for water and their relationship to health risk" (PDF). Communicable Disease and Public Health. 3 (1). ss. 8-10. 21 Ekim 2020 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ a b c d e Nicholas J. Ashbolt, Willie O.K. Grabow, Mario Snozzi (2001). "Indicators of microbial water quality". Lorna Fewtrell, Jamie Bartram (Ed.). Water quality : guidelines, standards, and health : assessment of risk and risk management for water-related infectious disease (PDF) (İngilizce). Cenevre: World Health Organisation. ss. 289-316. ISBN . OCLC 872681378. 6 Kasım 2020 tarihinde kaynağından (PDF). Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ a b Allen, Martin J; Edberg, Stephen C; Reasoner, Donald J (2004). "Heterotrophic plate count bacteria—what is their significance in drinking water?". International Journal of Food Microbiology (İngilizce). 92 (3): 265-274. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2003.08.017. 16 Ağustos 2020 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ Nigel J.Horan (2003). "7 - Faecal indicator organisms". D. Duncan Mara, N. J. Horan (Ed.). The handbook of water and wastewater microbiology (İngilizce). San Diego, Calif.: Academic. ss. 105-112. ISBN . OCLC 162677010.
- ^ Rompré, Annie; Servais, Pierre; Baudart, Julia; de-Roubin, Marie-Renée; Laurent, Patrick (1 Mart 2002). "Detection and enumeration of coliforms in drinking water: current methods and emerging approaches". Journal of Microbiological Methods (İngilizce). 49 (1): 31-54. doi:10.1016/S0167-7012(01)00351-7. ISSN 0167-7012. 25 Mayıs 2012 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ Malcolm J.Brandt, K.Michael Johnson, Andrew J.Elphinston, Don D.Ratnayaka (2016). "Chemistry, Microbiology and Biology of Water". Malcolm J. Brandt, K. Michael Johnson, Andrew J. Elphinston, Don D. Ratnayaka (Ed.). Twort's water supply. 7th ed (İngilizce). Oxford, United Kingdom: Butterworth-Heinemann. ss. 235-321. ISBN . OCLC 958385103.
- ^ a b Edberg, S.C.; Rice, E.W.; Karlin, R.J.; Allen, M.J. (2000). "Escherichia coli: the best biological drinking water indicator for public health protection". Journal of Applied Microbiology (İngilizce). 88 (S1): 106S-116S. doi:10.1111/j.1365-2672.2000.tb05338.x.
- ^ a b Cohen, Judith; Shuval, Hillel I. (1 Mart 1973). "Coliforms, fecal coliforms, and fecal streptococci as indicators of water pollution". Water, Air, and Soil Pollution (İngilizce). 2 (1): 85-95. doi:10.1007/BF00572392. ISSN 1573-2932.
- ^ Mohammad Manafi, Jvo Siegrist (2011). (PDF). Microbiology focus. Sigma-Aldrich. 10 Eylül 2016 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi.
- ^ Bisson, J. W.; Cabelli, V. J. (1980). "Clostridium perfringens as a Water Pollution Indicator". Journal (Water Pollution Control Federation). 52 (2): 241-248. ISSN 0043-1303. 14 Nisan 2021 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ Vierheilig, J.; Frick, C.; Mayer, R. E.; Kirschner, A. K. T.; Reischer, G. H.; Derx, J.; Mach, R. L.; Sommer, R.; Farnleitner, A. H. (15 Ağustos 2013). "Clostridium perfringens Is Not Suitable for the Indication of Fecal Pollution from Ruminant Wildlife but Is Associated with Excreta from Nonherbivorous Animals and Human Sewage". Applied and Environmental Microbiology (İngilizce). 79 (16): 5089-5092. doi:10.1128/AEM.01396-13. ISSN 0099-2240. (PMC) 3754692 $2. (PMID) 23747707.
- ^ a b c Assessing microbial safety of drinking water : improving approaches and methods. Organisation for Economic Co-operation and Development, World Health Organization. Paris: OECD. 2003. ISBN . OCLC 52060966.
