Escherichia coli (E.coli), Enterobacteriaceae familyasının bir üyesi olup memeli canlıların kalın bağırsağında yaşadığı için bu adı alan bir bakteri türüdür. E.coli çubuk şeklindedir ve gram negatif bakteri olduğundan endospor oluşturmaz. E. coli yaklaşık 2,0 μm uzunluğunda ve 0,5 μm çapındadır. E.coli ilk olarak 1885 yılında Theodor Escherich tarafından bebek dışkısından izole edilmiş ve özellikleri belirlenmiştir. "E. coli, doğumdan birkaç saat sonra bebeklerin mide ve bağırsak sisteminde kolonize olur ve burada yaşar." E.coli suşları insan vücudunda herhangi bir olumsuz etki olmaksızın bir arada bulunur. Bununla birlikte, E. coli gastrointestinal bariyerleri aşınmış ve/ya da bağışıklığı baskılanmış konakçılarda hastalığa neden olabilir. Özellikle bir kısım E. coli, dünya genelinde insanlarda ve hayvanlarda bağırsakta ve bağırsak dışında çeşitli hastalıklara aracılık eder. İnsanlardan izole edilen E. coli suşları ishale ve bir takım bağırsak dışı hastalıklara neden olmaktadır.
Escherichia coli | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bir Escherichia coli bakterisinin elektron mikroskobunda görüntüsü | |||||||||||||||
Biyolojik sınıflandırma | |||||||||||||||
| |||||||||||||||
İkili adlandırma | |||||||||||||||
Escherichia coli (Migula 1895) Castellani and Chalmers 1919 | |||||||||||||||
Sinonimler | |||||||||||||||
|
Bakterinin Hastalıkta rolü
Escherichia coli, insanların ve hayvanların gastrointestinal yollarında birçok yaygın bakteriyel enfeksiyonun en sık nedenlerinden biridir. E.coli, konakçılarla karşılıklı yarar sağlayan bir birliktelik içinde yaşar ve nadiren hastalığa neden olur. Bununla birlikte, birçok hastalığa sebep olduğu için en yaygın insan ve hayvan patojenlerinden biridir. E. coli, enterit, idrar yolu enfeksiyonu, septisemi ve neonatal menenjit gibi diğer klinik enfeksiyonların önde gelen nedenidir. E. coli enfeksiyonlarının terapötik tedavisi, antimikrobiyal direncin ortaya çıkması nedeniyle tehdit altındadır. Çoklu ilaca dirençli E. coli suşlarının yayılması nedeniyle dünya çapında hastalıklar artmaktadır.
E. coli içinde hastalık yapan pek çok tipi vardır. Bunlar hasta ettikleri dokular ve hastalık mekanizmalarına bağlı olarak aşağıdaki "patotip" olarak gruplandırılırlar:
İshalli hastalıklar
İshalli hastalıklara neden olan E. coli tipleri aşağıdaki gruplara ayrılırlar:
- Enterotoksijen E. coli (ETEC) tipleri, enterotoksin üreterek hastalık yapar. Çeşitli toksinler vardır, bazıları bağırsak mukozasına zarar veren sitotoksik enterotoksinlerdir, bazıları bağırsak hücrelerinin su ve elektrolit salgılamalarına neden olan sitotonik enterotoksinlerdir. ETEC’den kaynaklanan diyare hastalığı, çok az veya hiç ateşin olmadığı, sulu ve kansız ishalin hızlı başlangıcı olarak karakterize edilir. Bunun yanı sıra karın ağrısı, halsizlik, bulantı ve kusma gibi semptomlarda eşlik eder. 24 ila 72 saat sonra bu semptomlar ortadan kalkar.
- Enteroinvazif E. coli (EIEC) tipleri, doku hücrelerinin içine girip çoğalırlar. Bunun yol açtığı enflamasyon tepkisi doku hasarını artırır. Ateşle birlikte şiddetli mukozal ve kanlı ishal, karın krampları, gıda kaynaklı patojenler EIEC türlerinden kaynaklanan basilli dizanterinin klinik özellikleridir.
- Enteropatojenik E. coli (EPEC) tipleri dokuya sıkıca bağlandıktan sonra bir enflamasyon reaksiyonu oluştururlar. Toksin salgılayarak değil, hücre içi sinyalizasyona etki ettikleri için ishale yol açtıkları düşünülmektedir. EPEC suşları, kötü hijyen koşullarında başta çocuklarda olmak üzere ishale neden olur.
- Enterohemorajik E. coli (EHEC) Bu grupta olanlar Enteropatojenik özellikler taşımaya ilaveten Şiga toksinleri salgılar. Bu gruba ait olanların en ünlüsü E. coli O157:H7'nin yol açtığı hastalık hemorajik kolit olarak adlandırılır. İnsanların E. coli O157:H7'yi kontamine yiyecek, su, enfekte hayvanlar ve insanlarla doğrudan temas ile aldığı bilinmektedir. EHEC ateşsiz kanlı ishal ve karın ağrısıyla birlikte lökosit sayısının 10.000/microL'nin üzerinde olduğunda kendini gösterir. EHEC’nin kuluçka süresi 3 ila 4 gündür.
- EnteroAggregatif E. coli (EAEC), karakteristik bir "yığılmış tuğla" modelinde epitel hücrelerine yapışmış bakteriler şeklinde görünür, ancak bunun dışında oldukça heterojendir. Bu gruba has bakterilerin salgıladığı toksinler mukozaya zarar verip kronik ishale yol açarlar.
- Diffusely Adherent E. coli (DAEC), Özelleşmiş fimbiralar sayesinde seyrek bir şekilde epitele bağlanırlar ve hücre içi sinyal mekanizmasını etkinleştirirler. DAEC'nin konakçı hücre ile etkileşime girmesine, toksinleri salmasına ve konakçı hücrelerde sinyal olaylarını harekete geçirir. DAEC, konakçı hücrelere bağlanır ve yapışır. E. coli'nin heterojen bir patotipi olarak tanımlanır. DAEC, 1.5 ila 5 yaş arasındaki çocuklarda ishal, yetişkinlerde idrar yolu enfeksiyonu (İYE), gebelik komplikasyonları ile ilişkilidir. DAEC çocuklarda sulu ishale neden olur. "Yetişkinler, Crohn's, çölyak ve inflamatuar bağırsak hastalıkları ve bazı kronik inflamatuar bağırsak hastalıklarında bulunan DAEC suşlarının asemptomatik taşıyıcılarıdır."