- ^ "ISO 6222:1999 Water quality — Enumeration of culturable micro-organisms — Colony count by inoculation in a nutrient agar culture medium". ISO (İngilizce). Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ "ISO 9308-2:2012 Water quality — Enumeration of Escherichia coli and coliform bacteria — Part 2: Most probable number method". ISO (İngilizce). Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ a b c Water quality monitoring : a practical guide to the design and implementation of freshwater quality studies and monitoring programmes. 1st ed. Jamie Bartram, Richard Ballance, United Nations Environment Programme, World Health Organization. Londra: E & FN Spon. 1996. ISBN . OCLC 560420134.
- ^ a b "ISO 9308-1:2014 Water quality — Enumeration of Escherichia coli and coliform bacteria — Part 1: Membrane filtration method for waters with low bacterial background flora". ISO (İngilizce). Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
- ^ "ISO 7704:1985 Water quality — Evaluation of membrane filters used for microbiological analyses". ISO (İngilizce). Erişim tarihi: 8 Nisan 2021.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Su Mikrobiyolojisi suda yasayan mikroorganizmalari tum biyolojik yonleriyle inceleyen bilim dalidir Fakat su mikrobiyolojisi terimi daha cok insani tuketim amaciyla kullanilan veya insan sagligi icin onem arz eden sularda bulunan mikroorganizmalarin ozellikleri tespit edilmesi ve dezenfeksiyonu calismalari icin kullanilmaktadir Dogada tatli sular nehir agizlari okyanuslar gibi sucul ortamlardaki mikroorganizmalari ayrintili inceleyen bilim dali ise aquatik mikrobiyolojidir Yasamin baslangic noktasi olan sucul ortamlar virusler arkeler bakteriler protozoalar funguslar ve algler basta olmak uzere pek cok mikroorganizma barindirirlar Membran filtre ile suzulmus suda bulunan koliform bakteri kolonileri Pembe Citrobacter freundii mavi Escherichia coli Icme pisirme gida hazirlama ya da diger evsel amaclar icin kullanilan butun sular insani tuketim amacli su olarak tanimlanmaktadir Insani tuketim amacli sular su mikrobiyolojisinin ana konusunu olusturur ve olasi kirliligin tespit edilebilmesi icin duzenli olarak analizleri yapilarak takip altinda tutulurlar Bunlardan baska yuzme sulari havuz sulari kaplica sulari gibi insan sagligi icin oneme sahip sularda su mikrobiyolojisinin kapsamina girmektedir Sulardan bulasabilen patojenlerAtiksularin temiz su kaynaklarini ve kiyi sularini kirletmesi insani tuketim amacli sulara mikroorganizmalarin ve dolayisiyla patojenlerin bulasmasinin en yaygin sebebidir ve genel olarak sulardan kaynakli en buyuk mikrobiyal risk hayvan veya insan diskisi ile kontamine olmus suyun tuketilmesi olarak kabul edilir Sularda bulunan patojenler cevresel patojenler ve enterik patojenler olarak 2 grupta incelenebilirler Legionella spp Pseudomonas aeruginosa Nagleria fowleri gibi cevresel patojenler surekli bu ortamlarda yasayan konak organizmaya ihtiyac duymadan dusuk besin ortaminda cogalabilen mikroorganizmalardir Enterik patojenler ise genellikle enfekte konaklarin bagirsak sistemlerinde cogalir ve suya fekal kontaminasyon yoluyla girerler ornegin Campylobacter Salmonella Cryptosporidium Giardia ve En yaygin su kaynakli patojenler ve sebep olduklari hastaliklar BakterilerVibrio cholerae serotip O1 O139 KoleraE coli Enterotoksik Enterohemorajik ve Enteroinvaziv tipler Gastroenterit akut kanli ishalShigella dysenteriae S flexneri S boydii S sonnei Basilli dizanteriSalmonella enterica subsp enterica Tifo paratifo ve tifoid atesVibrio parahaemolyticus GastroenteritCampylobacter jejuni CampylobacteriosisAkut ishal terminal ileitisHelicobacter pylori GastritGastroenterit ve septisemikompleksi Mac Deri lenf solunum ve sindirim sistemi enfeksiyonlariLegionella pneumophila Lejyoner hastaligi siddetli zaturre Pseudomonas aeruginosa Kulak enfeksiyonlariViruslerRotavirus GastroenteritEnterovirusler Poliovirus Hepatit A veE Felc Herpangina pleurodynia Infeksiyoz hepatit MenenjitAdenovirusler Akut konjuktivit gastroenterit Norwalk GastroenteritProtozoalarCryptosporidium sp Inatci ishal Ozellikle immunosupresif bireylerde Giardia lamblia GiardiazisEntamoeba histolytica Amipli dizanteriMeningoensefalitNaegleria fowleri N gruberi MeningoensefalitFunguslarMicrosporidia Kronik ishal Su sisteminde bulunan biyofilmler cevresel veya enterik kokenli tum patojenler icin tutunma beslenme ve hayatta kalma ortami saglarlar Biyofilmler mikroorganizmalarin bir yuzeye tutunarak olusturduklari ve salgiladiklari ekstraselluler polimerik bir matriks icinde bulunduklari ortak yasam alanlaridir Bu dis etmenlere kapali ortak yasam mikroorganizmalara daha fazla besin ve cevresel strese ve ozellikle dezenfektanlara karsi koruma saglamaktadir Ayrica biyofilm icerisinde cogalan patojenlerin hastalik yapma ihtimallerinin daha fazla oldugu yonunde gorusler de mevcuttur Mikrobiyolojik Su AnalizleriSularda patojen mikroorganizma varliginin arastirilmasi icin yapilan analizlerdir Bilinen tum patojenler icin test yapilmasi maliyet ve zaman acisindan islevsel degildir Bu nedenle rutin analizlerde belirlenmis bazi indikator mikroorganizmalar aranir ve elde edilen sonuclarla suyun kirliligi hakkinda bir yargiya ulasilir Indikator mikroorganizmalar Suda analizi yapilan indikator mikroorganizmalar 3 grupta incelenebilir Genel proses indikatorleri dagitim hattinin genel isleyisi ve dezenfeksiyon durumu hakkinda fikir veren gostergelerdir Mesela toplam koloni sayimi ve total koliform analizi klorla dezenfeksiyon isleminin yeterliligi hakkinda fikir verirler veya diger adiyla sayimi organik besin maddeleri iceren bir ortamda belli bir sicaklik ve surede ureyen tum mikroorganizmalarin sayilmasi anlamina gelmektedir Yuksek olmasi tam anlamiyla bir kirlilik gostergesi olmasa da su dagitim sisteminin genel temizlik durumu ve bu durumdaki olasi degisiklikler yapilan dezenfeksiyon isleminin sudaki bakteri varligina etkileri ve yeterliligi hakkinda fikir verdigi dusunulmektedir Koliform bakteriler Enterobacteriaceae familyasina uye pek cok cins ve turu kapsayan bir grubun genel adidir ve en bilinen uyeleri Escherichia Enterobacter Klebsiella Citrobacter Serratia Yersinia ve Hafnia dir Ortak ozellikleri aerobik veya fakultatif aerobik Gram negatif spor olusturmayan cubuk sekilli oksidaz negatif olmalari ve laktozu fermente edebilmeleridir Fekal kaynakli olabilecekleri gibi cevresel ortamdan kaynakli da olabilirler Cogu patojen degildir Su sistemlerinde tespit edilmeleri fekal kirlilik gostergesi sayilmaz Ancak eger sisteme koliformlar girebiliyor ve hayatta kalabiliyorsa bu durum patojenlerin bakterilerin de girebilecegi bir kontaminasyon kaynaginin var oldugunu ve dezenfeksiyonun yetersiz oldugunu gosterir Fekal kontaminasyon indikatorleri insan ve sicakkanli hayvan diskisi kokenli bakterilerin sularda bulunmasi fekal bir kontaminasyonu gosterir ve patojen mikroorganizmalarin da buyuk ihtimalle