İdrar yolu enfeksiyonu
- Uropatojenik E. coli (UPEC) İdrar yolu enfeksiyonlarının %90'ının nedenidir. Bu E. coli tipleri idrar yolu epitel hücrelerine özellikle bağlanabilen fimbriumlara sahiptir. Kadınların üretrasının erkeklerinkinden daha kısa olması nedeniyle bu enfeksiyon kadınlarda daha sıkça görülür. Dışkıdan gelen bakteri genelde cinsel ilişki sonucu idrar yoluna girer, bakteriler üretrayı tırmanıp mesaneye ulaşırlar. Mesane enfeksiyonuna sistit denir, tedavi edilmediğinde böbrek yangısına (piyelonefrit) dönüşebilir.
Virülans faktörleri
Shigella ve Salmonella familyasının üyeleri aslında E. coli'nin alt tipleridir. "Shiga toksinleri, Shigella dysenteriae bakterisi ve belirli E.coli suşları tarafından üretilen virülans faktörleridir." Çok çeşitli serotiplere ait Shiga toksin üreten E. coli (STEC) suşlarının insanlarda ciddi hastalıklara neden olabileceği kabul edilmiştir. O157:H7 bir STEC serotipidir. O157:H7 suşunun taşıdığı Shiga toksini geni, E.coli’ye Shigella’dan geçmiştir. Büyük salgınlarla ilişkilendirilen bir tip olmuştur.
- Pilus uzun, az sayıda ve yüzeylere tutunmaya yardımcı olan protein uzantılarını ifade eder. Fimbria terimi genellikle hücre yüzeyinden yüzlerce çıkıntı yapan kısa kıl benzeri proteinleri ifade eder. Pilus, gram-negatif bakterilerde bulunan önce sitoplazmik zarı sonra da çıkıntıları aracılığıyla dış zarı geçmesine izin verir. Pilus yapışma işlevi görür ve çeşitli yüzeylerle, diğer bakterilerle ve konakçı hücrelerle etkileşimlere aracılık eder. Fimbrialar, bir hücrenin yüzeylere ve diğer hücrelere tutunmasını sağlar. Bakteri hücreleri arasındaki DNA transferinde önemlidir. Fimbria ve pilus yapısal olarak benzerdir bu sebeple birbirinin yerine kullanılır. Zararsız E. coli 'ler de piluslara sahip olmakla beraber ETEC tiplerinde bulunan özelleşmiş piluslar onların ince bağırsak epitel hücrelerine bağlanmalarını sağlar. Bu sayede bakteri dışkıyla atılmayıp ince bağırsakta yerleşir ve orada çoğalabilir. Başka tip piluslar idrar yolu hücrelerine veya mesane hücrelerine bağlanmayı sağlarlar, bu yüzden idrar yolu enfeksiyonlarına yol açarlar.
- ETEC tiplerinin en belirgin ve etkili virülans faktörü, enterotoksinlerin salgılanmasıdır. İki tip enterotoksin vardır. Bunlardan ilki, ST eksotoksini, ikincisi ise LT eksotoksinidir. ST eksotoksini epitel hücrelerinin su emmelerini engeller, LT eksotoksini ise hücrelerin su ve elektrolit salgılamalarına neden olur. Bağırsaktaki su, tuz ve sıvı kaybına neden olarak insanlarda ve hayvanlarda salgısal ishale neden olur. Enterotoksinleri kodlayan genler, hem plazmitlerde hem de kromozomda (profajlar) bulunur. EHEC tipi bakterilerde ST ve LT eksotoksinleri yoktur, bunlar Şiga toksini salgılarlar, bu toksin bağırsak epitel hücrelerinin ölümüne yol açar, bu yüzden bağırsak su emme yeteneğini kaybederek kanlı ishale neden olur.
- Kapsül hücre duvarının dışında bulunan ve hücrenin çevresindeki yüzeylere tutunmasını sağlayan bir yapıdır.
- Hemolizin: E. coli suşları tarafından salgılanan sitolitik protein yapılı toksindir. Salınan demir bakteri için bir besin kaynağıdır. Alfa hemolizin ve beta hemolizin vardır. Hemolisin hly geni tarafından kodlanır. Hemolizinin üretimi ve taşınması için (hlyA, hlyB, hlyC, hlyD) genleri gerekmektedir.
- Sideroforlar ( ve ) kandaki demiri toplamaya yarar. Kanamalı ishalde ve sistemik enfeksiyonlarda bakterinin büyümek için ihtiyaç duyduğu demiri sağlar.
- bakterinin fagositozuna engel olur.
- Endotoksin hücre zarında bulunan bir glikolipittir, vücudun ona karşı gösterdiği kuvvetli tepki enflamasyonda önemli rol oynar.
Önleme
Güvenli suya erişim için ilk hedef E.coli enfeksiyonlarının önlenmesidir. Gıda ürünlerinden kaynaklanan enfeksiyonları önlemeye yönelik önlemler, uygun saklama ve pişirme sıcaklıklarını içerir.E. coli'nin bulaşmasına yönelik kanıtlanmış önleme yöntemleri arasında el yıkama ve iyileştirilmiş sanitasyon ve içme suyu yer alır, çünkü bulaşma gıda ve su kaynaklarının fekal kontaminasyonu yoluyla gerçekleşir. Ek olarak, E. coli'yi önleme yöntemlerinin arasında eti iyice pişirmek, meyve suları ve süt gibi çiğ, pastörize edilmemiş içeceklerin tüketiminden kaçınmak yer alır. Son olarak, yemek hazırlarken mutfak gereçlerinin ve çalışma alanlarının çapraz kontaminasyonundan kaçınılmalıdır.
Tedavi
Antibiyotikler, insanlarda ve hayvanlarda E. coli enfeksiyonlarının kontrolü ve tedavisi için gereklidir. Uygun tedavi, enfeksiyonun nedeni olan E. coli tipinin antibiyotik duyarlılığına bağlıdır. Antibiyotiğe direnç gelişmesi büyüyen bir sorundur. "Antimikrobiyal direncin antibiyotik tüketim miktarı ile ilişkili olduğu kabul edilmektedir. Antimikrobiyallerin uygunsuz kullanımı ve yanlış kullanımı, normal insan bakteri florasındaki patojenlerin direncini artırdı."E. coli enfeksiyonlarını tedavide kullanılabilecek antibiyotikler arasında amoksisilin, trimethoprim-sulfamethoxazole, , nitrofurantoin sayılabilir. E. coli 'nin neden olduğu her hastalık için her antibiyotik uygun olmayabilir, bu konuda bir doktora danışmak gereklidir. üreten E.coli suşları çeşitli antibiyotiklere dayanıklı bir enzimi üretirler ve bunların tedavisi çok daha zordur. Çoğu durumda bu suşlara karşı yalnızca iki oral antibiyotik ve damardan alınan sınırlı bir grup antibiyotik etkilidir.
Suşlar
Bakterilerde "suş", ortak özellikleri ile başka suş'lardan ayırdedilebilen bir gruptur. Bu farklılıklar genelde moleküler düzeyde algılanabilse de bakterinin fizyolojisi ve yaşam döngüsüne etki edebilirler, örneğin patojenliğe yol açabilirler. Farklı E. coli suşları farklı hayvanlarda yaşadıkları için sudaki dışkı kirlenmesinin kaynağını anlamak mümkündür. Yeni E. coli suşları doğal mutasyonlar sonucu sürekli olarak belirmektedir ve bunların bazılarının özellikleri içinde bulundukları konak hayvana zararlı olabilir. Çoğu sağlıklı insanda böylesi yeni bir E. coli suşu bir hafif bir ishale yol açsa da, küçük çocuklarda, başka bir hastalıktan dolayı zayıf düşmüşlerde veya bazı ilaçları alanlarda ciddi bir hastalık hatta ölüm meydana gelebilir.
E. coli’nin suşlarının sınıflandırılması, bakterilerin yüzeyindeki antijenler yoluyla yapılır. Serotiplendirme için ilk şema Kaufmann tarafından geliştirmiştir. Bu serotiplendirme E. coli’nin somatik (O), flagellar (H) ve kapsül (K) antijenlerine göre yapılır. O antijeni dış hücre zarını oluşturan lipopolisakkarit yapıdadır ve ısıya dirençli yüzey antijeni olarak tanımlanır. O antijeni, beş ya da daha fazla sayıda farklı polisakkarit grubu tarafından oluşturulmaktadır. "H" de flagelladaki antijeni belirtir. "1945 yılında Kauffmann ve Vahlne kapsül antijenini göstermek için K antijeni kavramını ortaya atmıştır." E. coli serotipleri arasında ölümcül olabilmesinden dolayı en ün yapmış olanı O157:H7'dir.
Evrimi
E. coli türünün içinde büyük bir çeşitlilik vardır. Bu, kısmen farklı ortamlarda yaşayan bakterilerin ufak mutasyonlar biriktirerek farklılaşmasından dolayı olsa da, çeşitliliğin büyük bir bölümü bazı genlerin başka bakterilerden ediniminden meydana gelir. Çeşitli patojen E. coli türlerinin farklı suşlardan kaynaklandıkları, bunların birbirlerinden bağımsız olarak virülans genlerini "yatay transfer" yoluyla elde ettikleri gösterilmiştir. Genomunda "genetik ada" olarak adlandırılan bölgelerde dışarıdan alınma genler kümelenir. Shigella türlerinin patolojik E. coli türlerinden evrimleştiği düşünülmektedir.
Mikrobiyolojide yeri
E. coli’nin kendine özgü özelliklerinden biri olan hem aerobik hem de anaeorobik koşullar altında büyüyebilme yeteneğine sahip olması onu biyoteknolojide önemli bir konak organizma yapar. Araştırmacılar bu bakteriyi büyük miktarda DNA veya protein üretmek amacıyla bir fabrika gibi kullanırlar. "Rekombinant DNA teknolojisi alanında en çok kullanılan mikroorganizmadır." Rekombinant DNA teknolojisinin ilk faydalı uygulamalarından biri E. coli 'nin manipüle edilerek onun diyabetli hastalar için insülin üretmesini sağlamak olmuştur. E. Coli, hem endüstriyel hem de medikal alanda birçok uygulamada kullanılmaktadır.
E. coli suşunun adı K-12'dir. E. coli K-12, laboratuvarda çalışılan en iyi bakteri türlerindendir. K12 suşu hastalık yapan faktörleri taşımaz ve hatta K12'nin ilk izolasyonundan günümüze geçen yıllar zarfında kapsül yapma yeteneğini kaybederek laboratuvar ortamına uyum sağlamış, artık doğal ortamında (yani insan bağırsağında) başka E. coli türleriyle rekabet edemeyecek kadar zayıflamıştır. K-12 suşu, Alkalin Fosfataz (ALP) enzimini aşırı eksprese eden bir E. coli mutant formudur. Mutasyon, enzimi sürekli olarak kodlayan gendeki bir kusur nedeniyle ortaya çıkar. Bu özel mutant form, yukarıda belirtilen enzimi izole etmek ve saflaştırmak için kullanılır.
Bakteriyel konjugasyon ve transdüksiyon E. coli K-12'de genetik araştırmayı mümkün hale getirmiştir ve moleküler biyolojinin ortaya çıkmasına neden olmuştur. DNA'nın çoğalması, RNA transkripsiyonu, protein sentezi gibi, moleküler biyolojinin pek çok önemli mekanizması bu organizmada yapılan araştırmalarla anlaşılmıştır. Modifiye edilmiş E. coli hücreleri aşı geliştirme, biyoremediasyon, biyoyakıt üretimi, aydınlatma ve immobilize enzimlerin üretiminde kullanılmıştır.