bulunabilecegine isaret eder En yaygin kullanilan fekal indikator E coli dir Koliform grubuna ait gram negatif laktozu fermente eden ve tum sicakkanli hayvan diskilarinda bulunan bir bakteridir Su analizlerinde indikator olarak tercih edilmesinin sebepleri Tum memelilerin diskilarinda cok yuksek miktarlarda bulunur Konak canlilar olmadan dogada nadiren cogalabilir Tespit metotlari ucuz basit hassas ve duyarlidir Icme suyu dagitim hatlarinda hayatta kalma suresi rutin bir numune alma programi ile tespit edilebilmesi icin yeterlidir E coli icin duzenli olarak analiz yapilmasi sistemin dusuk maliyetle etkin bir sekilde isletilerek halk sagliginin korunmasi duzeyinin arttirilmasini saglar Diger yaygin kullanilan fekal indikatorler Fekal Streptokoklar ve Clostridium perfringens tir Fekal streptokoklar veya diger adiyla enterokoklar gram kok seklinde bakterilerdir En yaygin turleri ve Enterococcus faecalis tir Su ortamina ve ozellikle tuzlu sulara koliformlara ve E coli ye nispeten daha dayaniklidirlar Bu acidan fekal viruslerle paralellik gosterirler Ozellikle yuzme sularinda indikator olarak kullanilirlar C perfringens gram anaerob sporlu bir bakteri turudur Indikator olarak tercih edilmesindeki baslica etken spor olusturmasi sayesinde cevresel sartlara ve biyosidlere dayanikliliginin fazla olmasi ve sularda diger bakterilerden cok daha uzun sure hayatta kalabilmesidir Ancak memeli hayvan bagirsaklarinda bulunma orani E coli ve Enterokoklara gore daha dusuktur bu nedenle fekal indikator olarak etkinligi tartismalidir Mikrobiyolojik su analizinde ureyen Fekal Indikator bakteri kolonileriEscherichia coli CCA agar besiyeri Enterococcus faecalis Slanetz bartley besiyeri Clostridium perfringens mCP agar besiyeri Fekal indikatorlerin karakteristik ozellikleri Indikator Fekal kaynak Hayatta kalma suresi Analiz yeterliligi Icme sularinda bulunmasina izin verilen sinirEscherichia coli Insan diskisinda 109 L 1 hafta 1 ay Iyi 0 kob 100 mLEnterokok Insan diskisinda 107 L Haftalarca Iyi 0 kob 100 mLC perfringens Insan diskisinda 106 L 1 ay 1 yil Iyi 0 kob 100 mL Model organizmalar patojenlere varliklari veya hareket tarzlarindaki benzerlikleri yonunden gosterge olarak kullanilan mikroorganizma gruplaridir Ornegin E coli Salmonella turleri icin bir belirtec ve model olarak kabul edilmektedir Analiz Yontemleri Sularda mikroorganizmalarinin tespit edilmesi ve yogunluklarinin belirlenmesi icin cesitli analiz yontemleri mevcuttur Bu yontemleri oncelikle mikrobiyolojik kultur ve molekuler yontemler olarak iki gruba ayirarak incelemek mumkundur Mikrobiyolojik kultur mikroorganizmalarin laboratuvar ortaminda kontrollu sartlar altinda ve belirli besin maddeleri iceren bir ortamda gelismelerinin ve ureyerek cogalmalarinin saglanmasidir Molekuler analizde ise DNA RNA gibi nukleik asit molekulleri hedeflenerek mikroorganizmalarin varligi tespit edilir Kultur metotlari daha zaman alici fakat maliyeti az iken molekuler yontemler tersine daha hizli fakat yuksek maliyetlidir Ayrica kultur yontemleri sadece ureme yetenegine sahip canli mikroorganizmalari tespit edebilirken molekuler yontemler olu veya inaktif organizmalara ait genetik molekulleri de tespit edeceginden ozellikle dezenfeksiyon islemi sonrasi alinan numuneler icin tartismali sonuclar elde edilebilir Bazi durumlarda birlikte kullanimlari da soz konusu olabilir Mikrobiyolojik Kultur Kulturu en kolay mikroorganizmalar bakteriler iken virus kulturu zor ve zaman alicidir Rutin