Su saflaştırılması ve evsel atık su arıtımında önemi
Su arıtım sahasında E. coli yeni teknolojilerin gelişiminin en başından itibaren su kirliliğinin bir "göstergeci" olarak kullanılmıştır. E. coli'nin içme suyunda dışkı kontaminasyonunun en iyi bakteriyel göstergesini sağladığı görülmektedir. Sudaki dışkı miktarı aracılığıyla ölçülmüştür. E. coli genelde zararsız olmasına rağmen kirlenmenin ölçütü olarak kullanılmasının nedeni, seçmeli (fakültatif) anaerob olmasından dolayı E. coli 'nin kolay kültürlenebilmesidir. "Escherichia coli, optimal büyüme koşulları altında hızla büyüyebilir ve ~20 dakikada çoğalabilir."
Ayrıca, dışkıda bulunan E. coli sayısı patojen bakterilerin (örneğin tifo etmeni Salmonella typhi) sayısından çok daha fazladır. Su kirlenmesini belirlemek amacıyla yapılan nispeten basit testlerde E. coli 'ye benzeyen organizmalar için "koliform" terimi kullanılır. Ancak, bağırsaklarda yaşamayan bazı saprotrof bakteriler de koliform tanımına uyarlar. Ayrıca, dışkı kirlenmesi olmayan ortamlarda da E. coli 'nin var olabildiği gözlemlenmiştir. Buna rağmen, pratik nedenlerden dolayı dünyanın çoğu ülkesinde su temizliğiyle ilgili standartlar "koliform sayısı"na dayandırılır.
Dış bağlantılar
- Nataro & Kaper (1998) Clinical Microbiology Reviews, 11:142-201 Diarrheagenic Escherichia coli13 Haziran 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
- E. coli serotipleri5 Kasım 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Encyclopedia of Escherichia coli Genes and Metabolism (EcoCyc)9 Mayıs 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
- - by Dr. F. Archibald (abstract only) (İngilizce)
- Coliform Bacteria and Nitrogen Fixation in Pulp and Paper Mill Effluent Treatment Systems27 Eylül 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde . - by Dr. F. Archibald (full text) (İngilizce)
- Investigation of a UK outbreak by Brian Deer18 Nisan 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
- (İngilizce)
- (İngilizce)
- (İngilizce)
- E. coli istatikleri17 Temmuz 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde . (İngilizce)
- Nobel ödüllü Joshua Lederberg'den E. coli 'nin bilimde kullanımının tarihçesi (İngilizce)
- Wikimedia Commons'ta Escherichia coli ile ilgili çoklu ortam belgeleri bulunur.
- Vikitür'de Escherichia coli ile ilgili ayrıntılı taksonomik bilgiler bulunur.
Kaynakça ve notlar
- Medical Microbiology, Samuel Baron, ed.12 Mayıs 2009 tarihinde Wayback Machine sitesinde . E. coli ile ilgili maddeler [2]12 Nisan 2007 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- Textbook of Bacteriology13 Eylül 2008 tarihinde Wayback Machine sitesinde . E. coli [3]9 Ekim 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- ^ Castellani A, Chalmers AJ. (1919). "Manual of Tropical Medicine, 3rd ed". Williams Wood and Co., New York.
- ^ a b c d Pakbin, Babak; Brück, Wolfram M.; Rossen, John W. A. (Ocak 2021). "Virulence Factors of Enteric Pathogenic Escherichia coli: A Review". International Journal of Molecular Sciences (İngilizce). 22 (18): 9922. doi:10.3390/ijms22189922. ISSN 1422-0067. 19 Ocak 2023 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 19 Ocak 2023.
- ^ a b c d Allocati, Nerino; Masulli, Michele; Alexeyev, Mikhail F.; Di Ilio, Carmine (Aralık 2013). "Escherichia coli in Europe: An Overview". International Journal of Environmental Research and Public Health (İngilizce). 10 (12): 6235-6254. doi:10.3390/ijerph10126235. ISSN 1660-4601. 19 Ocak 2023 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 19 Ocak 2023.
- ^ Tıbbi Mikrobiyoloji. 4. baskı. 28 Ekim 2022 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 19 Ocak 2023.
- ^ Trabulsi et al. (2002) Typical and Atypical Enteropathogenic Escherichia coli [1] 10 Ekim 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde .
- ^ Enterohemorajik Escherichia Coli. Treasure Island (FL): StatPearls Yayıncılık. 23 Ekim 2022 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 19 Ocak 2023.
- ^ Okeke, Iruka N; Nataro, James P (1 Aralık 2001). "Enteroaggregative Escherichia coli". The Lancet Infectious Diseases (İngilizce). 1 (5): 304-313. doi:10.1016/S1473-3099(01)00144-X. ISSN 1473-3099.
- ^ . 1 Ekim 2006 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 28 Eylül 2006.
- ^ Paton, James C.; Paton, Adrienne W. (Temmuz 1998). "Pathogenesis and Diagnosis of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli Infections". Clinical Microbiology Reviews (İngilizce). 11 (3): 450-479. doi:10.1128/CMR.11.3.450. ISSN 0893-8512. (PMC) 88891 $2. (PMID) 9665978. 24 Ocak 2023 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 24 Ocak 2023.
- ^ . 9 Ekim 2019 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Ocak 2023.
- ^ Sauvonnet, Nathalie; Vignon, Guillaume; Pugsley, Anthony P.; Gounon, Pierre (15 Mayıs 2000). "Pilus formation and protein secretion by the same machinery in Escherichia coli". The EMBO Journal. 19 (10): 2221-2228. doi:10.1093/emboj/19.10.2221. ISSN 0261-4189.
- ^ . Open Oregon Eğitim Kaynakları. 26 Eylül 2020 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 23 Ocak 2023.
- ^ a b "Escherichia coli Patotiplerinin Virülens Faktörleri". 24 Ocak 2023 tarihinde kaynağından . Erişim tarihi: 24 Ocak 2023.
- ^ . www.cdc.gov (İngilizce). 11 Ocak 2019. 21 Şubat 2012 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Ocak 2023.
- ^ . 23 Ocak 2023 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 17 Ocak 2023.
- ^ #author.fullName<nowiki>}</nowiki. . New Scientist (İngilizce). 16 Ekim 2015 tarihinde kaynağından arşivlendi. Erişim tarihi: 26 Ocak 2023.}
- ^ Jang, J.; Hur, H.-G.; Sadowsky, M.J.; Byappanahalli, M.N.; Yan, T.; Ishii, S. (Eylül 2017). "Environmental Escherichia coli : ecology and public health implications-a review". Journal of Applied Microbiology (İngilizce). 123 (3): 570-581. doi:10.1111/jam.13468.
wikipedia, wiki, viki, vikipedia, oku, kitap, kütüphane, kütübhane, ara, ara bul, bul, herşey, ne arasanız burada,hikayeler, makale, kitaplar, öğren, wiki, bilgi, tarih, yukle, izle, telefon için, turk, türk, türkçe, turkce, nasıl yapılır, ne demek, nasıl, yapmak, yapılır, indir, ücretsiz, ücretsiz indir, bedava, bedava indir, mp3, video, mp4, 3gp, jpg, jpeg, gif, png, resim, müzik, şarkı, film, film, oyun, oyunlar, mobil, cep telefonu, telefon, android, ios, apple, samsung, iphone, xiomi, xiaomi, redmi, honor, oppo, nokia, sonya, mi, pc, web, computer, bilgisayar
Escherichia coli E coli Enterobacteriaceae familyasinin bir uyesi olup memeli canlilarin kalin bagirsaginda yasadigi icin bu adi alan bir bakteri turudur E coli cubuk seklindedir ve gram negatif bakteri oldugundan endospor olusturmaz E coli yaklasik 2 0 mm uzunlugunda ve 0 5 mm capindadir E coli ilk olarak 1885 yilinda Theodor Escherich tarafindan bebek diskisindan izole edilmis ve ozellikleri belirlenmistir E coli dogumdan birkac saat sonra bebeklerin mide ve bagirsak sisteminde kolonize olur ve burada yasar E coli suslari insan vucudunda herhangi bir olumsuz etki olmaksizin bir arada bulunur Bununla birlikte E coli gastrointestinal bariyerleri asinmis ve ya da bagisikligi baskilanmis konakcilarda hastaliga neden olabilir Ozellikle bir kisim E coli dunya genelinde insanlarda ve hayvanlarda bagirsakta ve bagirsak disinda cesitli hastaliklara aracilik eder Insanlardan izole edilen E coli suslari ishale ve bir takim bagirsak disi hastaliklara neden olmaktadir Escherichia coliBir Escherichia coli bakterisinin elektron mikroskobunda goruntusuBiyolojik siniflandirmaUst alem BacteriaSube ProteobacteriaSinif GammaproteobacteriaTakim EnterobacterialesFamilya EnterobacteriaceaeCins EscherichiaTur E coliIkili adlandirmaEscherichia coli Migula 1895 Castellani and Chalmers 1919SinonimlerBacillus coli communis Escherich 1885Bakterinin Hastalikta roluEscherichia coli insanlarin ve hayvanlarin gastrointestinal yollarinda bircok yaygin bakteriyel enfeksiyonun en sik nedenlerinden biridir E coli konakcilarla karsilikli yarar saglayan bir birliktelik icinde yasar ve nadiren hastaliga neden olur Bununla birlikte bircok hastaliga sebep oldugu icin en yaygin insan ve hayvan patojenlerinden biridir E coli enterit idrar yolu enfeksiyonu septisemi ve neonatal menenjit gibi diger klinik enfeksiyonlarin onde gelen nedenidir E coli enfeksiyonlarinin terapotik tedavisi antimikrobiyal direncin ortaya cikmasi nedeniyle tehdit altindadir Coklu ilaca direncli E coli suslarinin yayilmasi nedeniyle dunya capinda hastaliklar artmaktadir E coli icinde hastalik yapan pek cok tipi vardir Bunlar hasta ettikleri dokular ve hastalik mekanizmalarina bagli olarak asagidaki patotip olarak gruplandirilirlar Bir E coli bakteri kumesinin elektron mikroskobunda 10 000 kere buyutulmus goruntusu Ishalli hastaliklar Ishalli hastaliklara neden olan E coli tipleri asagidaki gruplara ayrilirlar Enterotoksijen E coli ETEC tipleri enterotoksin ureterek hastalik yapar Cesitli toksinler vardir bazilari bagirsak mukozasina zarar veren sitotoksik enterotoksinlerdir bazilari bagirsak hucrelerinin su ve elektrolit salgilamalarina neden olan sitotonik enterotoksinlerdir ETEC den kaynaklanan diyare hastaligi cok az veya hic atesin olmadigi sulu ve kansiz ishalin hizli baslangici olarak karakterize edilir Bunun yani sira karin agrisi halsizlik bulanti ve kusma gibi semptomlarda eslik eder 24 ila 72 saat sonra bu semptomlar ortadan kalkar Enteroinvazif E coli EIEC tipleri doku hucrelerinin icine girip cogalirlar Bunun yol actigi enflamasyon tepkisi doku hasarini artirir Atesle birlikte siddetli mukozal ve kanli ishal karin kramplari gida kaynakli patojenler EIEC turlerinden kaynaklanan basilli dizanterinin klinik ozellikleridir Enteropatojenik E coli EPEC tipleri dokuya sikica baglandiktan sonra bir enflamasyon reaksiyonu olustururlar Toksin salgilayarak degil hucre ici sinyalizasyona etki ettikleri icin ishale yol actiklari dusunulmektedir EPEC suslari kotu hijyen kosullarinda basta cocuklarda olmak uzere ishale neden olur Enterohemorajik E coli EHEC Bu grupta olanlar Enteropatojenik ozellikler tasimaya ilaveten Siga toksinleri salgilar Bu gruba ait olanlarin en unlusu E coli O157 H7 nin yol actigi hastalik hemorajik kolit olarak adlandirilir Insanlarin E coli O157 H7 yi kontamine yiyecek su enfekte hayvanlar ve insanlarla dogrudan temas ile aldigi bilinmektedir EHEC atessiz kanli ishal ve karin agrisiyla birlikte lokosit sayisinin 10 000 microL nin uzerinde oldugunda kendini gosterir EHEC nin kulucka suresi 3 ila 4 gundur EnteroAggregatif E coli EAEC karakteristik bir yigilmis tugla modelinde epitel hucrelerine yapismis bakteriler seklinde