su analizlerinde mikrobiyolojik kultur yontemleri indikator bakteriler icin kullanilmaktadir ve baslica 3 analiz turu mevcuttur Dokme yayma plak yontemi Toplam koloni sayimi icin kullanilir Belirli bir hacimdeki numunenin maya ekstrakt agar gibi genel uretici tarzda agarli bir besiyerine asilama veya uzerine yayma ile aerobik inkubasyonu sonucunda olusan kolonilerin sayilmasi yontemidir Ureyen mikroorganizmalara dogrulama testleri yapilmaz tum ureyen koloniler sayilir Genellikle 1 mL numune ilave edilir ve inkubasyon sicakligi 36 C ve 22 C olarak secilebilir Yeralti suyu kaynaklarinin durumunu ve su aritim islemlerinin etkinligini tayin etmek icin yararli bir yontemdir ve sonuclar su dagitim sistemlerinin durumu ve temizliginin gostergesi olarak da kullanilabilir Coklu Tup En Muhtemel Sayi EMS Yontemi Sivi besiyeri iceren tuplere farkli konsantrasyon serilerinde 3 er tekrar numune ekimi yapilarak ureme olan tuplerin sayilmasi yontemidir Ureme besiyerindeki bulaniklik degisimi gaz olusumu veya renk degisimi gibi kriterlerle belirlenir ve gerekirse dogrulama testleri uygulanir Ureme tespit edilen konsantrasyonlar EMS istatistik tablosu ile karsilastirilarak sonuclar belirlenir Mikroorganizma sayilari kesin degil konsantrasyona dayali tahminidir bu nedenle seklinde rapor edilir Rutin su analizlerinde ozellikle Total Koliform ve E coli analizi icin uzun yillar kullanilmis ancak gunumuzde yerini yontemine birakmistir Filtre edilemeyecek kadar yogun partikullu ve bulanik sularda veya gida analizlerinde kullanilmaktadir Membran filtrasyon duzenegi Membran Filtrasyon Yontemi Analiz edilecek su numunesinin selulozik bir membran filtreden vakum pompasi ile suzulmesine dayali bir yontemdir Membran filtre genellikle 0 45 mikron capinda porlara sahiptir ve suzulen sudaki mikroorganizmalar bu porlardan gecemeyerek membranin ustunde kalirlar Membran uygun bir agarli besiyerine yerlestirilerek inkube edilir ve gelisen koloniler sayilarak sonuc elde edilir Gerekli ise kolonilere dogrulama testleri de yapilabilir Ureyen her koloninin suda bulunan bir bakteriden veya bakteri kumesinden meydana geldigi kabul edilir ve bu nedenle sonuclar koloni olusturan birim kob cinsinden ifade edilir Hedeflenen mikroorganizmaya uygun farkli por capina sahip filtreler kullanilabilir Olusan koloniler direkt sayilabildigi icin EMS yontemine gore daha hizli ve kesin sonuc vermektedir Ancak porlarin tikanmasina ve yeterli suyun filtre edilememesine neden olacagindan cok fazla partikul ve askida kati madde iceren asiri camurlu ve bulanik sular icin uygun bir yontem degildir Molekuler metodlar Rutin su analizlerinde molekuler metotlar pek kullanilmazlar Bunun baslica nedenleri kullanilan cihaz ve ekipmanlarin yaygin bulunmayisi ve yuksek maliyetli olusudur Molekuler metotlar nukleik asitlerin hibridizasyonu capraz eslesme restriksiyonu kesme amplifikasyonu kopyalayarak cogaltma ve sekanslamasi dizilim gibi teknikleri kullanirlar En bilinen yontem Polimeraz zincir reaksiyonudur PCR Hedef mikroorganizmaya ait nukleik asit molekulunun DNA polimeraz enzimi ile amplifikasyonu prensibi ile calisir Ayrica Floresan in situ hibridizasyon FISH Revers trankriptaz PCR Laser scanning DNA cipleri gibi bazilari yeni ortaya cikmis pek cok farkli metot mevcuttur Analiz Standartlari Analizlerin standartize edilmesi amaciyla TSEK ISO CEN gibi kuruluslarin yaptigi calismalar neticesinde analiz standartlari olusturulmustur Turkiye de en fazla kullanilan su