gorunur ancak bunun disinda oldukca heterojendir Bu gruba has bakterilerin salgiladigi toksinler mukozaya zarar verip kronik ishale yol acarlar Diffusely Adherent E coli DAEC Ozellesmis fimbiralar sayesinde seyrek bir sekilde epitele baglanirlar ve hucre ici sinyal mekanizmasini etkinlestirirler DAEC nin konakci hucre ile etkilesime girmesine toksinleri salmasina ve konakci hucrelerde sinyal olaylarini harekete gecirir DAEC konakci hucrelere baglanir ve yapisir E coli nin heterojen bir patotipi olarak tanimlanir DAEC 1 5 ila 5 yas arasindaki cocuklarda ishal yetiskinlerde idrar yolu enfeksiyonu IYE gebelik komplikasyonlari ile iliskilidir DAEC cocuklarda sulu ishale neden olur Yetiskinler Crohn s colyak ve inflamatuar bagirsak hastaliklari ve bazi kronik inflamatuar bagirsak hastaliklarinda bulunan DAEC suslarinin asemptomatik tasiyicilaridir Idrar yolu enfeksiyonu Uropatojenik E coli UPEC Idrar yolu enfeksiyonlarinin 90 inin nedenidir Bu E coli tipleri idrar yolu epitel hucrelerine ozellikle baglanabilen fimbriumlara sahiptir Kadinlarin uretrasinin erkeklerinkinden daha kisa olmasi nedeniyle bu enfeksiyon kadinlarda daha sikca gorulur Diskidan gelen bakteri genelde cinsel iliski sonucu idrar yoluna girer bakteriler uretrayi tirmanip mesaneye ulasirlar Mesane enfeksiyonuna sistit denir tedavi edilmediginde bobrek yangisina piyelonefrit donusebilir Virulans faktorleri Shigella ve Salmonella familyasinin uyeleri aslinda E coli nin alt tipleridir Shiga toksinleri Shigella dysenteriae bakterisi ve belirli E coli suslari tarafindan uretilen virulans faktorleridir Cok cesitli serotiplere ait Shiga toksin ureten E coli STEC suslarinin insanlarda ciddi hastaliklara neden olabilecegi kabul edilmistir O157 H7 bir STEC serotipidir O157 H7 susunun tasidigi Shiga toksini geni E coli ye Shigella dan gecmistir Buyuk salginlarla iliskilendirilen bir tip olmustur Pilus uzun az sayida ve yuzeylere tutunmaya yardimci olan protein uzantilarini ifade eder Fimbria terimi genellikle hucre yuzeyinden yuzlerce cikinti yapan kisa kil benzeri proteinleri ifade eder Pilus gram negatif bakterilerde bulunan once sitoplazmik zari sonra da cikintilari araciligiyla dis zari gecmesine izin verir Pilus yapisma islevi gorur ve cesitli yuzeylerle diger bakterilerle ve konakci hucrelerle etkilesimlere aracilik eder Fimbrialar bir hucrenin yuzeylere ve diger hucrelere tutunmasini saglar Bakteri hucreleri arasindaki DNA transferinde onemlidir Fimbria ve pilus yapisal olarak benzerdir bu sebeple birbirinin yerine kullanilir Zararsiz E coli ler de piluslara sahip olmakla beraber ETEC tiplerinde bulunan ozellesmis piluslar onlarin ince bagirsak epitel hucrelerine baglanmalarini saglar Bu sayede bakteri diskiyla atilmayip ince bagirsakta yerlesir ve orada cogalabilir Baska tip piluslar idrar yolu hucrelerine veya mesane hucrelerine baglanmayi saglarlar bu yuzden idrar yolu enfeksiyonlarina yol acarlar ETEC tiplerinin en belirgin ve etkili virulans faktoru enterotoksinlerin salgilanmasidir Iki tip enterotoksin vardir Bunlardan ilki ST eksotoksini ikincisi ise LT eksotoksinidir ST eksotoksini epitel hucrelerinin su emmelerini engeller LT eksotoksini ise hucrelerin su ve elektrolit salgilamalarina neden olur Bagirsaktaki su tuz ve sivi kaybina neden olarak insanlarda ve hayvanlarda salgisal ishale neden olur Enterotoksinleri kodlayan genler hem plazmitlerde hem de kromozomda profajlar bulunur EHEC tipi bakterilerde ST ve LT eksotoksinleri yoktur bunlar Siga toksini salgilarlar bu toksin bagirsak epitel hucrelerinin olumune yol acar bu yuzden bagirsak su emme yetenegini kaybederek kanli ishale neden olur Kapsul hucre duvarinin disinda bulunan ve hucrenin cevresindeki yuzeylere tutunmasini saglayan bir yapidir Hemolizin E coli suslari tarafindan salgilanan sitolitik protein yapili toksindir Salinan demir bakteri icin bir besin kaynagidir Alfa hemolizin ve beta hemolizin vardir Hemolisin hly geni tarafindan kodlanir Hemolizinin uretimi ve tasinmasi icin hlyA hlyB hlyC hlyD genleri gerekmektedir Sideroforlar ve kandaki demiri toplamaya yarar Kanamali ishalde ve sistemik enfeksiyonlarda bakterinin buyumek icin ihtiyac duydugu demiri saglar bakterinin fagositozuna engel olur Endotoksin hucre zarinda bulunan bir glikolipittir vucudun ona karsi gosterdigi kuvvetli tepki enflamasyonda onemli rol oynar Onleme Guvenli suya erisim icin ilk hedef E coli enfeksiyonlarinin onlenmesidir Gida urunlerinden kaynaklanan enfeksiyonlari onlemeye yonelik onlemler uygun saklama ve pisirme sicakliklarini icerir E coli nin bulasmasina yonelik kanitlanmis onleme yontemleri arasinda el yikama ve iyilestirilmis sanitasyon ve icme suyu yer alir cunku bulasma gida ve su kaynaklarinin fekal kontaminasyonu yoluyla gerceklesir Ek olarak E coli yi onleme yontemlerinin arasinda eti iyice pisirmek meyve sulari ve sut gibi cig pastorize edilmemis iceceklerin tuketiminden kacinmak yer alir Son olarak yemek hazirlarken mutfak gereclerinin ve calisma alanlarinin capraz kontaminasyonundan kacinilmalidir Tedavi Antibiyotikler insanlarda ve hayvanlarda E coli enfeksiyonlarinin kontrolu ve tedavisi icin gereklidir Uygun tedavi enfeksiyonun nedeni olan E coli tipinin antibiyotik duyarliligina baglidir Antibiyotige direnc gelismesi buyuyen bir sorundur Antimikrobiyal direncin antibiyotik tuketim miktari ile iliskili oldugu kabul edilmektedir Antimikrobiyallerin uygunsuz kullanimi ve yanlis kullanimi normal insan bakteri florasindaki patojenlerin direncini artirdi E coli enfeksiyonlarini tedavide kullanilabilecek antibiyotikler arasinda amoksisilin trimethoprim sulfamethoxazole nitrofurantoin sayilabilir E coli nin neden oldugu her hastalik icin her antibiyotik uygun olmayabilir bu konuda bir doktora danismak gereklidir ureten E coli suslari cesitli antibiyotiklere dayanikli bir enzimi uretirler ve bunlarin tedavisi cok daha zordur Cogu durumda bu suslara karsi yalnizca iki oral antibiyotik ve damardan alinan sinirli bir grup antibiyotik etkilidir SuslarBakterilerde sus ortak ozellikleri ile baska sus lardan ayirdedilebilen bir gruptur Bu farkliliklar genelde molekuler duzeyde algilanabilse de bakterinin fizyolojisi ve yasam dongusune etki edebilirler ornegin patojenlige yol acabilirler Farkli E coli suslari farkli hayvanlarda yasadiklari icin sudaki diski kirlenmesinin kaynagini anlamak mumkundur Yeni E coli suslari dogal mutasyonlar sonucu surekli olarak belirmektedir ve bunlarin bazilarinin ozellikleri icinde bulunduklari konak hayvana zararli olabilir Cogu saglikli insanda boylesi yeni bir E coli susu bir hafif bir ishale yol acsa da kucuk cocuklarda baska bir hastaliktan dolayi zayif dusmuslerde veya bazi ilaclari alanlarda ciddi bir hastalik hatta olum meydana gelebilir E coli nin suslarinin siniflandirilmasi bakterilerin yuzeyindeki antijenler yoluyla yapilir Serotiplendirme icin ilk sema Kaufmann tarafindan gelistirmistir Bu serotiplendirme E coli nin somatik O flagellar H ve kapsul K antijenlerine gore yapilir O antijeni dis hucre zarini olusturan lipopolisakkarit yapidadir ve isiya direncli yuzey antijeni olarak tanimlanir O antijeni bes ya da daha fazla sayida farkli polisakkarit grubu tarafindan olusturulmaktadir H de flagelladaki antijeni belirtir 1945 yilinda Kauffmann ve Vahlne kapsul antijenini gostermek icin K antijeni kavramini ortaya atmistir E coli serotipleri arasinda olumcul olabilmesinden dolayi en un yapmis olani O157 H7 dir Evrimi E coli turunun icinde buyuk bir cesitlilik vardir Bu kismen farkli ortamlarda yasayan bakterilerin ufak mutasyonlar biriktirerek farklilasmasindan dolayi olsa da cesitliligin buyuk bir bolumu bazi genlerin baska bakterilerden ediniminden meydana gelir Cesitli patojen E coli turlerinin farkli suslardan kaynaklandiklari bunlarin birbirlerinden bagimsiz olarak virulans genlerini yatay transfer yoluyla elde ettikleri gosterilmistir Genomunda genetik ada olarak adlandirilan bolgelerde disaridan alinma genler kumelenir Shigella turlerinin patolojik E coli turlerinden evrimlestigi dusunulmektedir Mikrobiyolojide yeriE coli nin buyumesi ve bolunmesi E coli orta kismindan yeni hucre duvari yaparak buyur solda Bazi baska bakteriler ise ornegin Corynebacterium diphtheriae hucrenin kutuplarindan buyur sagda Mavi ve kirmizi sirasiyla eski ve yeni hucre duvarini gosterir E coli nin kendine ozgu ozelliklerinden biri olan hem aerobik hem de anaeorobik kosullar altinda buyuyebilme yetenegine sahip olmasi onu biyoteknolojide onemli bir konak organizma yapar Arastirmacilar bu bakteriyi buyuk miktarda DNA veya protein uretmek amaciyla bir fabrika gibi kullanirlar Rekombinant DNA teknolojisi alaninda en cok kullanilan mikroorganizmadir Rekombinant DNA teknolojisinin ilk faydali uygulamalarindan biri E coli nin manipule edilerek onun diyabetli hastalar icin insulin uretmesini saglamak olmustur E Coli hem endustriyel hem de medikal alanda bircok uygulamada kullanilmaktadir E coli susunun adi K 12 dir E coli K 12 laboratuvarda calisilan en iyi bakteri turlerindendir K12 susu hastalik yapan faktorleri tasimaz ve hatta K12 nin ilk izolasyonundan gunumuze gecen yillar zarfinda kapsul yapma yetenegini kaybederek laboratuvar ortamina uyum saglamis artik dogal ortaminda yani insan bagirsaginda baska E coli turleriyle rekabet edemeyecek kadar zayiflamistir K 12 susu Alkalin Fosfataz ALP enzimini asiri eksprese eden bir E coli mutant formudur Mutasyon enzimi surekli olarak kodlayan gendeki bir kusur nedeniyle ortaya cikar Bu ozel mutant form yukarida belirtilen enzimi izole etmek ve saflastirmak icin kullanilir Bakteriyel konjugasyon ve transduksiyon E coli K 12 de genetik arastirmayi mumkun hale getirmistir ve molekuler biyolojinin ortaya cikmasina neden olmustur DNA nin cogalmasi RNA transkripsiyonu protein sentezi gibi molekuler biyolojinin pek cok onemli mekanizmasi bu organizmada yapilan arastirmalarla anlasilmistir Modifiye edilmis E coli hucreleri asi gelistirme biyoremediasyon biyoyakit uretimi aydinlatma ve immobilize enzimlerin uretiminde kullanilmistir Su saflastirilmasi ve evsel atik su aritiminda onemiSu aritim sahasinda E coli yeni teknolojilerin gelisiminin en basindan itibaren su kirliliginin bir gostergeci olarak kullanilmistir E coli nin icme suyunda diski kontaminasyonunun en iyi bakteriyel gostergesini sagladigi gorulmektedir