mikrobiyolojisi analiz standartlari sunlardir E coli ve koliformlar TS ISO EN 9308 1 membran filtrasyon TS ISO EN 9308 2 EMSFekal Stretokok TS EN ISO 7899 2 membran filtrasyonC perfringens 98 83 EC 31 Mayis 2019 tarihinde Wayback Machine sitesinde Toplam Koloni Sayimi TS EN ISO 6222P aeruginosa TS EN ISO 16266Legionella sp TS EN ISO 11731Salmonella sp TS EN ISO 19250Clostridia sporlari TS 8020 EN 26461 2Kaynakca www nature com 14 Temmuz 2014 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 8 Nisan 2021 www frontiersin org Ingilizce 5 Ekim 2017 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 8 Nisan 2021 a b Insani Tuketim Amacli Sular Hakkinda Yonetmelik www mevzuat gov tr T C Saglik Bakanligi 1 Aralik 2020 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 a b Cabral Joao P S 15 Ekim 2010 Water Microbiology Bacterial Pathogens and Water International Journal of Environmental Research and Public Health Ingilizce 7 10 3657 3703 doi 10 3390 ijerph7103657 ISSN 1660 4601 PMC 2996186 2 PMID 21139855 15 Agustos 2020 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 KB1 bakim PMC bicimi link a b Microbiology of waterborne diseases microbiological aspects and risks Second edition Steven L Percival M V Yates David W Williams Rachel Chalmers N F Gray Amsterdam 2014 ISBN 978 0 12 415976 1 OCLC 864708751 Sharma S Sachdeva P Virdi J S 2003 Emerging water borne pathogens Applied Microbiology and Biotechnology Ingilizce 61 5 6 424 428 doi 10 1007 s00253 003 1302 y ISSN 0175 7598 a b Bitton Gabriel 2014 Microbiology of drinking water production and distribution Hoboken New Jersey ISBN 978 1 118 74391 1 OCLC 886382400 Wingender Jost Flemming Hans Curt 2011 Biofilms in drinking water and their role as reservoir for pathogens International Journal of Hygiene and Environmental Health Ingilizce 214 6 417 423 doi 10 1016 j ijheh 2011 05 009 25 Haziran 2018 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 O Toole George Kaplan Heidi B Kolter Roberto 2000 Biofilm Formation as Microbial Development Annual Review of Microbiology Ingilizce 54 1 49 79 doi 10 1146 annurev micro 54 1 49 ISSN 0066 4227 27 Ocak 2021 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 Hall Stoodley Luanne Stoodley Paul 2005 Biofilm formation and dispersal and the transmission of human pathogens Trends in Microbiology Ingilizce 13 1 7 10 doi 10 1016 j tim 2004 11 004 12 Subat 2021 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 RAE Barrell PR Hunter G Nichols 2000 Microbiological standards for water and their relationship to health risk PDF Communicable Disease and Public Health 3 1 ss 8 10 21 Ekim 2020 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 8 Nisan 2021 a b c d e Nicholas J Ashbolt Willie O K Grabow Mario Snozzi 2001 Indicators of microbial water quality Lorna Fewtrell Jamie Bartram Ed Water quality guidelines standards and health assessment of risk and risk management for water related infectious disease PDF Ingilizce Cenevre World Health Organisation ss 289 316 ISBN 978 1 78040 588 9 OCLC 872681378 6 Kasim 2020 tarihinde kaynagindan PDF Erisim tarihi 8 Nisan 2021 KB1 bakim Editorler parametresini kullanan link a b Allen Martin J Edberg Stephen C Reasoner Donald J 2004 Heterotrophic plate count bacteria what is their significance in drinking water International Journal of Food Microbiology Ingilizce 92 3 265 274 doi 10 1016 j ijfoodmicro 2003 08 017 16 Agustos 2020 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 Nigel J Horan 2003 7 Faecal indicator organisms D Duncan Mara N J Horan Ed The handbook of water and wastewater microbiology Ingilizce San Diego Calif Academic ss 105 112 ISBN 978 0 12 470100 7 OCLC 162677010 KB1 bakim Editorler parametresini kullanan link Rompre Annie Servais Pierre Baudart Julia de Roubin Marie Renee Laurent Patrick 1 Mart 2002 Detection and enumeration of coliforms in drinking water current methods and emerging approaches Journal of Microbiological Methods Ingilizce 49 1 31 54 doi 10 1016 S0167 7012 01 00351 7 ISSN 0167 7012 25 Mayis 2012 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 Malcolm J Brandt K Michael Johnson Andrew J Elphinston Don D Ratnayaka 2016 Chemistry Microbiology and Biology of Water Malcolm J Brandt K Michael Johnson Andrew J Elphinston Don D Ratnayaka Ed Twort s water supply 7th ed Ingilizce Oxford United Kingdom Butterworth Heinemann ss 235 321 ISBN 978 0 08 100043 4 OCLC 958385103 KB1 bakim Editorler parametresini kullanan link a b Edberg S C Rice E W Karlin R J Allen M J 2000 Escherichia coli the best biological drinking water indicator for public health protection Journal of Applied Microbiology Ingilizce 88 S1 106S 116S doi 10 1111 j 1365 2672 2000 tb05338 x a b Cohen Judith Shuval Hillel I 1 Mart 1973 Coliforms fecal coliforms and fecal streptococci as indicators of water pollution Water Air and Soil Pollution Ingilizce 2 1 85 95 doi 10 1007 BF00572392 ISSN 1573 2932 Mohammad Manafi Jvo Siegrist 2011 PDF Microbiology focus Sigma Aldrich 10 Eylul 2016 tarihinde kaynagindan PDF arsivlendi Bisson J W Cabelli V J 1980 Clostridium perfringens as a Water Pollution Indicator Journal Water Pollution Control Federation 52 2 241 248 ISSN 0043 1303 14 Nisan 2021 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 8 Nisan 2021 Vierheilig J Frick C Mayer R E Kirschner A K T Reischer G H Derx J Mach R L Sommer R Farnleitner A H 15 Agustos 2013 Clostridium perfringens Is Not Suitable for the Indication of Fecal Pollution from Ruminant Wildlife but Is Associated with Excreta from Nonherbivorous Animals and Human Sewage Applied and Environmental Microbiology Ingilizce 79 16 5089 5092 doi 10 1128 AEM 01396 13 ISSN 0099 2240 PMC 3754692 2 PMID 23747707 KB1 bakim PMC bicimi link a b c Assessing microbial safety of drinking water improving approaches and methods Organisation for Economic Co operation and Development World Health Organization Paris OECD 2003 ISBN 92 64 09946 8 OCLC 52060966 ISO 6222 1999 Water quality Enumeration of culturable micro organisms Colony count by inoculation in a nutrient agar culture medium ISO Ingilizce Erisim tarihi 8 Nisan 2021 ISO 9308 2 2012 Water quality Enumeration of Escherichia coli and coliform bacteria Part 2 Most probable number method ISO Ingilizce Erisim tarihi 8 Nisan 2021 a b c Water quality monitoring a practical guide to the design and implementation of freshwater quality studies and monitoring programmes 1st ed Jamie Bartram Richard Ballance United Nations Environment Programme World Health Organization Londra E amp FN Spon 1996 ISBN 978 0 203 47679 6 OCLC 560420134 a b ISO 9308 1 2014 Water quality Enumeration of Escherichia coli and coliform bacteria Part 1 Membrane filtration method for waters with low bacterial background flora ISO Ingilizce Erisim tarihi 8 Nisan 2021 ISO 7704 1985 Water quality Evaluation of membrane filters used for microbiological analyses ISO Ingilizce Erisim tarihi 8 Nisan 2021