Sudaki diski miktari araciligiyla olculmustur E coli genelde zararsiz olmasina ragmen kirlenmenin olcutu olarak kullanilmasinin nedeni secmeli fakultatif anaerob olmasindan dolayi E coli nin kolay kulturlenebilmesidir Escherichia coli optimal buyume kosullari altinda hizla buyuyebilir ve 20 dakikada cogalabilir Ayrica diskida bulunan E coli sayisi patojen bakterilerin ornegin tifo etmeni Salmonella typhi sayisindan cok daha fazladir Su kirlenmesini belirlemek amaciyla yapilan nispeten basit testlerde E coli ye benzeyen organizmalar icin koliform terimi kullanilir Ancak bagirsaklarda yasamayan bazi saprotrof bakteriler de koliform tanimina uyarlar Ayrica diski kirlenmesi olmayan ortamlarda da E coli nin var olabildigi gozlemlenmistir Buna ragmen pratik nedenlerden dolayi dunyanin cogu ulkesinde su temizligiyle ilgili standartlar koliform sayisi na dayandirilir Dis baglantilarNataro amp Kaper 1998 Clinical Microbiology Reviews 11 142 201 Diarrheagenic Escherichia coli13 Haziran 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce E coli serotipleri5 Kasim 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Encyclopedia of Escherichia coli Genes and Metabolism EcoCyc 9 Mayis 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce by Dr F Archibald abstract only Ingilizce Coliform Bacteria and Nitrogen Fixation in Pulp and Paper Mill Effluent Treatment Systems27 Eylul 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde by Dr F Archibald full text Ingilizce Investigation of a UK outbreak by Brian Deer18 Nisan 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce Ingilizce Ingilizce Ingilizce E coli istatikleri17 Temmuz 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Ingilizce Nobel odullu Joshua Lederberg den E coli nin bilimde kullaniminin tarihcesi Ingilizce Wikimedia Commons ta Escherichia coli ile ilgili coklu ortam belgeleri bulunur Vikitur de Escherichia coli ile ilgili ayrintili taksonomik bilgiler bulunur Kaynakca ve notlarMedical Microbiology Samuel Baron ed 12 Mayis 2009 tarihinde Wayback Machine sitesinde E coli ile ilgili maddeler 2 12 Nisan 2007 tarihinde Wayback Machine sitesinde Textbook of Bacteriology13 Eylul 2008 tarihinde Wayback Machine sitesinde E coli 3 9 Ekim 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Castellani A Chalmers AJ 1919 Manual of Tropical Medicine 3rd ed Williams Wood and Co New York a b c d Pakbin Babak Bruck Wolfram M Rossen John W A Ocak 2021 Virulence Factors of Enteric Pathogenic Escherichia coli A Review International Journal of Molecular Sciences Ingilizce 22 18 9922 doi 10 3390 ijms22189922 ISSN 1422 0067 19 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 19 Ocak 2023 a b c d Allocati Nerino Masulli Michele Alexeyev Mikhail F Di Ilio Carmine Aralik 2013 Escherichia coli in Europe An Overview International Journal of Environmental Research and Public Health Ingilizce 10 12 6235 6254 doi 10 3390 ijerph10126235 ISSN 1660 4601 19 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 19 Ocak 2023 Tibbi Mikrobiyoloji 4 baski 28 Ekim 2022 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 19 Ocak 2023 Trabulsi et al 2002 Typical and Atypical Enteropathogenic Escherichia coli 1 10 Ekim 2006 tarihinde Wayback Machine sitesinde Enterohemorajik Escherichia Coli Treasure Island FL StatPearls Yayincilik 23 Ekim 2022 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 19 Ocak 2023 Okeke Iruka N Nataro James P 1 Aralik 2001 Enteroaggregative Escherichia coli The Lancet Infectious Diseases Ingilizce 1 5 304 313 doi 10 1016 S1473 3099 01 00144 X ISSN 1473 3099 1 Ekim 2006 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 28 Eylul 2006 Paton James C Paton Adrienne W Temmuz 1998 Pathogenesis and Diagnosis of Shiga Toxin Producing Escherichia coli Infections Clinical Microbiology Reviews Ingilizce 11 3 450 479 doi 10 1128 CMR 11 3 450 ISSN 0893 8512 PMC 88891 2 PMID 9665978 24 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 24 Ocak 2023 KB1 bakim PMC bicimi link 9 Ekim 2019 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 23 Ocak 2023 Sauvonnet Nathalie Vignon Guillaume Pugsley Anthony P Gounon Pierre 15 Mayis 2000 Pilus formation and protein secretion by the same machinery in Escherichia coli The EMBO Journal 19 10 2221 2228 doi 10 1093 emboj 19 10 2221 ISSN 0261 4189 Open Oregon Egitim Kaynaklari 26 Eylul 2020 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 23 Ocak 2023 a b Escherichia coli Patotiplerinin Virulens Faktorleri 24 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan Erisim tarihi 24 Ocak 2023 www cdc gov Ingilizce 11 Ocak 2019 21 Subat 2012 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 26 Ocak 2023 23 Ocak 2023 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 17 Ocak 2023 author fullName lt nowiki gt lt nowiki New Scientist Ingilizce 16 Ekim 2015 tarihinde kaynagindan arsivlendi Erisim tarihi 26 Ocak 2023 Jang J Hur H G Sadowsky M J Byappanahalli M N Yan T Ishii S Eylul 2017 Environmental Escherichia coli ecology and public health implications a review Journal of Applied Microbiology Ingilizce 123 3 570 581 doi 10 1111 jam 13468